摘要囊性纤维化跨膜电导调节剂(CFTR)阴离子通道和上皮Na +通道(ENAC)在许多上皮组织中在跨层离子和流体转运中起着重要作用。两个通道的抑制剂都是在体外定义其生理作用的重要工具。然而,两个常用的CFTR抑制剂CFTR INH -172和GLYH-101(也抑制非CFTR阴离子通道),表明它们不是CFTR的特异性。然而,迄今为止,这些抑制剂对上皮阳离子通道的潜在靶向效应尚未解决。在这里,我们表明,两个CFTR阻滞剂都以许多研究人员的常规使用浓度造成了对商店经营的钙进入(SOCE)的显着抑制,这些钙进入(SOCE)是时间依赖性,可逆的,并且独立于CFTR。斑块夹的实验表明,CFTR INH -172和GLYH-101都引起了ORAI1介导的全细胞电流的显着块,确定它们可能通过调制该Ca 2+释放激活的Ca 2+(CRAC)通道来减少SOCE。除了对钙通道的脱靶影响外,两种抑制剂在异武卵母细胞异源表达后都显着降低了人αβγ-ENAC介导的电流,但对Δβ-ENAC功能的影响有所不同。分子对接确定了两个CFTR阻滞剂的ENAC细胞外域中的两个假定结合位点。一起,我们的结果表明,在使用这两个CFTR抑制剂来剖析CFTR和潜在的ENAC在生理过程中的作用时,需要谨慎。
摘要:过去四年中,独特的跨膜 (TM) 蛋白质结构的数量翻了一番,这可以归因于低温电子显微镜的革命。此外,AlphaFold2 (AF2) 还提供了大量高质量的预测结构。但是,如果研究的对象是特定的蛋白质家族,那么尽管存在通用和蛋白质域特定的数据库,收集该家族成员的结构仍然极具挑战性。在这里,我们证明了这一点,并评估了通过 ABC 蛋白质超家族自动收集和呈现蛋白质结构的适用性和可用性。我们的流程使用 PFAM 搜索识别和分类跨膜 ABC 蛋白质结构,并旨在根据特殊几何测量 conftors 确定它们的构象状态。由于 AlphaFold 数据库仅包含单个多肽链的结构预测,我们对作为二聚体发挥作用的人类 ABC 半转运蛋白进行了 AF2-Multimer 预测。我们的 AF2 预测警告称,有关相互作用伙伴的一些生化数据的解释可能存在歧义,需要进一步进行实验和实验结构确定。我们通过网络应用程序提供了我们预测的 ABC 蛋白质结构,并加入了 3D-Beacons 网络,通过 PDBe-KB 等平台覆盖更广泛的科学界。
心肌缺血再灌注(I/R)损伤的特征是心肌细胞中线粒体损伤。跨膜bax抑制剂基序含有6(TMBIM6)和Presenilin-2(PS2)参与多个线粒体途径;因此,我们研究了这些蛋白质对急性再灌注损伤期间线粒体稳态的影响。心肌后再灌注胁迫损害心肌功能,诱导结构异常,并通过破坏野生型小鼠的线粒体完整性,但在TMBIM6转基因小鼠中促进心肌细胞死亡。我们发现TMBIM6直接与PS2结合并促进其转录后降解。在小鼠中敲出PS2可通过改善线粒体完整性来减少I/R损伤引起的心脏功能障碍,炎症反应,心肌肿胀和心肌细胞死亡。这些发现表明,足够的TMBIM6表达可以防止心脏I/R损伤期间PS2的积累,从而抑制了再灌注诱导的线粒体损伤。因此,TMBIM6和PS2是治疗心脏再灌注损伤的有希望的治疗靶标。
电穿孔会导致细胞膜通透性暂时增加,并导致兴奋细胞和非兴奋细胞的跨膜电压 (TMV) 发生长时间变化。然而,这些 TMV 变化的机制仍有待完全阐明。为此,我们使用 FLIPR 膜电位染料将两种不同的细胞系暴露于单个 100 µ s 电穿孔脉冲后,在 30 分钟内监测 TMV。在表达极低水平内源性离子通道的 CHO-K1 细胞中,脉冲暴露后的膜去极化可以用非选择性漏电流来解释,这种漏电流一直持续到膜重新密封,使细胞能够恢复其静止的 TMV。在表达多种不同离子通道的 U-87 MG 细胞中,我们意外地观察到初始去极化阶段之后的膜超极化,但仅在 33 ◦ C 时发生,而在 25 ◦ C 时未发生。我们开发了一个理论模型,该模型得到了离子通道抑制剂实验的支持,该模型表明超极化在很大程度上可归因于钙激活钾通道的激活。离子通道激活与 TMV 和细胞内钙的变化相结合,参与各种生理过程,包括细胞增殖、分化、迁移和凋亡。因此,我们的研究表明离子通道可能是影响电穿孔后生物反应的潜在靶点。
• Type-II transmembrane glycoprotein: ~40kDa CRD • Hetero-oligomer of homologous subunits H1 and H2 • Density: ~100,000–500,000 receptors per hepatocyte • Function: endocytosis of galactose-(Gal) and N-acetyl galactosamine-(GalNAc) serum glycoproteins / cells
• Trophoblast cell surface antigen 2 (TROP2) is a 36-kDa single-pass transmembrane protein which is widely expressed in solid tumors, and highly expressed in non-small cell lung cancer (NSCLC), hormone receptor positive breast cancer (HR+BC) and triple negative breast cancer (TNBC) 1 , supporting the therapeutic potential of TROP2- directed therapies in these跨不同治疗线的肿瘤类型
TRPV1 在结构上被描述为同型四聚体通道。四个亚基中的每一个都含有六个跨膜结构域(S1-S6;图 2)。每个单体链总共由 838 个氨基酸组成,氨基酸残基 433–684 形成跨膜结构域。跨膜区由六个螺旋(S1-S6)组成,这些螺旋形成电压传感器样结构域(S1-S4)和内孔区(S5-S6)。跨膜结构域 5 和 6 由疏水 S4S5 连接环连接,并参与通道孔的形成。离子通道孔由选择性过滤器和孔螺旋形成。来自螺旋 S6 底部的残基充当激活门。不同的 TRPV 亚型具有不同的孔半径,可调节通道选择性。激活配体的结合导致两个门 8 的顺序和变构耦合打开。
• AAT: alpha-1 antitrypsin • AATD: alpha-1 antitrypsin deficiency • AAV: adeno-associated virus • CF: cystic fibrosis • CFTR: cystic fibrosis transmembrane conductance regulator • CKD: chronic kidney disease • COPD: chronic obstructive pulmonary disease • Cas9: CRISPR-associated protein 9 • CRISPR: clustered regularly interspaced short palindromic repeats • ESKD: end-stage kidney disease • FDA: US Food and Drug Administration • FEV1: forced expiratory volume in 1 second • HSCs: hematopoietic stem cells • IPF: idiopathic pulmonary fibrosis • LNPs: lipid nanoparticles • PH1: primary hyperoxaluria type 1 • PKD: polycystic kidney disease • rAAV:重组腺相关的病毒载体•siRNA:小干扰RNA•TGF-β:转化生长因子β•UABC:高层基础干细胞
特异性和注释DC-SIGN是一种跨膜受体,在树突状细胞和巨噬细胞表面表达。它参与了先天的免疫系统,并认识到从寄生虫到病毒的许多进化发散的病原体。蛋白质被组织成三个不同的结构域:N末端跨膜结构域,串联重复的颈域和C型凝集素碳水化合物碳水化合物识别结构域。由C型凝集素和颈部结构域组成的细胞外区域具有双重功能,是病原体识别受体和细胞粘附受体,通过结合微生物和内源细胞表面上的碳水化合物配体。颈部区域对于同型寡聚很重要,这使受体能够结合较高亲和力的多价配体。
