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World File Search System生物群落
微塑料改变土壤结构和微生物群落组成
城市集群环境安全和绿色发展的关键实验室，教育部，生态学，环境与资源学院，广东技术大学，广州大学，广州510006，B中国B农业资源与环境研究所，江苏大学农业科学学院，农业科学科学科学科学科学科学科学系，北美农业科学学院Ottingen，37077 G ottingen，德国D人民友谊大学（Rudn University），117198，俄罗斯莫斯科，俄罗斯E州主要水中水主要实验室，北京师范大学，北京师范大学，北京100875年，北京大学，伯林研究所，北卡罗来纳大学，北京大学研究所。 （BBIB），柏林，德国
无处不在的过滤器馈线形成开放海洋微生物群落结构和功能
死亡率机制在开放海洋中的微生物如何促进全球能量和营养循环中起着很大作用。salp是无处不在的上膜膜，是沿海和高纬度系统中大型光致动微生物的众所周知的死亡率来源，但是它们对热带和亚热带开放式海宝中较小原核生物的巨大原核生物的影响尚未得到很好的量化。我们使用鲁棒的定量技术来测量北太平洋亚热带Gyre（地球上最大的生态系统之一）中特定微生物官能团的SALP清除率和富集。我们发现萨尔普斯是以前未知的全球丰富氮固定剂的捕食者。因此，萨尔普斯将新的氮递送到海洋生态系统中。我们表明，海洋的两个主导细胞ProChorococcus和Sar11并未被Salps消耗，该细胞为开放海洋系统中小细胞的优势提供了新的解释。我们还确定了proChorococcus的双重奖励，其中它不仅可以逃脱salp捕食，而且还消除了其主要的混合营养性捕食者之一，即prymnephenephinephinephyte chrysochromulina。当我们建模SALP网格与颗粒之间的相互作用时，我们发现单独的细胞大小无法解释这些猎物选择模式。相反，结果表明替代机制（例如表面特性，形状，营养质量甚至猎物行为）确定哪些微生物细胞被salps消耗。一起，这些结果将萨尔普斯确定为塑造开海微生物群落的结构，功能和生态的主要因素。
来自大豆加工的微生物群落蛋白质......
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利用宏基因组测序分析杭州市城市饮用水的微生物群落
虽然传统的依赖培养的方法可以有效检测某些微生物，但市政饮用水 (DW) 微生物组的综合组成，包括细菌、古菌和病毒，仍然未知。宏基因组测序为准确确定和分析 DW 的整个微生物群落打开了大门，全面了解 DW 物种多样性，特别是在 COVID-19 时代的公共卫生问题背景下。在这项研究中，我们发现大多数可培养细菌和一些粪便指示菌，如大肠杆菌和铜绿假单胞菌，在所有样品中均无法使用依赖培养的方法培养。然而，宏基因组分析表明，DW 样品中的主要细菌种类属于变形菌门和浮霉菌门。值得注意的是，甲基杆菌属在所有水样中最为丰富，其次是鞘氨醇单胞菌、芽生菌和固氮螺菌。虽然检测到了低水平的毒力相关因子，例如 Esx-5 VII 型分泌系统 (T7SS) 和 DevR/S，但仅在一个样本中以低丰度鉴定出红霉素抗性基因 erm (X)，一种 rRNA 甲基转移酶。在一些样本中鉴定出了与毒力和抗性基因相对应的宿主，包括分枝杆菌属。在一些 DW 样本中发现了微量的古细菌 DNA（Euryarchaeota、Cren archaeota）。使用胶体金和实时逆转录聚合酶链反应 (RT ‒ PCR) 方法，所有 DW 样本中的轮状病毒、柯萨奇病毒、人类肠道病毒和 SARS-CoV-2 等病毒均为阴性。然而，在一些 DW 样本中发现了编码新目逆转录病毒（Ortervirales）和疱疹病毒目的 DNA。整个微生物群落的代谢途径涉及细胞间通讯和信号分泌，有助于水中不同微生物种群之间的合作。本研究利用培养依赖方法和宏基因组测序结合生物信息学工具，深入了解了 COVID-19 大流行期间中国杭州 DW 的微生物群落和代谢过程。
沿盐梯度的土壤启动效应和相关微生物群落
摘要。土壤盐分介导微生物和土壤过程，如土壤有机碳 (SOC) 循环。然而，土壤盐分如何通过塑造细菌群落多样性和组成来影响 SOC 矿化仍然难以捉摸。因此，沿盐梯度（盐度为 0.25%、0.58%、0.75%、1.00% 和 2.64%）采集土壤样本并培养 90 天，以研究 (i) SOC 矿化（即棉籽粉作为底物引起的土壤启动效应）和 (ii) 负责任的细菌群落，方法是使用高通量测序和 13 C 同位素的天然丰度（以分离棉籽粉衍生的 CO 2 和土壤衍生的 CO 2 ）。我们观察到在培养的前28天中出现负向启动效应，而在56天之后转为正向启动效应。早期的负向启动可能是由于优先利用棉籽粕所致。随后的正向启动随着盐度的增加而降低，这可能是由于高盐度土壤中微生物群落的α多样性降低所致。具体而言，沿盐度梯度的土壤pH值和电导率（EC）是调节微生物群落结构从而调节SOC启动的主要变量（通过基于距离的多元分析和路径分析估计）。通过采用双向正交投影到潜在结构（O2PLS），将启动效应与特定的微生物类群联系起来；例如，变形菌门（Luteimonas、Hoeflea 和 Stenotrophomonas）是归因于底物诱导的启动效应的核心微生物属。在这里，我们强调盐度的增加降低了微生物群落的多样性，并转移了优势微生物（放线菌和 Pro-
Long W，Li M，Gao Y，Zhang Y，Yuan X，Ye H，Huang H，Liang W，Zhang R，Du G.微生物群落，致病细菌和高风险的抗生物生物分离
抽象目标。该研究的目的是探索微生物群落，致病细菌和高风险抗生素抗生素基因的特征，沿海海滩与多功能宿主之间的相关性，以确定中国热带海岸海滩上的粪便源污染物的潜在物种生物标志物。“一项健康”方法用于海滩和温血宿主的微生物研究。微生物使用16S rRNA基因扩增子和shot弹枪元基因组学上分析了社区。非盐海滩的混乱，辛普森，香农和王牌索引大于属属和OTU级别的盐海滩（P <0.001）。bacteroidota，halanaerobiaeota，蓝细菌和富公司在盐海滩上很丰富（p <0.01）。人类采购的微生物在盐海滩上更丰富，占0.57％。粪便核酸杆菌和hallii菌群被认为是人类粪便污染的可靠指标。在盐海滩上观察到了耐高风险的碳苯甲酸克雷伯氏菌肺炎和基因型KPC-14和KPC-24。TET（X3）/TET（X4）基因和四种类型的MCR基因在海滩和人类上共发生； MCR9.1占多数。TET（X4）在蓝细菌中发现。在中国海滩上很少报道，但观察到病原体，例如藤本植物，肺炎军团菌和幽门螺杆菌。低微生物社区的多样性并未表明风险降低。高危ARM向极端沿海环境的转移应受到足够的关注。
生物刺激素对土壤微生物群落的潜力
为了提高农业的可持续性，需要建立一个农业生产系统来保持土壤肥力并减少土壤生物多样性的丧失。现代技术之一是利用微生物刺激素，它可以创造丰富的农业产量和高营养价值，控制因环境变化而带来的不利因素。本综述旨在提供有关生物刺激素对微生物群落促进农业生产的潜力的影响的知识。植物生物刺激素是当今农业领域用来提高作物产量的新型材料，通常用于植物种子中，作为作物化学衍生物应用的替代品。微生物生物刺激素作为生物投入品，可以增加作物产量并减少土壤分解。总之，生物刺激素的应用需要对有益微生物进行绝对选择，并有潜力解决农业领域以后会遇到的问题。
与拟南芥中与植物基因型和生物量相关的根际微生物群落的多代生态系统选择
摘要：微生物组在塑造宿主表型中的作用已成为一个关键的研究领域，对生态，进化和宿主健康具有影响。复杂而动态的相互作用涉及植物及其多样化的根际微生物群落受到许多因素的影响，包括但不限于土壤类型，环境和植物基因型。了解这些因素对微生物社区大会的影响是产生特定于植物的宿主特定和强大的好处的关键，但它仍然具有挑战性。在这里，我们对八代拟南芥l和cvi进行了人工生态系统选择实验，以选择与宿主的较高或更低生物量相关的土壤微生物。这导致了由于随机环境变化，植物基因型和生物量选择压力之间复杂的相互作用所塑造的不同微生物群落。在实验的初始阶段，基因型和生物量选择处理具有适中但显着的影响。随着时间的流逝，植物基因型和生物量处理的影响更多，解释了微生物群落组成的约40％。此外，在选择高生物量的选择下，观察到在选择中，观察到在选择中，观察到在选择中，观察到在选择中，观察到了植物生长促进根细菌的基因型特异性关联，labraceae和l er和rhizobiaceae与CVI的基因型相关性。
代谢交流在天然微生物群落中无处不在
微生物群落推动全球生物地球化学周期并塑造包括人类的动植物的健康。它们的结构和功能取决于控制微生物群落的组装，稳定性和演变的生态和环境相互作用。广泛认为的是，诸如竞争之类的拮抗相互作用在微生物群落中占主导地位，并且在生态上比协同的相互作用更重要，例如互动或共同主义。在过去的十年中，出现了更细微的图片，其中细菌，古细菌和真菌存在于交互式网络中，在这些网络中，它们交换基本和非必需的代谢物。这些代谢相互作用不仅会影响所涉及的菌株的生理，生态和进化，而且对许多（如果不是全部）微生物组的功能也是核心。因此，我们主张对微生物组生态学的平衡观点，该观点涵盖了协同和拮抗的相互作用，作为推动微生物群落中结构和动态的关键力量。
高温对猪肉和鸭皮中微生物群落的影响
摘要：猪皮和鸭皮在中国备受消费者青睐，高温加工方法在烹饪和食品制备中被广泛采用。但高温处理对猪皮和鸭皮中微生物群落的影响尚不清楚。本研究采用模拟烹饪过程的高温处理方法在60 ◦ C至120 ◦ C的温度下处理猪皮和鸭皮样品。研究结果表明，高温处理显著改变了猪皮和鸭皮中的微生物群落。热暴露导致微生物多样性降低并引起特定微生物群落相对丰度的变化。在猪皮中，高温处理导致细菌多样性降低和特定细菌类群的相对丰度下降。同样，鸭皮中微生物群落的相对丰度也降低。此外，猪皮和鸭皮中潜在的致病菌，包括革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌以及需氧菌、厌氧菌和兼性厌氧菌，对高温处理的反应不同。这些发现凸显了高温处理对猪皮和鸭皮中微生物群落组成和结构的重大影响，可能影响食品安全和质量。本研究有助于加深对猪皮和鸭皮高温加工过程中微生物群落变化的微生物机制的理解，对确保食品安全和开发有效的烹饪技术具有重要意义。