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免疫基因沉默增加烟草中瞬时蛋白质表达
。CC-BY 4.0 国际许可证永久有效。它以预印本形式提供（未经同行评审认证），作者/资助者已授予 bioRxiv 许可，可以在该版本中显示预印本。版权所有者于 2025 年 1 月 31 日发布了此版本。；https://doi.org/10.1101/2025.01.30.635616 doi：bioRxiv 预印本
塔斯马尼亚的连通性：力量的源泉还是沉默的工具？
该项目总理和内阁部 (DPAC) 领导国家服务部门支持政府为塔斯马尼亚社区实现最佳结果。他们通过与所服务的社区和整个公共服务部门合作来实现这一目标。在调查结果及其对塔斯马尼亚文化的见解发布后，DPAC 寻求更好地了解塔斯马尼亚社区的积极和消极联系体验。目标是利用这些见解为未来政策提供信息，以有效解决该州的社会问题。特别关注儿童性虐待，以响应调查结果第 5.2 章文化和建议 19.12 1。为此，DPAC 与塔斯马尼亚品牌合作，并聘请 Folket Consultancy 团队开展研究。
卵菌的转化系统、基因沉默和基因编辑技术
卵菌是一类多样化的丝状产孢生物，由数百种臭名昭著的病原体组成。其中一些已被列入全球检疫名单，并受到国家和国际法律的严格管制，以防止其传播（Rossmann 等人，2021 年）。宿主包括主要养殖鱼类和植物物种，以及自然生态系统中的众多动物和植物物种（Cao 等人，2012 年；Fern andez-Ben eitez 等人，2008 年；Kamoun 等人，2015 年；van den Berg 等人，2013 年）。卵菌是一类在分类学上截然不同的真核微生物大类，它与真菌有一些相同的生理和形态特征（例如，都有菌丝和不同的孢子类型），但在系统发育上与异鞭毛藻有亲缘关系（Baldauf 等人，2000 年；Latijnhouwers 等人，2003 年）。卵菌与真真菌可通过一些只有卵菌才具备的生化和细胞学特征来区分：a) 纤维素是菌丝壁的主要微纤维成分；b) 胞质致密体/指纹液泡含有磷酸化的 β-(1,3)-mycolaminarin 葡聚糖；c) 二倍体叶状体，减数分裂先于配子形成；d) 线粒体有管状嵴；最后 e) 利用 a - ε -二氨基庚二酸赖氨酸合成途径 ( Beakes 等人，2012 年)。卵菌生长的环境条件和宿主范围广泛，这反映在其系统发育多样性中 ( Thines，2014 年)。在过去的几十年里，宿主与卵菌相互作用的研究结合基因组学和转录组学，对卵菌如何感染宿主有了相当深入的了解 ( Burra 等人，2017 年)。了解许多相互作用分子的作用对于有针对性地制定管理策略非常重要。已确定卵菌会分泌一系列效应蛋白，这些效应蛋白可以改变宿主的免疫系统以促进感染（Bozkurt 等人，2012 年；de Bruijn 等人，2012 年；Fabro 等人，2011 年）。然而，不同卵菌病原体在感染过程中产生的大量分子尚未得到解释。为了在体内对这些分子进行功能分析，对卵菌进行基因改造的技术至关重要，例如 RNAi（Saraiva 等人，2014 年；Whisson 等人，2005 年）、稳定转化（Judelson 等人，1993 年）或 CRISPR/Cas（Fang 和 Tyler，2016 年）。卵菌的分子技术发展速度比真菌慢，目前仅限于相对较少的物种，与真菌相比效率较低。由于卵菌内部的异质性，转化方案需要针对每个物种进行优化，并且在同一物种内，通常针对每个菌株进行优化。因此
Trem2+心脏巨噬细胞中的治疗性SPP1沉默抑制心房颤动
越来越多的证据指向AFIB发病机理中的免疫系统3，特别是巨噬细胞4。在最近的一项研究中，我们观察到AFIB患者心房组织4的炎症性巨噬细胞和心房纤维化的扩大。为了更好地剖析巨噬细胞，纤维化和AFIB之间的关系，我们开发了一种小鼠模型，该模型通过结合常见的临床危险因素来概括人AFIB：高血压，肥胖和二尖瓣反流（称为荷马）。通过单细胞转录组学比较了人类与AFIB和荷马小鼠的心房组织，记录了AFIB动物模型的高保真度。我们确定了骨桥蛋白，在人类和小鼠中由SPP1编码为SPP1，是AFIB患者和荷马小鼠4的招募心房巨噬细胞中的最高上调基因4。骨桥蛋白是一种保守的多效性基质蛋白，结合了几种整合素和CD44家族受体。巨噬细胞衍生的骨桥蛋白刺激成纤维细胞产生更多的基质蛋白，并且与几种慢性纤维化疾病的进展5。心脏中的纤维化导致心房组织的异质性，它阻碍了均匀的电导传导，并充当AFIB 6的结构底物。最值得注意的是，单核细胞衍生的巨噬细胞中骨桥蛋白的转基因缺失减少了心房纤维化和荷马小鼠4。
沉默白细胞介素 6 和糖蛋白 130 可抑制癌细胞生长并诱导细胞凋亡
摘要背景：各种信号通路促进癌症生长并抑制癌细胞凋亡。据报道，各种癌症中白细胞介素 (IL)-6 细胞因子水平升高及其通过 IL-6 受体的信号传导与预后不良有关。另一方面，靶向 IL-6 和 IL-6 受体与癌症的改善作用有关。因此，本研究旨在抑制 IL-6 及其受体 (糖蛋白 130，[gp130]) 并协同减少体外癌症进展。方法：因此，使用 4T1 和 CT26 癌细胞系分析同时阻断 IL-6 和 gp130 的疗效。此外，使用小干扰核糖核酸 (siRNA) 分子来抑制这些因子的表达。使用定量实时聚合酶链反应测定法研究靶基因的表达。此外，采用 MTT 测定法研究细胞存活率。最后，用酶联免疫吸附试验测定细胞因子。结果：用脂质体转染癌细胞导致两种细胞系中这些因子的显著下调。此外，IL-6 和 gp130 的下调导致细胞死亡显著诱导，这与两种细胞的增殖潜力降低有关。最终，IL-6 沉默显着抑制了两种细胞中 IL-6 的分泌。结论：这些发现意味着同时沉默 IL-6 和 gp130 可以被视为一种潜在的抗癌治疗方法，应在未来的研究中进一步考虑。关键词：白细胞介素 6、癌症免疫疗法、糖蛋白 130、siRNA、白细胞介素 6 受体
病毒诱导基因沉默在蔬菜功能研究中的应用及拓展
摘要：增加蔬菜摄入量已成为世界范围内健康饮食习惯的一部分，因此，明确育种材料中的基因功能对于蔬菜改良以满足蔬菜新品种的可持续发展至关重要。然而，遗传转化费时费力，限制了对各类蔬菜作物基因功能的探索。病毒诱导的基因沉默（VIGS）由于缩短了实验周期并且不依赖于稳定的遗传转化，可以在植物中进行大规模、快速的基因沉默，为功能研究提供了绝佳的机会。VIGS可以加速模式植物研究，使蔬菜作物基因功能的分析和验证变得更加容易。此外，随着病毒介导的异源蛋白表达等技术的出现和CRISPR/Cas9技术的发展，病毒介导的遗传工具开创了遗传学和作物改良的新时代。本研究总结了蔬菜中VIGS和病毒诱导的基因编辑（VIGE）的最新成果。我们还确定了蔬菜中 VIGS 技术当前面临的几个挑战，为未来的研究提供指导。
喷雾诱导的疾病控制基因沉默取决于病原体RNA摄取的效率
最新发现表明，真菌可以占据环境RNA，然后可以通过环境RNA干扰沉默真菌基因。这一发现促使开发用于植物疾病管理的喷雾诱导的基因沉默（SIGS）。在这项研究中，我们旨在确定在各种真核微生物中SIG的效率。我们首先检查了多种致病性和非致病真菌和卵形病原体中RNA摄取的效率。我们观察到了真菌植物病原体中有效的双链RNA（dsRNA）摄取，果仁酸酯，硬化菌核，根瘤菌索拉尼，索拉尼菌，尼日尔和佛罗里达州的黄瓜和佛罗里西亚果皮，但在浓度较弱真菌，Trichoderma Virens。对于卵植物病原体，植物疫霉菌，RNA吸收有限，并且在不同的细胞类型和发育阶段有所不同。靶向毒力相关基因的DSRNA局部应用在具有高RNA摄取效率的高效率的病原体中显着抑制了植物性疾病症状，而DSRNA在低RNA效率效率低的病原体中的应用不会抑制感染。我们的结果表明，在真核微生物物种和细胞类型之间，DSRNA摄取效率各不相同。SIG在植物性疾病管理方面的成功可以在很大程度上取决于病原体的RNA摄取效率。
喷雾诱导的基因沉默：植物特质改善和疾病控制的创新策略
摘要：即使使用最先进的技术，例如基因编辑，现代植物繁殖仍然是一个耗时且昂贵的过程。因此，迫切需要开发植物特质操纵和植物保护的替代方法。RNA干扰（RNAi）是一种由天然存在的双链RNA（DSRNA）和小RNA（SRNA）介导的保守细胞机制，可以靶向mRNA用于破坏或减少转录的mRNA。在这里，我们回顾了基于RNAi的技术的潜力，称为喷雾诱导的基因沉默（SIGS），是在植物或病原体控制中操纵内源基因表达的繁殖的替代或辅助。SIGs可能在减少害虫或病原体影响的情况下特别有用，从而改善生物胁迫并提高作物的农艺性能。关键字：RNA干扰，小RNA，SIGS，DSRNAS
热带植物 2024 , 3: e030 芋头病毒诱导基因沉默系统的构建及应用
摘要 病毒诱导的基因沉默（VIGS）技术是快速鉴定植物基因功能的重要手段，建立稳定的芋头VIGS系统可为快速高效验证基因功能提供技术支持。以烟草脆裂病毒（TRV）为载体，构建以八氢番茄红素脱氢酶（CePDS）为指示基因的VIGS系统，并通过沉默CeTCP14基因以进一步验证该系统的稳健性。以赣榆一号芋头为材料，采用叶片注射法，以OD 600 = 0.6的CePDS构建VIGS系统，沉默植物率为12.23%，CePDS表达量与对照相比约为59.34%～77.18%，CePDS沉默植物的叶绿素含量降低了37.80%～56.11%。叶片注射OD 600 = 1.0可显著提高芋头的沉默植株率，达到27.77%，但叶片注射法和球茎真空处理的沉默植株率差异不显著。在赣榆2号中，用OD 600 = 1.0菌液和球茎真空处理对CeTCP14进行进一步沉默，沉默植株率为20%，CeTCP14表达量为对照的43.94%～63.34%，同时球茎中淀粉含量与对照相比显著降低，为70.88%～80.61%。综上所述，结果表明基于TRV的VIGS系统在芋头中是有效的，菌液浓度是影响VIGS系统的关键因素，CeTCP14能够影响芋头球茎中淀粉的积累。建立健全的芋头VIGS系统可为后续快速验证基因功能奠定良好的基础。