基因组资源联盟(简称“联盟”)由 7 个知识库项目共同努力而成:酵母菌基因组数据库、WormBase、FlyBase、小鼠基因组数据库、斑马鱼信息网络、大鼠基因组数据库和基因本体资源。联盟致力于提供多种益处:为这些项目服务的各个社区提供更好的服务;为所有生物医学研究人员、生物信息学家、临床医生和学生提供统一的数据视图;以及提供更可持续的基础设施。联盟已统一了跨生物体数据,以提供基因功能、基因表达和人类疾病相关性的有用比较视图。比较视图的基础是直系同源关系的共享调用和通用本体的使用。关键的数据类型是等位基因和变异、基于基因本体注释的基因功能、表型、与人类疾病的关联、基因表达、蛋白质-蛋白质和遗传相互作用以及参与途径。信息呈现在统一的基因页面上,便于轻松总结所涵盖的 7 种生物(芽殖酵母、线虫秀丽隐杆线虫、果蝇、家鼠、斑马鱼、褐家鼠和人类)中每种基因的信息。统一的知识可在 alliancegenome.org 门户网站上免费获取,以可下载文件和 API 的形式提供。我们希望其他现有和新兴知识库能够加入这一努力,提供每个知识库目前提供的有用数据和功能的统一。
摘要关于癌症患者比例的持续辩论,这些癌症患者的比例是从精确肿瘤学中出发的,部分原因是关于哪种分子改变在临床上可起作用的观点相互冲突。为了量化自2017年以来的临床可行性的扩展,我们使用了两个相隔5年的Oncokb知识库的两个时间不同版本的Oncokb知识库进行了47,271个实体瘤的注释。在2017年至2022年之间,我们观察到具有标准护理(1或2级)的肿瘤(1或2级)的肿瘤比例增加到31.6%,预测治疗反应的预测生物标志物几乎使携带非可行驱动因素的肿瘤减半(44.2%到22.8%)。在有限或没有临床可行性的肿瘤中,TP53(43.2%),KRAS(19.2%)和CDKN2A(12.2%)是最常见的基因。
庆应义塾大学学术资源联合知识库 (KOARA) 上提供的内容的版权属于各自的作者、学术团体或出版商/发行人,这些权利受日本版权法保护。引用内容时,请遵守日本版权法。
我的仪表板显示小部件和统计信息以及产品权利的合同状态。特色统计信息下方是趋势支持文档和知识库文章的小部件。要查找特定问题或疑问的答案,请点击任何小部件右上角的信息图标。
在本研究中使用了一种定制的Chatgpt,称为GPTS [15] [15],结果模型被称为“ Physio Exam gpt”。自定义过程涉及两个主要组成部分:首先,一个包括340个MCQ的知识库以及相应的正确答案,解释和链接的主题,这些主题是从第57届日本和第58届日本国家物理治疗师的国家许可检查中得出的。作者开发了这些解释和相关主题,如附录部分(补充1)所示。第二,量身定制的提示配置旨在使用户能够输入相关主题,从而使GPT可以根据知识库中嵌入的信息生成MCQ。提示设计的细节在补充2中列出;如上所述,自定义过程有意限于嵌入“知识”(MCQ)并配置“提示”,而没有其他微调或模型调整。生成的问题仅依赖于自定义GPT框架的标准功能。
基因组资源联盟(简称“联盟”)由 7 个知识库项目共同努力而成:酵母菌基因组数据库、WormBase、FlyBase、小鼠基因组数据库、斑马鱼信息网络、大鼠基因组数据库和基因本体资源。联盟致力于提供多种益处:为这些项目服务的各个社区提供更好的服务;为所有生物医学研究人员、生物信息学家、临床医生和学生提供统一的数据视图;以及提供更可持续的基础设施。联盟已统一了跨生物体数据,以提供基因功能、基因表达和人类疾病相关性的有用比较视图。比较视图的基础是直系同源关系的共享调用和通用本体的使用。关键的数据类型是等位基因和变异、基于基因本体注释的基因功能、表型、与人类疾病的关联、基因表达、蛋白质-蛋白质和遗传相互作用以及参与途径。信息呈现在统一的基因页面上,便于轻松总结所涵盖的 7 种生物(芽殖酵母、线虫秀丽隐杆线虫、果蝇、家鼠、斑马鱼、褐家鼠和人类)中每种基因的信息。统一的知识可在 alliancegenome.org 门户网站上免费获取,以可下载文件和 API 的形式提供。我们希望其他现有和新兴知识库能够加入这一努力,提供每个知识库目前提供的有用数据和功能的统一。