XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System后生
3D数字技术在雕塑创作中的应用研究
固定创造性流是传统雕塑创作形式的特征之一，这是不可互换的。在第一步中，雕塑骨骼是雕塑的核心形式，应根据雕塑的整体形状空间来构建骨架的大小和动态电位。它的构造是雕塑创作序列中的主要链接。建造骨骼的材料主要是木材和金属材料，过程缓慢而繁琐。尤其是，大型雕塑作品的骨骼的建造不亚于建筑物的框架。如果后生产过程中存在问题，则必须在及时甚至重新制作中进行调整，因此骨骼的构造是雕塑创作中最重要的第一步。第二步，掌握模制物体的势能和整体形状是骨架结构后进行的一部分，它要求创建者在一定时间段内显示在形状成型过程中符合创建标准的对象，并塑造，并塑造并雕刻其详细信息；第三步，在将雕塑图像模制在核心骨架上之后，应将其翻转并通过转弯技术进行模制，最后转换为硬材料雕塑。在传统的雕塑生产过程中，每个过程都起着至关重要的作用，并且生产序列是固定和不可逆转的。如果逆转生产过程，则最终工作将不会以最初的创建意图显示。
使用机器学习方法估算参考蒸散量
摘要：农业是人类文明的基本支柱，不仅提供了我们生存所需的食物，而且还是全球经济增长的主要驱动力。然而，这个关键部门越来越受到气候变化的不断影响的影响，尤其是由于关键农业区域中水稀缺性的加剧。改变气候模式正在破坏降雨周期，导致干旱更加频繁并减少了水的可用性。随着全球人口的成倍增长并需要上升，农民需要灌溉水才能满足这些需求。这种日益增长的资源稀缺性强调了迫切需要可持续的农业解决方案来适应这些挑战。为了确保水资源的未来和保护农业生产力，至关重要的是主动实施诸如物联网（IoT）和人工智能（AI）之类的尖端技术。在这种情况下，我们提出了一种新的方法，用于估计参考蒸散量表，以最大程度地减少水浪费并提高灌溉水管理的效率。这项研究是在现实世界中进行的，安装了几个传感器以测量各种参数，包括温度，土壤水分和降雨。该站连接到服务器应用程序，在数据清洁和预处理后生成数据集。从数据集获得的参数与输出值et 0的相关性进行了分类。回归以预测水应力。开发的算法在确定系数r 2
KDM1A 维持转录增强子的全基因组稳态
转录增强子能够对后生动物的基因表达进行精确的时空控制。组蛋白 H3 赖氨酸 4 (H3K4me1) 的单甲基化富集是转录增强子的主要染色质特征。赖氨酸 (K) 特异性脱甲基酶 1A (KDM1A，也称为 LSD1) 是一种 H3K4me2/me1 脱甲基酶，可在小鼠胚胎干细胞 (mESC) 分化过程中使干细胞增强子失活。然而，其在未分化 mESC 中的作用仍不清楚。在这里，我们表明 KDM1A 在未分化和谱系定向细胞中都积极维持最佳增强子状态。KDM1A 占据了未分化 mESC 中的大部分增强子。增强子处的 KDM1A 水平与其底物 H3K4me2、H3K27ac 和增强子处的转录呈现明显的正相关性。在缺乏 Kdm1a 的 mESC 中，这些增强子中的大部分获得了额外的 H3K4 甲基化，同时伴有 H3K27 乙酰化增加以及增强子 RNA (eRNA) 和靶基因表达增加。在有丝分裂后的神经元中，KDM1A 的缺失会导致神经元活动依赖性增强子和基因的过早激活。总之，这些结果表明 KDM1A 是一种多功能的增强子调节器，并充当变阻器，通过平衡增强子处的 H3K4 甲基化来维持最佳增强子活性。
通过长读长重新审视非模型物种的基因组，可以对其生物学和进化产生新的见解
使用长读数据获得的高质量基因组不仅可以更好地了解杂合性水平、重复内容以及与使用短读技术获得的基因组相比更准确的基因注释和预测，而且还可以帮助了解单倍型分化。近年来，长读测序技术的进步使得为非模式生物生成此类高质量组装成为可能。这使我们能够重新审视基因组，而使用前几代数据和组装软件将其组装到染色体规模上一直存在问题。线虫是后生动物中种类最多、种类最多的动物门之一，但对其研究仍然很少，许多以前组装的基因组都是碎片化的。使用 Nanopore R10.4.1 和 PacBio HiFi 获得的长读长，我们生成了 Mermithidae 科二倍体线虫的高度连续组装体，目前尚未获得该科的密切相关基因组，以及 Panagrolaimidae 科三倍体线虫的折叠组装体和分阶段组装体。这两个基因组之前都已分析过，但碎片组装体的支架大小与组装前的长读长长度相当。我们的新组装体说明了长读长技术如何更好地表示物种基因组。我们现在能够根据更完整的基因和转座因子预测进行更准确的下游分析。
a-t-i RNA编辑
作为后生动物后期的重要调节机制，作用于RNA上的腺苷脱氨酶（ADAR）诱导的A-to-I RNA编辑修饰，对双链RNA的RNA进行了修改，已被广泛检测到并报告了。编辑可能会导致非同义氨基酸突变，RNA二级结构改变，前MRNA处理变化和microRNA-MRNA重定向，从而影响多个细胞过程和功能。近年来，研究人员成功地开发了几种生物信息学软件工具和管道来识别RNA编辑站点。但是，由于平行优化和RNA高seq协议和程序的种类繁多，仍然没有广泛接受的编辑站点标准。由于高DNA突变速率，通过肿瘤样品中正常方案进行识别RNA编辑也很具有挑战性。据报道，许多RNA编辑位点位于非编码区域，可能会影响NCRNA的生物合成，包括miRNA和圆形RNA。预测位于非编码区域和NCRNA中的RNA编辑位点的功能非常困难。在这篇综述中，我们旨在更好地了解人类癌症的生物信息学策略A至I-I RNA编辑识别和Brie-fl Y讨论相关领域的最新进展，例如RNA编辑的致癌和肿瘤抑制作用。
果蝇组织特异性 CRISPR 诱变的大规模资源
摘要 基因筛选是基因组功能注释的有力工具。在多细胞生物中，允许在空间和时间上控制基因消除的方法极大地促进了基因功能的探究。在这里，我们描述了一个大规模转基因短向导 (sg) RNA 文库，用于以组成性或条件性方式有效地基于 CRISPR 破坏特定靶基因。该文库目前由 2600 多个质粒和 1700 个果蝇系组成，重点是靶向激酶、磷酸酶和转录因子，每个都在 Gal4/UAS 系统的控制下表达两个 sgRNA。我们表明，条件性 CRISPR 诱变在许多靶基因中都很有效，并且可以有效地用于各种体细胞组织以及生殖系。为了防止通常与过量 Cas9 蛋白相关的假象，我们开发了一系列新型 UAS-Cas9 转基因，这些转基因允许对 Cas9 表达进行微调，以实现高基因编辑活性，而不会产生可检测的毒性。功能测定以及基因组 sgRNA 靶位点的直接测序表明，绝大多数转基因 sgRNA 系可介导有效的基因破坏。此外，我们在所有后生动物中进行了迄今为止最大的完全转基因 CRISPR 筛选，这进一步证明了我们文库的高效率和准确性，并揭示了许多迄今为止尚未鉴定的发育必需基因。
研究文章有关...
蠕虫寄生虫是来自各种分类家庭的一组复杂的后生动物。排泄物分泌（ES）副产品，由表面活的寄生虫分泌，似乎调节了宿主对蠕虫感染的免疫反应。这项研究旨在研究Helminth寄生虫的ES抗原对结直肠细胞活力的影响。蠕虫在无菌PBS冲洗后，在37°C的磷酸盐缓冲盐水（PBS X1）中培养24小时。使用砂浆和杵，使用PBS剧烈压碎蠕虫。使用0.22 µM过滤器提取获得的排泄分泌（ES）抗原，并在-20°C下储存以进行进一步测定。对于LCM，使用安捷伦Zorbax Eclipse加C18快速分辨率HT分析提取物的100 µL。使用CRC细胞系HCT 116。细胞活力和MTT分析。液相色谱和质谱法（LCM）数据表明，ES抗原含有代谢化合物，即脂肪酸，氨基醇，吲哚，吲哚，固醇，糖苷和鞘脂。对于Ascaris Lumbricoides LCMS分析，检测到约405个代谢峰。通过数据库检测到58个，而检测到的几种化合物具有抗癌特性。MTT分析表明，与对照组相比，在24小时和48小时暴露后，所有处理的细胞均显示细胞活力降低。初步研究表明，来自Ascaris Lumbricoides的ES抗原具有降低HCT116 CRC细胞系的细胞活力的能力。需要进一步的研究来检查ES抗原对CRC细胞系的细胞周期停滞和凋亡作用。
非生物因子塑造增强宿主发育的蚊子微生物
后生动物通过多个生命阶段依靠与微生物的互动。例如，蚊子的发育轨迹可能会根据水生幼虫阶段可用的微生物而变化。然而，当地环境在塑造这种宿主微叶动力学和对宿主有机体的后果中所扮演的作用仍然不足。在这里，我们研究了非生物因子，局部可用的细菌的影响，以及它们对蚊子艾德斯白化菌的发育和相关微生物群的相互作用。Our findings reveal that leaf detritus infused into the larval habitat water, sourced from native Hawaiian tree ‘ ¯ ohi‘a lehua Metrosideros polymorpha , invasive strawberry guava Psidium cattleianum , or a pure water control, displayed a more substantial influence than either temperature variations or simulated microbial dispersal regimes on bacterial community composition in adult mosquitoes.然而，特定的细菌在跨碎屑输注中表现出不同的模式，这些蚊子与幼体栖息地中的丰度不符。具体来说，我们观察到了菊花杆菌的相对丰度较高。从草莓番石榴输注中的蚊子中的菌株比纯水控制，而对于假单胞菌sp。观察到相反的趋势。应变。在一项后续实验中，我们操纵了这两种细菌菌株的存在，并通过包括菊科SP来增强幼体发育成功。草莓番石榴输注和假单胞菌sp。在纯水控制中应变。共同表明，幼虫环境的非生物因素和微生物之间的相互作用可以帮助塑造蚊子人群的成功。
编辑的作用是什么？了解腺苷脱氨酶作用于 RNA 的 A-to-I RNA 编辑的生理功能
腺苷到肌苷 (A-to-I) 编辑是一种 RNA 转录后修饰，可改变其序列、编码潜力和二级结构。在作用于 RNA 的腺苷脱氨酶 (ADAR) 蛋白 ADAR1 和 ADAR2 的催化下，A-to-I 编辑发生在小鼠的约 50 000 – 150 000 个位点上，而人类的位点则达到数百万个。绝大多数 A-to-I 编辑发生在重复元素中，这解释了物种间位点总数的差异。ADAR1 在哺乳动物中编辑的主要物种保守作用是抑制未编辑的细胞来源的内源性 RNA 引起的先天免疫激活。在没有编辑的情况下，反向配对序列（例如 Alu 元素）被认为会形成稳定的双链 RNA (dsRNA) 结构，从而触发 dsRNA 传感器（例如 MDA5）的激活。一小部分编辑位点位于编码序列内，并且在后生动物中进化保守。已证明 ADAR2 编辑对于大脑神经递质受体的重新编码具有生理重要性。此外，RNA 编辑的变化与各种病理状态有关，从严重的自身免疫性疾病 Aicardi-Goutières 综合征到各种神经发育和精神疾病以及癌症。但是，检测到编辑位点是否意味着功能重要性？人类和转基因小鼠模型中的遗传学研究以及进化基因组学已开始阐明 A-to-I 编辑在体内的作用。此外，最近的发展表明在癌症等病理条件下编辑可能具有不同的功能。
染色体规模的基因组组装，粗糙的littorina saxatilis
潮间带腹足动物Littorina saxatilis是研究物种形成和局部适应的模型系统。反复出现的不同生态型表现出不同水平的遗传差异使得萨克萨蒂利乳杆菌特别适合研究相同谱系中形成连续性的不同阶段。一个主要发现是存在与生态型差异相关的几种大染色体反转，并且该物种提供了一种系统来研究反演在这种差异中的作用的系统。萨克萨蒂利乳杆菌的基因组为1.35 GB，由17个染色体组成。该物种的第一个参考基因组是使用Illumina数据组装的，高度碎片（N50的44 kb），非常不完整，Metazoan数据集的BUSCO完整性为80.1％。一个全同胞家族的连锁图将587 MBP的基因组的放置放在17个连锁基团中，与单倍体数量相对应，但该参考基因组的分散性质限制了对divergent选择和在生态型形成过程中的相互作用的理解。在这里，我们提出了一个新生成的参考基因组，该基因组高度连续，n50为67 Mb，占总组装长度的90.4％，占17个超级折叠术。它也高度完成了BUSCO的完整性，占后生数据集的94.1％。此新参考将允许研究与生态型形成有关的基因组区域，并更好地表征反转及其在物种物种中的作用。