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从印度洋中脊北部深海沉积物中分离出的革兰氏阳性发酵细菌对钒酸盐的还原作用
钒的氧化状态决定了它的迁移率和毒性，已有报道称多种微生物存在异化钒酸盐还原反应，突出了该途径在钒污染修复和生物地球化学循环中的潜在意义。然而，到目前为止，已知的大多数能够还原钒酸盐的微生物都是属于变形菌门的革兰氏阴性呼吸道细菌。在本研究中，我们从北部中印度洋脊的深海沉积物中分离出一株嗜热杆菌 VROV1 菌株，并研究了其还原钒的能力以及钒酸盐对其细胞代谢的影响。一系列培养实验表明，分离的菌株在发酵过程中能有效地将 V(V) 还原为 V(IV)，即使在 mM 水平上也是如此，而且这种还原涉及直接的生物过程，而不是通过代谢产物的间接还原。钒影响微生物的碳和氮代谢。值得注意的是，在钒酸盐存在的情况下，丙氨酸产量会减少，这表明代谢通量从转氨反应转向钒酸盐还原。T. mesophilus VROV1 是继 Lactococcus raffinolactis 之后第二种被鉴定为能还原钒的革兰氏阳性细菌，但这些细菌属于不同的类别：T. mesophilus 被归类为梭菌，而 L. raffinolactis 被归类为芽孢杆菌。VROV1 去除钒酸盐的特定速率高达 2.8 pmol/细胞/天，与金属还原细菌相当，明显超过 L. raffinolactis。我们的研究结果扩大了细菌领域内钒酸盐还原生物的分布。鉴于 T .嗜温杆菌及其近亲，我们推测发酵钒酸还原对钒的全球生物地球化学循环的影响可能比以前认为的更大。
倾析罐沉积物中存在药物目标残留物：这是评估其历史排泄情况的一个很好的线索吗？
本研究调查了下水道系统中积累的沉积物通过药物靶标残留物 (DTR) 的出现记录人类活动的可能性。研究的装置是一个 17 米深的地下倾析池，用于收集单一下水道系统（法国奥尔良北部）的粗馏分，收集雨水和废水。沉积在该池中的沉积物可能为研究流域内非法和合法药物消费的历史演变提供绝佳机会，然而，目前沉积过程和 DTR 的记录仍然很大程度上未知。2015 年至 2017 年采集了五个岩心。使用超纯水：甲醇 (1:1) 混合物提取了 152 个沉积物样本，然后通过高压液相色谱串联质谱法对提取物进行分析。还对这些样品进行了几项经典的沉积学分析，例如总有机碳、相描述和粒度分析，以了解影响其沉积的最重要因素（例如 DTR 的物理化学性质、固体类型、废水中的假定负荷）。有机层中中性和阴离子 DTR 的含量较高，而矿物层中仅发现阳离子 DTR，这突显了 DTR 形态的关键作用。因此，在根据倾析槽沉积物中的 DTR 浓度反推药物消费的历史模式时，必须考虑由不同来源（即雨水或废水）引起的沉积物性质的显著变化这一最重要的驱动因素。需要进一步研究以充分了解沉积过程，但这项研究为解释这些时间演变提供了新的线索。
对表面沉积物中微生物群落的宏基因组学和培养基分析，以及原始河中抗生素抗性基因的流行：
摘要：居住在河流地区沉积环境中的微生物群落是原始河流生态系统的关键指标。虽然已经建立了抗生素抗性与致病性与核心肠道细菌之间的相关性，但存在着一个很大的知识差距，即抗生素抗性基因（ARGS）与人类病原细菌（HPB）与河流中的特定微生物的相互作用，通常引用了“ terrestrial terestrial gut”。在自然栖息地内，了解微生物组成，包括细菌和居民遗传因素，例如ARGS，HPB，移动遗传因素（MGE）和毒力因子（VFS）（VFS），在全球变化的背景下是必须的。为了解决这一差距，在本研究中进行了一种基于富集的培养基互补培养物和宏基因组学，以表征微生物生物库，并提供初步的生态见解，以介绍兰坎河源流域中ARG的传播。根据我们的发现，在兰开河源盆地的主流中，有674种细菌菌株在厌氧条件下包括540个菌株，在有氧条件下有124个菌株，已成功地分离出来。其中，有98种被确定为已知物种，而4种是潜在的新物种。在这98种中，有30种与人类健康有关的HPB。此外，Baca和Bacitracin分别作为该河中最丰富的ARG和抗生素出现。此外，对ARGS的风险评估主要表明危害人类健康的风险等级（等级IV）。总而言之，基于富集的培养基学被证明可有效分离稀有和未知细菌，尤其是在厌氧条件下。ARG的出现显示与MGE的相关性有限，表明对兰开河源源盆地主流内人类健康的威胁很小。
在存在由stenotrophomonas sp。介导的铬的存在下聚丙烯的生物降解。和Lysinibacillus sp。从湿地沉积物中孤立
通过引入损害环境整体功能的组成部分，工业化和全球化的进步一直在恶化性质。塑料和重金属被广泛融合到我们的日常生活中，生产和消费都会产生最终处置的废物，这些废物无法充分管理。在目前的工作中，研究了从湿地沉积物中分离出的天然微生物介导的两种生物修复机制。已经报道了在这些地点的两种污染物的存在。根据细菌根据其形态和代谢特征分组。选择用于进一步测试的细菌的决定性标准是生物膜形成。据报道，这种能力是塑料生物降解的第一步。评估了表现出较高生物膜形成的最佳5种细菌的生物降解能力，并且在单独的系统中，它们在不同的铬浓度下生长并将重金属生长到无害形式的能力。选择了三种表现最好的细菌来评估其在包含两种污染物的批处理系统中的生长。聚丙烯是在既定条件下生物降解的，结果表明，两种造成这种降解的细菌属于骨pen虫属，而第三个细菌属于溶质性。这些属据报道为聚丙烯生物降解剂，但不存在其他污染物。这项工作中提出的结果可能是新研究的起点，该研究将使未来在生物修复过程中污染环境中使用本地微生物。
细菌群落结构中的精细尺度一致性，来自iLlumina上的短读和纳米孔上的长阅读的海洋沉积物
在开发高通量测序仪后，环境原核生物群落通常是通过在16S域上用遗传标记来描述的。然而，由于底漆的选择和读取长度，简短读取测序遇到了系统发育覆盖率和分类分辨率的局限性。在这些关键点上，纳米孔测序（一种适用于长读的元编码的上升技术）被低估了，因为其每读的错误率相对较高。在这里，我们比较了模拟社区中的原核生物群落结构和两个对比的红树林遗址的52个沉积物样本，由16SV4-V5标记上的短读描述（Ca。0.4kpb）通过Illumina测序分析（Miseq，v3），由长读细菌对细菌的描述几乎完整16s（Ca。1.5 kpb）由牛津纳米孔（Minion，R9.2）分析。短读和长阅读从模拟中检索了所有细菌属，尽管两者都显示出与所期待的比例相似的偏差。从沉积物样品中，具有覆盖范围的读数稀有性，在单例过滤后，共同恩赐和Procrustean测试表明，从短读和长长读取的细菌社区结构显着相似，表明位点之间的相当对比度和站点内相干的海岸方向是可比的。在我们的数据集中，分别将84.7和98.8％的短阅读分别分别分配给了相同的物种和属，而不是长阅读所检测到的物种和属。长期16的底漆特异性使其能够检测到309个家庭中的92.2％，而在短16SV4-V5检测到的448属中，有87.7％。长阅读记录了973个未检测到的额外分类单元，其中91.7％被确定为该属等级，其中一些属于11个独家门，尽管仅占长期读数的0.2％。
有机碳和养分在硫化沉积物上发展的酸性土壤中的储存和分布：反应性铁和大孔的作用
摘要：在过去70年中，在硫酸盐和有机富的沉积物上发育于硫酸盐富含硫酸盐的富含硫酸盐的地下（pH 3-4）中，在大孔孔上形成了广泛的褐色至黄色层。我们的数据表明，这些层（“大孔表面”）在1 M HCl提取的反应性铁（2-7％的干重）中强烈富集，很大程度上与Schwertmannite和2-线二氢岩结合。这些反应性铁相捕获了大的不稳定有机物（OM）和可提取的磷，可能是源自培养层的。在土壤聚集体中，OM的性质与大孔表面的性质不同，但与基础硫的沉积物（C-Horizon）相似。这提供了证据表明，散装地下土壤中的沉积物OM在很大程度上保存而没有明显的分解和/或分馏，这可能是由于反应性铁相的生理化学稳定而导致的，而反应性铁相也存在于聚集体内。These findings not only highlight the important yet underappreciated roles of iron oxyhydroxysulfates in OM/ nutrient storage and distribution in acidic sulfate-rich and other similar environments but also suggest that boreal acidic sulfate-rich subsoils and other similar soil systems (existing widely on coastal plains worldwide and being increasingly formed in thawing permafrost) may act as global sinks for OM and nutrients in the短期。关键字：酸性硫酸盐土壤，大孔，反应性铁，硫化物氧化，有机碳储存，养分■简介
有机碳和养分在硫化沉积物上发展的酸性土壤中的储存和分布：反应性铁和大孔的作用
摘要：在过去70年中，在硫酸盐和有机富的沉积物上发育于硫酸盐富含硫酸盐的富含硫酸盐的地下（pH 3-4）中，在大孔孔上形成了广泛的褐色至黄色层。我们的数据表明，这些层（“大孔表面”）在1 M HCl提取的反应性铁（2-7％的干重）中强烈富集，很大程度上与Schwertmannite和2-线二氢岩结合。这些反应性铁相捕获了大的不稳定有机物（OM）和可提取的磷，可能是源自培养层的。在土壤聚集体中，OM的性质与大孔表面的性质不同，但与基础硫的沉积物（C-Horizon）相似。这提供了证据表明，散装地下土壤中的沉积物OM在很大程度上保存而没有明显的分解和/或分馏，这可能是由于反应性铁相的生理化学稳定而导致的，而反应性铁相也存在于聚集体内。These findings not only highlight the important yet underappreciated roles of iron oxyhydroxysulfates in OM/ nutrient storage and distribution in acidic sulfate-rich and other similar environments but also suggest that boreal acidic sulfate-rich subsoils and other similar soil systems (existing widely on coastal plains worldwide and being increasingly formed in thawing permafrost) may act as global sinks for OM and nutrients in the短期。关键字：酸性硫酸盐土壤，大孔，反应性铁，硫化物氧化，有机碳储存，养分■简介
粪便脂质标记与古代沉积物 DNA 相结合，可作为从土壤和沉积物中追踪过去畜牧业的工具
当考古材料缺失时，重建过去的环境可能具有挑战性。研究有机分子是克服这一缺点的一种方法，这些分子在环境中以痕迹的形式存在了数千年。粪便脂质标记物（类固醇和胆汁酸）和古代沉积物 DNA 提供了一种互补和交叉验证的分析工具，可以拓宽环境考古学中使用的方法范围。然而，人们对结合这两种方法的好处知之甚少。我们简要概述了目前对粪便脂质标记物和古代沉积物 DNA 的了解状况。我们确定了科学和方法上的差距，并提出了它们对更好地理解过去动态的人与动物关系的潜在相关性。通过这篇评论，我们旨在促进新的研究途径，既在既定学科中，也结合迄今为止很少结合的分析方法。
7541测试单
BM019 using Non-dispersive Infra-Red Spectroscopy and Chemiluminescence Isotopic Tests Documented In-House Methods Isotopes: Sr AM005 using Thermal Ionisation Mass Spectrometry (TIMS) Chemical Tests FLEXIBLE SCOPE ENCOMPASSING: ROCKS / GEOLOGICAL MATERIALS, SEDIMENTS, SOILS, ANIMAL TISSUE, LEACHATES, WATERS, CHEMICAL PRODUCTS (Liquids, Solids, Organic,无机喂食，植物材料，作物
地貌学和挑战的定量革命以及
分数下地区的沉积区几乎占据了尼日利亚土地区域的一半，在该地区，沉积盆地形成部分（板I和V）。盆地包括：贝努埃盆地（Benue Basin）分为三（3）上下贝努埃（Benue），阿达伐（Adamawa）（或冈戈拉）盆地，尤拉盆地（Yola Basin），东部有阿南布拉盆地，贝达盆地，西北部有索科托盆地和尼日尔·德尔塔基金。西北部的索科托盆地和东北的远乍得盆地是Iulemeden和Taodeni盆地的一部分，它们在尼日利亚以外，历史可以追溯到古生代（Whiteman，1982）。The oldest sedimentary rocks dated at the surface in Nigeria (excluding the basement complexes) are early Cretaceous (Albian) in age and the youngest sediments are the present day Niger-Delta complex deposits which are being laid down at the present by the Benue and Niger distributaries in the coastal areas of south Nigeria (Okonkwo, 1995) Sedimentary rocks and sediments are found in six major basins which占地约462,000平方公里（或约191,000英里），几乎是地下室占据或覆盖的面积的50％。