XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search Systemprevotella
牙科龋齿的青少年口腔菌群
目的：这项系统评价总结了青少年口腔菌群与龋齿之间关联的当前知识。设计：在五个数据库中进行了电子搜索。如果他们对一般健康的青少年，基于分子的微生物分析和评估的龋齿状态进行研究，则包括研究。数据提取是由两名审稿人进行的，纽卡斯尔 - 奥塔瓦量表用于质量评估。结果：总共审查了3935个记录，从而选择了20个横断面研究（2005 - 2022年出版），样本量范围为11至614名参与者，包括11到19年之间的青少年。研究分析了使用棋盘DNA-DNA杂交，（Q）PCR或下一代测序方法的唾液，牙齿生物膜或舌头拭子。prevotella denticola，scardoviae wiggsiae，sobrinus链球菌和链球菌突变是最常见的物种，在龋齿青少年中表现出较高的丰度。大多数研究报告说，有和没有牙科龋齿的参与者之间的微生物多样性相似。结论：这项系统的审查是第一个显示青少年口腔微生物群的组成如何在有和没有牙齿龋齿的人之间有所不同，这表明某些分类群可能与龋齿风险增加有关。但是，需要在更大的纵向研究中复制和扩展这些发现，这些发现也集中在龋齿的严重性上，并考虑到青少年特定的因素。
细菌CRISPR/CAS9系统作为所有健康问题的有希望的解决方案，并进步的生物工程
缩写：BP1，肿瘤抑制剂p53结合蛋白1； BRCA，乳腺癌抗原；汽车，嵌合抗原受体； CAS9，CRISPR相关蛋白9;级联，抗病毒防御的CRISPR综合体； CMR，CAS模块坡道（重复相关的神秘蛋白质）； CMR III-B，多个亚基III型B CRISPR RNA-CAS蛋白； CPF1，Prevotella和Francisella1的CRISPR； CRISPR，定期间隔间隔室； Crrna，Crispr RNA； CSM III-A，多支亚基III-A CRISPR-CAS蛋白； dcas9/ sgrna-sg I，停用cas9/短指南RNA-Sybrr-green i; DNA-PK，DNA-蛋白K; DNA-PKC，DNA蛋白K催化亚基； DSB，双链断裂； ege，额外的基因元素； GRNA，导向RNA； HDR，同源性维修； IAP，碱性磷酸酶同工酶； MRE 11，减数分裂重组11; NHEJ，非同理结局加入； PAM，原始间隔者相邻基序； PD，程序性细胞死亡； RAD，重组酶A；代表，重复的外部回文； RPA，复制蛋白A； RT，逆转录酶； Sgrna，简短的指南RNA； SSB，单链断裂； tracrrna，反式激活CRISPR RNA； XLF，类似XRCC4的因子； XRCC 4，X射线修复交叉补充蛋白4； Yoyo-1，（恶唑黄色）
在复发性植入失败患者中的子宫内膜微生物组的表征
摘要：异常子宫内膜微生物群与植入衰竭有关；因此，评估它可能很重要，以改善不育患者的生殖结果。我们研究的主要目的是比较患有抗植入术衰竭（RIF）患者的子宫内膜微生物组和接受辅助繁殖治疗（ART）的对照患者。一项前瞻性队列研究，包括45名具有自己或捐赠配子的患者。通过细菌16S rRNA基因的大规模测序分析子宫内膜微生物组。在RIF和对照患者中检测到不同的细菌群落。乳酸杆菌是最常见的属，RIF患者为92.27％，对照患者的97.96％脱颖而出，两组之间有显着差异（P = 0.002）。在α多样性指数方面没有发现显着差异。在β多样性分析中，在既定组之间的细菌群落分离中观察到了一个显着的趋势（p <0.07）。相对丰度分析鉴定出普雷特氏菌（p <0.001），链球菌（p <0.001），双杆菌（p = 0.002），乳杆菌（p = 0.002）和拨号（p = 0.003）。我们的结果表明，RIF患者的特征是存在近代菌群的特征，并表明子宫内膜微生物组和胚胎植入失败之间可能存在关系，这使我们有可能改善该患者的临床结果。
Vlachou，Stefania等。研究相互作用：牙周疾病和1型糖尿病 - 对临床研究的全面回顾。在
摘要：糖尿病（DM）对全球健康构成了重大挑战，其患病率预计到2045年会急剧上升。这篇叙述性综述探讨了牙周炎（PD）与1型糖尿病（T1DM）之间的双向关系，重点是源自口腔微生物群和宿主免疫反应之间相互作用的细胞和分子机制。进行了2008年至2023年之间发表的研究的全面搜索，以阐明这两种疾病之间的关联。临床前和临床证据表明双向关系，T1DM的个体表现出对牙周炎的敏感性增强，反之亦然。审查包括人类临床研究的最新发现，揭示了T1DM患者口服微生物群组成的变化，包括某些病原物种（例如卟啉念珠菌，prevotella insmedia和cotregatibactibacter contregatibacter contregatemycetemcetemitans）的增加，以及微生物多样性和丰度的转移。该关联所基于的分子机制在炎症细胞因子（如IL-6，IL-8和MMP）中介导的载体氧化应激和失调的宿主免疫反应。此外，诸如RANKL和OPG等骨转换标记的破坏会导致T1DM患者的牙周并发症。尽管治理T1DM患者牙周并发症的预防措施可能会改善整体健康状况，但需要进一步的研究来了解该人群中口腔微生物群，宿主反应，牙周疾病和全身健康之间的复杂相互作用。
接受的手稿
微生物群落，例如居住在人类肠道中的群落高度多样而复杂，许多人对健康和疾病具有重要意义。这些微生物群落的效果和功能不仅取决于其物种组成和多样性，而且还取决于转录水平的动态细胞内和细胞间状态。因此，完全需要能够获取单微粒分辨率的RNA测序信息，以便完全需要对复杂的微生物群落以及其宿主进行全面了解。在这里，我们报告了能够鉴定人类样品中的大物种品种的基于液滴的SmRNA-Seq（单微粒RNA测序）的发展和利用，我们将其命名为Smrandom-Seq2。与三个人类肠道样品中的Smrandom-seq2一起设计为细菌和噬菌体测序数据的三型调制计算管道，我们建立了人类肠道肠道微生物组的单细菌转录景观，其中包括29,742个单微生物和329个独特的物种。发现了Prevotella and Roseburia属中物种之间的不同自适应反应，以及在phascalcoltctcoltctobacterium accinatium succinatutens中的内在适应性策略异质性。此外，我们确定了人类肠道微生物组中数百种新型的宿主 - 含量转录活性关联。我们的结果表明Smrandom-Seq2是一种高通量和高分辨率的SMRNA-SEQ技术，在现实词的情况下非常适应复杂的微生物群落，并希望在理解人类微生物组中有新的观点。
在微生物组指导的食物中，生物活性糖
有证据表明，肠道微生物组的产后发育有助于儿童营养不良1-4。在这里，我们分析了来自微生物组指导的互补食品（MDCF-2）的随机对照试验的生物测量，该试验与在12-18个月大的班加拉德岛（12-18个月大的邦格拉德郡儿童中）相比，与热量更密集的常规辅助食品相比，其体重增加率较高。We reconstructed 1,000 bacterial genomes (metagenome-assembled genomes (MAGs)) from the faecal microbiomes of trial participants, identified 75 MAGs of which the abundances were positively associated with ponderal growth (change in weight-for-length Z score (WLZ)), characterized changes in MAG gene expression as a function of treatment type and WLZ response, and quantified carbohydrate MDCF-2和粪便中的结构。结果表明，与WLZ正相关的两个Prevotella copri mag是MDCF-2诱导的代谢途径表达的主要贡献者，该代谢途径涉及使用MDCF-2的成分聚糖。The predicted specificities of carbohydrate-active enzymes expressed by their polysaccharide- utilization loci are correlated with (1) the in vitro growth of Bangladeshi P. copri strains, possessing varying degrees of polysaccharide-utilization loci and genomic conservation with these MAGs, in defined medium containing different purified glycans representative of those in MDCF-2, and （2）试验参与者中粪便碳水化合物结构的水平。这些关联表明，通过与生长相关的细菌分类群代谢的MDCF中鉴定生物活性聚糖结构将有助于指导有关其在急性营养不良儿童中使用的建议，并能够开发出其他配方。
下一代益生菌
当前市场上目前可用的大多数益生菌细菌候选者包括属于不同类别的各种菌株。尽管如此，胃肠道微生物组是未定义的微生物剂的集合，可能会对人类产生一些医学益处。因此，目前，来自不同角落的研究人员集中于研究和识别胃肠道衍生的益生菌菌株，以提高下一代益生菌的发展。下一代益生菌术语是指通过删除，添加或修饰特定基因产生的遗传修饰的微生物，以产生益生菌菌株，从而调节代谢，胃肠道健康并直接递送到粘膜。由不同益生菌菌株产生的下一代益生菌旨在为宿主提供一种或多种健康益处，并有效控制和/或对多种疾病的治疗。即使某些下一代益生菌对几种慢性病的控制和治疗吉祥，但对人类的研究仍然是零星的，因此监管机构的确认很少。此外，需要通过向公众发布广泛的应用来解决一些问题。这篇评论强调了下一代益生菌的益生菌潜力，并讨论了现有和新兴的下一代益生菌的潜在益生菌。Probiotic strains such as Faecalibacterium prausnitzii, Prevotella copri, Bacteroides uniformis , Bacteroides thetaiotaomicron , Bacteroides acidifaciens , Clostridium butyricum , Christensenella minuta , Akkermansia muciniphila and Parabacteroides goldsteinii , have been postulated as next-generation益生菌候选者由于对结肠炎，肥胖，糖尿病和肝病等疾病的治疗或预防作用。
来自美洲印第安人的肠道微生物群的初步概况...
摘要Yanomami是亚马逊中最古老的土著部落之一，并且是12，000年前在南美殖民的第一批人的直接后代。他们位于委内瑞拉和巴西之间的边界，维恩塞兰的一侧仍然无与伦比。当他们维持一个狩猎者社会时，他们目前正在与巴西的城市化人口接触。由于饮食的西化以及引入抗生素和其他化学物质的人类肠道微生物群已成为最近研究的主题，这些化学物质影响了土著种群的微生物多样性，从而威胁了其存在。在这项研究中，我们初步描述了亚马逊的狩猎 - 采集者社会Yanomami肠道菌群的多样性，并与城市化人群接触。同样，我们将它们的多样性与马瑙斯的亚马逊人的人口进行了比较。在粪便样品上进行了16 s rRNA基因的元法编码方法。差异，尤其是关于属的丰度（例如Prevotella和bacteroides）和较高的firylyicutes的较高值，这仅在Yanomami中很重要。在Yanomami（treponema和succinivibrio）中仅发现了一些细菌。但是，它们之间的多样性在统计学上是平等的。总而言之，Yanomami肠道微生物群的组成仍然保持着具有传统生活方式的社区的特征。但是，我们的结果表明，与Manaus相比，Yanomami微生物群的潜在西化过程必须由当局仔细监测，因为多样性的丧失可能表明对Yanomami健康的危险越来越大。
B细胞恶性肿瘤的正向和反向遗传学
背景：绿叶蔬菜（GLV）含有无机硝酸盐，该阴离子对口服微生物组具有潜在的益生元作用。然而，尚不清楚GLV和药理学补充[硝酸钾（PN）是否具有硝酸盐盐会引起对口腔微生物组的类似作用。目标：本研究旨在将GLV与PN补充对高血压个体中口腔微生物组组成和唾液生物标志物的影响进行比较。方法：将70个人随机分配给3个不同的组，以进行5周的饮食干预。第1组以GLV的形式消耗300 mg/d的硝酸盐。第2组食用的药丸，含300 mg/d的PN和低硝酸盐蔬菜。第3组用氯化钾（安慰剂：PLAC）和低硝酸盐蔬菜食用的药丸。在饮食干预之前和之后分析了口腔微生物组组成和口腔健康的唾液生物标志物。结果：GLV和PN组显示出类似的微生物变化，可能依赖硝酸盐，包括奈瑟氏菌，cap虫，弯曲杆菌，弯曲杆菌的丰富度增加，以及治疗后Veillonella，Megasphaera，segasphaera，megasphaera，sectinoryces和eubacterium种类的降低。在GLV组中观察到了Rothia物种的丰度，链球菌，Prevotella，放线菌和摩菌细菌的丰度降低，这可能是硝酸盐独立的。GLV和PN处理增加了唾液pH值，但只有GLV治疗显示唾液缓冲能力和乳酸降低的增加。结论：与PN相比，GLV组中硝酸盐依赖性和独立的微生物变化的结合对改善口服健康生物标志物具有更强的作用。
重新定义肠心轴
心力衰竭 (HF) 增加了全球心血管健康的负担。最近有研究表明，心力衰竭患者的肠道微生物群具有独特的变化，这些变化会影响免疫稳态和代谢。在本次文献系统综述中，我们旨在确定肠道菌群失调对心力衰竭的影响。我们使用了系统评价和荟萃分析的首选报告项目 (PRISMA) 2020 指南进行系统评价。我们在 PubMed、PubMed Central (PMC)、Medline 和 ScienceDirect 等数据库上搜索了文献。纳入了十篇文章进行审查。心力衰竭患者的肠道微生物组组成存在显著差异。瘤胃球菌、大肠杆菌、志贺氏菌、链球菌属、韦荣球菌属和放线菌相对丰度较高，真细菌、普氏菌、粪杆菌、SMB53 和巨单胞菌相对减少。这种组成因年龄、心力衰竭分期和失代偿水平而异。但射血分数不变，其组成保持不变。负责氨基酸、碳水化合物、胆碱三甲胺裂解酶 (TMA-裂解酶)、脂多糖 (LPS) 生物合成、色氨酸和脂质代谢的基因表达增加。由此产生的变化影响了代谢物（如三甲胺 N-氧化物 (TMAO)、吲哚硫酸盐 (IS) 和 LPS）以及粪便和血浆中的炎症标志物的水平，从而导致心力衰竭。这些心力衰竭生物标志物可以作为预防和治疗心力衰竭的目标。心力衰竭患者拥有独特的肠道微生物群，这些微生物群会影响心力衰竭的发病机制。需要进一步研究来了解菌群失调与心力衰竭之间的因果关系。