解密基因组中的核苷酸如何编码调节指令和分子机器是生物学的长期目标。DNA语言模型(LMS)通过对每个核苷酸的序列上下文进行建模概率来隐式捕获功能元素及其组织。但是,由于缺乏可解释的方法,使用DNA LMS发现功能基因组元素一直在挑战。在这里,我们引入了核苷酸依赖性,该核苷酸依赖性量化了一个基因组位置的核苷酸取代如何影响其他位置核苷酸的概率。我们生成了动物,真菌和细菌种类千倍体范围内成对核苷酸依赖性的全基因组图。我们表明,核苷酸依赖性比序列比对和DNA LM重建更有效地表明了人类遗传变异的有害性。调节元素在依赖图中显示为密集块,从而可以准确地对转录因子结合位点的系统识别,就像在实验结合数据上训练的模型一样准确地识别。核苷酸依赖性还突出了RNA结构内接触的基础,包括伪诺和三级结构接触,精确地。这导致发现了四个小说,实验验证的RNA结构中的大肠杆菌。最后,使用依赖图,我们通过基准测试和视觉诊断来揭示几种DNA LM体系结构和训练序列选择策略的临界局限性。完全,核苷酸依赖性分析为发现和研究功能元件及其在基因组中的相互作用开辟了新的途径。
CRISPR-Cas系统的出现加速了基因编辑技术的发展,并在生命科学领域得到了广泛的应用。为了提高这些系统的性能,人们设计和开发了各种CRISPR-Cas工具,其靶标范围更广,效率和特异性更高,精度更高。此外,CRISPR-Cas相关技术也已扩展到DNA切割之外,通过引入功能元件来实现精确的基因修饰、控制基因表达、进行表观遗传改变等。在本文中,我们介绍和总结了不同类型的CRISPR-Cas工具的特点和应用,讨论了当前方法的某些局限性以及优化CRISPR-Cas系统的未来前景。
小型航天器航空电子设备 (SSA) 是指航天器平台中包含的所有电子子系统、组件、仪器和功能元件。这些主要包括飞行子元件命令和数据处理 (CDH)、飞行软件 (FSW) 和其他关键飞行子系统,包括有效载荷和子系统航空电子设备 (PSA)。所有这些都必须可配置到特定的任务平台、架构和协议中,并由适当的操作概念、开发环境、标准和工具管理。CDH 和 FSW 被认为是集成航空电子系统的大脑和神经系统,通常以某种方式提供与所有其他子系统的命令、控制、通信和数据管理接口,无论是直接点对点、分布式、集成还是混合计算模式。航空电子系统本质上是航天器上集成的所有组件及其功能的基础。由于任务的性质会影响航空电子架构设计,因此航空电子系统存在很大的可变性。
测量仪器的广义配置和功能描述:仪器的功能元件、测量误差:粗大误差和系统误差、绝对误差和相对误差、测量仪器和仪器系统的 I/O 配置 - 干扰和修改输入的校正方法。08 小时仪器的广义性能特征:静态特性:静态校准的含义、准确度、精密度和偏差、静态灵敏度、线性度、阈值、分辨率、滞后和死区。刻度可读性、跨度、广义静态刚度和输入阻抗、动态特性基础。06 小时电阻、电感、电容和 Q 因数的测量:惠斯通电桥、灵敏度分析、局限性、开尔文双电桥、麦克斯韦电桥、西林电桥、源和探测器、电桥屏蔽、Q 计。08 小时位移测量:位移测量原理、电阻电位器、电阻应变计、可变电感和可变磁阻拾音器、LVDT、电容拾音器、激光位移传感器。 06 小时
知识:功能基因组学:对功能基因组原理和应用的理解,包括调节基因活性,基因瘤结构和理解分子生物学的概念。高性能技术:有关转录组学,基因组编辑技术(例如CRISPR/CAS9)和基因组的知识,包括有关功能基因组学中使用的方法及其适用性的知识。多摩学数据集成:了解复杂基因调节网络分析的多摩变数据集成系统和技术的生物学。比较基因组学:关于分子进化,哲学和鉴定物种之间功能元件的观点。疾病中的功能基因组学:了解表型特征和复杂疾病的遗传基础,包括全球基因组关联(GWAS)及其功能性基因组整合和个性化医学。生物信息学:熟悉用于基因组数据分析的生物信息学工具,包括序列比对,基因组障碍和表观基因组数据分析。高级生物信息学工具:有关多摩尼亚数据集成的知识以及智能自动学习在个性化医学的基因组数据分析中的应用。横向技能(角色,专业发展,个人)
光电探测器是指能够将入射光转换为电信号的光电子器件,是环境监测、消防和安全、光通信、太空探索和视频成像等多个领域的重要功能元件[1,2]。光电探测器采用了不同类型的半导体材料,例如GaN、InGaAs、Si、ZnO、碳纳米管、共轭聚合物和量子点[3]。基于这些材料的器件需要复杂而昂贵的制造成本和机械刚性。在过去的十年中,金属卤化物钙钛矿材料因其在光伏和光电子器件中的广泛应用而引起了研究人员的极大兴趣[4]。由于其突出的高性能、低成本和溶液可加工性,这类材料已经成为未来大量光伏和光电子器件的潜在候选材料[5]。在众多可用的金属卤化物中,甲基铵碘化铅 (MAPbI 3 ) 已被广泛研究用于光伏和光传感应用 [ 6 ]。事实上,钙钛矿材料在光伏器件中已经实现了显著的效率,但这些太阳能电池
随着物联网 (IoT) 的快速发展和 5G 的引入,传统的硅基电子产品已无法完全满足市场需求,例如由于机械不匹配导致的非平面应用环境。这为使用柔性材料避免物理刚性的柔性电子产品带来了前所未有的可能性。丝素蛋白、纤维素、果胶、壳聚糖和黑色素因其出色的生物相容性和生物降解性而成为下一代柔性电子产品最有吸引力的材料之一。丝素蛋白在生物相容性和生物降解性方面优于它们,并且还具有多种其他理想特性,例如可调节的水溶性、出色的光学透射率、高机械弹性、重量轻和易于加工,而这些特性是其他材料部分或完全不具备的。因此,丝素蛋白已成为生物相容性柔性电子产品最广泛使用的构建块之一,尤其是用于可穿戴和可植入设备。此外,近年来,丝素蛋白的功能特性研究也越来越受到重视,如介电特性、压电特性、高失电子倾向性、环境敏感性等。本文不仅介绍了不同种类丝素蛋白的制备技术以及丝素蛋白作为基础材料应用的最新进展,还介绍了丝素蛋白作为功能元件的最新进展。本文还对丝素蛋白基柔性电子产品面临的挑战和未来发展进行了探讨。
全基因组测序 (WGS) 在医疗保健和研究中的应用日益广泛,使我们能够识别非编码区域中的大量变异,从而激发了近年来人们对这些非编码变异及其生物学意义的兴趣。越来越多的证据表明,功能性非编码变异可能是外显子组测序队列中遗传性缺失的原因,其中很大一部分患者未得到分子诊断(74)。值得注意的是,全基因组关联研究 (GWAS) 发现的近 90% 的疾病相关变异位于非编码区域,它们富含转录调控元件 (TRE),可能通过扰乱基因调控发挥作用(81)。尽管非编码变异在人类疾病中发挥着至关重要的作用,但由于我们对非编码区域的了解有限,对非编码变异的解释和优先排序长期以来一直受到阻碍。大型联盟(如 ENCODE (32) 和 FANTOM5 (5))和独立研究小组在这一未知领域对潜在功能元件进行注释方面取得了巨大进展。在这篇综述中(图 1),我们首先讨论了调控格局的各种注释,以及这些努力如何帮助解读非编码变异的生物学影响。然后,我们描述了通过整合这些功能注释来确定非编码变异优先次序的生物信息学工具的进展。最后,我们提出了一系列实验分析来评估候选变异的调控潜力。
基因组注释是一项具有挑战性的工作,其目的不仅是描述蛋白质编码和非编码基因目录,还包括参与基因表达调控、维持基因组完整性和跨代基因组传递的其他功能元件。最近的技术发展通过提供转录、翻译、染色质状态和三维构象等的大规模评估,极大地改进了注释过程。因此,可以轻松获得各种生化活动的全基因组图谱。然而,生化活性并不等同于生物功能,许多活性基因组元件实际上可能是可有可无的。基因组编辑技术可以更直接地测试生物功能,但仍然成本高昂、耗时,并且在很大程度上局限于可以在实验室中观察到的表型。在这种情况下,进化方法对于功能基因组注释来说是一项重要的资产,它可以识别在净化选择下保留现有功能的基因组区域,或在获得新生物学角色后在正向选择下保留的基因组区域。虽然进化分析无法确定精确的生物学功能,但它们可用于测试多个层面的功能,通过评估对初级 DNA 或 RNA 序列、二级 RNA 结构、转录水平或模式、转录因子结合位点等的选择压力。。。在这里,我回顾了系统基因组学方法对基因组注释的已证实和潜在贡献,重点关注如何将这些方法与分子生物学和遗传学的见解相结合,以提供功能基因组景观的全面图像。
印刷电子是一个充满活力的研究和技术领域,可获得按需功能元件。[1–3] 近年来,已报道了具有半导体、[4] 光电、[5] 储能[6] 和磁性 [7] 特性的印刷电子。特别是印刷磁阻传感器已证明其作为非接触式电磁开关 [8,9] 和非接触式交互式皮肤平台的相关性。[10] 这些磁敏感复合材料是通过将铁磁磁阻 (MR) 颗粒或薄片分散在各种凝胶状或热塑性粘合剂溶液中而制成的(表 1)。[9–17] 虽然这些贡献在过去十年中显著推动了该领域的发展,但由于组成颗粒或薄片的复杂性和高生产成本,这些技术的大规模应用仍未实现。表现出高达 37% 的巨磁电阻效应 (GMR) 的薄片由多层异质结构组成,需要逐层沉积亚纳米厚的薄膜。[9–13] 需要精确调整层的厚度以实现可测量的磁阻变化。这导致表现出 GMR 的粉末的生产成本增加。为了解决 GMR 粉末的可扩展性问题,采用了表现出各向异性磁阻 (AMR) 的商品可用铁磁材料颗粒。[14] 然而,测得的 AMR 效应降低到 0.34%。此外,这些 MR 技术通常在 500 mT 以下的磁场下具有线性响应,并且在此之外几乎不敏感。缺乏一种具有强磁阻信号并在宽磁场范围内工作的可打印商品级材料。使用打印技术瞄准更广泛的磁场可以实现新型低成本技术解决方案,从非接触式开关应用到机械的工业监控。采用传统的印刷方法实现大规模生产和高磁场下的线性响应需要新材料的开发。