SCOV-2的类似木瓜蛋白酶样蛋白酶(PLPRO)是病毒复制的必不可少的蛋白质,也是开发小分子药物的有吸引力的靶标。11 - 14 PLPRO在病毒复制15 - 17中起着至关重要的作用,并防止受感染的细胞产生干扰素,这对于安装针对SCOV-2的免疫反应至关重要。12,18,19 PLPRO裂解肽序列LXGG(X表示任何氨基酸),该氨基酸存在于未成熟SCOV-2病毒多蛋白的3个位点中。PLPRO催化了未成熟病毒多蛋白的三种非结构蛋白的释放,称为NSP1,NSP2和NSP3。12 NSP1,NSP2和NSP3在病毒复制中起关键作用,并抑制PLPRO块SCOV-2在细胞中的复制。20 PLPRO还切开包含序列RLGG的宿主蛋白,该蛋白存在于几种泛素(Ub)和泛素样蛋白(UBL)中,例如干扰素诱导的基因15(ISG15)蛋白。21 PLPRO具有显着的去渗透和去泛素化活性和PLPRO抑制可诱导病毒感染细胞产生干扰素,这应该导致对病毒的免疫反应增强。因此,从SCOV-2中对PLPRO的开发抑制剂非常感兴趣。14,20
1 联合实验室 i4HB—健康与生物经济研究所,新里斯本大学新科学技术学院,2819-516 Caparica,葡萄牙 2 UCIBIO—应用分子生物科学部,化学系,新里斯本大学新科学技术学院,2819-516 Caparica,葡萄牙 3 环境科学研究所,HKC-202 室,博阿齐奇大学,贝贝克,伊斯坦布尔 34342,土耳其; enginbayram@reotek.com.tr(EB); berat.haznedaroglu@boun.edu.tr (BZH) 4 萨拉热窝大学理学院生物系,萨拉热窝 71000,波斯尼亚和黑塞哥维那; llbilela@pmf.unsa.ba 5 天然产品和农业生物学研究所—CSIC,38206拉古纳,西班牙; mcueto@ipna.csic.es (MC) 6 拉拉古纳大学生物有机物研究所(IUBO),38206 拉拉古纳,西班牙 7 CICA- 化学与生物学跨学科中心,拉科鲁尼亚大学科学学院化学系,15071 拉科鲁尼亚,西班牙; carlos.jimenez@udc.es 8 希腊海洋研究中心海洋生物、生物技术和水产养殖研究所,HCMR Thalassocosmos,71500 Gournes,克里特岛,希腊; mandalakis@hcmr.gr 9 LAQV,REQUIMTE,里斯本新大学新科学技术学院化学系,2819-516 Caparica,葡萄牙; florbela.pereira@fct.unl.pt 10 MEDINA 基金会,Avda. Knowledge 34, 18016 阿米拉,西班牙; fernando.reyes@medinaandalucia.es 11 GEOMAR 海洋生物技术中心(GEOMAR-Biotech),海洋天然产物化学研究单位,GEOMAR 亥姆霍兹基尔海洋研究中心,Am Kiel-Kanal 44, 24106 基尔,德国; dtasdemir@geomar.de 12 基尔大学数学与自然科学学院,Christian-Albrechts-Platz 4, 24118 基尔,德国 * 通讯地址:s.gaudencio@fct.unl.pt;电话:+351-212948300;传真:+351-212948550
1中国医学科学院牛津研究所,牛津大学,牛津大学,牛津大学,牛津大学,英国2号,纳菲尔德医学系,牛津大学牛津大学,牛津大学,牛津大学,英国3英国感染与免疫学和免疫与移植研究所,UCL,UCL,伦敦,伦敦,金dom,Kingdom,4个皇后和分子医学学院,英国皇后科学院。 London, United Kingdom, 6 Departments of Molecular Medicine and Neuroscience, The Scripps Research Institute, San Diego, California, United States of America, 7 Skaggs Graduate School of Chemical and Biological Sciences, The Scripps Research Institute, San Diego, California, United States of America, 8 The Pirbright Institute, Woking, United Kingdom, 9 Department of Virology II, National Institute of Infectious Diseases, Tokyo, Japan, 10东京科学大学应用生物学系,日本诺达,11个研究中心,日本东京国立传染病研究所,日本东京,12个呼吸医学部和牛津卫生研究所,牛津生物医学研究中心,诺夫菲尔德医学院,牛津大学,牛津大学,牛津大学,牛津大学,美国联合王国,美国牛津大学。
1中国医学科学院牛津研究所,牛津大学,牛津大学,牛津大学,牛津大学,英国2号,纳菲尔德医学系,牛津大学牛津大学,牛津大学,牛津大学,英国3英国感染与免疫学和免疫与移植研究所,UCL,UCL,伦敦,伦敦,金dom,Kingdom,4个皇后和分子医学学院,英国皇后科学院。 London, United Kingdom, 6 Departments of Molecular Medicine and Neuroscience, The Scripps Research Institute, San Diego, California, United States of America, 7 Skaggs Graduate School of Chemical and Biological Sciences, The Scripps Research Institute, San Diego, California, United States of America, 8 The Pirbright Institute, Woking, United Kingdom, 9 Department of Virology II, National Institute of Infectious Diseases, Tokyo, Japan, 10东京科学大学应用生物学系,日本诺达,11个研究中心,日本东京国立传染病研究所,日本东京,12个呼吸医学部和牛津卫生研究所,牛津生物医学研究中心,诺夫菲尔德医学院,牛津大学,牛津大学,牛津大学,牛津大学,美国联合王国,美国牛津大学。
探测DNA复制动力学的主要方法是DNA纤维分析,该分析利用胸苷类似物掺入新生的DNA中,然后将DNA纤维的免疫荧光显微镜检查。除了耗时且容易出现实验者偏见外,它不适用于研究线粒体或细菌中的DNA复制动力学,也不适合进行高通量分析。在这里,我们介绍了质谱 - 基于新生DNA(MS波段)的分析,作为DNA纤维分析的快速,无偏,定量的替代方案。在这种方法中,使用三重四极尖串联质谱法对胸苷类似物的结合进行定量。MS波段准确地检测到人类细胞的细胞核和线粒体以及细菌的DNA复制改变。在大肠杆菌DNA损伤诱导基因库中捕获的MS-BAND捕获的复制改变的高通量能力。因此,MS波段可以作为DNA纤维技术的替代方案,并具有对不同模型系统中复制动力学的高通量分析的潜力。
此预印本的版权持有人(该版本发布于2023年4月19日。; https://doi.org/10.1101/2023.04.18.537310 doi:Biorxiv Preprint
本综述总结了2023年初COVID-19的状况。首先,提到了COVID-19是如何出现的、如何传播的、应采取的预防措施和预防策略,并给出了当前的病例。给出了SARS-CoV-2的变体,并提到Omicron变体,尤其是其亚变体XBB 1.5是最具传染性的形式。详细介绍了SARS-CoV-2的结构和复制机制。比较了用于检测SARS-CoV-2的测试的程序、准确率、成本、样本来源、检测区域和结果时间。解释了疫苗的一般机制,包括基于蛋白质的疫苗、病毒载体疫苗、全病毒疫苗和核酸疫苗。回顾了针对SARS-CoV-2变体的COVID-19疫苗的安全性、有效性和有效性,并列出了已批准的COVID-19疫苗。已评估了用于 COVID-19 患者的各种免疫调节剂和抗病毒分子。病毒聚合酶、主要蛋白酶 (M pro ) 和木瓜蛋白酶样蛋白酶 (PL pro ) 已被讨论为治疗靶点。已详细介绍了用于 COVID-19 治疗的耐药性和恢复期血浆和单克隆抗体 (mAb)。
不是疫苗针对的,很可能会在抗疫苗的菌株上活跃。尽管有很大的作用,雷姆斯维尔,mol-nupiravir和paxlovid,它由Nir-Matrelvir和Ritonavir的共同严重组成,但仍然是唯一批准用于治疗SARS-COV-2的FDA小分子药物,并且只有Marginal Clinical Implatike。1,2因此,尽管有显着性,但仍然需要开发可以有效治疗SARS-COV-2的药物。SARS-COV-2的类似木瓜蛋白酶样蛋白酶(PLPRO)是开发小分子药物的有吸引力的靶标。PLPRO在病毒复制中起着至关重要的作用,其抑制作用可防止细胞中的病毒复制。3 - 7此外,PLPRO抑制了干扰素的产生,这对于安装针对SARS-COV-2的免疫反应至关重要。PLPRO裂解肽序列LXGG,它存在于未成熟的SARS-COV-2病毒多蛋白中的3个位点中。PLPRO催化从未成熟病毒多蛋白中释放出三种非结构性蛋白,称为NSP1,NSP2和NSP3。NSP1,NSP2和NSP3在病毒复制中起关键作用,PLPRO抑制细胞中SARS-COV-2复制。3,5,8 PLPRO还切割包含序列RLGGG的宿主蛋白,该蛋白存在于几种泛素(UB)和泛素样蛋白(UBL)中,例如干扰素诱导的基因15(ISG15)蛋白。PLPRO具有显着的de液化和去泛素化活性和PLPRO的抑制可诱导病毒感染细胞的产生,这应该导致
双子座科的家族由500多个可以感染众多双核和单子植物的圆形单链(SS)DNA病毒物种组成。双子病毒利用宿主的DNA复制机制,在植物细胞的核中复制其基因组。将其DNA转化为双链DNA,随后复制,这些病毒依赖于宿主DNA聚合酶。但是,此过程的第一步的启动,即传入的圆形ssDNA转化为dsDNA分子,已经难以捉摸近30年。In this study, sequencing of melon ( Cucumis melo ) accession K18 carrying the Tomato leaf curl New Delhi virus (ToLCNDV) recessive resistance quantitative trait locus (QTL) in chromosome 11, and analyses of DNA sequence data from 100 melon genomes, showed a conservation of a shared mutation in the DNA Primase Large subunit ( PRiL ) of all accessions that对TolCNDV的挑战表现出抵抗力。沉默(天然)烟熏本尼亚人pril以及随后对三种不同的双子病毒的挑战表明,所有三种病毒的滴度都严重减少,完全强调了pril在双子病毒复制中的重要作用。呈现了一个模型,以解释Pril在GESINIVIRAL DNA复制启动中的作用,即 作为原始酶的调节亚基,在DNA复制开始时类似于DNA Primase - 在所有生物体中介导的DNA复制起始。呈现了一个模型,以解释Pril在GESINIVIRAL DNA复制启动中的作用,即作为原始酶的调节亚基,在DNA复制开始时类似于DNA Primase - 在所有生物体中介导的DNA复制起始。
真核基因组是由数千个复制起源重复的,这些复制起源是依次形成了复制簇的定义时空模式。DNA反应的时间顺序是通过染色质结构来确定的,并且更具体地通过RIF1稳定的染色质接触来确定。在这里,我们表明RIF1位于新合成的DNA附近。暴露于DNA复制抑制剂蚜虫蛋白的细胞中,RIF1的抗压显着降低了蛋白质在阳性DNA上分离的有效性,这表明蛋白质对蛋白质在新生DNA过程中的分离是由染色质拓扑降低的。RIF1来限制蚜虫治疗诱导的DNA病变的积累,并促进新生DNA附近的粘着素的募集。共同表明,通过RIF1对染色质拓扑的稳定限制了复制 - 相关的基因组不稳定性。