单位 - 3:微生物技术14 H培养基:细菌的营养需求,培养基的成分。天然和合成媒体,化学定义的培养基,复杂的培养基,选择性,差异和丰富的培养基。纯文化方法:细菌的隔离,培养,鉴定和保存以及伴侣稀释和镀铜方法(倒,散布,条纹)。厌氧菌的培养。纯文化的维护和保存/库存。染色和染色技术:染色原理,细菌染色技术 - 简单染色和差异染色(革兰氏染色和抗酸性染色)。类型的污渍简单污渍和差分污渍。细菌计数技术 - 板(菌落)计数和浊度法。
因子:一种因素,如微生物、化学物质或辐射形式,其存在、过量存在或(在缺乏疾病中)相对缺失对于疾病的发生至关重要。厌氧菌:在缺氧条件下生长最好的生物。专性厌氧菌只能在缺氧条件下生长。分析流行病学:流行病学中寻找与健康相关的原因和影响的方面。使用提供基线数据的比较组来量化暴露与结果之间的关联,并检验有关因果关系的假设。分析研究:旨在识别和量化关联、检验假设和识别原因的比较研究。两种常见类型是队列研究和病例对照研究。抗毒素:含有针对特定毒素的抗体并中和毒素作用的药物。注射抗毒素并不总能使患者完全康复,因为抗毒素(如肉毒杆菌抗毒素)可能只与循环毒素结合,而不与已经与组织结合的毒素结合。 关联:两个或多个事件、特征或其他变量之间的统计关系。 发病率:发病率的一种变体,适用于在有限时间内观察到的狭义人群,例如在流行病期间。 B 条形图:变量不同类别大小的直观显示。变量的每个类别或值都用一个条形表示。 偏差:结果或推论与事实的偏差,或导致此类系统偏差的过程。数据收集、分析、解释、发布或审查过程中的任何趋势都可能导致得出与事实有系统差异的结论。 生物传播:传染源的间接媒介传播,其中病原体在传播给新宿主之前在媒介内发生生物学变化。沸腾:沸腾发生在 100 C(或 212 F)。C 携带者:没有明显疾病的人或动物,但携带特定传染源并能够将传染源传播给他人。携带者状态可能发生在
链球菌是非运动型,微粒细胞,革兰氏阳性的球形细菌(COCCI)。它们通常是作为链或成对出现的,可能是兼职或严格的厌氧菌。过氧化氢酶测试为阴性(葡萄球菌是过氧化氢酶阳性),并且链球菌无法合成细胞色素(无氧化磷酸化)。链球菌能够发酵糖,但是最终产物始终是乳酸。因此,它们具有非常酸的耐受性,并在乳酸菌组中分类。链球菌的自然来源很广。他们被发现居住在人类和许多不同的动物中,并且经常被发现在口腔,肠道,鼻孔和咽部的粘膜表面定植。在饮用水中,链球菌是粪便污染的指标。
关于土壤中微生物寿命的讨论通常集中在细菌和较小程度的放线菌(一组专业的厌氧菌细菌)上。这部分是由于在土壤中发现的细菌和放线菌的种群通常比所有其他微生物寿命都大,其次是由于对有益细菌的广泛了解可以添加到农作物系统中。经常被排除在讨论之外的是其他微生物,例如真菌,原生动物和线虫,它们在土壤健康中都具有关键作用。虽然在英亩的犁沟中发现的真菌,原生动物和线虫(6英寸深度x 1英亩)被细菌和放线菌在种群中矮小,它们对土壤的微生物生物量比较大的种群贡献更多(表1)。虽然土壤应用的农产品添加真菌,原生动物和线虫很少见,但重要的是要了解这些微生物物种在植物营养和土壤健康中的重要性。
阴道是一种湿生物体,包括一个由几种类型的微生物定植的复杂生态系统[1]。döderlein杆菌或乳酸杆菌是育儿健康妇女的阴道菌群中的大多数细菌[2]。已经进行了许多研究,其中一些结论是,该综合生态系统主要由属于乳酸属的物种主导[3]。这种曲线的不平衡会导致阴道病[4]。细菌性阴道病首先由Schröder于1921年描述。他注意到营养不良的特征是乳脂核酸的降低,阴道粘膜的pH值增加以及主要是革兰氏阴性厌氧菌细菌(例如Gardnerella cardnerella cagnnerella cagnnerella cartnerella cartnerella cartnerellias cartnerella curnobobium paginae and Mobiluncus curtisii [5,5,6])。人类阴道微生物群在
纤维化,以及四个主要驱动基因(KRAS,TP53,CDKN2A /P16,SMAD4)的改变。结果使用QPCR和ISH将肿瘤内细菌的存在固定在52个肿瘤中(32%)。16S元基因组测序揭示了这些肿瘤内的特征性剖面,包括蛋白质细菌和坚果类的门。比较良好和预后良好的病例之间的细菌核对文件表明,较短的生存时间与厌氧细菌(例如bacte-roides,乳酸杆菌和peptoniphilus)之间存在显着的正相关。这些细菌的丰度与CD4,CD8和CD45RO阳性的肿瘤浸润T细胞的减少相关。结论厌氧菌细菌(例如菌孢子,乳酸杆菌和peptoniphilus)的肿瘤内感染与抑制的抗PDAC免疫和不良预后有关。
气候变暖预计将迅速改变高纬度泥炭地系统的局部环境条件。这项研究探索了土壤呼吸速率,沿着从排水良好的高地森林到北部北方北方的泥泥泥面的样带。我们发现,在20°C下孵育的高地森林和间植入栖息地通常产生的厌氧菌Co 2比冷却器孵化温度组(0,4°C)多,而最初的土壤碳含量是强大的地球化学和物理参数,与掺杂的CO 2相关,与此140天的掺杂相关。有趣的是,沼泽样品是此的例外,并且在较冷的温度下更有生产力。这意味着沼泽中厌氧CO 2产生的控件与周围习惯的土壤中的控件不同。沿其他参数(例如土壤碳含量),这一发现可以使对高植酸土壤中潜在的碳生产有更大的见解。
生态系统是一个具有生命和非生存部分的系统。四个Winogradsky柱每个都有自己的生态系统。每列的营养素和/或光的可用性都不同,因此,每列中不同的微生物物种繁荣起来。随着时间的流逝,Winogradsky柱中应形成不同营养素的可用性逐渐变化。这些差异会影响不同微生物在色谱柱内生长的地方。例如,随着时间的流逝,空气旁边的圆柱顶部的氧气多于底部。这意味着可以耐受或产生氧气的微生物将位于顶部。微生物无法忍受游离氧(称为厌氧菌)将进一步下降。同样,需要光来制造能量的微生物(通过光合作用或类似的过程)需要生活在可以在列中获得光的地方。
某些厌氧菌需要添加维生素K和Hemin(1,2)才能生长。因此,建议将硫代糖果培养基和维生素K用于分离和培养临床材料中存在于临床材料中存在的刺激性或缓慢增长的强制性厌氧微生物。也建议将多种有氧和辅助厌氧微生物分离和培养。色氨酸和酵母提取物提供氮化合物,维生素B复合物以及其他必要的生长养分,可用于细菌代谢。硫代基酸钠和l-cyst ine充当减少剂并在培养基中保持低氧张力。维生素K是某些prevotella黑色素毒素菌株的生长需求。顶部的粉红色环(氧化培养基)是由于硫唑蛋白指示剂引起的。hemin是X因子的来源,它刺激了许多微生物的生长。
摘要 微生物学领域传统上侧重于在群体水平上研究微生物。然而,包括微流体和成像技术在内的单细胞水平方法的应用揭示了群体内的异质性,使得这些方法对于以更高的分辨率了解细胞活动和相互作用至关重要。此外,单细胞分选为从微生物群体或复杂的微生物群落中分离感兴趣的细胞开辟了新途径。这些分离的细胞可以在下游的单细胞“组学”分析中进一步研究,提供生理和功能信息。然而,由于厌氧微生物对氧气敏感,将这些方法应用于原位条件下的研究仍然具有挑战性。在这里,我们回顾了现有的在单细胞水平上分析活体厌氧微生物的方法,包括活体成像、细胞分选和微流体(芯片实验室)应用,并解决了它们在缺氧操作中遇到的挑战。此外,我们还讨论了针对厌氧菌的非破坏性成像技术的开发,例如不依赖氧气的荧光探针和替代方法。