摘要 本综述介绍了 DNA 微阵列技术及其应用的最新进展。介绍了多种 DNA 微阵列或 DNA 芯片设备和系统,以及它们的制造方法和用途。这包括用于高通量筛选应用的高密度微阵列和用于各种诊断应用的低密度微阵列。所综述的微阵列制造方法包括各种喷墨和微喷射沉积或点样技术和工艺、原位或芯片上光刻寡核苷酸合成工艺以及电子 DNA 探针寻址工艺。所综述的 DNA 微阵列杂交应用包括基因表达分析和点突变、单核苷酸多态性 (SNP) 和短串联重复序列 (STR) 基因分型的重要领域。除了许多分子生物学和基因组学研究用途外,本综述还涵盖了微阵列设备和系统在药物基因组学研究和药物发现、传染病和遗传病和癌症诊断以及法医和遗传鉴定方面的应用。此外,还回顾了正在开发并应用于蛋白质组学和细胞分析新领域的微阵列技术。
摘要:传染病被认为是全球死亡的主要原因,占所有死亡的三分之一。传统上,诊断传染病的微生物学方法是劳动密集型且耗时的。分子方法在这些约束上显着改善。DNA微阵列是一种针对传染病的新型诊断测试,旨在同时鉴定多种生物。微阵列在传染病诊断中有各种高级应用,包括2019年大流行19号,检测食源性传染剂和奈瑟氏菌脑膜炎的检测。这篇综述的目的是提供DNA微阵列技术的更新应用,以诊断传染病,并探索新的DNA微阵列方法的发展。总而言之,DNA微阵列技术是未来的快速,准确的诊断工具,用于传染病诊断和检测抗菌素耐药性。关键字:DNA微阵列,传染病诊断,分子技术
未知的原始(杯)原始描述/背景癌症(杯)占美国所有癌症病例的3%,详细的病史和物理以及放射学和组织学检测可以识别一些次要肿瘤的一些主要来源。1建议相应地确定可能的主要来源并指导治疗可能会改善健康结果。未知初级杯子的癌症是腺癌或未分化的肿瘤;少于它们可能是鳞状癌,黑色素瘤,软组织肉瘤或神经内分泌肿瘤。 骨肉瘤和软骨肉瘤很少产生未知主要的癌症。 最常见的原发性癌症最常见的主要部位是肺和胰腺,其次是结肠和胃,然后是肾脏,甲状腺,甲状腺和肝脏的乳腺,卵巢,前列腺和固体癌。 用于帮助识别杯子起源的常规方法包括彻底的病史和体格检查,胸部,腹部和骨盆的计算机断层扫描(CT)扫描;常规实验室研究;并针对特定体征和症状的有针对性评估。 2诊断和分类癌的未知主要癌症可以分为4个类别。 腺癌占未知主要癌症的70%。 神经内分泌肿瘤约为1%,鳞状细胞癌为5%,分化较差的癌症为20 -25%的未知主要癌症。 具有详细病理评估的杯子的活检可能包括对肿瘤的免疫组织化学(IHC)分析。未知初级杯子的癌症是腺癌或未分化的肿瘤;少于它们可能是鳞状癌,黑色素瘤,软组织肉瘤或神经内分泌肿瘤。骨肉瘤和软骨肉瘤很少产生未知主要的癌症。最常见的原发性癌症最常见的主要部位是肺和胰腺,其次是结肠和胃,然后是肾脏,甲状腺,甲状腺和肝脏的乳腺,卵巢,前列腺和固体癌。用于帮助识别杯子起源的常规方法包括彻底的病史和体格检查,胸部,腹部和骨盆的计算机断层扫描(CT)扫描;常规实验室研究;并针对特定体征和症状的有针对性评估。2诊断和分类癌的未知主要癌症可以分为4个类别。腺癌占未知主要癌症的70%。神经内分泌肿瘤约为1%,鳞状细胞癌为5%,分化较差的癌症为20 -25%的未知主要癌症。具有详细病理评估的杯子的活检可能包括对肿瘤的免疫组织化学(IHC)分析。IHC鉴定出存在不同类型肿瘤上的不同抗原,通常可以将上皮肿瘤(即癌)与黑色素瘤或肉瘤区分开。详细的细胞角蛋白面板通常可以进一步分类癌。但是,不同起源的肿瘤可能显示出重叠的细胞角蛋白表达。IHC的结果可能会提供狭窄的肿瘤起源可能来源的差异,但不一定是确定的答案。
简单的摘要:大约15%的患有先天性心脏病(CHD)的患者具有特定的遗传异常,称为拷贝数变体。他们的大多数基因检测(称为染色体微阵列(CMA))被认为是正常的。但是,我们怀疑即使在测试结果中没有报告过一些很小的遗传缺失,也可能与CHD有关。为了调查这一点,我们研究了319例CHD患者的基因测试数据。然后,我们专注于这些与CHD相关的小缺失中的基因,基于某些标准,例如它们与CHD的关联,其在胎儿心脏中的表达水平以及失去这些基因的潜在影响。分析数据后,我们发现这些未报告的小遗传缺失的可能性更大的可能涉及与CHD相关的基因以及可能很重要但以前尚未识别的基因。我们的研究表明,可以随时获得的“正常”基因测试数据对于发现与CHD的新遗传联系很有价值。此外,还应给予较小的遗传缺失,以使冠心病的潜在影响更加临床关注。
☐ 染色体分析,常规 ☐ 染色体分析,高分辨率(仅限血液) ☐ 染色体分析,嵌合性研究 ☐ 染色体分析和 FISH [指定探针] ☐ FISH(间期研究,指定以下探针) ☐ 染色体反射至 SNP 微阵列* ☐ 5 细胞染色体研究 + SNP 微阵列* ☐ SNP 微阵列* ☐ 建立细胞系以供送出测试
结果:从2019年到2021年,检测到皮肤分枝杆菌感染的发病率增加。最常见的感染病原体是野马菌,然后是脓肿。皮肤组织培养方法的敏感性,特异性和准确性分别为70%,100%和76.62%,而DNA微阵列CHIP测定法分别为91.67%,100%和93.51%。DNA微阵列芯片测定的灵敏度和准确性显着高于皮肤组织培养方法的灵敏度和准确性。这两种方法的阳性可能性和诊断优势比分别> 10和> 1。与DNA微阵列CHIP分析相比,皮肤培养方法中的负类似然比显着高(30%比8.33%),而Youden的指数显着较低(70.00%vs 91.67%)。假阴性结果与皮肤组织培养方法中使用抗生素的史存在显着关联。
帕金森氏病(PD)是一种严重的神经系统疾病,其特征是失去自愿运动和运动的大大减慢。传统上归因于环境因素,但最近的研究强调了遗传学在PD发作和进展中的重要作用。这项研究旨在通过分析来自四个数据集(83个PD和53个控制质量Nigra样品)的基因表达数据来鉴定PD中差异表达的基因(DEG)和相关途径,这些数据来自基因表达综合(GEO)数据库。使用GEO2R,我们通过富集确定了常见的DEG并进行了功能注释和KEGG途径富集分析。我们使用StringDB构建了蛋白质 - 蛋白质相互作用(PPI)网络,并通过CytoHubba鉴定了集线器基因。结果显示,在多巴胺能突触和可卡因成瘾等途径中富含18个临界DEG。关键集线器基因包括酪氨酸羟化酶(Th),溶质载体家族18构件A2(SLC18A2)和钾在内部整流的通道亚家族J成员6(KCNJ6)。这些发现提供了对PD分子机制的见解,突出了潜在的生物标志物和治疗靶标。本研究为未来的研究和制定帕金森氏病的有效治疗策略提供了强大的框架。
摘要:到目前为止,玻璃是生物分子阵列的最常见底物,包括高通量测序流动细胞和微阵列。通过使用硅烷化学为原位合成或生物学或化学合成的生物分子的原位合成或表面固定化提供适当的官能团和反应性,对天然玻璃羟基表面进行了修饰。这些阵列通常是寡核苷酸或肽的,然后在荧光读数之前在温暖的水缓冲液中进行长时间的孵育时间。在这些条件下,玻璃的硅质键易于水解,导致生物分子的显着损失和伴随的测定信号丧失。在这里,我们证明,与标准单足硅烷的等效官能化相比,用二倍硅烷的玻璃表面功能化可大大提高稳定性。使用光刻原位DNA的原位合成,我们表明二倍体硅烷与磷光素化学兼容,并且在所得阵列上进行的杂交提供了大大改善的信号和信号 - 噪声比率,并且与单足硅烷官方化的表面相比。
摘要:微阵列是过去二十年的开拓性技术之一,并且在生物学的所有相关领域都表现出了重要性。他们被广泛探索以筛选,识别和获得对生物分子(单独或复杂解决方案)特征性状的见解。A wide variety of biomolecule-based microarrays (DNA microarrays, protein microarrays, glycan microarrays, antibody microarrays, peptide microarrays, and aptamer microarrays) are either commercially available or fabricated in-house by researchers to explore diverse substrates, surface coating, immobilization techniques, and detection strategies.这篇评论的目的是探索自2018年以来的基于生物分子的微阵列应用程序的开发。在这里,我们涵盖了不同的印刷策略,底物表面修饰,生物分子固定策略,检测技术和基于生物分子的微阵列应用。2018 - 2022年期间着重于使用基于生物分子的微阵列识别生物标志物,病毒的检测,多种病原体的分化等。微阵列的一些潜在应用可能用于个性化医学,候选疫苗筛查,毒素筛查,病原体鉴定和翻译后修饰。