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World File Search Systemxanthomonas
诊断Xanthomonads感染胡椒和番茄植物的特定遗传标记
摘要，我们通过使用整个基因组序列分析和细菌基因组中的重复区域来改进标记系统，以检查黄褐色质体物种的遗传多样性。具体而言，我们使用PCR扩增了微卫星区域，并用特定的酶消化所得的片段。这些碎片曲线用作分子标记。因此，通过将微卫星和RFLP方法组合以区分黄thomonads物种来开发细菌鉴定的更精确的标记。此外，我们分析了使用渐进式淡紫色比对在NCBI中可用的各种Xanthomonas物种的祖先顺序。数据揭示了Xanthomonas物种的独特共线区域。这些区域也与用作标记的切割基因组片段有关，从而使Xanthomonas物种感染了番茄和胡椒。我们建议这些发现有助于理解黄虫的遗传多样性和快速诊断。
隔离和鉴定从Ulyanovsk区域中的甘蓝种子分离的细菌
摘要。由细菌xanthomonas Campestris引起的细菌病被认为是栽培植物最危险的一种。在有利的农业季节，对于病原体的发展，问题尤其鲜明。同时，目前缺乏对这些杀菌作用的有效和现代作用的方法。建议的解决方案之一是使用噬菌体生物制作，其中对微生物的“田间”培养的活动很重要。在这方面，从36种种子材料样品中分离出22种Xanthomonas campestris细菌菌株。尽管种子材料有所不同，但所有分离的菌株均具有该物种的典型生物学特性，并且相互对应以及与工作中使用的参考菌株相对应。同时，在21种菌株中建立了与白菜有关的分离微生物的致病性。页面布局
番茄细菌性斑点病抗性育种进展与挑战
摘要：细菌性斑点病是番茄的一种严重病害，由至少四种黄单胞菌引起。这些菌种包括X. euvesicatoria（T1 菌种）、X. vesicatoria（T2 菌种）、X. perforans（T3 和 T4 菌种）和 X. gardneri，每组菌种的地理分布不同。目前，X. gardneri 和 X. perforans 是北美番茄的两种主要细菌性病原体，其中 X. perforans（T4 菌种）在东海岸占主导地位，而 X. gardneri 在中西部占主导地位。该病害可导致高达 66% 的产量损失。由于缺乏有效的化学防治措施和商业抗性品种，该病害的管理具有挑战性。尽管已经鉴定出主要的抗性基因（R）和数量抗性，但抗细菌性斑点病的番茄育种受到多种因素的阻碍，包括克服抗性的病原体新种群的出现、抗性的多基因控制、连锁累赘、抗性的非加性成分以及幼苗测定和田间抗性之间的低相关性。含有 Bs2 和 EFR 基因的转基因番茄对多个黄单胞菌种群均有效。然而，由于公众的担忧和复杂的监管流程，它尚未实现商业化。基因组学辅助育种、基于效应的基因组学育种和基因组编辑技术可能是实现番茄持久抗细菌性斑点病的新方法。本文的主要目的是了解番茄细菌性斑点病的现状，包括其分布和病原体多样性、疾病管理中的挑战、抗病来源、抗性遗传学和育种，以及新育种方法的未来前景。
RNP复合物对细菌的作物保护...
•含有Cas9和GRNA的纳米配方，将外源喷涂到感染植物上。•核糖核蛋白（RNP）络合物的递送，该复合物靶向特定细菌毒性基因HRPX，HRPG，HRPB和HOPP1。•用于不同疾病的GRNA复合物的个体或组合。•所提出的技术靶向病原体毒力因子，以防止细菌枯萎病，导致小米的xanthomonas oryzae pv oryzae（XOO）在水稻上，细菌斑点，引起丁香肌pv。番茄dc3000在拟南芥和细菌枯萎病上，在马铃薯上引起拉尔斯托尼亚溶剂。•RNPS纳米配方具有增强的渗透和效率。•将RNP应用的管道和SOPS靶向细菌中的其他基因
扩展了XCC-辅助农业浸润的前沿。
xanthomonas citri subsp。柑橘是柑橘溃疡的因果毒剂，近年来已被视为农业浸润的新型载体。XCC-辅助农业渗透提供了几种优势XCC在将DNA输送到植物细胞中的效率非常有效，从而导致快速且稳健的基因表达。XCC可用于多种植物物种，包括丁香和单子叶植物，使其成为植物生物学家的多功能工具。与涉及植物组织伤口的传统农业浸润方法不同，XCC促成的农业浸润是微创的，可减少潜在的组织损害和对植物的压力。使用XCC促进的农业浸润引入的基因通常会瞬时表达，这允许快速测试基因功能，而无需永久改变植物的基因组[2]。
通过 CRISPR 介导的同源定向修复进行木薯基因标记
多年的工具和资源开发使一些模型植物-病原体系统的研究受益。但对于绝大多数具有经济和营养价值的植物来说，情况并非如此，从而造成了作物改良的瓶颈。由 Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam) 引起的木薯细菌性枯萎病 (CBB) 是所有种植木薯 (Manihot esculenta Crantz) 的地区的重要疾病。本文，我们描述了可用于可视化体内 CBB 感染的初始步骤之一的木薯的开发。利用 CRISPR 介导的同源定向修复 (HDR)，我们生成了在 CBB 易感性 (S) 基因 MeSWEET10a 的 3' 端无疤痕插入 GFP 的植物。随后在转录和翻译水平上可视化了转录激活因子样 (TAL) 效应物 TAL20 对 MeSWEET10a-GFP 的激活。据我们所知，这是首次在木薯中通过基因编辑展示 HDR。
文章 嵌合化可实现基因合成和可定制 TALE 效应的慢病毒递送
摘要：基于黄单胞菌转录激活因子样效应 (TALE) 的 DNA 结合结构域 (DBD) 的设计效应是强大的序列特异性工具，因其在编辑基因组、转录组以及最近的表观基因组方面的特异性而享有盛誉。然而，组成 DBD 的 TALE 阵列的重复结构阻碍了它们作为基因合成产物的生成，并阻止了使用慢病毒载体 (LV)（一种广泛用于人类基因治疗的系统）递送基于 TALE 的基因。为了克服这些限制，我们旨在通过引入足够的多样性来嵌合编码 TALE-DBD 的 DNA 序列，以促进它们的基因合成和实现慢病毒递送。为此，我们用来自细菌伯克霍尔德菌的 TALE 样单元替换了 17 个黄单胞菌 TALE 重复序列中的 3 个。这与整个 DBD 中的广泛密码子变异和特定氨基酸替换相结合，以最大限度地提高重复序列内和重复序列间的变异性。我们证明，使用传统的 Golden Gate 克隆策略或基因合成可以轻松生成嵌合 TALE。此外，嵌合化使得使用慢病毒载体递送基于 TALE 的设计核酸酶、转录组和表观基因组编辑器成为可能。当以质粒 DNA 递送时，靶向 CCR5 和 CXCR4 基因座的嵌合 TALE 在人体细胞中显示出类似的活性。然而，基于 TALE 的转录激活因子的慢病毒递送仅在嵌合形式下才成功。同样，递送嵌合的 CXCR4 特异性表观基因组编辑器会导致内源性 CXCR4 表达快速沉默。总之，基于 TALE 的 DBD 的广泛密码子变异和嵌合使得设计 TALE 的生成和慢病毒递送变得简单，因此有利于这些工具的临床应用，以精确编辑基因组、转录组和表观基因组。
通过CRISPR介导的同源指导修复的基因标记。
对一些模型植物 - 病原系统的研究已从多年的工具和资源开发中受益。对于绝大多数经济和营养重要的植物而言，情况并非如此，从而产生了农作物改善的瓶颈。木薯细菌疫病（CBB），由xanthomonas axonopodis PV引起。manihotis（XAM）是木薯（Manihot esculenta crantz）种植的所有地区的重要疾病。在这里，我们描述了木薯的开发，可用于可视化体内CBB感染的初始步骤之一。使用CRISPR介导的同源指导修复（HDR），我们在CBB易感性的3'端（S）基因Mesweet10a生成了含有GFP的植物。随后在转录和翻译水平上可视化了转录激活剂（TAL）效应tal20的Mesweet10a-GFP。据我们所知，这是通过木薯中的基因编辑进行HDR的第一个证明。