XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System共价键
EDEM2 与 TXNDC11 稳定地形成二硫键，催化哺乳动物糖蛋白 ERAD 中的第一个甘露糖修剪步骤
摘要 N-糖链的连续甘露糖修剪（Man 9 GlcNAc 2 -> Man 8 GlcNAc 2 -> Man 7 GlcNAc 2 ）促进内质网相关错误折叠糖蛋白（gpERAD）的降解。我们在人类 HCT116 细胞中进行的基因敲除实验表明，EDEM2 是第一步所必需的。然而，之前的研究显示，纯化的 EDEM2 在体外对 Man 9 GlcNAc 2 不表现出 1,2-甘露糖苷酶活性。在这里，我们发现 EDEM2 与 TXNDC11 稳定地通过二硫键结合，TXNDC11 是一种含有五个硫氧还蛋白 (Trx) 样结构域的内质网蛋白。 EDEM2 甘露糖苷酶同源域之外的 C558 与 Trx5 中的 C692 相连，后者仅包含 TXNDC11 中的 CXXC 基序。这种共价键合对于 HCT116 细胞中的甘露糖修剪和随后的 gpERAD 至关重要。此外，从转染的 HCT116 细胞中纯化的 EDEM2-TXNDC11 复合物在体外将 Man 9 GlcNAc 2 转化为 Man 8 GlcNAc 2（异构体 B）。我们的研究结果确立了 EDEM2 作为 gpERAD 启动子的作用，并首次清楚地证明了 EDEM 家族蛋白的体外甘露糖苷酶活性。
定量分析和优化哺乳动物细胞中位点特异性蛋白生物结合
摘要：尽管有多种共价蛋白质修饰，但很少有用于定量细胞中蛋白质生物结合的技术。在这里，我们描述了一种通过与Halotag共价键形成在纤维素蛋白生物偶联中量化的新方法。这种方法利用不自然的氨基酸（UAA）诱变选择性地在蛋白质表面上安装小而生物串管的反应性手柄。我们利用了反电子二极管的快速动力学和高选择性 - 评估四嗪苯丙氨酸（TETF）与紧张的反甲环烯 - 氯酸酯（STCO-CA）（STCO-CA）和跨循环链烯（TETR-caclecten）（TETR-CATRE）的反应（TETF）与TETRECANE（TETRE）（TETER-CARORE（TETRE）。生物缀合后，叶绿素配体暴露于释放酶标记，以通过简单的蛋白质印迹分析直接定量生物缀合。我们证明了该工具的多功能性，以快速，准确地确定不同UAA/氯烷烃对的生物缀合效率以及对不同蛋白质的不同位点（包括EGFP和雌激素相关的受体ERR）的不同位点。■简介
人类神经干细胞的自我更新和分化之间的时间平衡需要淀粉样蛋白前体蛋白
青霉素结合蛋白（PBPS）的D，D-转肽酶活性是β-乳用于阻断肽聚糖多物种的β-乳酰胺抗生素的众所周知的主要靶标。β -lactam诱导的细菌杀死涉及复杂的下游反应，其原因和后果很难解决。在这里，我们使用β-乳酰胺不敏感的L，D- trans-肽酶对PBP的功能替代，以鉴定在积极分裂细菌中β-l -lactams在β -lactams灭活PBP所必需的基因。通过这种方法鉴定的179个有条理的基本基因的功能远远超出了肽聚糖聚合的L，D-转肽酶伴侣，包括包括参与胁迫反应的蛋白质和外膜外聚合物的组装。β-乳转酰胺的未引起的作用包括脂蛋白介导的共价键的丧失，该键将外膜与肽聚糖连接到肽聚糖，不动deptagi-lization，尽管有效地具有有效的肽聚糖交叉链接，并增加了外膜外膜的渗透性。后一种效应表明β-乳酰胺的作用方式涉及通过外膜自促进的穿透力。
三维纳米石墨烯与介孔锗的集成
摘要：石墨烯是用于改性物理化学表面性质的关键材料。然而，其平坦表面限制了需要高比表面积的应用。可以通过将二维材料集成到三维结构中来克服这一限制。本文介绍了一种石墨烯-介孔锗 (Gr-MP-Ge) 纳米材料的受控合成策略。分别采用双极电化学蚀刻和化学气相渗透对 Ge 基底进行纳米结构化，随后进行 3D 纳米石墨烯涂层。虽然拉曼光谱显示纳米石墨烯的域尺寸可随处理温度而调整，但透射电子显微镜数据证实 Gr-MP-Ge 的结晶度得以保留。X 射线光电子能谱表明，对于 Gr-MP-Ge，碳与 Ge 之间存在非共价键合。最先进的分子动力学建模可以通过自由基的存在更深入地了解合成过程。这种纳米材料的成功合成使得纳米石墨烯可以集成到具有高纵横比和轻重量的三维结构中，从而为这种多功能纳米材料的多种应用开辟了道路。
蛋白质 - 蛋白质结合：酪氨酸提供
蛋白质 - 肽和蛋白质 - 蛋白结合物的合成可能很棘手，这是由于带来化学选择性和现场挑战的蛋白质中的多样化化学功能。2生物正交化学的使用已成功克服了其中的一些挑战，但通常需要冗长的合成才能掺入不自然的氨基酸。同时，使用天然蛋白质功能的使用通常仅限于N-或C-termini，或者导致非选择性标记亲核残基（例如半胱氨酸或赖氨酸）。由于这些原因，人们非常有兴趣扩展允许仔细阐述蛋白质体系结构的方法的工具箱。在他们在ACS Central Science发表的最新作品中，由Francis，Doudna和Fellman领导的团队描述了一种耦合两种生物分子的方法，分别含有酪氨酸和半胱氨酸残留物。酶酪氨酸酶用于将暴露于溶剂的酪氨酸残基氧化为正质酮弹性基团。该组随后与硫醇轴承成分反应，从而导致两种底物之间形成新的共价键（图1）。这建立在团队以前在利用原位形成的奎因酮功能的经验上
IISER Bhopal Swarnajayanti 研究员将从事生物...
IISER 博帕尔 Swarnajayanti 研究员致力于蛋白质生物结合以促进药物发现 印度科学教育与研究学院博帕尔分校的 Vishal Rai 博士是印度科学技术部资助的著名 Swarnajayanti 奖学金获得者，他计划研究生物结合，这是一种可以改变药物发现的蛋白质生物工程颠覆性策略。该研究将涉及连接两个分子（其中至少一个是生物分子）以在它们之间形成稳定共价键的程序。Rai 博士建议开发一个化学平台，该平台可以提供浓度独立的化学选择性和位点选择性蛋白质单点修饰方法。蛋白质影响生物学、化学、生物材料和治疗学等交叉学科的各个科学方面。Vishal Rai 博士的研究小组已经开发出用于蛋白质精密工程的化学技术。此外，他们还参与了同质抗体-药物偶联物 (ADC) 的合成、蛋白质固定以及肽和蛋白质的分析工具。他的研究团队希望通过实现定向治疗并使未来的精准治疗成为可能，为社会做出贡献。
![arxiv：2501.12222v1 [cond-mat.supr-con] 2025年1月21日](/simg/g:\will\search\icon\source\7\7540757cbb28fe0de820db3d25a4a9a131a39337.webp)
arxiv：2501.12222v1 [cond-mat.supr-con] 2025年1月21日
我们使用开发的AI搜索引擎（Invdesflow）对环境稳定的超导氢化物进行了广泛的研究。一个立方结构li 2 auh 6具有Au-H八人体图案的auh 6被确定为候选者。进行热力学分析后，我们提供了可行的途径，以通过已知的LIAU和LIH化合物在环境压力下实验合成该材料。第一个原理计算表明，在环境压力下，Li 2 Auh 6显示了高超导过渡温度（T C）〜140 K。H-1的电子与Au-H八人体的振动和Li原子的振动的声子模式强烈，在其他以前类似的情况下，后者并未认真对待后者。因此，与以前搜索金属共价键以发现高t c超导体的主张不同，我们在这里强调了那些具有强电子偶联（EPC）的声子模式的重要性。，我们建议一个人可以插入二元或三元氢化物中，以引入具有强EPC的更多潜在的声子模式，这是一种有效的方法，可以在多组分化合物中找到高t c超导体。
配体构象偏差驱动 Hsp90 上表面暴露赖氨酸的对映选择性修饰
摘要：由于表面暴露的赖氨酸的固有反应性低且在整个蛋白质组中普遍存在，因此对其进行靶向共价修饰具有挑战性。优化可逆结合抑制剂 ( k inact ) 共价键形成速率的策略通常涉及提高亲电试剂的反应性，这会增加离靶修饰的风险。在这里，我们采用了一种替代方法来提高赖氨酸靶向共价 Hsp90 抑制剂的 k inact ，而不依赖于可逆结合亲电性 ( K i ) 或固有亲电性。从非共价配体开始，我们附加了一个手性、构象受限的连接体，它使芳基磺酰氟与 Hsp90 表面的 Lys58 快速且对映选择性地发生反应。共价和非共价配体/Hsp90 复合物的生化实验和高分辨率晶体结构提供了有关配体构象在观察到的对映选择性中的作用的机制见解。最后，我们展示了细胞 Hsp90 的选择性共价靶向，尽管共价配体/Hsp90 复合物同时降解，但仍会导致热休克反应延长。我们的工作突出了设计配体构象约束的潜力，可以大大加速蛋白质靶标表面远端、亲核性较差的赖氨酸的共价修饰。■ 简介共价抑制剂作为药物、细胞生物学工具和化学蛋白质组学探针具有广泛的用途。不可逆的共价修饰导致药物-靶标停留时间与靶蛋白的寿命相匹配，通常与药物清除率无关。 1、2 此外，共价抑制剂可以通过与配体结合位点内或附近的非保守亲核氨基酸反应来区分密切相关的旁系同源物。3 − 8 目标亲核试剂的选择性修饰由两步反应机制决定，其中配体的可逆结合先于共价修饰。可逆结合亲和力和最初形成的非共价复合物内共价键形成的速率 ( k inact ) 都会影响共价抑制剂的效力。9 增加 k inact 的一个明显方法是增强亲电试剂的固有反应性。这种方法的缺点是它增加了发生不良的脱靶反应的可能性。因此，共价抑制剂的优化主要依赖于最大化非共价识别元素的可逆结合亲和力。 10,11 迄今为止，快速作用、高选择性共价配体的设计主要集中在半胱氨酸上，部分原因是其高内在反应性允许使用相对不活泼的亲电试剂（例如丙烯酰胺）。12 − 14 然而，半胱氨酸是蛋白质组中最不常见的氨基酸之一，许多配体结合位点缺乏近端半胱氨酸。
超耐火过渡金属二硼化物陶瓷的致密化
doi:https://doi.org/10.2298/SOS2001001F UDK: 546.271；622.785；676.056.73 超耐火过渡金属二硼化物陶瓷的致密化 WG Fahrenholtz 1*）、GE Hilmas 1、Ruixing Li 2 1 密苏里科技大学，密苏里州罗拉 2 北京航空航天大学，北京，中国 摘要：回顾了过渡金属二硼化物的致密化行为，重点介绍了 ZrB 2 和 HfB 2 。这些化合物被认为是超高温陶瓷，因为它们的熔点高于 3000°C。过渡金属二硼化物的共价键很强，导致熔点极高，自扩散系数低，因此很难对其进行致密化。此外，粉末颗粒表面的氧化物杂质会促进颗粒粗化，从而进一步抑制致密化。20 世纪 90 年代之前的研究主要采用热压进行致密化。这些报告揭示了致密化机制，并确定有效致密化需要氧杂质含量低于 0.5 wt%。后续研究采用了先进的烧结方法，如放电等离子烧结和反应热压，以生产出接近全密度和更高金属纯度的材料。还需要进一步研究以确定基本的致密化机制并进一步改善过渡金属二硼化物的高温性能。关键词：过渡金属二硼化物；致密化；烧结；热压。1. 简介过渡金属二硼化物 (TMB2) 作为用于极端环境的材料已被研究多年。 1-7 多种 TMB2 被视为超高温陶瓷 (UHTC)，因为它们的熔点超过 3000°C，其中包括 TiB 2 、ZrB 2 、HfB 2 和 TaB 2。其他 TMB2，例如 OsB 2 和 ReB 2，作为新型超硬材料备受关注。8-10 TMB2 拥有不同寻常的性能组合，例如金属般的热导率和电导率以及陶瓷般的硬度和弹性模量，这是由共价键、金属键和离子键特性的复杂组合产生的。11-13 由于其性能，TMB2 被提议用于极端温度、热通量、辐射水平、应变速率或化学反应性，这些都超出了现有材料的能力。通常提到的 TMB2 的一些潜在应用包括高超音速航空航天飞行器、火箭发动机、超燃冲压发动机、轻型装甲、高速切削工具、熔融金属接触应用的耐火材料、核聚变反应堆的等离子体材料以及先进核裂变反应堆的燃料形式。5,14-22 TMB2 具有极高的熔化温度和硬度值，而同样的特性也使 TMB2 难以致密化。陶瓷材料的致密化可以通过多种方法实现。许多商用陶瓷都是通过无压烧结粉末加工方法制造的部件生产的。23-25有些陶瓷很难通过无压烧结致密化。
构建谷胱甘肽响应性紫杉醇前药纳米粒子用于图像引导靶向递送和乳腺癌治疗
以提高代谢稳定性和实时监测药物位置。基于多糖的纳米前药由于其成分清晰、结构准确、载药量稳定、抗肿瘤活性高而受到广泛关注。14,15壳聚糖（CS）是一种天然无毒的高分子材料，具有良好的生物降解性和生物相容性，被广泛应用于抗肿瘤药物的递送，用于癌症的诊断和治疗。16,17此外，CS具有大量的氨基（-NH 2）和羟基（-OH），是极好的功能化修饰位点。18如果将疏水性抗癌药物通过共价键直接偶联到亲水性聚合物链上，可以大大防止药物过早释放。然而，以壳聚糖为基础形成的阳离子纳米粒子不仅缺乏肿瘤靶向作用，而且易受血清蛋白介导的聚集和消除。19 透明质酸具有天然电负性，可用于包覆阳离子基纳米粒子。同时，透明质酸由于其低免疫原性，高生物相容性以及靶向肿瘤特异性表达受体（簇决定簇44，CD44）而被用于药物递送系统。20 因此，HA功能化的药物递送系统可以主动靶向癌细胞。21,22