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社论抗性结核病和生物信息学
结核病（TB）是仅次于Covid19的感染因素的第二大死亡原因。这种疾病是由结核菌细菌引起的。但是，还有其他细菌也可以在人类和其他动物中引起它，并且是结核分枝杆菌复合物的一部分，即：M。Afri Canum，M。Cannetti，M。Orygis，M。Orygis，M。Bovis，M。Microti，M。Microti，M。Canetti，M。Caprae，M。Caprae。M. Pinnipedi和M. Mungi。TB会影响身体的不同组织；但是，在大多数情况下，它会影响肺部，称为肺结核。受这种疾病影响的患者会出现症状，例如咳嗽需要超过15天的时间来治愈，咳嗽，体重减轻，食欲不振，夜汗和发烧峰。
Ag85B 与 c-di-AMP 作为粘膜佐剂对小鼠持续性结核分枝杆菌感染具有免疫治疗作用
结核病 (TB) 是由结核分枝杆菌引起的，是全球单一感染病原体导致死亡的主要原因。结核分枝杆菌感染还可能导致临床慢性感染，称为潜伏性结核感染 (LTBI)。与目前有限的治疗方法相比，几种亚单位疫苗表现出免疫治疗效果，并被纳入临床试验。在本研究中，Ag85B 亚单位疫苗与新型粘膜佐剂 c-di-AMP (Ag85B:c-di-AMP) 经鼻腔内注射给持续性结核分枝杆菌 H37Ra 感染小鼠模型，该模型也表现出 LTBI 的无症状特征。与Ag85B免疫相比，Ag85B:c-di-AMP疫苗接种诱导了更强的体液免疫反应，显著更高的CD4 + T细胞募集，增强了肺中Th1/Th2/Th17谱反应，减轻了肺病理损害，并降低了小鼠体内的结核分枝杆菌负荷。总之，Ag85B:c-di-AMP黏膜途径免疫对持续性结核分枝杆菌H37Ra感染具有免疫治疗作用，而c-di-AMP作为一种有希望的潜在黏膜佐剂，可进一步用于持续性结核分枝杆菌感染以及LTBI的治疗或预防疫苗策略。
在秘鲁耐多药结核病高发区常规条件下对结核分枝杆菌进行全基因组测序
全基因组测序 (WGS) 是全球抗击结核病 (TB) 的一个有前途的工具。本研究的目的是评估在秘鲁耐多药结核病热点地区常规使用 WGS 检测耐药标志物和传播簇的情况。为此，前瞻性地选择了来自利马和卡亚俄的 140 种耐药结核分枝杆菌菌株，并同时通过常规（GenoType MTBDR sl 和 BACTEC MGIT）和 WGS 工作流程进行处理。根据世界卫生组织突变目录确定耐药性。计算了利福平、异烟肼、吡嗪酰胺、莫西沙星、左氧氟沙星、阿米卡星和卷曲霉素的 WGS 和 BACTEC 结果之间的一致性。使用不同的单核苷酸多态性差异截止值确定传播簇。 100% (140/140) 的菌株对 13 种抗结核药物具有有效的 WGS 结果。然而，最终确定的表型 BACTEC MGIT 结果的可用性因药物而异，七种比较药物的无效结果为 10-17%。获得全套药物 WGS 结果的中位时间为 11.5 天，而常规工作流程为 28.6-52.6 天。比较药物的 WGS 和 BACTEC MGIT 的总体分类一致性为 96.5%。除莫西沙星外，Kappa 指数良好 (0.65 k 1.00)，但所有病例的敏感性和特异性值都很高。 97.9% (137/140) 的菌株仅具有一个亚谱系（134 株属于“谱系 4”，3 株属于“谱系 2”），2.1% (3/ 140) 为混合菌株，呈现两个不同的亚谱系。5、10 和 12 个 SNP 截止值的聚类率分别为 3.6% (5/ 140)、17.9% (25/140) 和 22.1% (31/140)。综上所述，常规 WGS 对检测对当前主要抗结核药物的耐药性具有很高的诊断准确性，可通过一次分析获得结果，并有助于迅速切断秘鲁耐药结核病的传播链。
通过核糖核蛋白复合物的CRISPR/CAS9系统的核糖蛋白蛋白复合物破坏了马铃薯（茄状结核L.）块茎的颜色变化。
加工品种，源自1902年的“ Burbank”突变（Bethke等，2014）。世界上有4000多个马铃薯品种，在英国列表中有500多个（Ghimire，2022年）。这表明一旦某种品种吸引了一旦捕捉到一个新的来代替它就很难。为了进一步使繁殖复杂的栽培马铃薯是四倍体的，具有高度的杂合性和同样高的近交抑郁症的可能性（Slater等，2014），需要12-20年的年度，用于开发和释放一种新的马铃薯品种（Bonierbale等人（Bonierbale等，2020年）。它的四倍体性质使得难以繁殖所有四个等位基因的特征，其中所有四个等位基因都必须是基因的最佳版本，例如对疾病的抗性。一旦进行了交叉，所有特征就在发挥作用，并且会重新组合以创建新型的马铃薯类型，但不一定与所需特征的结合，或者只有一个或几个特定的改变特征。此外，
维生素D在结节硬化症中与复合物相关肿瘤
雷帕霉素抑制剂（MTORI）的哺乳动物靶标已用于治疗小儿结核性硬化症复合物（TSC）相关肿瘤，尤其是在完全进行手术或完全肿瘤切除的情况下进行抑制。 但是，某些患者在停用治疗后会经历副作用和肿瘤消退。 因此，迫切需要开发可与MTORI结合使用的药物，以增加其效果并最大程度地减少其副作用。 具有抗癌特性的1,25-二羟基维生素D 3（1,25-D）可能是辅助或替代疗法的有前途的候选者，因为TSC和癌细胞具有共同的机制，包括血管生成，细胞生长和增殖。 维生素D受体介导的信号传导可以表观遗传修饰，并在1,25-D的敏感性中起重要作用。 因此，维生素D信号传导可能是一个有希望的药物靶标，并且需要进行体外研究来评估1,25-D在TSC相关肿瘤，脑发育和精神疾病的核心症状中的效率。哺乳动物靶标已用于治疗小儿结核性硬化症复合物（TSC）相关肿瘤，尤其是在完全进行手术或完全肿瘤切除的情况下进行抑制。但是，某些患者在停用治疗后会经历副作用和肿瘤消退。因此，迫切需要开发可与MTORI结合使用的药物，以增加其效果并最大程度地减少其副作用。具有抗癌特性的1,25-二羟基维生素D 3（1,25-D）可能是辅助或替代疗法的有前途的候选者，因为TSC和癌细胞具有共同的机制，包括血管生成，细胞生长和增殖。维生素D受体介导的信号传导可以表观遗传修饰，并在1,25-D的敏感性中起重要作用。因此，维生素D信号传导可能是一个有希望的药物靶标，并且需要进行体外研究来评估1,25-D在TSC相关肿瘤，脑发育和精神疾病的核心症状中的效率。
一种针对结核病的新型疫苗策略
未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印本的版权持有人（本版本发布于2024年5月15日。; https：//doi.org/10.1101/2024.05.15.15.15.594337 doi：biorxiv Preprint
阐明石墨烯量子点对结核分枝杆菌感染的潜力
基于碳的纳米材料（CNM）治疗，尤其是石墨烯 - 氧化物（GO）已经显示出对分枝杆菌的有希望的活性（De Maio等，2019）。即使GO没有显示直接的杀菌活性，它也能够将分枝杆菌置于网中，从而干扰正常的巨噬细胞感染（De Maio等，2019）。此外，由于活性氧（ROS）产生的增加，二线抗TB药物LineZolid的共同给药导致了协同的抗MTB效应（De Maio等人，2020年）。然而，GO板与异念珠菌或amikacin的相互作用干扰并阻碍了抗生素活性（De Maio等，2020）。此外，当基于外周血单核细胞的MTB感染模型中使用GO时，我们观察到控制分枝杆菌复制的失败，这在很大程度上是由于抗单核细胞和CD4 T细胞的毒性（Salustri et al。，2023）。
定量性状基因座和候选基因的物理化学性状与大山药的块茎质量有关（Dioscorea alata L.）
遗传改进计划需要简单，快速和低成本的工具来筛选大量人群。近红外的反射光谱（NIR）已被证明是一种可靠的技术，可以预测D. alata山药物种中主要的块茎成分。9,10然而，由于光谱是由我们的样品而不是从原始样本产生的，因此该协议需要长时间的样本处理时间，并且仍然很难适用于大量基因型。标记辅助选择可能是促进育种工作的高通量方法。的确，随着新一代测序技术的发展，搜索与互动特征相关的基因组区域变得更加容易。已经对山药进行了一些研究，以阐明块茎质量相关特征的遗传决定论。通过在两个双阶层种群上使用定量性状基因座（QTL）映射方法，已经确定了与重要形态和农艺块茎质量性状相关的几个基因组区域。11在包括八种不同的二若氏种类（包括八种不同的二维体物种）上估算了DMC的遗传力。12在D. alata中进行了全基因组关联研究，可以鉴定与与DMC相关的一些单核苷酸多态性（SNP）标记。13
摘要该研究采用计算策略来识别对结核分枝杆菌FTSZ的潜在抑制剂，这是一种关键的细胞分裂
摘要该研究采用计算策略来鉴定对结核分枝杆菌FTSZ的潜在抑制剂，这是一种关键的细胞分裂蛋白。对FTSZ的晶体结构进行了精心验证，是基于药效团的虚拟筛选和随后的分子对接模拟的基础。piperine是一种源自黑胡椒的天然配体，指导了三分药团模型的开发，该模型成功筛选了多种化学数据库。十种顶级化合物以有希望的药效分数出现，证明了与FTSZ结合位点的潜在相互作用。分子对接模拟揭示了特定化合物，包括Zinc000012440615和Zinc000014658239，分别显示出对口袋C5和C1的一致偏好。FTSZ的结构分析揭示了一套不同的口袋（C1 – C5），其体积和尺寸不同，强调了蛋白质结构的复杂性。这些发现为潜在的抑制剂提供了至关重要的见解，以进一步实验验证和针对结核分枝杆菌的药物开发。关键词：结核分枝杆菌，FTSZ蛋白，分子对接，药物团筛查，计算药物发现，杂氨酸，晶体结构验证，虚拟筛选，铅化合物，袋装分析。国际药品保证杂志。2024; 15（1）：351-356。支持来源：零。利益冲突：无国际药品保证杂志（2024）； DOI: 10.25258/ijpqa.15.1.56 How to cite this article: Deore S, Wagh V, Thube U, Kayande N, Tare H. In-silico Discovery of Potential Mycobacterium tuberculosis Cell Division Protein FtsZ Inhibitors: A Natural Ligand Piperine-Derived 3-Point Pharmacophore Screening and Structure-Guided Blind Docking Study.
耐药性结核病中的贝达喹啉耐药性
荟萃分析还确定了 141 个耐药相关变异 (RAV)，包括 58 个独特位点上的 71 个独特 RAV。四个 RAV 被定位到结核分枝杆菌基因组的启动子区域，19 个被定位到二聚化域，42 个被定位到 DNA 结合区域。基因型耐药标记和表型耐药之间的一致性较差被强调为开发贝达喹啉耐药性快速分子诊断检测的主要制约因素。总之，这项工作要求加强对贝达喹啉耐药性的监测，加大对快速表型检测的投资和创新，并加强国家结核病规划，以消除与结核病相关的灾难性成本，提高治疗依从性，并保持高水平的护理保留率。