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World File Search System大肠杆菌
大肠杆菌中的 CRISPR-Cas：受 H-NS、LeuO 的调节……
CRISPR-Cas 适应性免疫系统存在于许多细菌和古细菌中，可保护细菌免受噬菌体和质粒等 DNA 入侵。这些系统的基因组成和基因组结构非常灵活和复杂。CRISPR-Cas 系统分为 2 类、6 种类型和 33 种亚型，尽管这个数字尚不确定，研究仍在进行中。所有 CRISPR-Cas 系统都经过了彻底研究，以便更好地了解 CRISPR 免疫机制，使其可用作基因组编辑和其他生物技术应用的工具。然而，CRISPR-Cas 系统的调控也非常复杂，目前仍未完全了解；它必须提供最佳保护，而不会给宿主带来有害后果。在本综述中，我们概述了大肠杆菌中 CRISPR-Cas 系统 1 类 IE 型的调控，重点介绍了温度在调节 CRISPR-Cas 活性中的作用，以及关键调节剂 H-NS 和 StpA 阻遏物与 LeuO 抗阻遏物在调节 cas 基因表达中的相互作用以及 HtpG 分子伴侣在维持 Cas3 功能水平中的相互作用。
重新定义没有抗生素的家禽中的大肠杆菌控制
摘要家禽行业通过生产具有较高蛋白质和重要养分的鸡蛋和肉类产品，以较低的成本生产鸡蛋和肉类产品在弥合许多国家的营养差距中发挥了重要作用。自禁止抗生素启动子（AGP），天然抗生素替代品，包括益生元，有机酸，有机酸，共生剂，免疫刺激剂，酶，精油和植物生成剂，包括植物学，油脂素，精油，精油和herbs的造型性，包括杂种，包括普遍的范围。，由于其独特的特征和对家禽生产的良好影响，它们在世界范围内广泛使用。They are simple to combine with other feed ingredients, leave no tissue residue behind, enhance feed intake, feed gain, feed conversion rate, boost immunity in birds, enhance digestion, increase the availability and absorbability of nutrients, have anti-microbial properties, do not alter carcass characteristics, reduce the need for antibiotics, act as antioxidants and anti-inflammatory agents, compete for stressors,并生产营养有机产品，这些有机产品可安全。因此，当前的评论重点介绍了对不同自然抗生素增长者的替代方案的全面描述，其作用方式以及对家禽生产的影响。关键词大肠杆菌，抗生素，有机添加剂，家禽，AMR，健康
菲律宾Losbaños的自流井水域的多药耐药大肠杆菌
由于商业饮用水的成本上涨，居民（尤其是在农村地区）越来越依赖自流井水，而自流井水通常是未经处理的，并且没有经常测试是否有损坏。这可能导致摄入对抗生素耐药性的微生物的摄入风险更高。因此，这项研究的重点是从菲律宾Losbaños，菲律宾的Losbaños中检测出来自选定Barangays（Bayog，Malinta和Mayondon）的自流井水样品的粪便（特别是大肠杆菌）。分离的大肠杆菌以获得抗菌素耐药性。使用多管发酵法确定，在30个水样中，大肠菌群的八个水样呈阳性。在八个样品（MY2-2，ML2-3和ML2-4）中，有三个获得了大肠杆菌分离株，如通过表型和分子表征所识别的。使用磁盘扩散测定法，在分离株中鉴定出抗生素头孢唑酮，Meropenem，loxacinem和甲氧苄啶磺胺甲恶唑的耐药模式。的结果表明，MY2-2对头孢曲松，MeropeNem和甲氧苄啶磺胺甲氧唑具有抗性。 ML2-3对头孢唑酮和MeropeNem具有抗性，而ML2-4对所有四种抗生素具有抗性。聚合酶链与引物检测到TEM基因的反应，这是一种扩展的β-内酰胺酶基因，表明分离株对氨苄西林和青霉素具有抗性。表型和分子方法的结果表明分离株具有多药耐药性。根据家庭访谈，隔离了MY2-2的自流井水被10个家庭用来饮酒。因此，地方政府部门应定期监测自流井水的微生物质量，进行教育和信息运动，以了解可以从消耗不洁的水中染上的疾病，并确保可以使用饮用水，尤其是对于没有净化水的家庭。
反刍生物过滤器的大肠杆菌中的合成甲烷植物
反刍动物的排放量负责导致全球变暖的人为温室气体的很大一部分。牛的甲烷排放量是弥漫性的，难以治疗，但是，已经提出了几种溶液，可以降低从牛发出的低（v/v）甲烷流，最高约30％。Wageningen大学和研究国际基因工程机竞赛提出的新型Cattlelyst生物滤器旨在通过引擎盖系统和两个在三层安全机制下收集和转化从牛发出的甲烷和氨和氨。目标是将大肠杆菌施加到合适的合成甲烷肉芽菌中。在本文中，试图在合适的甲肉营养菌株SM1或C1SAUX中表达合成甲烷营养。所得的产物是一个PSEVA2610-SMMO质粒，其中包含SMMO的亚基，并在MMOX基因中复制。无法实现其他伴侣的质粒，并且未显示SM1和C1SAUX菌株的甲基营养生长。最后，该假设既没有得到证实或拒绝。生物过滤器的合成甲烷植物正在成为一种越来越相关的技术来解决低浓度的甲烷，因为本文中探讨了多种技术进步。预计生物滤器设计的改进，例如在引擎盖中浓缩甲烷，多孔填料材料以及具有工程性的特定培养物，可以使生物过滤器成为实现全球甲烷承诺的有用工具。
大肠杆菌 SymE 是一种 DNA 结合蛋白，可以浓缩核苷
I 型毒素-抗毒素 (TA) 系统通常由嵌入内膜的蛋白质毒素和直接与毒素 mRNA 相互作用以抑制其翻译的 RNA 抗毒素组成。在大肠杆菌中，symE/symR 被注释为具有非典型毒素的 I 型 TA 系统。SymE 最初被认为是一种内切核糖核酸酶，但预测其结构与 DNA 结合蛋白相似。为了更好地了解 SymE 的功能，我们使用 RNA-seq 检查异位产生它的细胞。尽管 SymE 会驱动基因表达的重大变化，但我们没有发现内切核糖核酸酶活性的有力证据。相反，我们的生化和细胞生物学研究表明 SymE 会结合 DNA。我们证明 symE 过表达的毒性可能源于其能够驱动严重的类核缩合，从而破坏 DNA 和 RNA 合成并导致 DNA 损伤，类似于过量产生类核相关蛋白 H-NS 的影响。总之，我们的结果表明 SymE 代表了一类广泛分布于细菌中的新型类核相关蛋白。
使用大肠杆菌作为宿主进行重组胰岛素生产的挑战
在马来西亚，糖尿病 (DM) 的患病率取决于性别、年龄和种族等因素，其中女性、老年人和印度族群的糖尿病患病率最高。在构成研究样本的 103,063 名参与者中，基于人群的研究中按性别划分的糖尿病患病率男性为 13.80%，女性为 14.54%，而糖尿病前期的患病率女性为 11.40%，男性为 10.98%（Akhtar 等人，2022 年）。就年龄而言，从本研究可以看出，随着年龄的增长，糖尿病的患病率呈明显上升趋势，从 20-29 岁年龄组的 3.16% 上升到 30-45 岁年龄组的 13.71%，46-59 岁年龄组的 25.66%，60 岁及以上年龄组的 33.45% (Akhtar et al., 2022)。种族和民族也会影响糖尿病的患病率。在所有种族中，印度人亚群的糖尿病患病率最高，为 25.10%，其次是马来人（15.25%）、华人（12.87%）、土著人（8.62%）和其他（6.91%）。马来西亚口服降糖药 (OHA) 市场规模在 2025 年达到 2.8222 亿美元，预测期内 (2025-2030) 的复合年增长率超过 3%。药物主要属于以下类别：双胍类、α-葡萄糖苷酶抑制剂、多巴胺-d2 受体激动剂、钠-葡萄糖协同转运体-2 (SGLT-2) 抑制剂、二肽基肽酶-4 (DPP-4) 抑制剂、磺酰脲类和格列奈类 (马来西亚口服抗糖尿病药物市场规模 | Mordor Intelligence，2025 年)。
大肠杆菌中鞭毛蛋白表达和运动的启动子驱动的调节
合成生物学为工程生物系统提供了强大的工具，用于不同的应用。然而，在实现现实世界应用（例如环境生物修复或用于靶向药物的治疗微型机器人）之类的实际应用之前，主要的挑战一直存在。这项研究旨在通过在大肠杆菌中使用工程启动子调节基因表达来精确控制细菌运动。我们专注于模型生物的大肠杆菌，并通过工程化鞭毛蛋白的表达来操纵其运动，这是一种至关重要的细菌运动蛋白。为了实现这一目标，采用了特定的遗传启动子来调节鞭毛蛋白的产生，从而决定了这些细菌的运动能力。启动子启用了针对鞭毛蛋白表达的有针对性的调整，这反过来允许增强或抑制细菌运动。有趣的是，启动子设计参数与基因表达水平之间的关系是非线性的，突出了复杂的基础动力学。最佳细菌运动发生在30°C，说明了环境因素的影响。我们的发现证明了使用基因工程策略有效调节运动型等复杂微生物表型的能力。结果不仅扩展了我们对细菌基因调节的理解，而且还强调了合成生物学在创建各种生物技术应用中创建功能和适应性的微生物表型方面的变革潜力。
大肠杆菌在微流体限制和化学梯度下的异常扩散
我们报告了一种双层微流体装置，以研究限制和化学梯度对野生型大肠杆菌运动性的综合影响。我们在 50 µm 和 10 µm 宽的通道中跟踪单个大肠杆菌，通道高度为 2.5 µm，以产生准二维条件。我们发现与预期相反，即使在没有化学（葡萄糖）梯度的情况下，细菌轨迹也是超扩散的。在引入化学梯度或加强横向限制时，超扩散行为会变得更加明显。在没有化学梯度的情况下，弱限制的游程分布遵循指数分布。限制和化学吸引都会导致这种行为的偏差，在这些条件下，游程分布接近幂律形式。限制和化学吸引都抑制大角度翻滚。我们的结果表明，野生型大肠杆菌在物理限制和化学梯度下以类似的方式调节其运行和翻滚。
探索海洋环境中塑料生物膜的形成和大肠杆菌的定植
摘要 微生物（包括潜在病原体）可在水环境中的塑料表面定殖。本研究调查了大肠杆菌（E. coli）作为水环境中粪便病原体的替代物对塑料颗粒的定殖情况。将来自污染海滩的塑料颗粒放置在添加了大肠杆菌的海水水族箱中。多种细菌（主要来自变形菌门）在 24 小时内迅速在颗粒上定殖，其中值得注意的是以塑料或碳氢化合物降解而闻名的菌种。在 26 天内，塑料表面形成了生物膜，细菌种群达到 6.8 10 5 个 16S rRNA 基因拷贝数 (gc) mm 2 。使用培养方法在颗粒中检测到大肠杆菌长达 7 天，无论来源或环境因素如何，其附着密度均有所不同。该研究强调塑料生物膜是大肠杆菌的储存器，有助于粪便细菌在水生系统中生存和持续存在。这些发现加深了我们对海洋环境中塑料污染相关风险的理解，深入了解了粪便指标的行为及其对水质评估的影响，同时提供了有关塑料相关微生物群落中潜在病原体传播的宝贵信息。