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World File Search System大肠杆菌
大肠杆菌 K12 长时间暴露于模拟微重力后的表型变化
在过去的几十年中，人们对太空环境在微生物遗传和表型变化中的作用的研究兴趣日益浓厚。更具体地说，人们担心宇航员在执行月球及更远太空任务期间的健康会因许多条件的变化而受到损害。这些变化包括细菌生理学变化，这些变化会导致与人类健康直接相关的变化，例如毒性和抗生素耐药性，或生命支持系统的功能变化，例如供水或处理组件中生物膜形成的增加。十多年来，人们一直在研究太空条件对微生物的影响；然而，仍然需要确定微重力的生理效应不仅对细菌生长的影响，而且对可能有助于表型可塑性和微生物适应的不同毒力相关表型的影响。本研究重点是利用 2D 微重力模拟物来解释共生菌大肠杆菌 K12 在模拟微重力条件下生长后的表型变化。利用 2D 回转器，大肠杆菌生长长达 22 天，并用于测量通常与毒力相关的表型变化。测量的表型包括细胞群生长、生物膜发育以及对酸性 pH 和氧化应激的反应。我们的研究结果表明，在酸性条件下，生物膜形成有增强趋势，对氧化应激的抵抗力下降，并且更容易生长。这些结果表明，微重力调节大肠杆菌的适应性和表型可塑性，从而导致毒力发生变化。
大肠杆菌DNA回旋酶DNA交叉捕获的结构基础
对于大多数生物体，DNA采用了负超螺旋的状态[（ - ）SC]，该状态已知促进DNA螺旋的疾病，从而促进与关键细胞过程有关的分子机械获得遗传信息的获取（1）。相比之下，在DNA复制和转录机械之前生成正涂层[（+）SC]（2）。在没有放松（+）SC的拓扑异构酶的情况下，这些基本过程受到阻碍（3）。IIA型DNA拓扑异构酶（topoiia）是进化保守的大分子，通过通过短暂的双链断裂，使DNA弛豫，衰减和脱节来调节DNA拓扑，从而调节DNA拓扑。拓扑素酶是用于传染病和癌症治疗的治疗剂的主要靶标（5，6）。
大肠杆菌中双向姐妹重新分裂的相互依存进展
抽象目标在低收入和中等收入国家（LMIC）中，糖尿病的负担正在增加。很少有研究探讨了LMIC中糖尿病患者的护理途径。这项研究评估了危地马拉农村糖尿病成年人的护理轨迹。Design A qualitative investigation was conducted as part of a population-based study assessing incidence and risk factors for chronic kidney disease in two rural sites in Guatemala.807个个体的随机样本对两个部位的糖尿病进行了血红蛋白A1C（HBA1C）筛查。Based on results from the first 6 months of the population study, semistructured interviews were performed with 29 adults found to have an HbA1c≥6.5% and who reported a previous diagnosis of diabetes.访谈探索了通往糖尿病护理的途径和经历。Detailed interview notes were coded using NVivo and used to construct diagrams depicting each participant's pathway to care and use of distinct healthcare sectors.Results Participants experienced fragmented care across multiple health sectors (97%), including government, private and non-governmental sectors.The majority of participants sought care with multiple providers for diabetes (90%), at times simultaneously and at times sequentially, and did not have longitudinal continuity of care with a single provider.Many participants experienced financial burden from out-of-pocket costs associated with diabetes care (66%) despite availability of free government sector care.Participants perceived government diabetes care as low-quality due to resource limitations and poor communication with providers, leading some to seek care in other health sectors.Conclusions This study highlights the fragmented, discontinuous nature of diabetes care in Guatemala across public, private and non-governmental health sectors.Strategies to improve diabetes care access in Guatemala and other LMICs should be multisectorial and occur through strengthened government primary care and innovative private and non-governmental organisation care models.
毒素 - 抗毒素基因在大肠杆菌中的大肠杆菌中差异表达，并在氮，脂肪酸或碳饥饿条件下培养的斑点突变
营养物质的可用性是调节细胞整个代谢的关键因素。因此，养分的缺乏激活了特定的适应机制。严格的反应是控制和调节细菌应力条件适应的基本机制之一。严格的响应效应子是特定的核苷酸，四磷酸鸟苷和五磷酸鸟苷，统称为（p）PPGPP。These nucleotides, in E. coli , are synthesized by RelA and SpoT proteins using two different pathways, where RelA produces (p)ppGpp in response to the presence of uncharged tRNA in the ribosomal A-site, during amino acid starvation, or in response to pyruvate depletion during fatty acid starvation ( Kushwaha et al., 2019 ; Sinha et al., 2019 ).另一方面，斑点负责响应葡萄糖或脂肪酸饥饿以及其他几种压力条件（Potrykus and Cashel，2008年），负责（P）PPGPP的积累。此外，斑点也充当A（P）PPGPP水解酶（Potrykus and Cashel，2008年）。
克隆，表征和表达的大肠杆菌中的CpG DNA甲基酶的基因中的大肠杆菌中的克隆，表征和表达。菌株MQ1（M SSSI）
摘要我们在这里描述了从螺旋体SP中编码DNA甲基化酶的基因大肠杆菌中的克隆，表征和表达。菌株MQ1（M * SSSI）。该酶完全和仅CPG序列（1）。使用其自身的启动子在E.盘管中转录螺旋质基因。整个消息的翻译需要使用蛋白石抑制器，这表明UGA三胞胎代码用于螺旋形的色氨酸代码。对基因的序列分析在1158 bp的长开放式阅读框架中揭示了几个UGA三胞胎。在M SSSI中揭示的推导的氨基酸序列所有共同结构域的特征是细菌胞嘧啶DNA甲基酶的特征。尽管具有共同的序列特异性，但M SSSI的推定序列识别域与小鼠DNA甲基化酶的相似性没有明显的相似性。克隆的甲基化酶在体内和体外均仅CpG序列。与主要是维持甲基酶的哺乳动物酶相比，MSSI显示了从头开始的甲基化酶活性，这是原核生物胞嘧啶DNA甲基化酶的特征。
使用 EasyGuide CRISPR 系统设计适应大肠杆菌在蔗糖上生长的等位基因
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可证下可用（未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者此版本于 2024 年 12 月 22 日发布。；https://doi.org/10.1101/2024.12.20.629655 doi：bioRxiv 预印本
来自新西兰环境来源的大肠杆菌分离株的基因组序列草图
温血动物（包括鸟类）肠道中自然存在的大肠杆菌是淡水水质监测中粪便污染的常用指标，可作为粪便污染和病原体的替代指标（1）。然而，目前用于计数大肠杆菌的培养方法无法区分粪便大肠杆菌和归化或环境相关的“类大肠杆菌”菌株，也称为大肠杆菌隐蔽进化枝（2-4）。Escherichia whittamii（隐蔽进化枝 2）（5）、Escherichia ruysiae（隐蔽进化枝 3 和 4）（6）和 Escherichia marmotae（隐蔽进化枝 5）（7）是最近描述的类群，但宿主物种和环境持久性仍有待确定。该项目专注于大肠杆菌和大肠杆菌属的全基因组测序。来自环境来源（淡水、河流沉积物、水生生物膜、土壤和鸟类及哺乳动物的粪便）。菌株是在研究对比土地使用对大肠杆菌属的影响的研究中获取的，并按照之前描述的方式进行培养（8）。大肠杆菌和新大肠杆菌属的基因组数据将提供有关这些细菌在环境中存活的信息和更准确的粪便追踪，从而能够识别并迅速解决影响水道的最严重污染源。
DUKORAL® 口服灭活霍乱和产肠毒素大肠杆菌疫苗
腹泻，由霍乱细菌产生。ETEC 细菌也会产生一种毒素，这种毒素与霍乱毒素几乎相同。您的身体产生的对抗霍乱毒素的抗体也会对抗 ETEC 毒素。如果接种疫苗的人接触到霍乱细菌、霍乱毒素或 ETEC 毒素，身体通常会将其消灭。接种疫苗后，您的身体通常需要一周时间才能产生针对霍乱或 ETEC 细菌引起的腹泻的保护作用。大多数人会产生足够的抗体来预防霍乱或 ETEC 细菌引起的腹泻。但是，与所有疫苗一样，不能保证 100% 的保护。大约 85% 的人可以在初次接种疫苗后的 6 个月内获得对霍乱的保护。大约 60% 的人在第二剂疫苗接种后的 3 个月内获得对 ETEC 腹泻的保护。疫苗不会让你或你的孩子患上霍乱或 ETEC 腹泻。 Dukoral ® 发生严重反应的可能性非常小，但是不接种霍乱疫苗的风险可能非常严重。
工程大肠杆菌菌株用于生产长的单链DNA
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。它是此预印本版本的版权持有人，该版本发布于2024年2月29日。 https://doi.org/10.1101/2024.02.29.582813 doi：Biorxiv Preprint
大肠杆菌 BL21 对 D-木糖的有效厌氧消耗...
比较了在含有 D-葡萄糖 (12.5 mM) 和 D-木糖 (12.5 mM) 的发酵培养基中生长的野生型和适应性进化的 BL21(DE3) 菌株的 xylA 和 xylF 基因 (分别编码木糖异构酶和木糖 ABC 转运蛋白) 的表达水平。与 BL21(DE3) 相比，JH001 菌株中 xylA 和 xylF 基因的表达分别上调了 11 倍和 3 倍。同样，在 JH019 菌株中，xylA 和 xylF 基因的表达水平与野生型菌株相比分别增加了 5 倍和 2 倍 (图 4A)。当每种菌株在仅含有 D-木糖 (25 mM) 的发酵培养基中生长时，JH001 和 JH019 细胞的 xylA 和 xylF 基因转录水平显著升高，至少比野生型 BL21(DE3) 菌株高出 5 倍（图 4B）。这些结果表明，D-木糖运输和代谢酶在携带 xylR 适应性突变的适应性 BL21(DE3) 细胞中高度表达。