转录增强子能够对后生动物的基因表达进行精确的时空控制。组蛋白 H3 赖氨酸 4 (H3K4me1) 的单甲基化富集是转录增强子的主要染色质特征。赖氨酸 (K) 特异性脱甲基酶 1A (KDM1A,也称为 LSD1) 是一种 H3K4me2/me1 脱甲基酶,可在小鼠胚胎干细胞 (mESC) 分化过程中使干细胞增强子失活。然而,其在未分化 mESC 中的作用仍不清楚。在这里,我们表明 KDM1A 在未分化和谱系定向细胞中都积极维持最佳增强子状态。KDM1A 占据了未分化 mESC 中的大部分增强子。增强子处的 KDM1A 水平与其底物 H3K4me2、H3K27ac 和增强子处的转录呈现明显的正相关性。在缺乏 Kdm1a 的 mESC 中,这些增强子中的大部分获得了额外的 H3K4 甲基化,同时伴有 H3K27 乙酰化增加以及增强子 RNA (eRNA) 和靶基因表达增加。在有丝分裂后的神经元中,KDM1A 的缺失会导致神经元活动依赖性增强子和基因的过早激活。总之,这些结果表明 KDM1A 是一种多功能的增强子调节器,并充当变阻器,通过平衡增强子处的 H3K4 甲基化来维持最佳增强子活性。
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