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牛鼻炎 B 病毒 (BRBV)（属：口蹄疫病毒，科：小核糖核酸病毒科）是牛呼吸道疾病综合征的重要病原体。尽管全球都有关于 BRBV 的报道，但日本菌株的基因组数据尚未登记。在此，我们旨在分析日本 BRBV 的遗传特征。在 66 头牛的鼻拭子中，有症状和无症状的牛分别在 7/10 和 4/56 中检测到 BRBV。宏基因组测序和桑格测序确定了两种日本 BRBV 菌株 IBA/2211/2 和 LAV/238002，它们与已知的 BRBV 菌株具有显著的遗传相似性，并表现出独特的突变和重组事件，表明受区域环境和生物因素影响的动态进化。值得注意的是，LAV/238002 的领导基因位于不同的进化谱系中，与其他 BRBV 菌株有显著差异。基于前导蛋白氨基酸序列的系统发育分析表明，两株日本毒株与其他BRBV毒株处于明显不同的分支，表明存在显著的遗传多样性。该研究结果有助于我们深入了解日本BRBV毒株的遗传组成，丰富其遗传多样性和进化机制的认识。
日本牛鼻炎B病毒的检测及基因分析
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