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World File Search System核糖
新颖的核糖开关通过口服小分子诱导剂调节哺乳动物中的AAV传递的转基因表达
HEK 293细胞用荧光素酶构建体，其中含有鸟嘌呤适体的核糖开关（左），腺嘌呤适体（中间）或TPP Aptamers（右）。转染的细胞用适体配体以指定的剂量处理。图显示了开关对不同适体粘合剂的剂量反应。con 1是没有核糖开关盒的控制构建体。
Ribosafe RNase抑制剂
核糖核酸酶（RNase）无处不在，可以在许多方面引入实验：例如，在RNA隔离期间的共纯化，裸手和移液器尖端的持久性。这种RNase污染通常不会引起人们的注意。核糖防护RNase抑制剂非常适合对RNA敏感的应用，例如RT-QPCR，因为即使少量RNase也可能不利于最终的实验结果。核糖防护酶抑制剂是一种高效的抑制剂（图1）一系列真核RNass，没有抑制聚合酶或逆转录酶活性（图2），因此可以用于cDNA合成或一步RT-QPCR反应中。
使用基于 CRISPR 核糖核蛋白的方法扩展念珠菌物种的基因操作和发现工具包
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可证（未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者此版本于 2023 年 6 月 17 日发布。；https://doi.org/10.1101/2023.06.16.545382 doi：bioRxiv 预印本
通过Shap和贝叶斯机器学习的聚合物设计优化PDNA和CRISPR核糖核蛋白递送
核酸是重要的治疗方法，但是递送效率的问题继续阻碍诊所的广泛进步。输送系统对于封装和保护这些大型且高度敏感的有效载荷并改善组织内在化至关重要。1,2当前的病毒输送方法一直在努力克服障碍，包括有限的货物容量，3个制造成本，4和免疫。5,6个非病毒输送方法已在商业配方中得到证明，可用于外源性核酸药物的功能，可调节和不兼容的车辆。聚生物是建立的药物制剂，但由于性能较低而导致在体内携带核酸的利用不足。7然而，由于化学和物理调制的易于性以及可及时的制造，因此存在无限的聚合物输送车辆的潜力。7,8
病毒衍生的合成核糖开关用于实时冠状病毒在活细胞中感测
活细胞中病毒感染的实时感知对于病毒学研究和抗病毒药发育至关重要。但是，现有方法面临低信号灵敏度的挑战以及病毒操纵和细胞固定的必要性。在这里，我们开发了一种病毒核糖开关（VRIBO）方法，该方法采用病毒复制酶在病毒感染后诱导转基因表达。Vribo旨在检测活细胞中的病毒实时转录和复制，这响应触发了报告基因和治疗基因的翻译。通过整合病毒包装序列，可以通过后代病毒体将Vribo传播到相邻细胞，从而有效地充当“特洛伊木马”。由于跨冠状病毒的顺式作用RNA结构保存，负链Vribo元件显示出有效检测了几种冠状病毒，包括229E和OC43。值得注意的是，Vribo充当双重用途系统，既充当感染检测器和诱导抗病毒系统。vribo具有基本病毒学研究应用的潜力，可以在改善未来冠状病毒的mRNA药物的诱导表达方面采用。
核定向核糖核酸酶变体靶向癌症干细胞并抑制乳腺癌细胞的迁移和侵袭
简单总结：在过去的几十年中，癌症治疗的成就显著提高了患者的生存率。然而，癌症仍然是导致死亡的主要原因之一。有人认为，治疗失败是由一种名为癌症干细胞的肿瘤细胞亚群介导的，这些细胞可以在治疗后存活并促进癌症复发。针对这些细胞对于改善癌症治疗非常重要。我们的研究目的是确定人类核糖核酸酶变体对 3D 生长的乳腺癌细胞和癌症干细胞的影响。此外，我们研究了它对乳腺癌细胞迁移和产生转移能力的影响，约 90% 的癌症死亡是由这种转移引起的。我们表明，这种核糖核酸酶可以抑制 3D 生长的肿瘤细胞，而不会影响正常的乳腺细胞，这显著抑制了癌症干细胞的发展。此外，它还降低了肿瘤细胞的迁移和侵袭能力。
工程病毒样颗粒用于体内瞬时递送主要编辑器核糖核蛋白复合物
Prime 编辑能够在生物系统中精确安装基因组替换、插入和删除。然而，在体外和体内高效递送 Prime 编辑组件仍然是一个挑战。我们在此报告了 Prime 编辑改造的病毒样颗粒 (PE-eVLP)，它们将 Prime 编辑蛋白、Prime 编辑向导 RNA 和切口单向导 RNA 作为瞬时核糖核蛋白复合物递送。我们系统地设计了 v3 和 v3b PE-eVLP，与基于我们之前报告的碱基编辑器 eVLP 架构的 PE-eVLP 构建体相比，其在人类细胞中的编辑效率提高了 65 到 170 倍。在两种遗传性失明的小鼠模型中，单次注射 v3 PE-eVLP 可在视网膜中产生治疗相关的 Prime 编辑水平、蛋白质表达恢复和部分视觉功能挽救。优化的 PE-eVLP 支持 Prime 编辑核糖核蛋白的瞬时体内递送，通过减少脱靶编辑和消除致癌转基因整合的可能性来提高 Prime 编辑的潜在安全性。
基因
™ ( 合成的crRNA 和tracrRN) 和重组的Cas9 蛋白可以形成特核糖核蛋白复合物(RNP) 。 直接转染sgRNA-Cas9 RNP 可以避免质体DNA 嵌入宿主基因组， 也可进一步增强和扩展CRISPR 基因修饰技术的应用。 早期的报导表明， 与转染Cas9 质体相比， 利用sgRNA-Cas9 RNP 转染的基因组修饰具有更高的特异性(Juris et al. 2015, Kim et al., 2014, Lin et al. 2015, Liang et al. 2015) 。 此外， sgRNA- Cas9 RNP 技术在细胞治疗应用中也具有更好的愿景， 比如近期成功获得基因插入的人类原代T 细胞(Schumann et al. 2015) 。
250113-02咨询临床研究 - 与gg-t-t-cellen- ...
摘要：已要求COGEM就一项临床研究的环境风险进行建议，在该研究中，固体肿瘤患者用转基因（GG）免疫细胞治疗。在临床研究中，人体自身的免疫细胞（T细胞）使用所谓的CRISPR/CAS核糖核酸酶复合物在体外进行了基因修饰。调整后，再次将GG T细胞给予患者。CRISPR/CAS核糖核酸酶复合物由核酸酶蛋白与RNA序列结合使用，RNA序列与DNA分子一起插入。这将存在于T细胞上的原始受体变成肿瘤特异性受体。由于这种修饰，GG-T细胞识别肿瘤细胞，并在给患者给药后对肿瘤产生免疫反应。不能排除在T细胞修饰后，剩余的核糖核酸酶复合物保留在GG T细胞中或医疗产品的悬浮液中。在细胞生长中，几乎没有观察到48小时后的复合物。在患者中，预计免疫系统将去除剩余的核糖核酸酶复合物。如果剩余的核糖核酸酶复合物仍然存在于GG T细胞中，则这些（GG）T细胞将无法在体内生存。上述考虑到COGEM的观点是，进行临床研究的环境风险明显很小。
用于人类原代免疫细胞和造血干细胞中 CRISPR 工程 (PERC) 的肽基核糖核蛋白递送
Srishti U Sahu 1,2,3,10、Madalena Castro 1,2,3,10、Joseph J Muldoon 4,5、Kunica Asija 1,2,3、Stacia K Wyman 1、Netravathi Krishnappa 1、Justin Eyquem 4,5,6,7,8,9、David N Nguyen 1,4,5、Ross C Wilson 1,2,3 隶属关系：1 美国加利福尼亚州伯克利市加州大学伯克利分校创新基因组学研究所。2 美国加利福尼亚州伯克利市加州大学伯克利分校分子与细胞生物学系。3 美国加利福尼亚州伯克利市加州定量生物科学研究所。4 美国旧金山市格拉德斯通-UCSF 基因组免疫学研究所。5 美国旧金山市加州大学旧金山分校医学系。 6 美国加利福尼亚州旧金山市加利福尼亚大学帕克癌症免疫治疗研究所。7 美国加利福尼亚州旧金山市加利福尼亚大学微生物学和免疫学系。8 美国加利福尼亚州旧金山市加利福尼亚大学海伦·迪勒家庭综合癌症中心。9 美国加利福尼亚州旧金山市加利福尼亚大学人类遗传学研究所。10 这些作者对本研究的贡献相同。