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在人类原代 B 细胞中高效 CRISPR-Cas9 介导基因敲除，用于 Epstein-Barr 病毒感染的功能遗传学研究
基因编辑现在已成为所有原核和后生动物细胞的常规技术，但在不到十年前 CRISPR-Cas9 技术被引入哺乳动物细胞生物学领域时，它在免疫细胞中并未受到太多关注。这种多功能技术已成功应用于人类髓系细胞和 T 细胞等的基因修饰，但应用于人类原代 B 细胞的情况很少，且仅限于活化的 B 细胞。这一限制阻碍了对这种细胞类型的细胞活化、分化或细胞周期控制的结论性研究。我们报告了在原代静息人类 B 细胞中进行高效、简单和快速的基因组工程，使用 Cas9 核糖核蛋白复合物的核转染，然后在 CD40 配体饲养细胞上进行 EBV 感染或培养以驱动体外 B 细胞存活。我们提供了使用两个模型基因在静止人类 B 细胞中进行基因编辑的原理证明：CD46 和 CDKN2A。后者编码细胞周期调节因子 p16 INK4a
先天免疫中NF-κB反应的动态调节
摘要：后生动物已经制定了保护自己免受致病攻击的策略。这些保存的机制构成了由先天和适应性反应组成的免疫系统。在两种类型中，先天免疫系统涉及快速反应的激活。NF-κB信号通路在感染过程中被激活，并导致及时控制的免疫反应基因的表达。然而，当不符合措施时，NF-κB途径的激活可能是有害的。他们的调节对于防止炎症性疾病或癌症的发展是必要的。介导昆虫和哺乳动物中免疫机制的NF-κB途径的相似性使果蝇Melanogaster成为研究先天免疫反应和学习一般机制的合适模型，这些模型也与人类相关。在这篇综述中，我们总结了中央NF-κB轨道的动态调节的了解，并详细介绍了IMD途径的分子水平。我们报告了核蛋白Akirin在NF-κB调节中的作用。果蝇模型的使用允许理解该中央NF-κB途径的细节调节。
植物免疫中的信号
所有真核生物都使用免疫系统来保护自己免受潜在病原体的侵害。植物免疫系统由两个特性感知层组成：一种利用细胞表面模式识别受体（PRR）来感知细胞外免疫原性模式，而另一个依赖于细胞内核苷酸结合的葡萄丁式重复（NLR）的受体（nlr）的受感染性受体受usefec-the Cyrec-the the the the the the joins＆joins＆the the joins and t＆nectrec-the the the joins＆the the joins＆the the joins＆joins and the joins＆joins and。In the first layer of the plant immune system, apoplastic immuno- genic elicitors such as pathogen-, microbe-, damage-, or herbivore- associated molecular patterns (PAMPs, MAMPs, DAMPs, or HAMPs, respectively) or immune-modulating peptide phytocytokines are recognized by PRRs, which leads to defense responses termed pattern-triggered immunity （PTI）（Boller＆Felix，2009; Yu等，2017; Defalco＆Zipfel，2021）。迄今为止描述的所有植物PRR是受体激酶（RKS）或受体蛋白（RPS）（Boutrot＆Zipfel，2017; Albert等，2020）。rks的特征是结构域的结构让人联想到后生受体酪氨酸激酶（RTKS）（Defalco＆Zipfel，2021）；也就是说，配体结合细胞外域（ECD），单跨跨膜螺旋（TM）和
海平面控制Ediacaran
Ediacaran-Cambrian后生动物辐射的驱动因素仍然不清楚，记录的保真度也是如此。We use a global age framework [580–510 million years (Ma) ago] to estimate changes in marine sedimentary rock volume and area, reconstructed biodiversity (mean genus richness), and sampling intensity, integrated with carbonate carbon isotopes ( δ 13 C carb ) and global redox data [carbonate Uranium isotopes ( δ 238 U carb )].采样强度与总体平均重建的生物多样性> 535 MA相关，而二阶（〜10–80 mA）全球侵出性回归周期控制了不同海洋沉积岩的分布。Avalon组合的时间分布部分受到深入海洋硅质碎石岩石的时间和空间限制的记录。定义Avalon，White Sea和Cambrian组合的后代形态群的连续升高似乎与δ13C Carb Maxima处的全球浅海洋氧合事件相吻合，该事件先于主要海平面传播。虽然生物多样性的记录有偏见，但早期的后代辐射和氧合事件与主要的海平面周期有关。
果蝇中先天免疫的类固醇激素调节Melanogaster
au：PleaseConfirmThatalleadingLevelSarerePresentedCorrectly：内分泌信号网络控制着多种后生动物的各种生物学过程和生活历史特征。在无脊椎动物和脊椎动物分类群中，类固醇激素调节免疫系统的功能，响应内在和环境刺激（例如微生物感染）。这种内分泌 - 免疫调节的机制是复杂的，并构成了正在进行的研究促进基因动物模型所促进的努力。20-羟基丁香（20E）是节肢动物中的主要类固醇激素，主要研究其在介导发育过渡和变质中的重要作用。 20E还可以调节各种昆虫类群中的先天免疫力。本评论概述了我们当前对20E介导的先天免疫反应的理解。在一系列的多代谢昆虫中总结了20E驱动的发育过渡和先天免疫激活之间的相关率。随后的讨论重点是使用果蝇中广泛的遗传资源进行的研究，这些研究已开始揭示在发育和细菌感染的背景下20E免疫调节的机制。最后，我提出了对20E免疫调节的未来研究方向，这将促进我们对交互式内分泌网络如何协调动物对环境微生物的生理反应的了解。
珊瑚体细胞和精子的突变意味着终生干细胞更新和细胞谱系选择
在许多动物中，生殖系在胚胎发生早期就已分化，因此只有在生殖细胞中积累的突变才会被后代遗传。这一发育过程的例外可能表明已经进化出其他机制来限制有害突变积累的影响。石珊瑚是可以存活数百年的动物，人们一直认为它们从体细胞组织中产生配子。为了澄清关于珊瑚生殖系-体细胞区别的相互矛盾的证据，我们对亲本珊瑚分支及其精子库进行了高覆盖率的全基因组测序和技术重复。我们确定了每个亲本分支独有的胚胎后单核苷酸变异 (SNV)，然后检查每个 SNV 是否由各自的精子库共享。26% 的胚胎后 SNV 由精子共享，74% 则不是。我们还确定了生殖系 SNV，即存在于精子中但不存在于亲本中的 SNV。这些数据表明，自我更新的干细胞在群落的成年期会分化为生殖细胞和体细胞，而 SNV 率和模式在干细胞、体细胞和生殖细胞谱系中存在显著差异。除了为后生动物生殖细胞的进化提供信息外，这些见解还揭示了珊瑚如何产生应对全球气候变化所必需的适应性多样性。
多种果蝇幼虫造血器官表现出效应胱天蛋白酶活性和DNA损伤反应
1882 年，埃利·梅契尼科夫 (Élie Metchnikoff) 在海星幼虫中发现了巨噬细胞，这种细胞通过吞噬外来物质来破坏外来物质。他将这一过程描述为吞噬作用 (Underhill 等人，2016)。后续研究表明，巨噬细胞在整个后生动物中都得到了保留，在调节发育、组织修复、体内平衡和先天免疫方面表现出额外的功能 (Lazarov 等人，2023；Park 等人，2022)。在三胚层动物中，吞噬细胞由于开放的循环系统而穿过体腔并清除细胞碎片或病原体 (Maheshwari，2022；Banerjee 等人，2019)。在哺乳动物中，常驻组织巨噬细胞在早期胚胎阶段从卵黄囊和红细胞-髓系前体细胞发育而来，并在整个生命过程中具有自我更新能力。单核细胞衍生的巨噬细胞也与快速补充的组织有关，例如肠道（Lazarov 等人，2023；Lee & Ginhoux，2022；Park 等人，2022）。在从单细胞生物进化到高度复杂的脊椎动物的过程中，巨噬细胞的作用和吞噬过程在很大程度上保持了下来（Yutin 等人，2009）。然而，吞噬巨噬细胞分化的潜在机制仍不清楚。
珊瑚相关细菌的多样性和分布
摘要：珊瑚礁是所有海洋生态系统中生物多样性最丰富的；然而，人们对这些系统中的原核生物多样性知之甚少。为了解决这个问题，我们对巴拿马和百慕大的 3 种大型珊瑚（Montastraea franksi、Diploria strigosa 和 Porites astreoides）的 1000 多个细菌 16S rDNA 进行了测序。仅对 14 个珊瑚样本的分析就产生了 430 种不同的细菌核糖体型。统计分析表明，额外的测序将产生总共 6000 种细菌核糖体型。其中半数序列与之前发表的 16S 序列的同一性不到 93%，因此可能代表新的细菌属和物种；这种新颖性程度远远高于其他海洋样本的新颖性。来自巴拿马珊瑚的样本比来自百慕大的样本更具多样性，与后生动物的多样性梯度相似。珊瑚-细菌关联是非随机的。不同的珊瑚物种拥有不同的细菌群落，即使它们在物理上相邻，而同一珊瑚物种在时间（约 1 年）或空间（3000 公里）上相隔的细菌群落则相似。对分枝珊瑚 Porites furcata 的分析表明，细菌核糖体型也可以在群落内按空间结构排列。因此，珊瑚和礁石代表了多样化、生态结构化的原核生物群落景观。
聚（ADP-核糖）聚合酶-1（PARP-1）抑制
ETS 转录因子是一个蛋白质家族，由一组在从后生动物到人类的进化过程中保守的基因编码 [1,2]。迄今为止，已在脊椎动物中描述了该家族的 28 个成员，分为 12 组 [3]。这些转录因子的特点是具有一个高度保守的有翼螺旋-转角-螺旋 DNA 结合域 (DBD)，该域可识别位于靶基因启动子中的具有中央 5′-GGA(A/T)-3′ 核心的特定 DNA 元素，称为 ETS 结合位点 (EBS)。尽管所有 ETS 家族成员都共享相同的 DBD，但每个 ETS 转录因子都有自己的 DNA 结合特性，这些特性受到严格控制以确保特定的生物学作用。具体而言，ETS 转录因子的 DNA 结合特性可通过以下方式彼此区分：(i) EBS 序列识别的细微差异 [4]、(ii) 与不同结合伙伴的特异性相互作用，或 (iii) 调节其对 DNA 亲和力的差异性翻译后修饰 [3]。尽管如此，ETS 转录因子在许多细胞类型（例如造血细胞、乳腺和前列腺组织）中广泛共表达，并且这些细胞中每种因子的生物学特异性仍不清楚 [3]。
隐杆线虫和其他线虫内胚层基因调控网络的进化和发育系统漂移
发育基因调控网络 (GRN) 是后生动物胚胎发生的基础，经历了重大修改，形成了当今地球上种类繁多的动物形态。线虫秀丽隐杆线虫一直是推动基础机械生物学许多重要发现的核心模型，最近，它为探索 GRN 结构的进化多样化和其他物种的发育过程提供了坚实的基础。在这篇简短的综述中，我们将重点关注最古老的胚胎胚层内胚层的 GRN 进化多样化。早期胚胎发生在线虫门中存在很大差异。值得注意的是，虽然一些物种部署了调控发育，但更衍生的物种，如秀丽隐杆线虫，则表现出胚胎发生的马赛克模式。尽管不同物种的线虫肠道形态相对相似，但已观察到启动内胚层 GRN 的信号输入存在广泛差异，这是发育系统漂移 (DSD) 的一个典型。我们将探索内胚层 GRN 的遗传变异如何帮助在物种间和物种内推动 DSD，从而形成强大的发育系统。使用不同线虫进行比较研究有望揭示控制发育可塑性的遗传机制，并为控制胚胎 GRN 进化修饰的原理提供范例。