XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search Systemtranscription
先天免疫响应转录因子可爱...
共济失调是一种罕见的人类疾病，意味着没有协调。是由A-T基因的突变引起的，A-T基因是导致激酶的EN编码的。Purkinje和颗粒神经元在小脑中逐渐退化，影响手指，手臂，腿部，言语，听力和眼睛以及视线。共济失调可以是遗传性的或零星的。有七种类型的共济失调，其症状各不相同，但具有关于身体运动缺乏协调性和弱化的IM Mune系统的共同点，使该人容易受到许多疾病和早期死亡的影响。共济失调的人的预期寿命最早可能是20多岁的或60多岁的，尽管他们的生活很常见。对共济失调知之甚少，并且无法治愈这种轻松的方法。围绕协调丧失的治疗是基本的，因为它仅限于使用自适应辅助装置，并且需要采取多种类型的药物来治疗每种症状，例如分别进行语音，抑郁，震颤等。atm（ataxia telangiectasia突变）是果蝇中必不可少的果蝇蝇基因，代码与人类中的激酶结构相似。它在氧化应激，免疫力，DNA损伤控制，RNA生物发生等中起关键作用。了解A-T中神经退行性的潜在病理，果蝇Melanogaster被用作本研究的模型生物。研究人员使用了对温度敏感的ATM等位基因（ATM8）和RNA干扰（RNAI），以有条件地使神经胶质细胞中的ATM失活。因此，有三个主要实验组：纯合子ATM8突变体（ATM8），杂合子ATM8突变体（ATM8/+）和repo-ATMI（敲低）。这些表型激活了神经胶质细胞中的先天免疫反应，从而在阿尔茨海MER病的苍蝇模型中引起感光细胞神经退行性，这表明先天免疫反应（IMD和TOLL途径）激活与神经变性之间存在致病关系。
先天性免疫缺陷症中的转录因子缺陷
转录因子 (TF) 是调节免疫系统发育、维持和功能的关键成分。因此，某些 TF 的单基因缺陷会导致先天性免疫缺陷 (IEI)，其临床意义深远，包括感染、恶性肿瘤，在某些情况下还会导致严重的过敏性炎症。本综述探讨了以严重过敏性为定义临床表型的 IEI 背后的 TF 缺陷，包括 STAT3 功能丧失、STAT6 功能获得、FOXP3 缺陷和 T-bet 缺陷。这些疾病为了解过敏性炎症的病理生理学提供了宝贵的见解，拓展了我们对罕见单基因和常见多基因过敏性疾病的理解。基因检测的进展可能会发现与过敏性相关的新 IEI，丰富我们对过敏性炎症分子通路的理解。单基因疾病的识别对患者的预后、治疗计划和遗传咨询有深远的影响。因此，对于患有严重、早发性过敏症的患者，考虑 IEI 至关重要。本综述强调需要继续研究 TF 缺陷，以加强我们对过敏性疾病的理解和管理。
用于细菌中同时转录和翻译控制的 CRISPR-Cas 工具
此预印本的版权所有者此版本于 2023 年 10 月 12 日发布。；https://doi.org/10.1101/2023.10.11.561958 doi：bioRxiv preprint
双功能C2H2型锌指转录因子...
ISO avones是由豆类产生的一类二级代谢产物，在人类健康和植物胁迫耐受性中起重要作用。 C2H2锌 - 纤维转录因子（TF）在植物胁迫耐受性中的功能，但对其在大豆（Glycine Max）中的异含量反应中的功能知之甚少。 在这里，我们报告了一个C2H2锌 - 纤维TF基因GMZFP7，该基因调节大豆中的Iso avone积累。 过表达的GMZFP7增加了跨基因根和植物中的ISO avone浓度。 相比之下，沉默的GMZFP7表达显着降低了同avone水平。 代谢组和QRT-PCR分析表明，GMZFP7可以增加苯基丙烷途径的频率。 此外，双 - 荧光酶和电泳动物移动分析测定法表明，GMZFP7通过侵入ISO纤维抗酮合酶2（GMIFS2）（GMIFS2）和3 B-氟酮3 B-羟基酶1（gmff3h1）来调节ISO avone的积累。 在这项研究中，我们证明了GMZFP7通过对竞争性苯基丙烷途径分支的Gateway酶（GMIFS2和GMF3H1）的表达来表达来导致ISO弹药积累，以将代谢流将代谢流引导到ISOOFONE中。 单倍型分析表明，GMZFP7启动子中存在重要的自然变化，P-HAP1和P-HAP3是精英单倍型。 我们的发现提供了有关GMZFP7如何调节苯基丙烷途径并增强大豆ISO avone含量的洞察力。ISO avones是由豆类产生的一类二级代谢产物，在人类健康和植物胁迫耐受性中起重要作用。C2H2锌 - 纤维转录因子（TF）在植物胁迫耐受性中的功能，但对其在大豆（Glycine Max）中的异含量反应中的功能知之甚少。在这里，我们报告了一个C2H2锌 - 纤维TF基因GMZFP7，该基因调节大豆中的Iso avone积累。过表达的GMZFP7增加了跨基因根和植物中的ISO avone浓度。相比之下，沉默的GMZFP7表达显着降低了同avone水平。代谢组和QRT-PCR分析表明，GMZFP7可以增加苯基丙烷途径的频率。此外，双 - 荧光酶和电泳动物移动分析测定法表明，GMZFP7通过侵入ISO纤维抗酮合酶2（GMIFS2）（GMIFS2）和3 B-氟酮3 B-羟基酶1（gmff3h1）来调节ISO avone的积累。在这项研究中，我们证明了GMZFP7通过对竞争性苯基丙烷途径分支的Gateway酶（GMIFS2和GMF3H1）的表达来表达来导致ISO弹药积累，以将代谢流将代谢流引导到ISOOFONE中。单倍型分析表明，GMZFP7启动子中存在重要的自然变化，P-HAP1和P-HAP3是精英单倍型。我们的发现提供了有关GMZFP7如何调节苯基丙烷途径并增强大豆ISO avone含量的洞察力。
基因组res
1纽约市达勒姆大学医学中心综合基因组学部生物统计学和生物信息学系，美国北卡罗来纳州27708； 2计算生物学和生物信息学研究生课程，杜克大学，北卡罗来纳州达勒姆市27708，美国； 3美国北卡罗来纳州达勒姆大学杜克大学基因组和计算生物学中心27708，美国； 4美国杜克大学高级基因组技术中心，北卡罗来纳州达勒姆市27708，美国； 5美国北卡罗来纳州达勒姆大学杜克大学生物医学工程系27708； 6北卡罗来纳州达勒姆大学杜克大学遗传学和基因组学的大学计划27708，美国； 7美国北卡罗来纳州达勒姆大学杜克大学医学中心手术系27708； 8北卡罗来纳州达勒姆大学杜克大学分子遗传学和微生物学系27708，美国1纽约市达勒姆大学医学中心综合基因组学部生物统计学和生物信息学系，美国北卡罗来纳州27708； 2计算生物学和生物信息学研究生课程，杜克大学，北卡罗来纳州达勒姆市27708，美国； 3美国北卡罗来纳州达勒姆大学杜克大学基因组和计算生物学中心27708，美国； 4美国杜克大学高级基因组技术中心，北卡罗来纳州达勒姆市27708，美国； 5美国北卡罗来纳州达勒姆大学杜克大学生物医学工程系27708； 6北卡罗来纳州达勒姆大学杜克大学遗传学和基因组学的大学计划27708，美国； 7美国北卡罗来纳州达勒姆大学杜克大学医学中心手术系27708； 8北卡罗来纳州达勒姆大学杜克大学分子遗传学和微生物学系27708，美国
AP-1亚基在增强子处随意聚集，增强转录
2 杜克大学基因组与计算生物学中心，北卡罗来纳州达勒姆 27708，美国 3 杜克大学生物医学工程系，北卡罗来纳州达勒姆 27708，美国 4 杜克大学遗传学与基因组学大学项目，北卡罗来纳州达勒姆 27708，美国 5 杜克大学医学中心综合基因组学分部生物统计学与生物信息学系，北卡罗来纳州达勒姆 27708，美国 6 杜克大学医学中心外科系，北卡罗来纳州达勒姆 27708，美国
与血红蛋白病相关的 C2H2 锌指转录因子
在人类中，β-珠蛋白的特异性畸变会导致镰状细胞病和β-地中海贫血，而这些疾病的症状可以通过增加胎儿珠蛋白 (HbF) 的表达来改善。最近进行的两次 CRISPR-Cas9 筛选以 ~1500 种带注释的序列特异性 DNA 结合蛋白为中心，在表达成人血红蛋白的人类红系细胞中进行，发现了四组 HbF 基因表达的候选调节因子。它们是 (1) 已知可用于控制 HbF 的核小体重塑和去乙酰化酶 (NuRD) 复合蛋白的成员；(2) 七种 C2H2 锌指 (ZF) 蛋白，其中一些 (ZBTB7A 和 BCL11A) 已知可直接沉默成人人类红系细胞中的胎儿 γ-珠蛋白基因；(3) 一些其他不同结构类别的转录因子，它们可能间接影响 HbF 基因表达； （4）DNA 甲基转移酶 1 (DNMT1) 维持 DNA 甲基化标记，这些标记将 MBD2 相关的 NuRD 复合物吸引到 DNA 上，以及相关的组蛋白 H3 赖氨酸 9 甲基化。本文我们简要讨论了这些调节剂（特别是 C2H2 ZF）在诱导 HbF 表达以治疗 β 血红蛋白疾病方面的作用，以及开发安全有效的小分子疗法以调节这种高度保守的血红蛋白转换的最新进展。
与大豆种子重量相关的转录因子
栽培大豆 ( Glycine max (L.) Merrill ) 是由野生大豆 ( Glycine soja ) 驯化而来，其种子比野生大豆更重，含油量更高。在本研究中，我们利用全基因组关联研究 (GWAS) 鉴定了一个与 SW 相关的新型候选基因。连续三年通过 GWAS 分析检测到候选基因 GmWRI14-like。通过构建过表达 GmWRI14-like 基因的转基因大豆和 gmwri14-like 大豆突变体，我们发现 GmWRI14-like 的过表达增加了 SW 和增加了总脂肪酸含量。然后我们利用 RNA-seq 和 qRT-PCR 鉴定了 GmWRI14-like 直接或间接调控的靶基因。过表达GmWRI14-like的转基因大豆比非转基因大豆株系表现出GmCYP78A50和GmCYP78A69的积累增加。有趣的是，我们还利用酵母双杂交和双分子荧光互补技术发现GmWRI14-like蛋白可以与GmCYP78A69/GmCYP78A50相互作用。我们的研究结果不仅揭示了栽培大豆SW的遗传结构，而且为改良大豆SW和含油量奠定了理论基础。