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喷雾诱导的疾病控制基因沉默取决于病原体RNA摄取的效率
最新发现表明，真菌可以占据环境RNA，然后可以通过环境RNA干扰沉默真菌基因。这一发现促使开发用于植物疾病管理的喷雾诱导的基因沉默（SIGS）。在这项研究中，我们旨在确定在各种真核微生物中SIG的效率。我们首先检查了多种致病性和非致病真菌和卵形病原体中RNA摄取的效率。我们观察到了真菌植物病原体中有效的双链RNA（dsRNA）摄取，果仁酸酯，硬化菌核，根瘤菌索拉尼，索拉尼菌，尼日尔和佛罗里达州的黄瓜和佛罗里西亚果皮，但在浓度较弱真菌，Trichoderma Virens。对于卵植物病原体，植物疫霉菌，RNA吸收有限，并且在不同的细胞类型和发育阶段有所不同。靶向毒力相关基因的DSRNA局部应用在具有高RNA摄取效率的高效率的病原体中显着抑制了植物性疾病症状，而DSRNA在低RNA效率效率低的病原体中的应用不会抑制感染。我们的结果表明，在真核微生物物种和细胞类型之间，DSRNA摄取效率各不相同。SIG在植物性疾病管理方面的成功可以在很大程度上取决于病原体的RNA摄取效率。
单个基因的反复获得和丢失调节维管植物病原体生活方式的进化
维管植物病原体通过宿主静脉长距离传播，导致危及生命的全身性感染。相反，非维管病原体仍然局限于感染部位，引发局部症状发展。维管疾病和非维管疾病的对比特征表明病因不同，但每种疾病的基础仍不清楚。在这里，我们表明水解酶 CbsA 充当维管植物和非维管植物致病机制之间的表型转换。cbsA 在黄单胞菌科的维管植物病原菌基因组中富集，而在大多数非维管物种中不存在。CbsA 表达使非维管黄单胞菌引起维管病，而 cbsA 诱变导致维管病减少或非维管病症状发展增强。系统发育假设检验进一步表明，cbsA 在多个非维管谱系中丢失，最近被一些维管亚群获得，这表明维管病是祖先的。我们的研究结果总体证明了单个基因座的获得和丢失如何促进复杂生态特征的进化。
结核分枝杆菌激活 MDA5 RNA 传感通路促进先天免疫颠覆和病原体存活
引言结核病 (TB) 仍然是一项严重的健康挑战，仅在 2021 年全球就造成约 150 万人死亡 (1)。结核分枝杆菌 (M . tuberculosis) 具有极强的人类适应性，通过尚不完全了解的免疫破坏机制在巨噬细胞内存活。肺巨噬细胞最初吞噬结核分枝杆菌会激活由种系编码的模式识别受体 (PRR) 组成的胞浆监视途径，导致 I 型干扰素 (IFN) 和促炎细胞因子产生增加、炎症小体活化和自噬 (2–4)。我们实验室和其他实验室的研究表明，结核分枝杆菌 DNA 和分枝杆菌衍生的环状二核苷酸可激活胞浆 DNA 传感途径 (5–8)，从而驱动 I 型 IFN 的表达。虽然已经广泛研究了细胞浆病毒 RNA 在先天免疫感应中的作用，但细菌 RNA 对疾病发病机制的贡献尚不明确 (9)。最典型的 RIG-I 样受体 (RLR) 家族成员 RIG-I 和黑色素瘤分化因子 5 (MDA5) 包含一个中央 ATPase 含 DExD/H-box 解旋酶结构域和一个 C 末端阻遏物结构域，这两个结构域均参与 RNA 结合 (10, 11)。通过 RNA 结合激活后，2 个串联 caspase 激活和募集结构域 (CARD) 与衔接子线粒体抗病毒信号蛋白 (MAVS) 相互作用，介导 NF- κ B 和 IFN 调节因子 (IRF) 的诱导以及随后 IFN 刺激基因 (ISG) 的表达 (12–14)。尽管结构相似，RLR 检测的 RNA 种类往往不同，这些 RNA 种类往往具有病原体特异性，但不一定相互排斥 (11, 15)。越来越多的证据表明，RIG-I 在结核分枝杆菌感染的 I 型干扰素反应中起着非冗余作用 (16–18)，它通过与特定的结核分枝杆菌 RNA 转录本结合，这些转录本利用分枝杆菌 ESX-1 分泌系统进入巨噬细胞胞质 (16)。我们最近发现，结核分枝杆菌 RNA 转录本能够通过与特定结核分枝杆菌 RNA 转录本结合，从而进入巨噬细胞胞质。
关于可持续淡水水产养殖生产中病原体监测宏基因组分析的新观点：系统评价
近年来，淡水和盐水水生食品行业经历了最显着的增长，并越来越被认为是促进繁荣的社会自我绩效和生态上的可持续替代方案。水产养殖生产中的一个主要经济和健康危险因素是健康控制，在热带和发展中国家中可能会发现更严重的影响。虽然宏基因组学对在水产养殖等农业工业领域的应用有很大的希望，但其采用仍然有限。因此，本研究旨在评估开发和应用宏基因组学在识别淡水水产养殖中病原体时的前景。WIPO数据库用于搜索使用宏基因组学开发的专利，以监测淡水水产养殖中的病原体。宏基因组方法已广泛用于不同的领域，例如医学，兽医，生物技术，农业，特别是在重点是不同生态系统中的微生物群落的研究中。在水产养殖中，宏基因组学的利用主要围绕研究抗生素耐药性基因，主要是在盐水农场中。尽管如此，淡水水产养殖，尤其是在鱼类和甲壳类动物中，与可持续发展目标密切相符，尤其是（SDGS）2、3、6和13。国家，例如美利坚合众国，韩国和加拿大，在利用元基因组学对淡水水产养殖的疾病监测的最前沿，其积极的专利发展证明了这一点。与生物信息学工具和数据库相结合的宏基因组分析代表了用于预防目的的环境监测的快速，安全且无创的方法。
分析Marchantia多形 - 微生物相互作用：理解植物 - 微生物和植物病原体相互作用的基础
Marchantia多肌形是近年来进化研究中一种模型植物的矮苔属植物。这归因于其小序列的基因组，标准化转化方法，全球分布以及易于且快速的体外培养。作为一种进化模型，多晶型多形促进了我们对植物防御反应的演变和相关的激素信号通路的理解。通过与微生物的相互作用，多晶型菌是一种有价值的知识来源，可以对新的微生物物种和生物活性化合物产生见解。书目分析涉及使用不同的搜索词收集，阅读和分类从Scopus和Web of Science数据库中获得的文档。该评论基于1995年至2023年之间发表的30篇文章，日本和西班牙作者成为该领域中最重要的贡献者。这些文章已分为四个主要主题：M. polymorpha产生的抗菌代谢产物；附生，内生和致病微生物的鉴定和表征；分子研究多形和微生物之间的直接相互作用；并使用细菌载体转化植物。本评论重点介绍了这些文章的关键发现，并确定了潜在的未来研究方向。
微生物悬浮液和各种有机肥料对病原体Sp的发展的反应。在葱
葱（葱囊藻）是充当天然抗氧化剂的园艺植物之一。葱在印度尼西亚的生产率相对较低。它受到各种因素的影响，其中之一是由于土壤传播病原体的攻击，即oxysporum。镰刀菌病原体攻击的症状是黄色或淡绿色的叶子，并且更长的生长。严重的攻击会导致植物死亡。平衡的施肥和生物农药的施用可以防止镰刀菌。这项研究旨在减少和控制枯萎病疾病。所使用的研究方法是拆分图设计方法，该方法由两个因素组成，即主要图，即微生物的悬浮液的应用，包括两个级别，即应用两个级别，即施用杀菌剂（S0）和子图，以及子图，即对各种有机肥料的施用（M MOR）（MONAME）（MONAME）（MOR）（MOR）（MOR）（MOR）（MOR）（MOR）（MOR）。 （M1）和Piensbio有机肥料（M2）。将使用方差分析（ANOVA）分析每种处理的观察数据。，如果每种处理差异差异，则进行邓肯测试（α= 5％）。这项研究的结果，主要情节治疗，杀菌剂的应用（S0），孵育期为29天，疾病攻击的平均强度为4.2％。子图（一种有机肥料（M））的处理无法抑制攻击的强度，并减慢了镰刀菌在青葱农作物上的孵化期。在所有观察参数上的处理和子图之间没有相互作用。
通过病原体识别和炎症调节参与先天免疫的Litopenaeus Vannamei的甘露糖受体
摘要：作为C型凝集素超家族成员的甘露糖受体是一种非典型的pat-tern识别受体，可以内化与病原体相关的配体并激活细胞内信号传导。在这里，甘露糖受体基因LVMR是从Paci -Paci -files flitopenaeus vannamei中鉴定出来的。LVMR编码了信号肽，纤维蛋白II型（FN II）结构域和两个具有特殊EPS和FND基序的碳水化合物识别域（CRD）。LVMR转录本主要在肝癌中检测到，并在病原体挑战后提出了时间依赖的反应。重组LVMR（RLVMR）可以以Ca 2+依赖性的方式与各种PAMP和凝集的微生物结合，具有强大结合D-甘露糖和N-乙酰糖的能力。LVMR的敲低增强了大多数NF-κB途径基因的表达，炎症和氧化还原基因，而对大多数吞噬作用基因的转录没有明显影响。此外，LVMR的敲低导致活性氧（ROS）含量（ROS）含量和诱导型一氧化氮合酶（INOS）活性在颤动性和溶血感染后的肝癌中的活性增加。所有这些结果表明，LVMR在细菌感染过程中可能会作为免疫识别和炎症的负调节剂作为PRR。
野生肠道微生物组在驯养的饲养条件下抑制Medaka的机会性病原体气管
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证。是根据作者/资助者提供的预印本（未经同行评审认证）提供的，他已授予Biorxiv的许可证，以在2025年2月10日发布的此版本中在版权所有者中显示预印本。 https://doi.org/10.1101/2024.11.06.621463 doi：Biorxiv Preprint
评估重组侵入性，非致病性大肠杆菌作为针对细胞内病原体Brucella
我们的方法利用非病原性大肠杆菌在递送和呈递抗原时模仿细胞内病原体的布鲁氏菌融合体来刺激TH1和CTL反应。大肠杆菌通常是细胞外的，而布鲁氏菌是细胞内细菌。因此，我们启动了大肠杆菌（DH5α），以表达含有耶尔森氏菌的INV基因的质粒，单核细胞增生李斯特氏菌的基因和HLY基因[31]。通过结合αβ1-整合素异二聚体来引入宿主细胞的大肠杆菌侵袭。整合素的聚类后，Inva-sin激活了信号级联。一种信号通路会导致局灶性粘附组分的激活，包括SRC，局灶性粘附激酶和细胞乳蛋白蛋白，导致形成伪足，使细菌吞噬细菌进入宿主细胞。侵入蛋白与β1-整合蛋白的结合是必要的，并且足以诱导细菌的吞噬，即使是非专业的吞噬细胞。第二个途径，包括Rac1，NF-κB的激活和有丝分裂原激活的蛋白激酶，导致促炎细胞因子的产生[32]。互隔化后，将大肠杆菌带入发生细菌裂解的吞噬体/溶酶体。HLY基因产物以及其他细菌蛋白被释放到乳胶囊泡中。硫酸激活的Hly，也称为李斯特氏蛋白酶O（LLO）是一种在低pH值下的结合和孔形吞噬体膜的孔形成细胞溶胶蛋白酶。此批判步骤将抗原从大肠杆菌出口到细胞质细菌的细胞质含量可以通过LLO产生的孔中逃脱到乳腺细胞的胞质区室。
使用氧化锌纳米粒子
细菌感染可能发生在各种身体组织中，包括呼吸道，尿路，胃肠道和血流。这项研究旨在使用表型和基因型方法鉴定三种重要的致病物种 - 大肠杆菌，克雷伯氏菌和铜绿假单胞菌。细菌分离株最初通过标准诊断测试鉴定，并通过多重PCR确认。将与每种病原体相对应的三个随机选择的分离株进行基因测序，并与NCBI的参考菌株进行比较。此外，从乳杆菌属的氧化锌（ZnO）纳米颗粒的抗生物胶片活性。提取物。使用FTIR，XRD，FE-SEM和AFM对合成的ZnO纳米颗粒进行表征。XRD分析显示出不同的峰值指示晶相，而AFM和FE-SEM显示球形纳米颗粒，平均直径为58.30 nm。该研究还评估了ZnO纳米颗粒抑制生物膜形成的能力。结果表明，样本类型（烧伤，伤口和尿液）与感染病原体之间没有统计学意义的关联（P = 0.37）。多重PCR扩增在28个分离株中成功成功，共同感染如下：57.15％的分离株显示三重感染（所有三种病原体），而在57.14％（E. coli and P. aeruginosa）中观察到双重感染，e.luginosa和46.42％（E. coli and K. pneos and aerug anderos and Aerimonia和46.42％）和46.46％（和46.42％）和46％。分离株的肺炎。用ZnO纳米颗粒处理后观察到生物膜形成的显着降低（P≤0.001）。在50.01％（大肠杆菌），28.58％（铜绿假单胞菌）和17.86％（K。肺炎）中检测到单一感染。测序分析显示，大肠杆菌，铜绿假单胞菌和K.肺炎的参考基因的相似性分别为99％和98％。总而言之，基因型和表型方法对病原体鉴定有效，ZnO纳米颗粒在抑制生物膜形成方面具有显着潜力，为对抗细菌感染提供了有希望的方法。