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肺外低分化 NEC，包括分子和免疫方面
患有肺外低分化神经内分泌癌 (EP-PD-NEC) 的患者预后不良。对于局部疾病患者可以进行手术，但大多数患者在出现症状时已处于晚期。所采用的治疗策略与肺部高级别 NEC 类似，对于晚期疾病，一线治疗建议使用铂类/依托泊苷类方案。目前尚无标准的二线疗法。对其分子和免疫途径的研究可能为新型药物的研发铺平道路。NEC 的分子驱动因素在小细胞肺癌中最为常见，其表现为 TP53 和 RB1 的近乎普遍的基因组改变。EP-PD-NEC 的遗传学仍然知之甚少；已发现 TP53 、 KRAS 、 PIK3CA/PTEN 和 BRAF 突变，此外还报告了宫颈小细胞 NEC 中 BRCA 通路的改变以及膀胱 NEC 中精氨酰琥珀酸合成酶 1 表达的缺失。我们还将探索使用细胞系和患者来源的异种移植 (PDX) 来预测 NEC 对治疗的反应以及替代生物标志物的出现，例如循环肿瘤细胞和无细胞 DNA。尽管关于 EP-NEC 免疫微环境的已发表数据有限，但仍有许多临床试验在研究免疫靶向药物在该疾病类别中的使用，迄今为止的研究数据相互矛盾。本综述将总结这种研究不足的诊断的治疗方法和可用的分子和免疫数据，并可能激发未来探索性研究的方向。
使用 CRISPR-Cas9 核糖核蛋白复合物编辑康乃馨中的乙烯生物合成基因。
摘要 本研究利用CRISPR/Cas9核糖核蛋白（RNP）复合体系统对康乃馨乙烯（ET）生物合成基因[1-氨基环丙烷-1-羧酸（ACC）合成酶1（ACS1）和ACC氧化酶1（ACO1）]进行编辑。首先，验证靶基因（ACS1和ACO1）的保守区域，以生成不同的单向导RNA（sgRNA），然后使用体外切割试验验证sgRNA特异性切割靶基因的能力。体外切割试验表明，sgRNA在切割各自的靶区域方面具有很高的效率。将sgRNA：Cas9复合物直接递送到康乃馨原生质体中，并对原生质体中的靶基因进行深度测序。结果表明，sgRNA 适用于编辑 ET 生物合成基因，因为 ACO1 的突变频率范围为 8.8% 至 10.8%，ACS1 的突变频率范围为 0.2–58.5%。在对用 sgRNA：Cas9 转化的原生质体产生的愈伤组织中的目标基因进行测序时，在 ACO1 中发现了不同的 indel 模式（+ 1、- 1 和 - 8 bp），在 ACS1 中发现了不同的 indel 模式（- 1、+ 1 和 + 11）。这项研究强调了 CRISPR/Cas9 RNP 复合物系统在促进康乃馨 ET 生物合成的精确基因编辑方面的潜在应用。关键词 愈伤组织，CRISPR/Cas9，乙烯生物合成基因，Indel 模式，体外裂解，原生质体
RSC化学生物学
选择性抑制剂。因此，需要采用替代方法来推进与半胱氨酸以外的残基结合的小分子调节剂。8,9 硫（VI）-氟化物交换（SuFEx）化学已显示出作为合成可点击中心 10 和化学生物学平台的巨大前景，在药物发现中具有重要的应用价值。11,12 特别是，已证明掺入小分子配体的磺酰氟和氟硫酸盐亲电弹头可以位点选择性地修饰细胞中不同蛋白质的多个残基，包括酪氨酸、赖氨酸和丝氨酸。11,12 尽管组氨酸在蛋白质活性位点中占主导地位，但其靶向性研究相对不足，1,9 由于其两性性质，通常充当酸碱催化剂，或作为 RNA/DNA 结合蛋白中的催化亲核试剂。13,14 组氨酸在蛋白质结合位点中也经常靠近药物和类药物分子。 15 共价 ATP 模拟物 5 0 -氟磺酰基苯甲酰 5 0 -腺苷 (FSBA) 优先标记酪氨酸和赖氨酸，此前已发现它偶然与线粒体 F 1 -ATPase 酶中的组氨酸残基结合。16 还发现，一种功能重要的组氨酸与鼠伤寒沙门氏菌 5-磷酸核糖基-α-1-焦磷酸 (PRPP) 合成酶的结合口袋中的 ATP 相互作用，并被 FSBA 标记。17 这些偶然的发现证明了磺酰氟修饰组氨酸侧链的潜力，18
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摘要这项研究的目的是对来自波兰北部的一个地理位置收获的蜂蜜的全基因组分析和评估细菌分离株的抗菌潜力。总共源自三个蜂蜜样品，总共获得了132个菌株，CFAM的抗菌活性（无细胞后培养培养基）用作菌株选择和详细基因组研究的标准。两个测试的分离株（SZA14和SZA16）被归类为帕拉酸芽孢杆菌，基于其ANI和系统发育分析的相关性，一个分离株（SZB3）为枯草芽孢杆菌。分离株SZA14和SZA16是从相同的蜂蜜样品中收获的，核苷酸同一性为98.96％。已经发现所有三个分离株都是不同抗菌化合物的潜在生产者。二次代谢产物基因组挖掘管道（抗石）鉴定了14个基因簇编码为非核糖体肽合成酶（NRP），Polyketide合酶（PKSS）和核糖体合成的核糖体合成和核糖体合成的，并且是经过转化的肽（Ripps），这些肽是新型替代品的替代品。Bagel4分析揭示了分离株SZA14和SZA16中有九个假定的基因簇（包括两个分离物中存在的六个类似的簇，编码肠球菌NKR-5-3B，Haloduracin-alpha，sonorensin，sonorensin，bottromycin and comx2，comx2，comx2，comx2，comx2，suloduracin-alloduracin- SZB3（能力因子，孢子杀伤因子，枯草脂蛋白A和乙酰肽）。这项研究的结果证实了蜂蜜衍生的芽孢杆菌属。菌株可以被认为是各种抗菌剂的潜在生产者。
木制rapa孤儿基因在很大程度上影响可溶性糖代谢
摘要孤儿基因（OG S）是特定分类群独有的基因，在原代新陈代谢中起着至关重要的作用。然而，对于我们先前的研究中鉴定出的铜管rapa og s（brog s）的功能意义知之甚少。为了研究其生物学功能，我们在拟南芥中开发了43个基因的Brog过表达（Brog OE）突变库，并评估了植物的表型变异。我们发现43个Brog OE突变体中有19个表现出突变体表型，而42个显示出可变的糖含量。选择了一个突变体Brog1 OE，具有显着升高的果糖，葡萄糖和总糖含量，但蔗糖含量降低，以进行深度分析。Brog1 OE显示出拟南芥合成酶基因（ATSUS）的表达和活性降低；但是，转化酶的活性没有变化。In contrast, silencing of two copies of BrOG1 in B. rapa, BraA08002322 ( BrOG1A ) and BraSca000221 ( BrOG1B ), by the use of an ef fi cient CRISPR/Cas9 system of Chinese cabbage ( B. rapa ssp.campestris）由于brsus1b，brsus3的上调，果糖，葡萄糖和总可溶性糖含量降低，并且特定于编辑的Brog1转基因线中的BRSUS5基因。此外，我们观察到蔗糖含量增加和Brog1突变体中的SUS活性，转化酶的活性保持不变。因此，Brog1可能以SUS依赖性方式影响了可溶性糖代谢。这是研究Brog S在可溶性糖代谢方面的功能的第一份报告，并强化了OG S是营养代谢的宝贵资源的观念。
药物重新利用的屏幕将vidofludimus钙和吡afur蛋白识别为开发肝炎干预措施的新型化学实体
乙型肝炎病毒（HEV）感染会引起严重的并发症和高死亡率，尤其是在孕妇，器官移植受者，患有肝病的患者和免疫抑制患者。但是，仍然有未满足的治疗慢性HEV感染的需求。在此，我们筛选了一个由262种药物/化合物组成的一流的药物重新利用库。筛选后，我们将钙钙和吡af舌蛋白识别为新型抗HEV实体。vido流胞菌钙是在3期管道中的下一代二氢二甲酸酯（Dhodh）抑制剂，用于治疗自身免疫性疾病或SARS-COV-2感染。pyr- azofurin选择性靶向尿苷单磷酸合成酶（UMP）。在一系列具有野生型HEV菌株和利巴韦林治疗失败相关的HEV菌株的细胞培养模型和人肝脏器官中，进一步研究了它们的抗HEV效应。令人鼓舞的是，两种药物都表现出对HEV的较大治疗窗口。例如，Vido钙钙的IC 50值比患者目前的治疗剂量低4.6 - 7.6倍。从机械上讲，它们的抗HEV作用方式取决于吡啶胺合成的阻塞。值得注意的是，两种药物可牢固抑制利巴韦林治疗与HEV突变体（Y1320H，G1634R）。它们与IFN-α的组合产生了协同的抗病毒活性。总而言之，我们确定了Vido钙钙钙和吡af舌蛋白是治疗HEV感染的有效候选者。基于其抗病毒效力，也是临床研究中确定的有利安全性，我们的研究支持临床研究的开始，以重新利用这些药物来治疗慢性肝炎。
自身免疫性炎症性肌病的抗体疗法
摘要 炎症性肌病是罕见疾病，包括多发性肌炎 (PM)、皮肌炎 (DM)、包涵体肌炎 (IBM)、坏死性肌病 (NM)、抗合成酶综合征 (ASS) 和重叠性肌炎 (OM)，简称肌炎。所有形式的肌炎都具有进行性肌肉无力的共同特征，每种亚型都具有不同的自身抗体谱、组织学发现和肌外表现。由于对肌炎肌肉炎症发病机制的了解越来越深入，人们发现了新的靶向治疗分子途径。当前的治疗方法针对先天性或适应性免疫反应的不同成分。此外，肌炎中的非炎症机制已成为可能的治疗靶点。各种临床研究都对治疗性抗体在肌炎中的应用进行了检验，其中一些是随机对照研究：利妥昔单抗消除 B 细胞已被证实可作为难治性肌炎的治疗方法。 IVIG 是一种广义上的抗体疗法，在最近的一次临床试验中取得了积极的效果，现已获准用于治疗糖尿病。英夫利昔单抗、西法木单抗和比马鲁单抗的随机试验报告了负面研究结果。巴利昔单抗和依库珠单抗的研究目前正在进行中，预计将在几年内产生结果。尽管抗体疗法在肌炎方面的临床研究取得了一些令人鼓舞的结果，但进一步的研究对于优化这种使人衰弱的疾病的治疗和为难治性患者找到治疗替代方案至关重要。
鉴定色氨酸代谢 - 阿尔茨海默氏病免疫和免疫疗法中相关的基因
最近的研究强调了色氨酸代谢在阿尔茨海默氏病（AD）的发病机理中的显着参与。然而，仍然缺乏对色氨酸代谢在AD背景下的确切作用的全面研究。这项研究采用生物信息学方法来识别和验证与AD相关的潜在色氨酸代谢相关基因（TRPMG）。通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）测试和17种已知的色氨酸代谢途径的交点促进了TRPMG的发现。随后，使用基因集变异分析（GSVA）阐明了TRPMG的推定生物学功能和途径。此外，采用最低绝对收缩和选择算子（LASSO）方法来识别枢纽基因并评估5个TRPMG在区分AD时的诊断效率。还研究了轮毂TRPMG与临床特征之间的关系。最后，使用APP/PS1小鼠对五个TRPMG进行体内验证。我们确定了与AD相关的5个TRPMG，包括丙酰辅酶A羧化酶亚基β（PCCB），TEA结构域转录因子1（TEAD1），苯基丙烷基TRNA合成酶亚基β（FARSB），Neurofascin（NFASC）（NFASC）和EZRIN（EZRIN（EZRIN）。在这些基因中，PCCB，FARSB，NFASC和TEAD1与年龄相关。在APP/PS1小鼠的海马中，我们观察到FARSB，PCCB和NFASC mRNA表达的下调。此外，在APP/PS1小鼠的脑皮质和海马中，PCCB和NFASC蛋白表达也被下调。我们的研究为未来的研究铺平了道路，旨在揭示AD中色氨酸代谢失调及其治疗意义的复杂机制。
探索生物活性化合物起源：分析基因簇标记与埃塞俄比亚sof umer洞穴中的生物合成有关
EBI2受体的内源配体，氧化酚7α，25OHC，至关重要的免疫反应，受CH25H，CYP7B1和HSD3B7酶的细节调节。淋巴样细胞和T细胞卵泡中的卵泡树突状细胞保持7α，25OHC的梯度，基质细胞增加，树突状细胞降低了其浓度。该梯度对于淋巴组织中适当的B细胞定位至关重要。在多发性硬化症的动物模型中，实验性自身免疫性脑脊髓炎，7α的水平，25OHC迅速增加了中枢神经系统的迅速增加，驱动EBI2通过血脑屏障（BBB）表达免疫细胞的迁移。要探索脑中的血管细胞是否表达这些酶，我们检查了正常的小鼠脑微孔塞尔，并研究了它们在炎症过程中表达的变化。EBI2在内皮细胞，周细胞/平滑肌细胞和星形胶质细胞端层中大量表达。CH25H，CYP7B1和HSD3B7在每种细胞类型中都被多样检测，这表明它们在氧化酚7α，25OHC合成和在不同条件下的梯度维持和梯度维持。在EBI2中出现了明显的物种特异性差异以及小鼠和人类BBB形成细胞之间的酶水平。在急性炎症条件下，EBI2和合成酶调节下发生在大脑中，基于酶的大小和方向。最后，在体外星形胶质细胞迁移模型中，CYP7B1抑制剂氯吡唑以及EBI2拮抗剂NIBR189抑制了脂多糖诱导的细胞迁移，表明EBI2及其在炎症下脑细胞迁移的脑细胞迁移中的配体受到了侵略。
从工业铜生物渗透环境分离到硫酸盐的瘦螺螺属铁中的渗透反应
铁和硫化微生物在几种自然和工业过程中起着重要作用。卵螺旋体（L.）铁皮氏菌是一种铁氧化的微生物，具有明显的适应性，可在极端的酸性环境中蓬勃发展，包括堆的生物渗透过程，酸性矿山排水（AMD）和天然酸性水。从智利北部的工业生物渗透过程中分离出了牛皮乳杆菌（IESL25）的菌株。该菌株挑战以增加硫酸盐浓度的生长，以评估蛋白质表达谱，细胞形状的变化并确定潜在的兼容溶质分子。结果揭示了三种蛋白质的变化：琥珀酸COA（SCOA）合成酶，异氯酸盐脱氢酶（IDH）和天冬氨酸半二氢脱氢酶（ASD）；当菌株以硫酸盐浓度升高时，它们显着表达。ASD在兼容溶质纤维蛋白的合成中起关键作用，该溶质纤维蛋白与羟基切除素一起使用矩阵辅助激光解吸/飞行质谱法的电离时间（MALDI-TOF）。IDH，SCOA和骨蛋白产生之间的关系可能是由于TCA循环引起的，在该周期中，这两种酶产生的代谢产物可以用作前体或中间体的生物合成。此外，在硫酸盐应激条件下生长时，观察到了甲乳杆菌IESL25中不同的丝状细胞形态。这项研究强调了在高硫酸盐水平的存在下可能会发现甲乳杆菌可能的细胞反应的新见解，这通常是在硫化物矿物质或AMD环境的生物含量中发现的。