抽象目标在许多疾病中,微生物组组成的因果关系和致病机制仍然难以捉摸,包括自身免疫性疾病,例如类风湿关节炎(RA)。这项研究旨在通过全面的元基因组协会研究(MWAS)阐明肠道微生物组在RA病理学中的作用。方法我们通过使用高深度的全基因组shot弹枪测序(平均每样本13 GB),在日本人群中进行了RA肠道微生物组的MWA(N病例= 82,N对照= 42)。我们的MWA由三个主要的生物信息学分析管道(系统发育分析,功能基因分析和途径分析)组成。结果系统发育病例 - 对照关联测试显示,在RA病例元基因组中,属于Prevotella属(例如Prevotella denticola)的多个物种的丰度很高。非线性机器学习方法有效地解除了案例 - 控制系统发育差异。基因功能评估表明,与对照组相比,RA元素组中,一个与氧化还原反应相关的基因的丰度显着降低。在案例对照比较中,富集了多种生物途径,包括与代谢相关的生物途径(例如脂肪酸生物合成和糖胺聚糖降解)。通过比较RA元基因组与RA基因组全基因组关联研究结果的生物途径富集来确定元基因组和宿主基因组之间的特定人群特异性联系。在RA病例和对照组之间,发现alpha或β多样性的α多样性中没有明显的差异。结论我们基于shot弹枪测序的MWA突出了肠道微生物组,宿主基因组和RA病理学之间的新联系,这有助于我们理解微生物组在RA病因中的作用。
抽象背景免疫检查点抑制剂(ICI)是无法切除的肝细胞癌(UHCC)的有前途的药物,但缺乏预测结果的有效生物标志物。肠道微生物组可以调节肿瘤对免疫疗法的反应,但其对HCC的影响尚不清楚。方法从2018年5月至2020年2月,预期接受ICI治疗的患者被前景招募;他们的粪便样品是在治疗前收集的。对20例放射学预反应(OR)和21例随机选择患有进行性疾病(PD)的患者分析了粪便菌群和代谢产物。2020年3月后,将33例连续的儿童PUGH-A患者招募为验证队列。此外,还收集了来自17位健康志愿者的粪便以比较背景微生物。结果在免疫疗法之前,患有或PD患者和PD患者之间的粪便细菌中观察到显着差异。Prevotella 9富含PD患者,而Lachnoctridium,Lachnospileceae和Veillonella则主要是OR患者。ursexyoxycholic酸和ursecolicac在患有或与lachnoclostridium的丰度密切相关的患者的粪便中显着富集。lachnoctrostridium富集和Prevotella 9的共存显着预测了更好的总生存期(OS)。在验证队列中,与反组相比具有可取的微生物签名的患者中,在验证队列中,预见了更好的无进展生存期(PFS)和OS(PFS:8.8个月vs 1.8个月; OS:未达到6.5个月,均为6.5个月,均为p <0.001 p <0.001)。结论粪便菌群和胆汁酸与UHCC免疫疗法的结局有关。这些发现突出了肠道菌群和代谢产物作为预测ICI处理HCC结果的生物标志物的潜在作用。
放线菌Odontolyticus(AO),聚集的放线菌ceTemcetemComitans(AA),弯曲杆菌薄(CG),弯曲杆菌矫正(CR),弯曲杆菌表演(CS),Fusobacterium cobacterium nucLeatum nucleatum(FN),Sp。 div>naviforme,fusobacterium nucleatum(fn)sp。 div>核,镰刀菌核(Fn)sp。 div>多晶,烟杆菌(FP),流感嗜血杆菌(HI),螺旋杆菌(PM),Prevotella(P),卟啉单胞菌(P),Pseudomonas aeraiosa(Pa),aphoccus anaerobius(saphyloccus anaocius othoccus andyoccus anaoccus andyoccus anaoccus andyoccus)溶血症(SK),链球菌(SI),轻度链球菌(SM),Tannerella(TF),Terry(TD),Treponema Socranskii(TS),Veillonella(vp) div) div>
与加速下降相关,而生物物理粘液特征导致了个体变异性。同时考虑粘液和微生物时,出现了加速下降的粘液 - 微生物组关联,其特征是粘蛋白(Muc5ac [Mucin 5ac]和Muc5b [粘液蛋白5B])浓度增加,并且存在Achromobobacter和Achromobacter和Klebsiella。随着COPD的进展,粘液 - 微生物组的转移发生,最初以低粘量浓度和从粘性到弹性优势的过渡,并伴随着Cermensals Veillonella,gemella,rothia和prevotella(全球性持续性肺部疾病的浓度,均与Mucus cisticins cisticentiention和Mucus cistctions,Mucus cistctientive Initiative and Mucus cistctientive Initiative and Mucus,Mucus cistctions,Mucus cistcts,Mucus cistcts and。微生物包括嗜血杆菌,摩拉氏菌和假单胞菌(Gold E)。
某些厌氧菌需要添加维生素K和Hemin(1,2)才能生长。因此,建议将硫代糖果培养基和维生素K用于分离和培养临床材料中存在于临床材料中存在的刺激性或缓慢增长的强制性厌氧微生物。也建议将多种有氧和辅助厌氧微生物分离和培养。色氨酸和酵母提取物提供氮化合物,维生素B复合物以及其他必要的生长养分,可用于细菌代谢。硫代基酸钠和l-cyst ine充当减少剂并在培养基中保持低氧张力。维生素K是某些prevotella黑色素毒素菌株的生长需求。顶部的粉红色环(氧化培养基)是由于硫唑蛋白指示剂引起的。hemin是X因子的来源,它刺激了许多微生物的生长。
摘要:目前,中国的“浓缩物”,“浓缩物 +干草”和TMR“总混合口粮”进食模式的犊牛通常尚不清楚实际生产中的三种分子调节机制。这项研究旨在探索中国荷斯坦犊牛最合适的喂养模式,以改善瘤胃发酵功能和犊牛的生长性能。在这方面,研究了瘤胃微生物与宿主代谢之间的相互作用。GF组的瘤胃体积和犊牛的重量显着高于GFF和TMR组中的瘤犊牛(P <0.05),而GF组的犊牛瘤pH值为6.47〜6.79。宏基因组学分析表明,GF和GFF犊牛的瘤胃微生物组的相对丰度较高,甲烷二磷,甲烷磷和甲诺氏菌具有较高的相对丰度(p <0.05)。prevotella多含糖果在GF犊牛的瘤胃中(p <0.05)的含量更高,这表明GF组犊牛具有更强的发酵糖的能力。值得注意的是,与TMR组相比,在丙酮酸代谢途径中,在GF犊牛中显着上调了磷酸烯醇丙酮酸羧化酶,并且丙酮酸磷酸二酮酶显着下调。代谢组学结果表明,在GF犊牛中,Ursodoxycholic的上调显着上调,并且大多数差异代谢产物都富含胆汁分泌途径。协会分析研究发现,Prevotella和Ruminococcaceae的微生物可能与宿主合作,这有助于消化和吸收脂质,并使犊牛的生长更好。这三种喂养模式具有相似的效果,但是“ GF”喂养模式对有关瘤胃形态,含量生理学和微生物的个人生长和瘤胃发展更为有益。此外,瘤胃微生物和宿主的协同作用可以更有效地水解脂质物质并促进脂质的吸收,这对犊牛的生长具有很大的意义。
常见的非传染性糖尿病在人体的几个部分中有许多并发症。口腔是受糖尿病症状影响的区域之一。口腔区域中糖尿病的最常见补充包括口腔干燥以及由微生物活性(例如龋齿,牙周疾病)和口腔念珠菌病或生理问题等微生物活性引起的口腔疾病增加,例如口腔癌,口腔癌,口腔癌,口腔综合征和颞叶肉眼疾病。糖尿病也对口服微生物群的多样性和数量有影响。口腔感染由糖尿病促进的主要是由于口服微生物群之间平衡的干扰而引起的。 某些口腔可能与糖尿病呈正相关或负相关,而另一些则可能不会受到影响。 糖尿病存在下最多的物种是细菌的脂肪菌,例如溶血链球菌,葡萄球菌属,prevotella spp。 ,leptotrichia spp。和veillonella和真菌念珠菌的物种。 proteeobacteria spp。 和双歧杆菌属。 是常见的微生物群,受糖尿病的负面影响。 通常,糖尿病的作用可能包括所有类型的口服微生物群,无论是细菌还是真菌。 在本次审查中将说明的糖尿病和口服微生物群之间的3种类型的关联是增加,减少或缺乏影响。口腔感染由糖尿病促进的主要是由于口服微生物群之间平衡的干扰而引起的。某些口腔可能与糖尿病呈正相关或负相关,而另一些则可能不会受到影响。糖尿病存在下最多的物种是细菌的脂肪菌,例如溶血链球菌,葡萄球菌属,prevotella spp。,leptotrichia spp。和veillonella和真菌念珠菌的物种。proteeobacteria spp。和双歧杆菌属。是常见的微生物群,受糖尿病的负面影响。通常,糖尿病的作用可能包括所有类型的口服微生物群,无论是细菌还是真菌。在本次审查中将说明的糖尿病和口服微生物群之间的3种类型的关联是增加,减少或缺乏影响。作为最终包含,在糖尿病存在下,大量口服微生物群增加了。
结果:结果表明,菜籽花粉可以通过选择性调节肠道微生物群有效地减轻慢性非细菌前列腺炎,并具有更高剂量和壁中断的花粉表现出更大的有效性。用高剂量的壁式腌菜蜜蜂花粉(WDH,1.26 g kg-1体重)的治疗使前列腺湿重量和前列腺指数降低了约32%和36%,几乎是对照组观察到的水平。壁dist的菜籽花粉处理也显着降低了(p <0.05),如通过Laser canernning microscal concanning microscal microscal microscol concanning concansince concansce concansece coNSIDE降低了促进性细胞因子(IL-6,IL-8,IL-1和TNF-⊍)的表达。我们的结果表明,菜籽花粉可以抑制致病性细菌并增强益生菌,特别是在企业与细菌的比率(f/b)比率和丰富的prevotella(属)中。
结果该研究包括236名HNSCC病例参与者,平均年龄为60.9(9.5)年龄,在平均为5.1(3.6)年的随访中,女性为24.6%,485名匹配的对照参与者。基线时的总体微生物组多样性与随后的HNSCC风险无关;然而,发现13种口腔细菌与HNSCC的发展有差异化。该物种包括新近鉴定的唾液,sanguinis链球菌和瘦素种类,以及属于Beta和伽马菌的几种物种。红色/橙色牙周病原体复合物与HNSCC风险相关(赔率比,每1 SD 1.06; 95%CI,1.00-1.12)。微生物风险评分(基于22种细菌创建)的1-SD增加与HNSCC风险增加50%有关(多元优势比,1.50; 95%CI,1.21-1.85)。未发现与HNSCC风险相关的真菌分类单元。
微生物组是一个术语,用于定义整个人体中存在的共生,共生和致病微生物的组合社区。每个身体部位都有一个特定的微生物群,取决于个人的习惯,地理位置和遗传组成。微生物组对于维持健康至关重要,但是当它被破坏时,它会进入“营养不良”状态,这可能会导致疾病。例如,胃肠道微生物群的失衡与炎症性肠病,哮喘和肥胖有关。因此,膀胱微生物组中的营养不良可能导致慢性病状态。研究详细介绍了泌尿微生物组的组成,将健康的尿液微生物组与健康联系起来以及泌尿营养不良与疾病的研究引起了很大的兴趣,但仍处于起步阶段。尿液微生物组对各种因素(例如健康和疾病)以及更年期的状态会改变。在健康的雌性中,膀胱中发现的最丰富的细菌属包括乳酸杆菌,prevotella,链球菌和Gardnerella。