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勘误：PSMB6在肺腺癌中的免疫调控及预后预测模型的建立及验证
赵海洋、罗可欣、刘梅寒、赵永胜、张红攀。除了现有的附属机构外，他们还应该有中国四川省南充市川北医学院附属医院。更正后的单位如下： 赵海洋 1,2,3,4,† ，罗可欣 1,2,3,4,† ，刘梅涵 1,2,4,5,† ，蔡元泽 2 ，刘思曼 2 ，李诗娟 6 ，赵永胜 1,2,3,*，张红攀 1,2,5,7,* 1.川北医学院附属医院，四川省南充市 2.川北医学院附属医院胸外科，四川省南充市 5.川北医学院附属医院肿瘤科，四川省南充市 6.南充市中心医院，四川省南充市 7.四川省治疗性蛋白质重点实验室，四川省南充市原文已更新。
揭开克罗恩病的面纱：抗聚糖抗体（ACCA、ALCA、AMCA）可提高诊断准确性，同时提供预后价值，尤其是对于 ASCA 血清阴性患者
抗聚糖抗体 (AGA) 包括 ACCA（抗壳聚糖苷）、ALCA（抗层状聚糖苷）和 AMCA（抗甘露二糖苷），是克罗恩病 (CD) 特异性抗体，靶向微生物（例如白色念珠菌和酿酒酵母）中的聚糖（多糖）。它们可能会改变对真菌菌群失调的免疫反应。与 gASCA（抗酿酒酵母）一起使用时，患者血清中 AGA 的存在可将 CD 与溃疡性结肠炎 (UC) 和非 IBD 区分开来，特异性约为 85%。此外，2 个或更多 AGA 同时呈阳性会增加 CD 特异性（>95%），并预测会更快进展为更严重的疾病，并伴有狭窄和瘘管。AGA 的诊断准确性已得到十几项独立的同行评审研究的验证，这些研究涉及 4,000 多名 IBD 患者。 1 AGA 在临床实践中的最新应用和实际表现尚未得到表征。
TfR1与H-铁蛋白纳米载体结合实现预后诊断并增强临床胃癌的治疗效果
摘要 H-铁蛋白 (HFn) 纳米载体正成为一种有前途的肿瘤诊断和治疗平台，它可以通过结合转铁蛋白受体 1 (TfR1) 特异性靶向肿瘤细胞。这促使我们研究 TfR1 在 GC 中的治疗功能。采用基于磁-HFn 纳米粒子的免疫组织化学方法评估了 178 个 GC 组织中 TfR1 的临床意义。在 TfR1 阳性 GC 患者来源的异种移植 (GC-PDX) 模型上评估了载阿霉素的 HFn 纳米载体 (HFn-Dox) 的治疗效果。通过体外和体内试验研究了 TfR1 的生物学功能。TfR1 在 GC 组织中上调 (73.03%)，并与患者结果呈负相关。 TfR1 阴性分选细胞表现出肿瘤起始特征，这增强了肿瘤形成和迁移/侵袭，而 TfR1 阳性分选细胞表现出显著的增殖能力。GC 细胞中 TfR1 的敲除也增强了细胞侵袭。当受到 IFN-γ 处理时，TfR1 缺陷细胞通过上调 PD-L1 、 CXCL9 和 CXCL10 表现出免疫逃逸。Western blot 结果表明，TfR1 敲除 GC 细胞上调了 Akt 和 STAT3 信号传导。此外，在 TfR1 阳性 GC-PDX 模型中，与游离 Dox 组相比，HFn-Dox 组显著抑制了肿瘤生长，并提高了小鼠的存活率。 TfR1 可能是 GC 的潜在预后和治疗生物标志物：(i) TfR1 与患者结果呈负相关，其阴性细胞具有肿瘤侵袭性特征；(ii) TfR1 阳性细胞可被 HFn 药物纳米载体杀死。鉴于 GC 的异质性，HFn 药物纳米载体与其他针对 TfR1 阴性细胞的疗法（如小分子或免疫疗法）相结合将成为 GC 治疗的新选择。
TfR1与H-铁蛋白纳米载体结合实现预后诊断并增强临床胃癌的治疗效果
摘要 H-铁蛋白 (HFn) 纳米载体正成为一种有前途的肿瘤诊断和治疗平台，它可以通过结合转铁蛋白受体 1 (TfR1) 特异性靶向肿瘤细胞。这促使我们研究 TfR1 在 GC 中的治疗功能。采用基于磁-HFn 纳米粒子的免疫组织化学方法评估了 178 个 GC 组织中 TfR1 的临床意义。在 TfR1 阳性 GC 患者来源的异种移植 (GC-PDX) 模型上评估了载阿霉素的 HFn 纳米载体 (HFn-Dox) 的治疗效果。通过体外和体内试验研究了 TfR1 的生物学功能。TfR1 在 GC 组织中上调 (73.03%)，并与患者结果呈负相关。 TfR1 阴性分选细胞表现出肿瘤起始特征，这增强了肿瘤形成和迁移/侵袭，而 TfR1 阳性分选细胞表现出显著的增殖能力。GC 细胞中 TfR1 的敲除也增强了细胞侵袭。当受到 IFN-γ 处理时，TfR1 缺陷细胞通过上调 PD-L1 、 CXCL9 和 CXCL10 表现出免疫逃逸。Western blot 结果表明，TfR1 敲除 GC 细胞上调了 Akt 和 STAT3 信号传导。此外，在 TfR1 阳性 GC-PDX 模型中，与游离 Dox 组相比，HFn-Dox 组显著抑制了肿瘤生长，并提高了小鼠的存活率。 TfR1 可能是 GC 的潜在预后和治疗生物标志物：(i) TfR1 与患者结果呈负相关，其阴性细胞具有肿瘤侵袭性特征；(ii) TfR1 阳性细胞可被 HFn 药物纳米载体杀死。鉴于 GC 的异质性，HFn 药物纳米载体与其他针对 TfR1 阴性细胞的疗法（如小分子或免疫疗法）相结合将成为 GC 治疗的新选择。
对大斋节的外部验证，并承诺对恶性胸腔积液的预后分数
该手稿最近被接受在ERJ公开研究中出版。它在我们的生产团队复制和排版之前以其公认的形式出版。完成这些生产过程并批准了由此产生的证据，该文章将转移到最新一期的Erjor Online。
C1ORF174在结直肠癌中的诊断和预后价值
摘要简介：结直肠癌（CRC）是致命的癌症之一，表明需要鉴定新的生物标志物以在早期阶段检测患者。RNA和microRNA测序，以鉴定差异表达的基因（DEG），然后在CRC患者中进行验证。方法：从631个样品中的全基因组RNA测序，包括398例患者和233例正常病例，从癌症基因组地图集（TCGA）中提取。使用deseq套件在R中鉴定了DEG。使用Kaplan -Meier分析评估生存分析以鉴定预后生物标志物。通过机器学习算法（例如深度学习，决策树和支持向量机）来确定预测性生物标志物。评估了生物学途径，蛋白质蛋白质相互作用（PPI），DEG的共表达以及DEG和临床数据之间的相关性。此外，使用Combioroc包装评估诊断标记。最后，CRC患者的实时PCR验证了候选TOPE评分基因。结果：生存分析揭示了五个新型的预后基因，包括KCNK13，C1ORF174，CLEC18A，SRRM5和GPR89A。39个上调，40个下调的基因和20个miRNA通过SVM检测到高精度和AUC。KRT20和FAM118A基因的上调以及LRAT和ProZ基因的下调在晚期阶段的系数最高。此外，我们的发现表明，三个miRNA（miR-19b-1，miR-326和miR-330）在晚期阶段上调。C1ORF174作为一种新基因。组合曲线分析表明，C1ORF174-AKAP4-DIRC1-SKIL-SCAN29A4的组合可以将其视为具有敏感性，特异性和AUC值0.90、0.94和0.92的诊断标记。结论：机器学习算法可用于识别与疾病发病机理有关的关键失调基因/miRNA，从而导致早期患者的检测。我们的数据还证明了C1ORF174在结直肠癌中的预后价值。
SNAI1 作为肺鳞状细胞癌预后预测和靶向治疗的生物标志物
结果：在正常人体组织中，与其他组织相比，SNAI1 在肺组织中明显高表达。然而，在 LUSC 中，其表达明显下调。SNAI1 mRNA 的高表达与较差的总生存期 (OS) 和无病生存期 (DFS) 相关。SNAI1 mRNA 的表达水平还与 LUSC 患者的年龄、肿瘤大小、淋巴结转移和远处转移有关。构建了列线图来预测 LUSC 患者的生存率。此外，LUSC 中 SNAI1 蛋白的高表达与预后不良有关。高表达组的 5 年生存率为 37%，低表达组的 59%。SNAI1 蛋白在 LUSC 组织细胞中的主要亚细胞定位是细胞核，但强蛋白表达也导致其定位在细胞质和膜中。基因集富集分析 (GSEA) 揭示了 LUSC 中 SNAI1 和 TP53 信号通路之间的相关性。SNAI1 可以与 TP53 相互作用，
原创文章 Dystrobrevin beta 是肝细胞癌的一个有希望的预后生物标志物和治疗靶点
摘要：目的：抗肌萎缩蛋白β（DTNB）是肌营养不良蛋白相关蛋白复合物（DPC）的组成部分。我们前期的RNA测序（RNA-seq）研究表明，敲低肝细胞癌（HCC）细胞中的致癌长链非编码RNA（ln cRNA）HOXD簇反义RNA 1（HOXD-AS1）可降低DTNB的表达水平。但DTNB与HCC之间的关联仍不明确。方法：采用定量实时PCR（qRT-PCR）验证HCC细胞系中DTNB的上调及HOXD-AS1对其表达的调控作用。通过生物信息学分析探讨DTNB在HCC中的潜在临床意义、生物学功能及其机制。验证DTNB在HCC组织中的高表达，并通过体外功能缺失试验研究其在HCC中的生物学功能。结果：DTNB 在肝癌细胞中高表达，并且在几种肝癌细胞系中受 lncRNA HOXD-AS1 的正向调控。DTNB 的上调与 T 分期、组织学分级、肿瘤状态、邻近肝组织炎症、甲胎蛋白 (AFP) 水平和不良预后显着相关，是与总体生存率相关的独立风险指标，对肝癌的诊断和预后具有重要意义。DTNB 还与免疫细胞浸润、免疫治疗和对抗肝癌药物的敏感性密切相关。鉴定出与 DTNB 在肝癌中共表达的基因，功能富集分析表明 DTNB 可能通过调节细胞周期在肝癌中发挥作用。预测并验证了肝癌中 HOXD-AS1/miR-139-3p/DTNB 的潜在 ceRNA（竞争性内源性 RNA）调控轴。 DTNB 的高表达在我们的 HCC 队列中得到验证，功能丧失试验表明，DTNB 敲低可抑制 HCC 细胞的增殖、迁移和侵袭，并引发细胞周期停滞在 G0/G1 期。结论：DTNB 是 lncRNA HOXD-AS1 的下游靶标，具有作为预后生物标志物和 HCC 治疗靶标的潜在用途。
评估接受自体移植的高风险经典霍奇金淋巴瘤患者的预后因素
1 Arthur G. James Cancer Hospital医学系血液学系和俄亥俄州俄亥俄州立大学的Richard J. Solove研究所，俄亥俄州哥伦布； 2犹他州盐湖城亨斯曼癌症研究所医学系血液学和血液学恶性肿瘤司； 3密苏里州圣路易斯华盛顿大学医学院现场癌症中心医学系； 4康涅狄格州纽黑文市耶鲁纽黑文的Smilow Cancer医院医学系； 5威斯康星州密尔沃基医学院医学院； 6佛罗里达州杰克逊维尔的梅奥诊所医学系； 7医学系，宾夕法尼亚州费城福克斯大通癌中心； 8宾夕法尼亚州宾夕法尼亚大学艾布拉姆森癌症中心医学系； 9医学院，俄亥俄州克利夫兰凯斯西部保护区； 10医学院，俄亥俄州克利夫兰克利夫兰诊所； 11田纳西州纳什维尔范德比尔特大学医学中心医学系； 12医学系，伊利诺伊州芝加哥西北大学罗伯特·H·卢里癌症中心； 13佛罗里达州卢茨市H. Lee Moft癌症中心H. Lee Moft癌症中心； 14纽约州布法罗市罗斯威尔公园综合癌症中心医学系； 15新罕布什尔州黎巴嫩达特茅斯 - 希区柯克医学中心医学系； 16佐治亚州亚特兰大埃默里大学Winship Cancer Institute医学系； 17肯塔基州列克星敦市肯塔基大学医学系； 18霍普市国家医疗中心医学系，加利福尼亚州杜阿尔特； 19号医学系和阿拉巴马大学伯明翰伯明翰伯明翰的阿拉巴马大学儿科系和20个儿科系1 Arthur G. James Cancer Hospital医学系血液学系和俄亥俄州俄亥俄州立大学的Richard J. Solove研究所，俄亥俄州哥伦布； 2犹他州盐湖城亨斯曼癌症研究所医学系血液学和血液学恶性肿瘤司； 3密苏里州圣路易斯华盛顿大学医学院现场癌症中心医学系； 4康涅狄格州纽黑文市耶鲁纽黑文的Smilow Cancer医院医学系； 5威斯康星州密尔沃基医学院医学院； 6佛罗里达州杰克逊维尔的梅奥诊所医学系； 7医学系，宾夕法尼亚州费城福克斯大通癌中心； 8宾夕法尼亚州宾夕法尼亚大学艾布拉姆森癌症中心医学系； 9医学院，俄亥俄州克利夫兰凯斯西部保护区； 10医学院，俄亥俄州克利夫兰克利夫兰诊所； 11田纳西州纳什维尔范德比尔特大学医学中心医学系； 12医学系，伊利诺伊州芝加哥西北大学罗伯特·H·卢里癌症中心； 13佛罗里达州卢茨市H. Lee Moft癌症中心H. Lee Moft癌症中心； 14纽约州布法罗市罗斯威尔公园综合癌症中心医学系； 15新罕布什尔州黎巴嫩达特茅斯 - 希区柯克医学中心医学系； 16佐治亚州亚特兰大埃默里大学Winship Cancer Institute医学系； 17肯塔基州列克星敦市肯塔基大学医学系； 18霍普市国家医疗中心医学系，加利福尼亚州杜阿尔特； 19号医学系和阿拉巴马大学伯明翰伯明翰伯明翰的阿拉巴马大学儿科系和20个儿科系
PD-L1 表达的流行率和预后价值...
目的：评估未接受免疫疗法治疗的晚期宫颈癌患者中程序性死亡配体 1 (PD-L1) 表达和肿瘤突变负荷 (TMB) 的患病率和预后作用。方法：回顾性收集韩国峨山医疗中心 2008 年 1 月 1 日至 2016 年 12 月 31 日的医疗记录中的临床资料；对存档的肿瘤样本进行 PD-L1 表达 (综合阳性评分 [CPS] ≥1) 和 TMB (≥175 个突变/外显子组) 评估。总生存期 (OS) 定义为从晚期诊断或开始一线或二线全身治疗到死亡/最后一次随访的时间。使用对数秩检验和调整协变量的 Cox 比例风险模型分析 OS 与 PD-L1 表达和 TMB 的关联。结果：267 例患者中，76.0% 为鳞状细胞癌 (SCC)，24.0% 为腺癌 (AC)/腺鳞癌 (ASC)，64.4% 为 PD-L1 CPS ≥1，32.6% 为 TMB ≥175 突变/外显子组。PD-L1 CPS ≥1 和 TMB ≥175 突变/外显子组在 SCC 中比在 AC/ASC 中更普遍（73.9% 和 37.2% vs. 34.4% 和 17.7%）。OS 与 PD-L1 表达之间无相关性（CPS ≥1 vs. <1：从晚期诊断开始的调整风险比 [HR]=1.14；95% 置信区间 [CI]=0.84–1.53）； TMB ≥175 突变/外显子组亚组的 OS 趋势比 <175 突变/外显子组亚组的 OS 趋势更短（调整后的 HR=1.29；95% CI=0.95–1.75）。结论：对未接受免疫疗法治疗的晚期宫颈癌患者的回顾性分析表明，SCC 中 PD-L1 CPS ≥1 和 TMB ≥175 突变/外显子组的患病率高于 AC/ASC。PD-L1 CPS ≥1 与 OS 无关；TMB ≥175 突变/外显子组显示出 OS 更短的趋势。需要进一步研究来证实这些发现。