。预处理过程中的下一步是设置相对于桥接因子桥接不同套件批次之间的数据的值。产生的归一化蛋白质表达(NPX)单位在log2量表上,其中较大的数字代表样品中较高的蛋白质水平,通常为背景水平或接近零。通过使用非线性逻辑回归模型中的四个参数,将NPX值拟合到标准曲线,以描述免疫测定的形状来获得标准浓度单位(PG/mL)中的蛋白质浓度。标准曲线是在验证过程中定义的,并通过产品页面(olink.com/target48human)找到。三个示例如图2所示。
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肿瘤细胞重新编程营养的获取和代谢路径,以满足其能量,生物合成和氧化还原需求。同样,免疫细胞中的代谢过程支持宿主免疫对癌症的免疫力,并确定白细胞的分化和命运。因此,据报道,肿瘤微环境中免疫细胞中的代谢失控和失衡会驱动免疫逃避并损害治疗结果。有趣的是,新兴的证据表明,抗肿瘤免疫性可以调节肿瘤异质性,侵略性和代谢重编程,这表明免疫监视可以指导多个维度的癌症进展。本综述总结了我们目前对肿瘤中代谢串扰如何影响肿瘤细胞的免疫原性并促进癌症进展的理解。此外,我们解释了代谢级联反应中的缺陷如何有助于对癌症产生功能失调的免疫反应,并讨论免疫监视对这些缺陷作为反馈机制的贡献。最后,我们重点介绍了针对癌症细胞代谢的新临床试验和新的治疗策略。
f i g u r e 2化学疗法,放射治疗和靶向抗癌药的有益免疫作用。几种临床使用的抗癌治疗,包括经典化学治疗剂,至少在某些情况下,局灶性放射治疗和选择的靶向抗癌药可以通过三种一般机制来介导有益的免疫作用:(1)通过在癌细胞中诱导免疫细胞死亡(ICD),这与多种免疫剂的发射有关,这与癌细胞相关。 (2)通过抑制或耗尽免疫抑制细胞群体,包括调节性T(T Reg)细胞,很大一部分与肿瘤相关的巨噬细胞(TAM)和髓样衍生的抑制细胞(MDSC);或(3)通过促进免疫效应细胞的激活,例如细胞毒性T淋巴细胞(CTL),这些细胞(CTL)识别出恶性细胞,这些细胞在MHC I类分子上呈现特定肿瘤相关的抗原(TAAS),并通过其T -Cell受体(TCR)(TCR)(TCR)对其进行反应,并通过产生效应效应分子,例如Inrolecules,例如Inrolegn,例如Interfeor,例如Inroven GAN,例如InroveNGAN,例如InroveNGAN,例如InroveNGAN,例如Inrofefors inserforefeanga。ATP,三磷酸腺苷; Calr,钙网蛋白; CXCL10,C -X -C基序趋化因子配体10; HMGB1,高移动性组框1; IFN,干扰素; MHC,主要的组织相容性复合物。ATP,三磷酸腺苷; Calr,钙网蛋白; CXCL10,C -X -C基序趋化因子配体10; HMGB1,高移动性组框1; IFN,干扰素; MHC,主要的组织相容性复合物。
我们和其他人试图证明肠道分子在癌症免疫监视中的关键影响,尤其是在抗癌治疗期间引起保护性先天和同源免疫反应方面。最引人注目的发现之一来自对抗生素(ATB)在免疫检查点抑制剂(ICI)中的免疫抑制作用的描述。首先,ATB大大降低了针对CTLA4或PD-1/PD-L1在肺和肾脏患者中的免疫疗法的功效。其次,在诊断时对粪便进行元基因组学分析预测了免疫疗法的治疗失败。第三,粪便微生物从反应或抗性癌症患者中反应或抗性的“阿凡达”肿瘤轴承啮齿动物分别赋予受体中对抗PD1/ pdl-1 ABS的敏感性或抗性。此外,我们报告说,与长期益处有关PD1封锁相关的三级淋巴器官与针对尿路上皮癌侵入癌细胞的病原体的熟练免疫反应有关。最后,我们揭示了MadCam-1是一个肠道免疫检查点,请检查TR17调节T细胞对肿瘤床的外流。最后,我们现在正在描述肠道营养不良的诊断工具(基于治疗前基线时粪便Akkermansia spp的相对丰度以及“ toposcore”),预测肺癌患者对PD1阻滞的抗性。Next, we identified various mechanisms accounting for the links between the gut microbiome and antitumor immunosurveillance: 1/ cancer causes a beta-adrenergic receptor-dependent stress ileopathy triggering the intestinal dysbiosis and contributing to tumor progression, requiring specific therapies 2/ isolation of a group of “immunogenic commensals” (such as Akkermansia粘膜菌,脆弱的B. fragilis,肠球菌及其肠植物Alistipes shahii,ruminococcus spp)能够安装IL-12依赖性的免疫反应,这是由卵泡式T helper细胞介导的,在Oxaliplatinum或Cyclophapinum和cyclophainm nimib nimib nimib nimib nimib nimib nimim nimim nimim nimim nimim(3/ s)中,毛磷脂型(3/) CD8+ T效应细胞识别的肠球菌噬菌体和癌症表位,解释了某些细菌种类的免疫原性(在小鼠和患者中),4/有害病原体(如肠球菌等)的免疫抑制作用。 (梭状芽胞杆菌梭状芽胞杆菌/玻璃体),ATB停止促进调节性T细胞向肿瘤床的肠道外流后占主导地位。这些发现具有开创性的临床实施,因为它们导致了概念验证试验,即IV期黑色素瘤中对ICI的主要抵抗力可以通过粪便微生物移植(FMT)的固化供体以及同一ICI的重新引入。
尽管我们一生中患癌症的风险约为 40%,但令人惊讶的是这个数字并没有更高。我们体内的 10 13 个有核细胞每细胞分裂约复制 3 × 10 9 个碱基对,内在突变率约为每碱基对 10 –4.5 个,而每天的化学致癌物和辐射还会产生额外的突变。DNA 质量控制途径修复了大部分损伤,但越来越明显的是,免疫系统在限制癌变方面发挥着重要作用——这就是免疫监视的概念。事实上,肿瘤进化出了无数机制来逃避免疫,这一过程称为免疫编辑 1 。Boon 等人 2 首次通过展示 CD8 + T 细胞对自身肽的耐受性可以被癌细胞突变打破,从而产生氨基酸取代,使肽具有免疫原性,从而定义了癌症免疫监视的分子性质。在接下来的十年里,越来越多的实验室开展研究,证实癌症特异性肽由多种机制产生,而且免疫系统在控制肿瘤发生方面起着至关重要的作用。限制 T 细胞活化和功能的免疫检查点分子(如细胞毒性 T 淋巴细胞抗原 4 (CTLA4) 和程序性细胞死亡蛋白 1 (PD1))的发现导致了免疫检查点抑制剂的开发,这些抑制剂已证明细胞免疫在根除人类癌症方面具有巨大潜力 3 。然而,大多数癌症对检查点抑制剂和其他免疫疗法的抵抗力
虽然皮肤是主动免疫监视的部位,但原发性黑色素瘤经常逃脱检测。在这里,我们开发了一个计算机模型来确定黑色素瘤和朗格汉斯细胞 (LC) 之间的局部串扰,朗格汉斯细胞是黑色素瘤发展部位的主要抗原呈递细胞。该模型预测,黑色素瘤在肿瘤达到临界大小之前无法激活 LC 向淋巴结迁移,这由黑色素瘤内的正 TNF-α 反馈回路决定,这与我们对小鼠肿瘤的观察结果一致。计算机药物筛选,以及随后的实验测试,表明用 MAPK 通路抑制剂治疗原发性肿瘤可能会进一步阻止 LC 迁移。此外,我们的计算机模型预测了绕过 LC 功能障碍的治疗组合。总之,我们结合计算机和体内研究的方法提出了一种分子机制,可以解释早期黑色素瘤如何在 LC 的免疫监视下发展。
淋巴瘤细胞与其微环境的相互作用在疾病发病机制中起着重要作用,目前正积极利用免疫调节药物(包括免疫检查点抑制剂)进行治疗。弥漫性大 B 细胞淋巴瘤 (DLBCL) 是一种侵袭性高级别疾病,接受 R-CHOP 免疫化疗治疗的患者中约 40% 仍无法治愈。FOXP1 转录因子在这种高风险 DLBCL 中大量表达,我们最近确定了其对免疫反应特征的调节,特别是其对主要组织相容性 II 类 (MHC-II) 细胞表面表达的抑制,这在抗原呈递给 T 细胞方面起着关键作用。利用 CRISPR/Cas9 基因组编辑,我们已消除侵袭性小鼠 A20 淋巴瘤细胞系中的 Foxp1 表达。在 BALB/c 小鼠中生长时,该细胞系可提供高保真免疫功能正常的播散性淋巴瘤模型,该模型显示出人类 DLBCL 的许多特征。使用 siRNA 暂时消耗 Foxp1,使用 CRISPR(通过独立靶向 Foxp1 外显子 6 或 7 产生)稳定消耗 Foxp1,可上调细胞表面 IA b(MHC-II)表达,而不会损害体外细胞活力。Foxp1 消耗的 A20 克隆的 RNA 测序确定了常见的失调基因,例如 B 细胞标志物 Cd19,以及标志性的 DLBCL 特征,例如 MYC 靶标和氧化磷酸化。患有 Foxp1 消耗的 A20 淋巴瘤的免疫功能正常的动物生存率显著提高,20% 没有发展为肿瘤;与调节免疫监视一致,这在免疫缺陷的 NOD SCID γ 小鼠中没有观察到。A20 Foxp1 CRISPR 模型将有助于进一步表征 Foxp1 对淋巴瘤免疫逃避的贡献以及 Foxp1 靶向与其他免疫疗法产生协同作用的潜力。
摘要:免疫检查点抑制(ICI)已彻底改变了癌症治疗。但是,对ICI的反应通常仅限于选定的患者子集或不耐用的子集。对检查点抑制无反应性的肿瘤的特征是抗肿瘤免疫细胞的效果低和高度免疫抑制性肿瘤微环境。运动可促进免疫细胞循环并改善免疫监视。最近的研究结果表明,体育活动可以诱导免疫细胞对肿瘤微环境(TME)的动员和重新分布,从而增强了抗肿瘤免疫力。这表明锻炼对ICI的效率产生了有利的影响。我们的评论可深入了解肌肉,肿瘤和免疫细胞之间串扰的可能分子机制。它总结了有关运动诱导的对抗肿瘤免疫和ICI的影响的当前数据。我们将临床前和临床研究的设计挑战考虑,并讨论癌症类型,运动频率,强度,时间和类型(FITT)和免疫敏感性的作用,这是对运动引起的对癌症免疫监视的影响的关键因素。