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World File Search System梭菌属
通过基于 Cas12a 的 CRISPR 干扰对溶剂产气梭菌进行单基因和多基因抑制
构成梭菌属的革兰氏阳性、产芽孢、专性厌氧厚壁菌种具有广泛的原料消耗能力并产生增值代谢产物，但基因操作困难，限制了它们的广泛吸引力。CRISPR-Cas 系统最近已应用于梭菌种，主要使用 Cas9 作为反选择标记与基于质粒的同源重组结合。CRISPR 干扰是一种通过精确靶向核酸酶缺陷型 Cas 效应蛋白来降低特定基因表达的方法。在这里，我们开发了一种基于 dCas12a 的 CRISPR 干扰系统，用于抑制多种中温梭菌种的转录基因。我们表明，与源自其他细菌的 CRISPR Cas 系统相比，由于梭菌种中的 GC 含量低，基于新凶手弗朗西斯菌 Cas12a 的系统具有更广泛的适用性。我们证实，丙酮丁醇梭菌中靶基因的转录水平降低了 99% 以上，巴氏梭菌中靶基因的转录水平降低了 75% 以上。我们还通过使用单个合成 CRISPR 阵列证实了多重抑制，靶基因表达降低了 99%，并阐明了其表达降低的独特代谢特征。总体而言，这项工作为无需基因编辑的高通量遗传筛选奠定了基础，而基因编辑是梭菌群落当前使用的筛选方法的一个关键限制。
个性化的梭状芽胞杆菌艰难梭菌植入风险预测和益生菌治疗评估
人类肠道的治疗评估。2作者：Alex Carr 1,2，Nitin S. Baliga 1,2,3,4，Christian Diener 1,5，**和Sean M. 3 Gibbons 1,2,6,7，* 4隶属关系：5 6 1 1 6 1 Systems Biology Institute for Systems Biology，Seattle，西雅图，西雅图，华盛顿州西部，美国华盛顿州，美国7 2分子工程学计划 Seattle, WA, USA 9 4 Lawrence Berkeley National Lab, Berkeley, CA, USA 10 5 Diagnostic and Research Institute of Hygiene, Microbiology and Environmental 11 Medicine, Medical University of Graz, Graz, Austria 12 6 Departments of Bioengineering and Genome Sciences, University of Washington, 13 Seattle, WA, USA 14 7 eScience Institute, University of Washington, Seattle, WA, USA 15 * correspondence can be addressed to cdiener@isbscience.org和162作者：Alex Carr 1,2，Nitin S. Baliga 1,2,3,4，Christian Diener 1,5，**和Sean M. 3 Gibbons 1,2,6,7，* 4隶属关系：5 6 1 1 6 1 Systems Biology Institute for Systems Biology，Seattle，西雅图，西雅图，华盛顿州西部，美国华盛顿州，美国7 2分子工程学计划 Seattle, WA, USA 9 4 Lawrence Berkeley National Lab, Berkeley, CA, USA 10 5 Diagnostic and Research Institute of Hygiene, Microbiology and Environmental 11 Medicine, Medical University of Graz, Graz, Austria 12 6 Departments of Bioengineering and Genome Sciences, University of Washington, 13 Seattle, WA, USA 14 7 eScience Institute, University of Washington, Seattle, WA, USA 15 * correspondence can be addressed to cdiener@isbscience.org和16
高通量 DNA 条形码技术用于测定禁食期间圈养极度濒危马来虎 (Panthera tigris jacksoni) 的肠道微生物组
马来虎 ( Panthera tigris jacksoni ) 是马来西亚半岛的极度濒危物种。为了模拟老虎不每天捕猎的野外环境，许多野生动物保护区并不每天喂食老虎。然而，禁食对圈养马来虎肠道菌群的影响仍然未知。这项研究旨在通过比较禁食和正常喂养条件下圈养马来虎的微生物群落来表征其肠道菌群。这项研究是在马来西亚半岛的马六甲动物园进行的，马来虎每周一禁食。总共收集了 10 个马来虎粪便样本、2 个孟加拉虎（外群）和 4 个狮子（外群）的粪便样本，并进行了针对 16S rRNA V3-V4 区域的宏条形码分析。总的来说，我们在马来虎样本中确定了 14 个门、87 个科、167 个属和 53 种肠道微生物组。本研究发现的潜在有害细菌属包括梭杆菌、拟杆菌、狭义梭菌 1、
大肠杆菌RECQ DNA解旋酶
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微型小马种马的精液微生物组
上下文。对种马精液的微生物组成知之甚少。目标。描述在健康微型小马种马中检测到的微生物群。方法。精液标本是在一个时间点使用密苏里人的人工阴道收集的。在这些标本上进行了16S rRNA基因的基因组DNA测序 PACBIO（PACBIO（PACICICIENCES），随后进行了下一代微生物组生物信息组平台qiime2用于处理快速Q纤维并分析amplicon数据。 数据分为属，家庭，阶级，顺序和门。 关键结果。 Firmicutes和杀菌植物占主导地位（76％），其次是proteeobacteria（15％）。 杀菌剂，梭菌和心杆菌占据了微生物等级的占主导地位（86％）。 类主要由细菌，梭状芽胞杆菌和γ-杆菌（87％）组成，而家族主要由卟啉单核，family_xi和心杆菌科（62％）组成。 在属的水平上，有80％的丰度由七个属，即卟啉单胞菌，suttonella，peptoniphilus，peptoniphilus，oftidiosipila，ezakiella，petrimonas和一个不知名的分类单元组成。 结论。 发现表明特定的微生物群可能是健康微型小马种马的特征，并且观察到一些个体间的变化。 含义。 本研究可以告知涉及肥沃和不育受试者的较大的马研究，并可以探索精液微生物组与男性生育能力的关系。PACBIO（PACBIO（PACICICIENCES），随后进行了下一代微生物组生物信息组平台qiime2用于处理快速Q纤维并分析amplicon数据。数据分为属，家庭，阶级，顺序和门。关键结果。Firmicutes和杀菌植物占主导地位（76％），其次是proteeobacteria（15％）。杀菌剂，梭菌和心杆菌占据了微生物等级的占主导地位（86％）。类主要由细菌，梭状芽胞杆菌和γ-杆菌（87％）组成，而家族主要由卟啉单核，family_xi和心杆菌科（62％）组成。在属的水平上，有80％的丰度由七个属，即卟啉单胞菌，suttonella，peptoniphilus，peptoniphilus，oftidiosipila，ezakiella，petrimonas和一个不知名的分类单元组成。结论。发现表明特定的微生物群可能是健康微型小马种马的特征，并且观察到一些个体间的变化。含义。本研究可以告知涉及肥沃和不育受试者的较大的马研究，并可以探索精液微生物组与男性生育能力的关系。
全身抗生素和质子泵抑制剂对梭状芽胞杆菌艰难梭菌感染和复发的综合作用
结果：与对照组相比，最近的PPI和抗生素的综合作用[或AB+PPI = 17.51（17.48–17.53）]对CDI风险的效果强于个人效应[或AB = 15.37（14.83-15.93）；或PPI = 2.65（2.54– 2.76）]。结果在前几个月内暴露不足。剂量 - 反应分析显示，暴露量增加与CDI风险相关[最近使用：或AB = 6.32（6.15–6.49）；或PPI = 1.65（1.62–1.68）每个处方增加]。与没有复发的个体（RCDI）相比，最近[或AB = 1.30（1.23–1.38）]和先前[或AB = 1.23（1.16–1.31）;或PPI = 1.12（1.03–1.21）]使用也影响了复发的风险，但两者之间没有显着相互作用。最近的大环内酯/林糖酰胺/链球菌素；包括硝基咪唑包括衍生物在内的其他抗菌剂；非苯甲霉素β乳糖酰和喹诺酮与CDI风险和复发性最强的关联，尤其是最近使用时。PPI最近和前面的使用都进一步增加了与几乎所有抗生素类别相关的CDI风险。
朋友之间的SNP是什么：梭状芽胞杆菌艰难梭菌的血统R20291可以影响研究结果
梭状芽胞杆菌差的差异（以前是梭状芽胞杆菌[1]）是发达国家与医院相关腹泻的主要原因。近年来，其流行率归因于高呼吸菌株的出现，尤其是属于BI/NAP1/PCR Ribotype 027（RT 027）的菌株的出现，这些菌株会详细征集毒素A/B的高滴度，从而产生二元毒素，并产生二元毒素并表现出增加孢子的倾向[2]。将其基因组测序的第一个RT 027菌株是R20291菌株[3]，负责2006年在英国Stoke Mandeville医院发生重大爆发。，R20291已成为研究最多的实验室菌株之一。对梭形基因组序列数据的全面开发依赖于正向和反向遗传学工具的应用[4]，最著名的是基于内含子重新定位的封闭技术[5]。初始
DBT-NII 获得针对产气荚膜梭菌 ε 毒素的疫苗专利
DBT-NIAB 科学家研究印度奶牛以获取治疗结核病的药物 结核病 (TB) 是全球主要死亡原因之一。2018 年全球约有 1000 万新发病例和 150 万人死亡。它是艾滋病毒感染者的主要杀手，也是与抗菌素耐药性 (AMR) 相关死亡的主要原因。印度是该病负担最重的国家，估计发病率约为 269 万例。据报道，相当一部分人类结核病是由牛分枝杆菌引起的，牛分枝杆菌是牛结核病 (牛结核病或 BTB) 的主要病原菌。换句话说，牛是人畜共患结核病的主要宿主。更糟糕的是，牛的结核病也是由人类结核杆菌 M. Tuberculosis 引起的。由于多种原因，牛结核病和人畜共患结核病对印度的健康提出了独特的挑战。
合欢属、Parkia 属和
在喀麦隆，人们使用与豆科-含羞草亚科资源相关的商品和服务来满足多种需求。尽管已经做了一些工作，但关于这些商品和服务的信息仍然不足。迄今为止，这些植物对人口需求的贡献也是未知的。这项研究的目的是概述喀麦隆农村和城市人口对豆科-含羞草亚科的用途。重点研究了 Albizia 属、Parkia 属和 Tetrapleura 属。通过对 173 名受访者进行半结构化个人访谈，收集了整个研究区域的社会经济和民族植物学数据。数据分析包括统计和描述性分析，以研究数据的位置和分散特性以及由参数和非参数检验组成的推理/决策分析。还计算了物种脆弱性风险指数。使用六个参数来评估最受欢迎物种的经济价值。结果表明，在 3 个属的 19 个物种中，有 7 个在喀麦隆有应用，且具有民族植物学价值。对于 Albizia，我们注意到已鉴定出 A. adianthifolia、A. laurentii、A. lebbeck 和 A. zygia 物种，而对于 Parkia，我们鉴定出 P. bicolor 和 P. biglobosa 物种，最后，对于 Tetrapleura 属，我们鉴定出 Tetrapleura tetraptera 物种。结果表明，Leguminosae-Mimosoideae 具有民族植物学价值，即使在喀麦隆以外也具有价值。推广这些物种将增加其开发潜力基础，并增加农村和城市人口的收入。© 2022 International Formulae Group。保留所有权利。关键词：用途、经济潜力、Albizia 属、Parkia 和 Tetrapleura（Leguminosae-Mimosoideae）、喀麦隆。引言
遗伝子组换え细菌と亲株细菌の相互作用に关する研究
13）Numan，Z。，Venares，W.A。和Vimpenny，J.W.T。：在化学稳定生长过程中，有和没有质粒RP4的大肠杆菌菌株之间的竞争，CAN.J。Microbiol。，37 pp.509-512（1991）14）Helling，R.B。，Kenney，t。和Adams，J。：含质粒的生物的主要居民大肠杆菌，J.Gen.Microbiol.123 pp.129-141（1981）15）Melling，J.，Ellwood，D.C。和Robinson，A：Chemostat中的混合库中携带大肠杆菌的R因子的生存，FEMS Microbiol.Lett。，2 pp.87-89（1977）16）Jones，S.A。和Melling，R.B。：PBR322-相关质粒在化学抑制培养物中生长的大肠杆菌中的存在，FEMS Microbiol.lett。，22 pp.239-243（1984）