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rnagen：一种基于生成对抗网络的模型，可生成靶蛋白的合成RNA序列
摘要。RNA-蛋白结合在调节蛋白质活性中通过影响定位和稳定性起着重要作用。 虽然蛋白质通常是通过小分子或其他蛋白质靶向的，但易于设计和合成小的RNA是一个相当尚未开发和有希望的场所。 问题是缺乏产生与某些蛋白质可能结合的RNA分子的方法。 在此，我们提出了一种基于生成对抗网络（GAN）的方法，该方法学会生成具有天然RNA样性能（例如二级结构和自由能）的短RNA序列。 使用优化技术，我们对这些序列进行微调以使它们与靶蛋白结合。 我们使用文献中的RNA-蛋白结合预测模型来指导模型。 我们表明，即使没有针对靶蛋白的专门训练的可用指南模型，我们也可以使用针对相似蛋白质的模型，例如来自同一家族的蛋白质，可以成功地生成与靶蛋白的结合RNA分子。 使用这种方法，我们使用了针对其相对的模型（SOX10，SOX14和SOX8）量身定制的PIRNA，并量身定制为SOX2蛋白结合，并在体外实验验证了我们生成的Top-2分子我们生成的Top-2分子特异性结合了SOX2。RNA-蛋白结合在调节蛋白质活性中通过影响定位和稳定性起着重要作用。虽然蛋白质通常是通过小分子或其他蛋白质靶向的，但易于设计和合成小的RNA是一个相当尚未开发和有希望的场所。问题是缺乏产生与某些蛋白质可能结合的RNA分子的方法。在此，我们提出了一种基于生成对抗网络（GAN）的方法，该方法学会生成具有天然RNA样性能（例如二级结构和自由能）的短RNA序列。使用优化技术，我们对这些序列进行微调以使它们与靶蛋白结合。我们使用文献中的RNA-蛋白结合预测模型来指导模型。我们表明，即使没有针对靶蛋白的专门训练的可用指南模型，我们也可以使用针对相似蛋白质的模型，例如来自同一家族的蛋白质，可以成功地生成与靶蛋白的结合RNA分子。使用这种方法，我们使用了针对其相对的模型（SOX10，SOX14和SOX8）量身定制的PIRNA，并量身定制为SOX2蛋白结合，并在体外实验验证了我们生成的Top-2分子我们生成的Top-2分子特异性结合了SOX2。
揭示神经元分化过程中 RNA 异构体变化的动态和后果
静态基因表达程序已在干细胞和成熟人类细胞中得到广泛表征。然而，在细胞分化过程中，RNA 异构体随细胞状态转变而变化的动态、决定因素和功能后果在很大程度上仍不清楚。在这里，我们建立了一个改进的体外人类神经发生模型，该模型适用于全系统的基因表达分析。我们的多组学分析表明，细胞形态的显著改变与 RNA 异构体表达的广泛变化密切相关。我们的方法确定了在不同分化阶段表达的数千种新的 RNA 异构体。RNA 异构体主要来自外显子跳跃和人类神经发生过程中转录起始和多聚腺苷酸化位点的替代使用。转录异构体的变化可以重塑蛋白质异构体的身份和功能。最后，我们的研究确定了一组 RNA 结合蛋白是分化阶段特异性整体异构体变化的潜在决定因素。这项工作支持了神经发生过程中状态转变背后的受调控异构体变化的观点。
情绪障碍和啮齿动物压力模型中的星形胶质细胞功能障碍：行为的后果和潜在的治疗目标
摘要：在患有抑郁症和其他精神疾病的患者中一直观察到星形胶质细胞功能障碍。尽管多年来，我们对这些变化的理解，它们的起源以及它们对行为和神经元功能的后果已经加深，但星形胶质功能障碍在主要抑郁症（MDD）和创伤后应激障碍（PTSD）中的作用的许多方面仍然不明。在这篇综述中，我们总结了与MDD和PTSD相关的已知星形胶质功能障碍，突出了慢性压力对特定星形胶质功能的影响，以及星形胶质细胞功能障碍与抑郁症和焦虑行为的表达如何，集中在表达抑郁症和焦虑的行为上，集中在行为上的行为上的行为对情感的恐惧进行了恐惧。我们还瞥见了潜在的星形胶质功能，可以针对潜在的抗抑郁药治疗。
DNA中DGPDC和DCPDG序列的光活化动力学：全面的量子机械研究
通过DNA吸收紫外线是细胞氧化损伤的主要来源，引发了一系列对生物体的可能非常有害结果的分子事件（DNA突变，凋亡和癌症）。1 - 3，因此，巨大的效果已致力于表征多核苷酸的光活化动力学。归功于时间分辨（TR）光谱技术4 - 6的发展以及量子机械（QM）计算的限制，已经取得了7 - 10个重要的进步，尤其是在模型多核苷酸序列的研究中。7 - 9,11 - 13他们的光活化动力学非常复杂，结合了超高过程，其特征是亚匹克秒（PS）中的时间常数多达几个PS，而其他过程则以较低的时间尺度出现，最高为纳米秒（NS）（NS）及以后。最快的过程通常与单体样衰减过程有关，即类似于孤立基地中发生的，而，而
评估拜登与特朗普的宏观经济后果
竞选期间提出的一些经济政策未包含在本分析中，包括一些监管和反垄断提案。虽然这些政策可能对特定行业或公司产生显著影响，但据推测它们对宏观经济的影响较小。7 一个值得注意的例外是特朗普可能会试图阻碍美联储的独立性和货币政策的实施。在他的第一任期内，这位前总统公开批评美联储的政策和美联储主席杰罗姆·鲍威尔，可靠的媒体报道表明特朗普的顾问正在仔细考虑他可能采取的措施，以影响或决定第二任期内的利率制定。虽然这将产生严重的负面宏观经济后果，但我们认为这太过投机，不宜纳入我们的分析中。
长度16S- ITS-23S rRNA操纵子序列
收到2024年2月2日； 2024年5月7日接受；于2024年6月7日发布：1 Doherty应用微生物基因组学，微生物学和免疫学系，墨尔本大学Peter Doherty感染与免疫学研究所，792 Elizabeth Street，Melbourne VIC 3000，澳大利亚澳大利亚墨尔本街792号； 2爱尔兰科克摩尔帕克的Teagasc食品研究中心； 3爱尔兰科克大学科克大学科克大学科克大学的APC微生物组和微生物学院； 4 Vistamilk SFI研究中心，爱尔兰科克Teagasc Moorepark。*信件：John G. Kenny，John。Kenny@teagasc。IE关键字：Amplicons;数据库;长阅读测序；微生物组；纳米孔； rRNA。缩写：COV，变异系数； ESV，精确的序列变体； Grond，基因组衍生的核糖体操纵子数据库； GTDB，基因组分类数据库； IQR，四分位数范围；它的内部转录垫片； NR，非冗余； ONT，牛津纳米孔技术； RRN，16S-ITS-23S rRNA操纵子； rRNA，核糖体RNA； SD，标准偏差； Taxlca，集群中所有序列的最低祖先； Taxmaj，最低的分类学等级，其中所有序列中的所有序列都具有简单的多数协议； Taxrep，集群代表序列的源基因组分类学； UMIS，唯一的分子标识符。数据语句：文章或通过补充数据文件中提供了所有支持数据，代码和协议。本文的在线版本可以使用两个补充表。001255©2024作者
ANNEXA-I 中 Xa 因子抑制剂相关 ICH 患者血肿扩大和血栓事件的临床后果
本教育活动中表达的观点和意见均为教职人员的观点，并不一定代表 Total CME, LLC、CME 提供商或提供教育补助的公司的观点。本演示并非旨在定义患者管理的专属课程；参与者应使用其临床判断、知识、经验和诊断技能，将此处提供的任何信息应用于专业用途。临床医生在未评估患者病情和使用中可能出现的禁忌症或危险、未查看任何适用制造商的产品信息以及未与其他权威机构的建议进行比较的情况下，不得使用本活动中讨论或建议的任何程序、药物或其他诊断或治疗课程。可能会提供指向其他网站的链接作为其他信息来源。
页岩气革命的长期影响
最初发表于：Acemoglu, Daron；Aghion, Philippe；Barrage, Lint；Hémous, David (2019)。气候变化、定向创新和能源转型：页岩气革命的长期后果。在：气候变化经济学，在线，2020 年 11 月 19 日至 2020 年 11 月 20 日，里士满联邦储备银行。
量子数据编码模式及其后果
使用量子处理单元 (QPU) 有望加快解决计算问题的速度，尤其是离散优化问题。虽然已知一些突破性的算法方法可以证明其性能优于传统计算机，但我们观察到构建高效量子算法的编程抽象很少。解决与数据库管理相关的具体问题的文献中，很大一部分集中于将它们转化为二次无约束二进制优化问题 (QUBO)，然后可以在基于门的机器（使用量子近似优化算法）或量子退火器上处理这些问题。影响这两种方法的效率和可扩展性的关键方面是如何将经典数据加载到量子位中，以及如何将问题编码为 QUBO 表示。众所周知，编码的有效性对于量子计算机至关重要，特别是在嘈杂的中型量子计算机时代，可用的量子比特数量受到严重限制。在本文中，我们介绍了三种编码模式，讨论了它们对可扩展性的影响以及它们的易用性。我们以娱乐性（但计算挑战性）数独问题及其简化为图形着色为例，讨论它们各自的优点和缺点。我们的目标是使数据库研究人员能够为他们的目的选择合适的编码方案，而无需深入了解量子特性，从而简化在数据管理系统上应用量子加速的途径。
