半个多世纪以来,蛋白质折叠一直是最困难的问题之一,随机热运动导致构象变化,从而导致能量下降到天然结构,这是漏斗状能量景观中捕获的原理。未折叠的多肽具有广泛的可能构象。由于潜在构象随链长呈指数增长,搜索问题对于经典计算机来说变得难以解决。到目前为止,有理论和实验证据表明,使用量子退火、VQE 和 QAOA 等量子计算方法解决此类优化问题具有优势。虽然谷歌的 DeepMind-AlphaFold 已经取得了很大成就,但我们可以通过量子方法走得更远。在这里,我们展示了如何使用变分量子特征求解器预测蛋白质结构以及 RNA 折叠,并使用条件风险值 (CVaR) 期望值来解决问题并找到最小配置能量,我们的任务是确定蛋白质的最小能量结构。蛋白质的结构经过优化以降低能量。还要确保满足所有物理约束,并将蛋白质折叠问题编码为量子比特算子。
姓氏“ Sectionin”源自Sectionin受体,该受体是该家庭中首次克隆的。3,1975年,Sasaki等。33求解了胰高血糖素的第一个X射线晶体结构,一个家族B GPCR。34 The family corresponds to group B of the A – F system of classi cation, 3 and comprises 15 members including: vasoactive intestinal peptide receptors (vIPR1, vIPR2), glucagon- like peptide receptors (GLP1R, GLP2R), adenylate cyclase acti- vating polypeptide receptor (PAC1/ADCYAP1R1), growth-激素释放激素受体(GHRHR),降钙素和类钙蛋白样受体(CALCR,CALCRL),胃抑制性多肽受体(GIPR),分泌蛋白受体(SCTR),cortropin-释放激素受体受体(CRHR1,CRHR1,CRHR1,GLCGOGAGON),GCRONORN HYRORS(GLCGOGANER)(GLCGOGAGON HYRORS HYRORS(GLCGRANER))(CRHR1,GLCGOGANS,GLCRONER HYRORS HYRORS(GLCRONER))受体(PTHR1,PTHR2)。3,31这15个受体共享21和
受自然启发而设计高性能蛋白质材料的努力主要集中在改变自然发生的序列以赋予所需的功能,而从头设计则明显落后,需要非常规的创新方法。在这里,使用部分无序的弹性蛋白样多肽 (ELP) 作为初始构建块,这项工作表明,可以通过混合仿生设计加速蛋白质材料的从头工程,这项工作通过整合计算建模、深度神经网络和重组 DNA 技术实现了这一点。这种可推广的方法涉及整合一系列具有 𝜶 螺旋构象的从头设计序列,并将它们遗传编码为受生物启发的内在无序重复基序。新的 ELP 变体保持结构构象,并在体外表现出可调节的非热平衡超分子自组装和相行为。这项工作说明了预测的分子设计在结构和功能材料中的有效转化。所提出的方法可应用于广泛的部分无序生物大分子,并可能为发现新的结构蛋白铺平道路。
引言Linagliptin是一种抗糖尿病药物,用于治疗和控制患有2型糖尿病的患者的血浆糖水平。建议与其他抗糖尿病药物一起进行适当的定期运动和饮食。这是一种有效的二肽基肽酶-4(DPP-4)抑制剂,并通过增加降低血糖升高的某些天然物质的量来发挥药理作用。1,2餐后,消化系统释放了肠降血糖素激素,例如依赖性葡萄糖胰岛素多肽(GIP)和胰高血糖素样肽-1(GLP-1),可提高其血液水平。3 GLP-1和GIP通过提高胰腺产生和释放胰岛素的能力来降低血糖水平。同样,GLP-1降低了血糖并降低了胰腺中胰高血糖素的分泌,从而提高了肝脏产生葡萄糖并升高血糖水平的能力。酶DPP-4破坏了GLP-1和GIP,Linagliptin增加了其水平和代谢活性。结果,GLP-1和GIP的血液水平继续更高,而血糖水平下降。Linagliptin通过抑制DPP-4并升高
摘要III-E型CRISPR-CAS效应子类的最新发现重塑了我们对CRISPR-CAS进化和分类的基本理解。III-E型效应子由几个类似CAS7的结构域和一个类似CAS11的域自然融合在一起的单个多肽组成,能够编程靶向和降解RNA。在这里,我们确定了由III-e型效应子组成的新颖组成,该效应子由Cas7样和类似Cas1的域组成,可以设计成具有活性的嵌合RNA靶向CAS效应器,并在RNA靶向中呈现Cas1的新功能。此外,我们通过有条不射的III-E型蛋白质之间的域来证明III-E型效应子的独特模块化,以设计紧凑的合成CAS效应子。我们完善了为哺乳动物细胞中可编程RNA靶向的几个紧凑效应子的方法。cas7-s代表了对III-E型结构和模块化的一种新理解,并为来自自然的蓝图提供了工程基因组工程技术的平台。
摘要:生物制药是包括多肽、蛋白质、核酸和细胞产物在内的新一代药物。由于其特殊的分子特性(如分子量大、易受酶活性影响),这些产品在给药方面存在一些限制,通常只能通过肠外途径给药。为了避免这些限制,人们提出了不同的胶体载体(如脂质体、胶束、微乳剂和树枝状聚合物)来改善生物制药的递送。尽管已报道了一些局限性(如体内失败、长期稳定性差和转染效率低),但脂质体仍是一种很有前途的药物递送系统,而且只有有限数量的制剂进入了市场。胶束和微乳剂需要更多的研究来排除一些观察到的缺点并确保其在临床上的应用潜力。由于其独特的结构,树枝状聚合物在核酸递送方面表现出良好的效果,预计这些系统在未来几年将有很大的发展。这是两篇综述文章的第二部分,介绍了生物制药输送系统的最新进展。第二部分涉及脂质体、胶束、微乳剂和树枝状聚合物。
质子转移使自然界和人造技术中的重要过程成为可能。然而,控制质子传导和利用生物材料制造设备仍然是一项挑战。更困难的是设计基于蛋白质的块状材料,没有任何功能性起始支架供进一步优化。在这里,我们展示了质子传导蛋白质材料的合理设计,超过了已报道的蛋白质系统。通过探索从内在无序线圈到超荷电纳米桶到包含蛋白质超荷电多肽嵌合体的分层蜘蛛片的各种序列,一步步进化出富含羧酸的结构。后一种材料的特点是相互连接的片纳米域,其表面由羧酸基团修饰,形成自支撑膜并允许在水合状态下进行质子传导。在 RH = 90% 时,膜显示出 18.5 ± 5 mS/cm 的非凡质子电导率,比其他蛋白质装置高一个数量级。这种设计范例为连接人工和生物系统的生物质子装置制造提供了巨大的潜力。
建立肽序列与原纤维形成之间的基本关系对于理解蛋白质错误折叠过程和指导生物材料设计至关重要。在这里,我们将全原子分子动力学(MD)模拟与人工intel-ligence(AI)相结合,以研究短肽序列排列的细微变化如何影响其形成原纤维的倾向。我们的结果表明,疏水残基的分布和电荷簇的分布很小,可以显着影响成核速率和跨β结构的稳定性。为了快速扩展此分析,我们开发了一个主动学习 - 增强的框架 - 用于分子动力学的机器学习(ML4MD),从而根据MD衍生的聚合数据迭代地完善了其预测。ML4MD有效筛选了许多肽排列,并指导发现先前未识别的原纤维式序列,从而在接收器操作特征(ROC)曲线(AUC)下达到0.939的接收器下方。总体而言,ML4MD通过将详细的原子模拟与快速和高敏锐的ML预测整合在一起,简化了淀粉样蛋白样肽的合理设计。
1因交易结案的因素; CER的增长数量和速率(持续汇率); ahr = avastin,Herceptin,Rituxan/Mabthera; RVO =视网膜静脉阻塞; HER2+=人表皮生长因子受体阳性; HR+=激素受体阳性; pik3ca-mut =磷酸肌醇3-激酶突变体; BC =乳腺癌;抗HEV IgG/IgM =抗肝炎病毒免疫球蛋白G/免疫球蛋白M; hbeag =乙型肝炎E抗原; TL1A = TNF样配体1a; GLP-1 =胰高血糖素样肽1; GIP RA =葡萄糖依赖性胰岛素多肽受体激动剂; POC =护理点; NSCLC =非小细胞肺癌; DLBCL =弥漫性大B细胞淋巴瘤; SC =皮下; MDS =骨髓增生综合征; ln =狼疮肾炎; GMG =广泛的肌腱肌症; PD =帕金森氏病; AD =阿尔茨海默氏病; SMA =脊柱肌肉萎缩; ASO =反义寡核苷酸; GA =地理萎缩; DME =糖尿病性黄斑水肿; CGM =连续葡萄糖监测; ISE =离子选择性电极; DMD = Duchenne肌肉营养不良
CD36 正在成为癌症治疗的一个新靶点。1,2 CD36 是细胞表面蛋白 B 类清道夫受体家族的成员,可促进游离脂肪酸的吸收以进行脂质代谢。3 CD36 通过促进癌症转移、支持耐药性和调节肿瘤免疫来促进肿瘤生长。1,4 最近的研究表明,CD36 在卵巢肿瘤中上调。5,6 与肿瘤微环境中的脂肪细胞相互作用导致 CD36 上调,从而增强卵巢肿瘤转移。2 基于 CD36 的疗法,包括单克隆抗体和多肽,已被证明可有效抑制癌症转移。1 然而,就卵巢癌的耐药性而言,CD36 的作用尚不清楚,也没有关于利用 CD36 进行穿梭疗法以靶向耐药卵巢癌细胞的报道。越来越多的证据表明,线粒体在卵巢癌细胞的耐药性中起着关键作用。7-9 最近的一项研究表明,耐药性卵巢癌细胞的线粒体氧化磷酸化增加。10 线粒体靶向药物,如盐霉素和氯硝柳胺,已显示出通过削弱氧化磷酸化来克服耐药性的活性。11-13 然而,系统性毒性限制了这些药物在