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World File Search System哺乳动物
哺乳动物脑中多晶镜神经元的突触和电路功能
哺乳动物脑中的神经元不限于释放单个神经递质，而是通常将神经递质的神经递质释放到突触后细胞上。在这里，我们回顾了整个哺乳动物中枢神经系统中发现的多晶月神经元的最新发现。我们重点介绍了最新的技术创新，这些创新使新的多晶镜神经元及其突触特性的研究成为可能。我们还专注于轴突末端和突触囊泡上神经递质corelease所需的机制和分子成分，以及多种晶状体神经元在多种脑电路中的一些可能功能。我们期望这些方法将导致对多晶镜神经元的机制和功能的新见解，它们在电路中的作用以及它们对正常和病理大脑功能的贡献。
使用机器学习将跨哺乳动物的增强子遗传变异与复杂表型相关联
*通讯作者。ikaplow@cs.cmu.edu（i.m.k.）; apfenning@cmu.edu（a.r.p.）。†这些作者为这项工作做出了同样的贡献。•目前的地址：美国马萨诸塞州剑桥市史丹利精神病学研究中心。§§地址：美国华盛顿州西雅图的艾伦脑科学研究所。¶刊登地址：美国马萨诸塞州剑桥大学的癌症计划。#Present地址：美国爱荷华州爱荷华州法学院，美国爱荷华州，美国。**动物联盟合作者和分支机构在本文的结尾列出。作者贡献：I.M.K.，A.J.L。和D.E.S.以姓氏为单位的顺序被列为联合第一作者，因为它们对手稿也同样贡献。概念化：I.M.K。和A.R.P.数据策划：I.M.K.，C.S.，B.N.P.，A.J.L.，W.K.M.，K.F。和D.P.G.正式分析：I.M.K.，D.E.S.，A.J.L.，C.S.，H.H.S.和B.N.P. 资金收购：A.R.P.，A.J.L.，B.N.P.，E.K.K.，D.P.G。和K.L.-T。调查：I.M.K.，A.J.L.，D.E.S.，C.S.，M.E.W.，H.H.S.，B.N.P.，K.P.，A.R.B。和A.R.P. 方法论开发：I.M.K.，A.J.L.，D.E.S.，C.S。和A.R.P. 监督：I.M.K.，A.R.P.，A.J.L.，M.E.W.，E.K.K。和K.L.-T。软件实施：D.E.S.，I.M.K.，A.J.L.，C.S.，H.H.S.，M.E.W.，W.K.M.，X.Z.和K.F. 可视化：I.M.K.，D.E.S.，C.S.，A.J.L.，H.H.S.和A.R.P. 手稿准备：I.M.K.，D.E.S.，A.J.L.，A.R.P.，C.S。和H.H.S. 手稿评论和编辑：所有作者。正式分析：I.M.K.，D.E.S.，A.J.L.，C.S.，H.H.S.和B.N.P.资金收购：A.R.P.，A.J.L.，B.N.P.，E.K.K.，D.P.G。和K.L.-T。调查：I.M.K.，A.J.L.，D.E.S.，C.S.，M.E.W.，H.H.S.，B.N.P.，K.P.，A.R.B。和A.R.P.方法论开发：I.M.K.，A.J.L.，D.E.S.，C.S。和A.R.P.监督：I.M.K.，A.R.P.，A.J.L.，M.E.W.，E.K.K。和K.L.-T。软件实施：D.E.S.，I.M.K.，A.J.L.，C.S.，H.H.S.，M.E.W.，W.K.M.，X.Z.和K.F.可视化：I.M.K.，D.E.S.，C.S.，A.J.L.，H.H.S.和A.R.P. 手稿准备：I.M.K.，D.E.S.，A.J.L.，A.R.P.，C.S。和H.H.S. 手稿评论和编辑：所有作者。可视化：I.M.K.，D.E.S.，C.S.，A.J.L.，H.H.S.和A.R.P.手稿准备：I.M.K.，D.E.S.，A.J.L.，A.R.P.，C.S。和H.H.S.手稿评论和编辑：所有作者。
重新审视BDNF及其受体在哺乳动物发育中的表达
脑衍生的神经营养因子（BDNF）促进了中枢神经系统中神经元的存活和功能，并有助于许多非神经组织的正常功能。尽管已经对BDNF的调节和作用进行了广泛的研究，但缺乏对BDNF及其受体TRKB和P75NTR的表达动力学进行严格的分析。在这里，我们分析了来自18个已发表的RNA测序数据集的3,600多个样品，并使用了来自GTEX的17,000多个样本，以及来自Brainspan数据库的约180个样本来描述BDNF在发育中的乳腺神经和非神经组织中的表达。我们显示了BDNF mRNA的进化保守动力学和表达模式和未经保存的替代5'外显子使用情况。最后，在几种非神经组织中，我们还显示了在鼠大脑发育和BDNF蛋白表达期间的BDNF蛋白水平的增加。并联，我们描述了鼠和人类中BDNF受体TRKB和P75NTR的时空表达模式。总的来说，我们对BDNF表达及其受体表达的深入分析使您可以深入了解整个生物体中BDNF的调节和信号传导。
来自无脊椎动物衍生的DNA 的哺乳动物有丝分裂基因组学 有效的张量网络状态的绝热制备 HUWE1缺陷通过调节BRCA1-∆11Q剪接变体来引起PAR抑制剂抗性
fi g u r e 1有丝分裂组的覆盖范围是由（a）单个苍蝇，（b）蝇池或（c）leeches的个体或水池池产生的。虚线表示整个基因组的10 bp平均值。绘图旁边的苍蝇或水ech图像表示使用了独特的颜色/形状组合以及是否使用了单个提取物或池。（d）从GenBank的91个灵长类有丝分裂基因组和由苍蝇，水ches或蝇池产生的高质量有丝分裂基因组的比对来推断出的最大可能性系统发育。提出的系统发育是有助于解释的，但是完整的树包括有关节点和分支长度的其他信息。至少需要10×覆盖范围才能为这些有丝分裂基因组拨打基础，阈值为95％的身份，以调用底座。出现在> 95％的bootstrap复制中显示为实线的节点。量表显示每个位置的核苷酸取代。
使用 AAV 介导的原位基因标记可视化哺乳动物大脑中的 Arc 蛋白动力学和定位
活性调节的细胞骨架相关 (Arc) 蛋白对于突触可塑性和记忆形成至关重要。Arc 基因含有结构 GAG 逆转录转座子序列的残余，它产生的蛋白质可自组装成含有 Arc mRNA 的衣壳状结构。从神经元释放的 Arc 衣壳已被提议作为一种新的 mRNA 传递细胞间机制。尽管如此，仍然缺乏 Arc 在哺乳动物大脑中细胞间运输的证据。为了能够在体内追踪来自单个神经元的 Arc 分子，我们设计了一种腺相关病毒 (AAV) 介导的方法，使用 CRISPR/Cas9 同源独立靶向整合 (HITI) 将荧光报告基因标记到小鼠 Arc 蛋白的 N 端。我们表明，编码 mCherry 的序列可以成功敲入 Arc 开放阅读框的 5′ 端。虽然 Arc 起始密码子周围有 9 个 spCas9 基因编辑位点，但编辑的准确性高度依赖于序列，只有一个靶标导致框内报告基因整合。在海马中诱导长期增强 (LTP) 时，我们观察到 Arc 蛋白的增加与荧光强度和 mCherry 阳性细胞数量的增加高度相关。通过邻近连接分析 (PLA)，我们证明 mCherry-Arc 融合蛋白通过与突触后棘中的跨膜蛋白 stargazin 相互作用而保留了 Arc 功能。最后，我们在靠近编辑神经元的 mCherry 阳性棘的 mCherry 阴性周围神经元中记录了 mCherry-Arc 与突触前蛋白 Bassoon 的相互作用。这是第一项为哺乳动物大脑中 Arc 的神经元间体内转移提供支持的研究。
皮肤病学中雷帕霉素（MTOR）抑制剂的哺乳动物靶标
雷帕霉素途径的哺乳动物靶标MTOR蛋白属于磷酸肌醇3-激酶（PI3K）家族及其信号通路是细胞代谢，增殖和分化，免疫系统调节和自噬机制的关键调节剂。3 MTOR蛋白与其他蛋白质结合，形成两种多蛋白络合物，即mTOR-complex 1和MTOR-COMPEMPERX 2，具有不同的组成和信号传导功能。如图1所述，mtor-complex 1对雷帕霉素敏感且对缺氧敏感，营养缺乏脱氧核糖核酸损伤。它由阳性调节剂组成，例如G蛋白β-亚基样蛋白和两个阴性调节剂Proline富含Akt蛋白40 kDa，以及含Dep域的MTOR相互作用蛋白。MTOR-COMPERX 2是一种对雷帕霉素不敏感的复合物，由m-tor，哺乳动物应激激活的蛋白激酶相互作用的雷帕霉素不敏感的伴侣组成，G蛋白β亚成蛋白和deptor。
哺乳动物雷帕霉素靶向抑制剂在肠道和多脏器移植后的疗效和安全性
1. Matsumoto CS, Subramanian S, Fishbein TM。成人肠道移植。北美胃肠病学杂志。2018；47(2):341-354。2. Lacaille F。1987 年首例肠道移植 30 年后：2018 年还有哪些适应症？器官移植最新观点。2018；23(2):196-198。3. Bharadwaj S、Tandon P、Gohel TD 等。肠道和多内脏移植的现状。胃肠病学杂志。2017；5(1):20-28。4. Herlenius G、Fagerlind M、Krantz M 等。慢性肾病——肠道移植后常见且严重的并发症。移植。 2008;86(1):108-113。5. Huard G、Iyer K、Moon J、Doucette JT、Nair V、Schiano TD。小肠移植后严重慢性肾病的高发病率及其对患者和移植物存活率的影响。临床移植。2017；31(5)：e12942。6. Morelon E、Kreis H。不使用钙调磷酸酶抑制剂的雷帕霉素疗法：Necker 医院 8 年经验。移植程序。2003；35(3 Suppl)：52s-57s。7. Schena FP、Pascoe MD、Alberu J 等。从钙调磷酸酶
宿主系统发育和功能性状分化了小型哺乳动物自然界的肠道微生物
fi g u r e 1小型哺乳动物社区系统发育和肠道微生物组组成。（a）14种的系统发育包括三个分类顺序：啮齿动物（啮齿动物；灰色的亚家族名称），lagomorpha（Hares）和Macroscelidea（Elephant Shrew）。节点上的数字代表Bootstrap支持值，大象sh作为适当的外群。节点上的灰色文本代表啮齿动物中相关的家族，亚家族和部落级进化枝，并表明系统发育代表了我们在这些分类群中及之内对进化关系的最佳当前知识。为了可视化整个系统发育的身体大小分布，我们使用了phytools在R. phytools中实现的最大似然祖先重建方法。微生物组样本量显示在括号中的尖端。（b）微生物组的多样性显示为每个样品±标准偏差的平均ASV数量。（c）堆叠的条形图显示了所有样品中六个细菌门的相对读取丰度（RRA）；灰色显示了代表<5％RRA的19个“其他”门的RRA。[可以在wileyonlinelibrary.com上查看颜色图]
海洋哺乳动物监测和缓解计划
从事所有项目活动的船舶操作员和机组人员（即，项目组件的安装，监视船，操作和维护船，船员运输船等）将遵守所有适用的法规，并采取美国风船的避免措施，以保护海洋哺乳动物免受船只罢工的影响。船只操作员和机组人员将保持警惕的海洋哺乳动物，并放慢或停止其血管，以避免击中这些受保护的物种。船舶操作员和机组人员将在船舶动员过程中进行简报，并在下面指定的有关WIND的船只罢工程序的机组人员更改。避免船只罢工措施将在所有活动中生效，除非在遵守这些要求的特殊情况下，将使船只或船员的安全处于危险之中。
辐射杂种的汇总分析确定了哺乳动物细胞生长和药物作用的基因座
TN5转座子标记双链DNA和RNA/DNA杂交产生的核酸，这些核酸准备被放大以进行高通量测序。必须探索TN5转座子的核酸底物以增加TN5的应用。在这里，我们发现TN5转座子可以将寡核酸转置超过140个核苷酸的单链DNA的5'端。基于TN5的此属性，我们开发了一种基于标记和启用连接的单链DNA测序方法，称为Table-Seq。通过一系列反应温度，时间和酶浓度测试，我们将表格seq应用于链特异性的RNA测序，从总RNA的30 pg开始。此外，与传统的基于DUTP特异性的RNA测序相比，该方法检测到更多的基因，具有较高的链特异性，并且在基因之间显示出更均匀分布的读数。一起，我们的结果提供了有关TN5转座子特性的见解，并扩展了TN5在尖端测序技术中的应用。