方法:从UCSC Xena和基因表达综合(GEO)数据库中提取了与CC和其他常见妇科癌有关的转录组数据和临床信息。在这项研究中,获得了CC(靶基因)的差异表达的CRRG,并通过“ clusterproFiller”进行了这些靶基因的功能富集分析。然后,将CC的生物标志物筛选为构建生存风险模型(风险评分)。此外,在不同风险组中进行了不同风险组的功能和肿瘤微环境(TME)分析,以进一步研究CC的潜在机制。此外,还进行了三种常见的妇科癌症中生物标志物的预后价值和功能分析,以揭示潜在的一致性或异质性法规。
对长的非编码RNA的功能,富含核的丰富转录本(Neat1)的功能知之甚少。neat1是形成拼贴需要的,但其各自的拼贴或独立功能尚不清楚。包括我们的一些研究报告说,Neat1参与了昼夜节律的调节。我们表征了Neat1遗传缺失在大鼠垂体细胞系中的影响。与通过CRISPR/CAS9删除Neat1的细胞相比,在高通量RNA测序的高通量RNA测序后,其昼夜节律表达模式或表达水平受到NEAT1的调节。发现受NEAT1缺失影响的众多RNA是昼夜节律或非曲目,目标或非目标的羊皮群,并且与许多关键的生物学过程相关联,表明Neat1与昼夜节律系统相互作用或独立性可以通过多种机构在关键的生理功能中起着关键作用。2021作者。由Elsevier B.V.代表计算和结构生物技术的研究网络发布。这是CC BY-NC-ND许可证(http://creative-commons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/)下的开放式访问文章。
睡眠障碍在自闭症谱系障碍(ASD)的青年中普遍存在。研究人员认为,昼夜节律功能障碍可能导致睡眠问题或加剧ASD症状。但是,这是有限的遗传证据。还不清楚一般人群中通过GWAS鉴定的失眠风险基因如何与ASD和常见的睡眠问题有关,例如ASD中的失眠性质。我们调查了包括昼夜节律途径基因和失眠风险基因对ASD风险以及ASD儿童的睡眠障碍的拷贝数变体(CNV)的贡献。我们研究了Simons Simplex Collection(SSC)和MSSNG数据库的5860 ASD Probands和2092个未受到影响的兄弟姐妹,以及来自两个未选择人群(Imagen and Generation scotland)的7509个人。睡眠持续时间和失眠症状是SSC概率的父母。我们分别识别335和616罕见的CNV,分别包含昼夜节律和失眠风险基因。与兄弟姐妹和未选择的对照相比,ASD概率中的缺失和复制在ASD检验中的代表性过高。 对于失眠风险基因,缺失(非重复)与两个队列中的ASD相关。 调整认知能力后,结果仍然很重要。 与含有其他基因的CNV相比,含有昼夜节律途径和失眠风险基因的 CNV与ASD的相关性更强。 昼夜节律基因不会影响ASD中的睡眠持续时间或失眠特征。 失眠的风险基因不耐受单倍努力的能力增加了复制时失眠的风险。缺失和复制在ASD检验中的代表性过高。对于失眠风险基因,缺失(非重复)与两个队列中的ASD相关。调整认知能力后,结果仍然很重要。与含有其他基因的CNV相比,含有昼夜节律途径和失眠风险基因的 CNV与ASD的相关性更强。 昼夜节律基因不会影响ASD中的睡眠持续时间或失眠特征。 失眠的风险基因不耐受单倍努力的能力增加了复制时失眠的风险。CNV与ASD的相关性更强。昼夜节律基因不会影响ASD中的睡眠持续时间或失眠特征。失眠的风险基因不耐受单倍努力的能力增加了复制时失眠的风险。CNV涵盖昼夜节律和失眠风险基因增加ASD责任,几乎没有对睡眠障碍的影响。
(未通过同行评审认证)是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印本版的版权持有人于2025年1月6日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.01.06.631487 doi:biorxiv preprint
由于开发这些模型的个人重点,新鼠标模型的抽象全面详细表征可能会具有挑战性。经常设计用于在有限数量的组织,阶段和/或其他情况下测试特定假设的模型。该模型是否会产生所需的表型,超出所需环境的表型可能是非常重要的工作密集型,并且通常不进行这些研究。但是,更广泛的表型引起的一般信息对于更广泛的科学界来说是无价的。国际小鼠表型联盟(IMPC)及其子公司,例如淘汰小鼠项目(KOMP),在简化此过程方面取得了长足的进步。尤其是,在整个胎儿/发育阶段检查内部器官系统方面,Microct的使用一直是宝贵的资源。在这里,我们提供了几种新颖的小插曲,证明了Microct在基于人类疾病相关性和未预测的基于人类疾病相关性的心脏表型中的实用性。
1 印度西孟加拉邦米德纳普尔学院生理学系,邮编 721101;2 美国纽约州花园城阿德菲大学文理学院生物系及美国纽约州花园城阿德菲大学戈登 F. 德纳心理学院心理学系;3 美国德克萨斯州休斯顿德克萨斯南方大学药学院药学系,邮编 77004;4 美国密苏里州圣路易斯华盛顿大学医学院精神病学系;5 美国俄亥俄州克利夫兰凯斯西储大学医学院精神病学系;6 巴西米纳斯吉拉斯联邦大学生物科学研究所遗传学、生态学和进化系,邮编 31270-901; 7 综合组学和应用生物技术研究所,Nonakuri,Purba Medinipur,721172,西孟加拉邦,印度;8 西方健康科学大学体育、锻炼和心理健康中心成瘾研究与教育部,加利福尼亚州波莫纳,91766,美国;9 匈牙利布达佩斯罗兰大学心理学研究所,1053,匈牙利;10 莱特州立大学邦绍夫特医学院和代顿 VA 医学中心精神病学系,俄亥俄州代顿,45435,美国;11 佛蒙特大学精神病学系,佛蒙特州伯灵顿,05405,美国;12 肯尼斯·布鲁姆行为与神经遗传研究所营养基因组学部,德克萨斯州奥斯汀,78701,美国; 13 以色列阿里埃勒大学阿德尔森医学院分子生物学系
KRAS的摘要突变激活通常发生在肺癌发生中,并且随着美国食品和药物管理局最近批准KRAS G12C的共价抑制剂,例如Sotorasib或Adagrasib,KRAS癌蛋白是非小细胞肺癌(NSCLC)的重要药理靶标。但是,并非所有KRAS G12C驱动的NSCLC都对这些抑制剂做出反应,并且那些反应反应的患者的耐药性出现可能是迅速而多效的。因此,基于共价抑制KRAS G12C的支柱,正在努力开发有效的组合疗法。在这里,我们报告说,KRAS G12C信号传导的抑制会增加KRAS G12C表达肺癌细胞的自噬。此外,DCC -3116(一种选择性ULK1/2抑制剂)的组合以及sotorasib显示了对人Kras G12C驱动的肺癌细胞增殖的合作/协同抑制体内体外和肿瘤对照中的抑制作用。此外,在KRAS G12C驱动的NSCLC的基因工程小鼠模型中,抑制KRAS G12C或ULK1/2的抑制会减轻肿瘤负担并增加小鼠的存活率。因此,这些数据表明ULK1/2介导的自噬是对肺癌中KRAS G12C抑制的药理作用的细胞保护胁迫反应。
昼夜节律,基础和类固醇分泌的季节性变化与几种哺乳动物物种的脑体积变化有关。然而,人类类固醇激素产生的昼夜节律变化与人类脑形态的节奏变化之间的关系在很大程度上是未知的。在这里,我们研究了类固醇激素中昼夜浮动之间的关系,在一项男性的精确成像研究中,男性在上午7点完成了40次MRI和血清学评估。和晚上8点在一个月的过程中,针对激素浓度在其峰值和Nadir处。昼夜浮动与全球和区域脑形态的明显变化相关。从早晨到晚上,总脑体积,灰质体积和皮质厚度降低,与类固醇激素浓度(睾丸激素,雌二醇和皮质醇)的降低一致。并行,脑脊液和心室尺寸从A.M.到下午全球变化是由枕骨和顶叶皮层内的减少驱动的。这些发现突出了脑形态中的自然节奏,这些节奏与类固醇激素的昼夜潮流和流动保持在一起。
糖尿病是一种以高血糖为特征的慢性疾病,分为两种主要类型:1型和2型。2型糖尿病(T2D)约占所有被诊断的糖尿病病例的95%,其患病率在全球范围内增加(Ong等,2023)。T2D的特征症状是口渴,经常感染和体重减轻。此外,T2D会导致外周循环,心血管疾病,肾衰竭,甚至死亡,如果不进行治疗,T2D(Chatterjee等,2017)。然而,由于高血糖向T2D的进展缓慢,许多病例仍无法诊断(Zheng等,2018)。此外,T2D基础的病理机制仍然复杂且不清楚。各种环境因素,包括昼夜节律,驱动T2D发病机理和进展。越来越多的研究表明,昼夜节律中断(例如旋转工作变化和喷气滞后)之间存在关联,以及T2D的高流行率(Pan等,2011; Onaolapo和Onaolapo,2018; Gao等,2020)。昼夜节律是
植物是无柄生物,已经获得了高度塑料发育策略以适应环境。在这些过程中,口腔过渡对于确保生殖成功至关重要,并且受到多个内部和外部遗传网络的最终调节。控制植物对白天长度的响应的光周期途径是控制流动的最重要的途径之一。在ara-bidopsis光周期旋转中,constans(CO)是中心基因,它在漫长的一天结束时在叶片中激活了叶片开花基因座t(ft)的表达。昼夜节律强烈地表达了CO的表达。迄今为止,尚无关于从光周期途径回到昼夜节律的反馈回路的证据。使用转录网络,我们确定了相关的网络图案,可以调节昼夜节律之间的相互作用。基因表达,染色质免疫沉淀实验和表型分析使我们能够阐明CO在昼夜节律中的作用。植物具有改变的CO表达的植物显示出不同的内部时钟周期,通过每日叶子节奏运动来衡量。我们表明,通过与启动子上的特定位点结合,CO上调了与昼夜节律时钟相关的关键基因的表达,例如CCA1,LHY,PRR5和GI。CO上的大量PRR5抑制靶基因上调,这可以解释COCo-Prr5复合物与BZIP转录因子HY5相互作用,并有助于将复合物定位在时钟基因的启动子中。总而言之,我们的结果表明,可能有一个反馈循环,可以在其中将循环回到昼夜节律时钟,从而为昼夜节律提供了季节性信息。