AU:请确认所有标题级别均正确显示:成簇的规律间隔短回文重复序列 (CRISPR)-Cas12a 系统是基因编辑的强大工具;然而,crRNA-DNA 错配可能会引起不必要的切割事件,尤其是在 PAM 的远端。为了最大限度地减少这种限制,我们通过修改与靶 DNA 和 crRNA 链相互作用的氨基酸残基,设计了一种携带突变 S186A/R301A/T315A/Q1014A/K414A 的超保真 AsCas12a 变体(称为 HyperFi-As)。HyperFi-As 保留了与人类细胞中的野生型 AsCas12a (AsCas12aWT) 相当的靶向活性。我们证明 HyperFi-As 显著降低了人类细胞中的脱靶效应,并且与野生型相比,HyperFi-As 对 PAM 远端区域位置的错配容忍度明显较低。此外,采用改进的适当恒定力单分子 DNA 解拉链分析来评估 CRISPR/Cas 核糖核蛋白 (RNP) 复合物的稳定性和瞬态阶段。在 DNA-Cas12a-crRNA 复合物的解体过程中敏感地检测到了多种状态。在脱靶 DNA 底物上,与 AsCas12aWT 相比,HyperFi-As-crRNA 更难维持 R 环复合物状态,这可以准确解释为什么 HyperFi-As 在人类细胞中具有较低的脱靶效应。我们的研究结果提供了一种具有低脱靶效应的新型 AsCas12a 变体,尤其能够处理 PAM 远端区域的高脱靶。在单分子水平上,我们还揭示了 AsCas12a 变体在脱靶位点的行为方式,而用于评估 CRISPR/Cas RNP 复合物多种状态的解压缩分析可能对深入了解 CRISPR/Cas 的行为方式以及将来如何对其进行工程改造大有帮助。
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