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World File Search System大肠杆菌
使用 MAD7TM 在大肠杆菌中进行基因编辑的快速入门指南
如果 MAD7 和 gRNA 由不同的载体编码，则可以依次（MAD7 然后是 gRNA）或同时将其转化为细胞。如果 MAD7 和 gRNA 在同一个载体中，只需将载体转化为细胞即可。根据需要进行基因编辑实验。注意：如果进行精确编辑，则需要 DNA 供体模板。DNA 供体可以是化学合成的单链 DNA (ssDNA) 或双链 DNA (dsDNA)，也可以克隆到表达 gRNA 的载体中。5' 和 3' 同源臂的长度取决于所需精确编辑的长度，可能需要针对您的系统进行优化。此外，Lambda Red（或其他重组酶）必须与 MAD7 共同表达才能实现最佳重组。
评估重组侵入性，非致病性大肠杆菌作为针对细胞内病原体Brucella
我们的方法利用非病原性大肠杆菌在递送和呈递抗原时模仿细胞内病原体的布鲁氏菌融合体来刺激TH1和CTL反应。大肠杆菌通常是细胞外的，而布鲁氏菌是细胞内细菌。因此，我们启动了大肠杆菌（DH5α），以表达含有耶尔森氏菌的INV基因的质粒，单核细胞增生李斯特氏菌的基因和HLY基因[31]。通过结合αβ1-整合素异二聚体来引入宿主细胞的大肠杆菌侵袭。整合素的聚类后，Inva-sin激活了信号级联。一种信号通路会导致局灶性粘附组分的激活，包括SRC，局灶性粘附激酶和细胞乳蛋白蛋白，导致形成伪足，使细菌吞噬细菌进入宿主细胞。侵入蛋白与β1-整合蛋白的结合是必要的，并且足以诱导细菌的吞噬，即使是非专业的吞噬细胞。第二个途径，包括Rac1，NF-κB的激活和有丝分裂原激活的蛋白激酶，导致促炎细胞因子的产生[32]。互隔化后，将大肠杆菌带入发生细菌裂解的吞噬体/溶酶体。HLY基因产物以及其他细菌蛋白被释放到乳胶囊泡中。硫酸激活的Hly，也称为李斯特氏蛋白酶O（LLO）是一种在低pH值下的结合和孔形吞噬体膜的孔形成细胞溶胶蛋白酶。此批判步骤将抗原从大肠杆菌出口到细胞质细菌的细胞质含量可以通过LLO产生的孔中逃脱到乳腺细胞的胞质区室。
来自Saboba区和Bolgatanga Municipality Ghana的食源沙门氏菌和大肠杆菌的基因组表征
肠道沙门氏菌和大肠杆菌是与人类和动物中食源性疾病有关的众所周知的细菌。为它们的进化，毒力因素和抗药性确定提供了宝贵的见解。这项研究旨在表征先前分离的沙门氏菌（n = 14）和e。大肠杆菌（n = 19），使用全基因组测序中的牛奶，肉及其相关的餐具。在加纳，大多数沙门氏菌血清射手（弗雷斯诺，普利茅斯，iftantis，fivantis，give和orle-ans）在加纳尚待报道。大多数沙门氏菌分离株都是泛敏感的，但是赋予fosfomycin的抗性的基因（Fosa7。2）和四环素（TET（a））分别在一个和三个分离株中检测到。七个沙门氏菌分离株带有INCI1-I（Gamma）质粒复制子。尽管在沙门氏菌菌株中抗菌抗性并不常见，但大多数（11/19）E。大肠杆菌菌株至少具有一个分辨率基因，近一半（8/19）具有多药耐药性和携带质粒。19 e中的三个。大肠杆菌菌株属于通常与肠道e e相关的血清。大肠杆菌（EAEC）病原体。虽然属于毒力相关谱系的菌株缺乏关键质粒编码的毒力质粒，但在大多数E中都检测到了几种质粒复制子。大肠杆菌（14/19）菌株。被这些病原体污染的食物可以作为疾病传播的工具，带来严重的公共卫生风险，并需要严格的食品安全和卫生习惯，以防止爆发。因此，需要进行持续的监视和预防措施，以阻止食源性病原体的传播并降低加纳相关疾病的风险。
北巴勒斯坦地区肉鸡养殖场分离的禽致病性大肠杆菌的分子特征
溶血性尿毒症综合征、脑膜炎、脑膜炎症、脓毒症、手术部位感染、尿路感染和医院获得性肺炎均与 ExPEC 有关 [1]。禽致病性大肠杆菌 (APEC) 是 ExPEC 的一个亚型，已成为禽类宿主的主要病原体，可引起禽类大肠杆菌病，这是一种以多种局部和全身感染为特征的综合征 [2]。最常见的病变是脐炎、蜂窝织炎、心包炎、肝周炎、气囊炎、心包炎、卵腹膜炎、输卵管炎、大肠杆菌肉芽肿和全身感染。导致疾病的大肠杆菌菌株中存在许多毒力因子 (VF)，这些毒力因子编码在质粒、噬菌体或致病岛 (PAI) 内的细菌染色体上，以及其他移动元件 [3]。致病性大肠杆菌菌株通过染色体或染色体外转移从非致病性菌株获得毒力操纵子 [4]。多项研究表明，由不同基因编码的一些 VF 增强了 APEC 的致病性，导致大肠杆菌病和肉鸡组织中的生长 [5, 6]。实验室用于识别大肠杆菌的传统诊断技术
在大肠杆菌支架基因组中重建鼠疫耶尔森菌脂质 A
Access Microbiology 是一个开放的研究平台。预印本、同行评审报告和编辑决定可在本文的在线版本中找到。收到日期：2023 年 10 月 11 日；接受日期：2024 年 6 月 26 日；发布日期：2024 年 7 月 17 日作者隶属关系：1 美国陆军作战能力发展司令部化学生物中心，8908 Guard St. E3831，Gunpowder，MD 21010，美国；2 Excet Inc. 6225 Brandon Ave #360，Springfield，VA 22150，美国。*通信：Nathan D. McDonald，Nathan.d.mcdonald5.civ@army.mil 关键词：CRISPR-Cas9；基因组工程；脂质 A；脂多糖。缩写：KDO，3-脱氧-d-甘露-辛-2-乌洛索；LOS，脂寡糖；LPS，脂多糖；PAM，原间隔区相邻基序。本文的在线版本提供了两个补充图。000723.v3
大肠杆菌中的全基因组 CRISPR-Cas9 筛选确定了有效靶向的设计规则
图 1. 全基因组 Cas9 杀灭筛选揭示了大规模消耗模式。a) 在携带受 Ptet 启动子控制的 cas9 的大肠杆菌菌株 LC-E19 中引入全基因组的向导 RNA 文库。细胞在 1nM aTc 存在下生长，并在诱导前和诱导后几小时对向导 RNA 文库进行测序。b) 散点图显示基因组周围向导的 log2FC。黑线表示窗口大小为 6kb 的移动平均值（圆外线：log2F=2，圆心：log2F=-6）。c) aTc 诱导 2H、4H 和 6H 后基因组周围向导 RNA 消耗的移动平均值。d) 在不同向导 RNA 存在下进行 Cas9 诱导后的延时显微镜检查。e) qPCR 测量的质粒拷贝数倍数变化，以非靶向对照为标准。点表示独立的生物学重复，黑条表示中位数。
红姜乙醇提取物抑制大肠杆菌和金黄色葡萄球菌的效果及机制
大肠杆菌和金黄色葡萄球菌是导致全球传染病的细菌。随着当今医学的发展，抗生素耐药性病例不断增加，人们越来越需要探索具有杀菌或抑菌特性的替代物质，包括来自天然来源的物质。红姜 (Zingiber officinale var. rubrum) 以其药用特性而闻名，尤其是其抗菌作用。这项研究旨在评估红姜抑制大肠杆菌和金黄色葡萄球菌生长的能力。进行了植物化学测试以确定提取物中的活性化合物，同时使用最低抑菌浓度 (MIC) 评估抗菌活性。用分光光度计和扫描电子显微镜 (SEM) 研究了抗菌作用机制。结果表明，红姜提取物含有生物碱、黄酮类化合物、皂苷、单宁和萜类化合物等活性化合物。大肠杆菌的最低抑菌浓度为 125 μg/ mL，金黄色葡萄球菌的最低抑菌浓度为 500 μg/ mL。在 260 nm 和 280 nm 吸光度下测量，添加 MIC 1 和 MIC 2 的红姜乙醇提取物与对照组相比显著影响细胞渗漏 (p<0.01)。SEM 分析显示，用红姜提取物处理的细菌细胞出现受损和空泡。因此，可以得出结论，红姜提取物对大肠杆菌和金黄色葡萄球菌的生长具有抑制作用，可以推荐作为治疗传染病的天然抗生素的替代品。
大肠杆菌和其他从巴格马蒂河分离的大肠菌菌中的抗菌抗性
pipericilin tazobactam（pit，100/10μg），Ce Fimime（CPM，30μg），CE固定（CFM，5μg），Ceotaxime（CTX，30μg），Ceftazidime（CazIme）（CAZ，30μg，30μg），ImipeNem（ImipeNem（ImipeNem（ImipeNem），ImipeNem（ImipeNem（ImipeNem））（imipnem（ipm，10μg）四环素（TE，3μg），cipro floproxatin（CIP，5μg），Nalidixic Acid（Na，30μg），氯霉素（C，30μg），红霉素（E，15μg），硝基氟烷素（Nitrofurantoin（Nit，300μG） （COT，25μg，1.25/23.75μg）。用于质量控制，使用了ATCC 25922培养。在正常盐水中制备了对生物体的接种，并与0.5 MAC FARLAND标准相比。接种物被擦在MHA板上，并在放置抗生素盘之前干燥5分钟。对于90毫米板，接种了五种不同的抗生素。将板孵育18小时，并用尺度测量抑制区。将抑制区与标准值进行比较。根据临床实验室标准指南（CLSI 2020）测试了抗生素。