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World File Search System病毒科
第 3.6.6 章 - 马流感（感染……
疾病描述：马流感是马、驴、骡和斑马的一种急性呼吸道感染，由正粘病毒科流感病毒 A 属的两种不同亚型（H7N7，以前称为 equi-1 和 H3N8，以前称为 equi-2）引起的。自 20 世纪 70 年代末以来，H7N7 亚型病毒一直未被分离出来。两种亚型的马流感病毒均被认为源自禽类，高致病性禽流感病毒 H5N1 与埃及驴的呼吸道疾病爆发有关。在完全易感的马科动物中，临床症状包括发热和剧烈干咳，随后流出粘脓性鼻涕。在部分免疫的疫苗接种动物中，可能没有这些症状中的一种或多种。接种疫苗的受感染马匹仍会传播病毒，并成为其同类的病毒来源。流感的特点是，在易感人群中传播迅速。这种疾病在许多拥有大量马匹的国家流行。
流感人类T细胞反应的靶标在H5N1
流感人类T细胞反应的靶标在H5N1作者John Sidney 1＃，A-Reum Kim 1＃，Rory D. de Vries 2，Bjoern Peters 1,3，Philip S. Meade 4,5，Florian Krammer 4,5,6,7，Alba Grifoni 1*，Alsesandro Sette 1,3* Inceltion 1,3* Inceltions 1,3* Jolla免疫学研究所（LJI），LA JOLLA，CA 92037，美国2病毒科学系，伊拉斯穆斯大学医学中心，鹿特丹，荷兰3号医学系3号医学系，感染性疾病和全球公共卫生部，加利福尼亚大学，加利福尼亚大学，圣地亚哥大学（UCSD），ucsd） NY, USA 5 Center for Vaccine Research and Pandemic Preparedness (C-VaRPP), Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, NY, USA 6 Department of Pathology, Molecular and Cell-Based Medicine, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, NY, USA 7 Ignaz Semmelweis Institute, Interuniversity Institute for Infection Research, Medical University of Vienna, Vienna, Austria
多发性硬化症患者的 Epstein-Barr 病毒感染标志物
摘要：多年来，人们一直怀疑病毒感染与某些自身免疫性疾病的发病机制有关。爱泼斯坦-巴尔病毒 (EBV) 是一种属于疱疹病毒科的 DNA 病毒，被认为与多发性硬化症 (MS)、系统性红斑狼疮、类风湿性关节炎、舍格伦综合征和 1 型糖尿病的发病和/或进展有关。EBV 的生命周期包括感染 B 细胞中发生的溶解周期和潜伏期 (0、I、II 和 III)。在此生命周期中，会产生病毒蛋白和 miRNA。本综述概述了 EBV 感染的检测，重点关注 MS 中的潜伏期和溶解期标志物。在 MS 患者中，潜伏期蛋白和抗体的存在与中枢神经系统 (CNS) 的病变和功能障碍有关。此外，在 MS 患者的 CNS 中可能会检测到在溶解期和潜伏期表达的 miRNA。 EBV 的溶解性再激活也可发生在患者的中枢神经系统中，MS 患者的中枢神经系统中存在溶解蛋白，并且 T 细胞会对此蛋白产生反应。总之，在 MS 患者中可以发现 EBV 感染的标志物，这支持了 EBV 与 MS 之间存在某种关系。
CRISPR-Cas 系统：一种有前途的新冠病毒诊断工具
2019 年 12 月，一种名为严重急性呼吸综合征相关冠状病毒 (SARS-CoV-2) 的新型冠状病毒在中国武汉出现，并迅速蔓延至全球。继严重急性呼吸综合征相关冠状病毒 (SA-RS-CoV) 和中东呼吸综合征冠状病毒 (MERS-CoV) 之后，SARS-CoV-2 是本世纪第三种导致大流行的人畜共患冠状病毒。SARS-CoV-2 导致 2019 年冠状病毒病 (COVID-19) 1-4。迄今为止，根据世界卫生组织 (WHO) 的报告，全球已有超过 1 亿人感染 COVID-19，超过 200 万人死于该疾病。SARS-CoV-2 是一种正义 RNA 病毒，基因组大小约为 ~27 至 ~32 kb。 SARS-CoV-2 属于冠状病毒科，可感染多种鸟类和哺乳动物，例如人类。由于其宿主范围广和冠状病毒重组频率高，因此在该科中产生高毒力病毒很常见。最常见的人类冠状病毒可引起轻微感染，例如普通感冒，包括人类冠状病毒 NL63 (HCoV- NL63)、人类冠状病毒 229E (HCoV-229E)、人类冠状病毒 OC43 (HCoV-OC-43) 和人类
为旅客接种登革热疫苗
登革热的当前流行病学状况和免疫学特异性 登革热是由黄病毒科节肢动物传播的病毒（虫媒病毒）引起的，在大多数热带和亚热带国家都有发现。它通过埃及伊蚊雌蚊叮咬传播，在较小程度上也通过白纹伊蚊传播。过去几十年来，全球发病率逐渐上升，2023 年报告病例数为 500 万例。（1）血清流行率随年龄不同而不同，也随世界不同地区不同而不同，甚至在同一个国家内也存在差异。大多数病例发生在南亚、东南亚和拉丁美洲。然而，由于潜在病媒物种的传播（瑞士也有）、人口流动以及全球变暖的影响，流行病学正在发生变化，非洲登革热病例增加，北美和南欧出现本土登革热病例。（2,3）除了发病率的社会经济影响外，登革热还被认为是亚洲儿童死亡的主要原因之一。前往流行地区的旅行者感染登革热的负担很低，但并非微不足道，因为它是从撒哈拉以南非洲以外（亚）热带地区旅行回来后发烧的主要原因。（4）
RNA病毒克隆平台 有历史的小鼠
《自然》杂志的一项研究报告了酵母酿酒酵母作为组装和维护各种 RNA 病毒基因组（包括 SARS-CoV-2）的平台的适用性，该平台可实现对 SARS-CoV-2 的基因操作和功能表征。在疫情爆发期间，病毒分离株可用于开发诊断、体内模型、抗病毒疗法和疫苗。如果病毒分离株的可用性有限，可以从化学合成的 DNA 中克隆病毒基因组，但使用大肠杆菌的既定方法通常不足以容纳冠状病毒（冠状病毒科）等 RNA 病毒的大型基因组。Thao 等人将转化相关重组 (TAR) 克隆应用于含有 GFP 基因的小鼠肝炎病毒 (MHV)，该病毒具有成熟的反向遗传学平台。将覆盖 MHV-GFP 基因组和 TAR 载体的重叠 DNA 片段转化到酵母中，DNA 片段通过同源重组组装，产生包含全长病毒 cDNA 的酵母人工染色体 (YAC)。值得注意的是，90% 以上的筛选克隆显示 YAC 组装正确，表明组装效率高。通过分离和线性化 YAC 进行体外转录以生成病毒 RNA，成功从两个单个克隆中回收了传染性病毒，然后将其与编码 MHV 核衣壳蛋白的 mRNA 一起转染到 BHK-MHV-N 仓鼠细胞系中，以产生和扩增病毒。回收的病毒表现出与亲本 MHV-GFP 相同的复制动力学。该团队着手确定合成基因组学平台是否可以应用于 MERS-CoV，使用低拷贝细菌人工染色体 (BAC) 从八个重叠的 PCR 扩增 DNA 片段克隆病毒。该方法还应用于突变的 MERS-CoV 克隆，该克隆中插入了 GFP 基因。YAC 克隆组装和从克隆 DNA 中拯救病毒均取得成功，确定了该平台可适用于更广泛的病毒，包括转基因病毒基因组。进一步的实验确定病毒基因组可以稳定维持，并且该平台适用于其他难以克隆的病毒，例如寨卡病毒（黄病毒科）和人类呼吸道合胞病毒（副粘病毒科），包括直接从临床样本中克隆，而无需事先了解病毒基因型。令人惊讶的是，在收到基于 2020 年 1 月发布的基因组序列的 SARS-CoV-2 合成 DNA 片段后 1 周内，就实现了重组 SARS-CoV-2 和 SARS-CoV-2-GFP 的克隆和拯救。总之，这项研究展示了合成基因组学平台在疫情期间从不同起始材料（包括病毒分离物、克隆 DNA、合成 DNA 或临床样本）快速生成和功能表征进化 RNA 病毒的实用性。
SARS-CoV-2 基因组和反基因组 RNA 的突变谱
病毒进化的原材料是由复制、转录或转录后过程中发生的宿主内突变提供的。冠状病毒科的复制和转录通过合成负义“反基因组”进行，这些“反基因组”充当正义基因组和亚基因组 RNA 的模板。因此，SARS-CoV-2 和其他冠状病毒的基因组突变可能发生在负义或正义 RNA 合成期间（和之后），并可能具有不同的模式和后果。我们首次探索了 SARS-CoV-2（亚）基因组和反（亚）基因组 RNA 的突变谱。我们使用了使用定量链感知测序方法生成的高质量深度测序数据集，控制了伪影和测序错误，并仔细检查以准确检测宿主内多样性。负链和正义链共识之间的核苷酸差异因患者而异，并且与年龄或性别无关。两条 RNA 链上的宿主内次要变异之间的突变模式相似和不同表明存在链特异性突变或宿主脱氨酶和氧化损伤编辑。我们观察到负链上通常存在中性和轻微的负选择，而基因组正链上的 ORF1a、ORF1b 和 S 基因则存在纯化选择。
日本牛鼻炎B病毒的检测及基因分析
牛鼻炎 B 病毒 (BRBV)（属：口蹄疫病毒，科：小核糖核酸病毒科）是牛呼吸道疾病综合征的重要病原体。尽管全球都有关于 BRBV 的报道，但日本菌株的基因组数据尚未登记。在此，我们旨在分析日本 BRBV 的遗传特征。在 66 头牛的鼻拭子中，有症状和无症状的牛分别在 7/10 和 4/56 中检测到 BRBV。宏基因组测序和桑格测序确定了两种日本 BRBV 菌株 IBA/2211/2 和 LAV/238002，它们与已知的 BRBV 菌株具有显著的遗传相似性，并表现出独特的突变和重组事件，表明受区域环境和生物因素影响的动态进化。值得注意的是，LAV/238002 的领导基因位于不同的进化谱系中，与其他 BRBV 菌株有显著差异。基于前导蛋白氨基酸序列的系统发育分析表明，两株日本毒株与其他BRBV毒株处于明显不同的分支，表明存在显著的遗传多样性。该研究结果有助于我们深入了解日本BRBV毒株的遗传组成，丰富其遗传多样性和进化机制的认识。
mRNA-1273 COVID的免疫反应和安全性...
1 荷兰大学医学中心鹿特丹大学医学中心，鹿特丹大学医学中心，荷兰2号，医学微生物学和感染预防局2阿姆斯特丹大学医学中心，阿姆斯特丹，荷兰，5实验室医学系，医学免疫学实验室，部分儿科感染疾病，拉德布德分子生命科学研究所，拉德布德疾病中心，纽约大学纽约大学医学中心，Neijmegen，Neijmegen，Neijmegen，Nepranlands，Neijmegen，Nepranlands，Neijmegen，NEPHRODS 6，纽约大学医学中心，纽约大学，纽约大学，纽约大学。格罗宁根，格罗宁根大学，格罗宁根，荷兰，病毒科学系7，伊拉斯mus医学中心，鹿特丹，鹿特丹，荷兰，荷兰8号，实验室医学系8，医学免疫学实验室，拉德布德分子生命科学研究所，拉德布德大学医学中心，纽约市纽约市，纽约市，美国9号。荷兰阿姆斯特丹大学，阿姆斯特丹大学，阿姆斯特丹大学，卫生部10号证据，拉德布德大学医学中心10号，拉德布德大学，荷兰Nijmegen，荷兰，荷兰11号，拉德布德大学医学中心11号，拉德布德大学，纽约市纽约市12号纽芬兰大学，Radboud University，Radboud University，Radboud Univers，Radboud Institution，Radboud Institution，Radboud Univer，Radboud Univer，Radmodsitution，Radmodsituty，Radmodsituty，Radboud Institut，radmen condboun scudij and radboun荷兰荷兰大学医学中心鹿特丹大学医学中心，鹿特丹大学医学中心，荷兰2号，医学微生物学和感染预防局2阿姆斯特丹大学医学中心，阿姆斯特丹，荷兰，5实验室医学系，医学免疫学实验室，部分儿科感染疾病，拉德布德分子生命科学研究所，拉德布德疾病中心，纽约大学纽约大学医学中心，Neijmegen，Neijmegen，Neijmegen，Nepranlands，Neijmegen，Nepranlands，Neijmegen，NEPHRODS 6，纽约大学医学中心，纽约大学，纽约大学，纽约大学。格罗宁根，格罗宁根大学，格罗宁根，荷兰，病毒科学系7，伊拉斯mus医学中心，鹿特丹，鹿特丹，荷兰，荷兰8号，实验室医学系8，医学免疫学实验室，拉德布德分子生命科学研究所，拉德布德大学医学中心，纽约市纽约市，纽约市，美国9号。荷兰阿姆斯特丹大学，阿姆斯特丹大学，阿姆斯特丹大学，卫生部10号证据，拉德布德大学医学中心10号，拉德布德大学，荷兰Nijmegen，荷兰，荷兰11号，拉德布德大学医学中心11号，拉德布德大学，纽约市纽约市12号纽芬兰大学，Radboud University，Radboud University，Radboud Univers，Radboud Institution，Radboud Institution，Radboud Univer，Radboud Univer，Radmodsitution，Radmodsituty，Radmodsituty，Radboud Institut，radmen condboun scudij and radboun荷兰荷兰大学医学中心鹿特丹大学医学中心，鹿特丹大学医学中心，荷兰2号，医学微生物学和感染预防局2阿姆斯特丹大学医学中心，阿姆斯特丹，荷兰，5实验室医学系，医学免疫学实验室，部分儿科感染疾病，拉德布德分子生命科学研究所，拉德布德疾病中心，纽约大学纽约大学医学中心，Neijmegen，Neijmegen，Neijmegen，Nepranlands，Neijmegen，Nepranlands，Neijmegen，NEPHRODS 6，纽约大学医学中心，纽约大学，纽约大学，纽约大学。格罗宁根，格罗宁根大学，格罗宁根，荷兰，病毒科学系7，伊拉斯mus医学中心，鹿特丹，鹿特丹，荷兰，荷兰8号，实验室医学系8，医学免疫学实验室，拉德布德分子生命科学研究所，拉德布德大学医学中心，纽约市纽约市，纽约市，美国9号。荷兰阿姆斯特丹大学，阿姆斯特丹大学，阿姆斯特丹大学，卫生部10号证据，拉德布德大学医学中心10号，拉德布德大学，荷兰Nijmegen，荷兰，荷兰11号，拉德布德大学医学中心11号，拉德布德大学，纽约市纽约市12号纽芬兰大学，Radboud University，Radboud University，Radboud Univers，Radboud Institution，Radboud Institution，Radboud Univer，Radboud Univer，Radmodsitution，Radmodsituty，Radmodsituty，Radboud Institut，radmen condboun scudij and radboun荷兰荷兰大学医学中心鹿特丹大学医学中心，鹿特丹大学医学中心，荷兰2号，医学微生物学和感染预防局2阿姆斯特丹大学医学中心，阿姆斯特丹，荷兰，5实验室医学系，医学免疫学实验室，部分儿科感染疾病，拉德布德分子生命科学研究所，拉德布德疾病中心，纽约大学纽约大学医学中心，Neijmegen，Neijmegen，Neijmegen，Nepranlands，Neijmegen，Nepranlands，Neijmegen，NEPHRODS 6，纽约大学医学中心，纽约大学，纽约大学，纽约大学。格罗宁根，格罗宁根大学，格罗宁根，荷兰，病毒科学系7，伊拉斯mus医学中心，鹿特丹，鹿特丹，荷兰，荷兰8号，实验室医学系8，医学免疫学实验室，拉德布德分子生命科学研究所，拉德布德大学医学中心，纽约市纽约市，纽约市，美国9号。荷兰阿姆斯特丹大学，阿姆斯特丹大学，阿姆斯特丹大学，卫生部10号证据，拉德布德大学医学中心10号，拉德布德大学，荷兰Nijmegen，荷兰，荷兰11号，拉德布德大学医学中心11号，拉德布德大学，纽约市纽约市12号纽芬兰大学，Radboud University，Radboud University，Radboud Univers，Radboud Institution，Radboud Institution，Radboud Univer，Radboud Univer，Radmodsitution，Radmodsituty，Radmodsituty，Radboud Institut，radmen condboun scudij and radboun荷兰荷兰大学医学中心鹿特丹大学医学中心，鹿特丹大学医学中心，荷兰2号，医学微生物学和感染预防局2阿姆斯特丹大学医学中心，阿姆斯特丹，荷兰，5实验室医学系，医学免疫学实验室，部分儿科感染疾病，拉德布德分子生命科学研究所，拉德布德疾病中心，纽约大学纽约大学医学中心，Neijmegen，Neijmegen，Neijmegen，Nepranlands，Neijmegen，Nepranlands，Neijmegen，NEPHRODS 6，纽约大学医学中心，纽约大学，纽约大学，纽约大学。格罗宁根，格罗宁根大学，格罗宁根，荷兰，病毒科学系7，伊拉斯mus医学中心，鹿特丹，鹿特丹，荷兰，荷兰8号，实验室医学系8，医学免疫学实验室，拉德布德分子生命科学研究所，拉德布德大学医学中心，纽约市纽约市，纽约市，美国9号。荷兰阿姆斯特丹大学，阿姆斯特丹大学，阿姆斯特丹大学，卫生部10号证据，拉德布德大学医学中心10号，拉德布德大学，荷兰Nijmegen，荷兰，荷兰11号，拉德布德大学医学中心11号，拉德布德大学，纽约市纽约市12号纽芬兰大学，Radboud University，Radboud University，Radboud Univers，Radboud Institution，Radboud Institution，Radboud Univer，Radboud Univer，Radmodsitution，Radmodsituty，Radmodsituty，Radboud Institut，radmen condboun scudij and radboun荷兰荷兰大学医学中心鹿特丹大学医学中心，鹿特丹大学医学中心，荷兰2号，医学微生物学和感染预防局2阿姆斯特丹大学医学中心，阿姆斯特丹，荷兰，5实验室医学系，医学免疫学实验室，部分儿科感染疾病，拉德布德分子生命科学研究所，拉德布德疾病中心，纽约大学纽约大学医学中心，Neijmegen，Neijmegen，Neijmegen，Nepranlands，Neijmegen，Nepranlands，Neijmegen，NEPHRODS 6，纽约大学医学中心，纽约大学，纽约大学，纽约大学。格罗宁根，格罗宁根大学，格罗宁根，荷兰，病毒科学系7，伊拉斯mus医学中心，鹿特丹，鹿特丹，荷兰，荷兰8号，实验室医学系8，医学免疫学实验室，拉德布德分子生命科学研究所，拉德布德大学医学中心，纽约市纽约市，纽约市，美国9号。荷兰阿姆斯特丹大学，阿姆斯特丹大学，阿姆斯特丹大学，卫生部10号证据，拉德布德大学医学中心10号，拉德布德大学，荷兰Nijmegen，荷兰，荷兰11号，拉德布德大学医学中心11号，拉德布德大学，纽约市纽约市12号纽芬兰大学，Radboud University，Radboud University，Radboud Univers，Radboud Institution，Radboud Institution，Radboud Univer，Radboud Univer，Radmodsitution，Radmodsituty，Radmodsituty，Radboud Institut，radmen condboun scudij and radboun荷兰荷兰大学医学中心鹿特丹大学医学中心，鹿特丹大学医学中心，荷兰2号，医学微生物学和感染预防局2阿姆斯特丹大学医学中心，阿姆斯特丹，荷兰，5实验室医学系，医学免疫学实验室，部分儿科感染疾病，拉德布德分子生命科学研究所，拉德布德疾病中心，纽约大学纽约大学医学中心，Neijmegen，Neijmegen，Neijmegen，Nepranlands，Neijmegen，Nepranlands，Neijmegen，NEPHRODS 6，纽约大学医学中心，纽约大学，纽约大学，纽约大学。格罗宁根，格罗宁根大学，格罗宁根，荷兰，病毒科学系7，伊拉斯mus医学中心，鹿特丹，鹿特丹，荷兰，荷兰8号，实验室医学系8，医学免疫学实验室，拉德布德分子生命科学研究所，拉德布德大学医学中心，纽约市纽约市，纽约市，美国9号。荷兰阿姆斯特丹大学，阿姆斯特丹大学，阿姆斯特丹大学，卫生部10号证据，拉德布德大学医学中心10号，拉德布德大学，荷兰Nijmegen，荷兰，荷兰11号，拉德布德大学医学中心11号，拉德布德大学，纽约市纽约市12号纽芬兰大学，Radboud University，Radboud University，Radboud Univers，Radboud Institution，Radboud Institution，Radboud Univer，Radboud Univer，Radmodsitution，Radmodsituty，Radmodsituty，Radboud Institut，radmen condboun scudij and radboun荷兰
丙型肝炎病毒对先天免疫的抑制 (...
摘要：丙型肝炎病毒 (HCV) 是肝炎的主要病原体，也可能导致肝癌和淋巴瘤。仅在美国，慢性丙型肝炎就影响了约 240 万人。作为黄病毒科丙型肝炎病毒属的唯一成员，HCV 编码单链正义 RNA 基因组，该基因组翻译成单个大多肽，然后进行蛋白水解处理以产生单个病毒蛋白，所有这些蛋白都是最佳病毒感染所必需的。然而，细胞先天免疫，如 I 型干扰素 (IFN)，可迅速阻止病毒和其他病原体的复制，这构成了使用结合 IFN-alpha 治疗慢性丙型肝炎的基础。作为一种对策，HCV 通过利用各种基因产物（如 HCV 蛋白酶）来抑制这种形式的免疫，其主要作用是将大型病毒多聚蛋白加工成具有特定功能的单个蛋白质。 HCV 免疫抑制剂的确切数量及其作用的特异性和分子机制仍不清楚。尽管如此，逃避宿主免疫会促进 HCV 发病、慢性感染和致癌作用。本文回顾和分析了已知和假定的 HCV 编码先天免疫抑制剂，主要强调分子机制。在临床上，这些知识应该有助于合理干预和管理 HCV 感染，特别是慢性肝炎。