基因组资源联盟(简称“联盟”)由 7 个知识库项目共同努力而成:酵母菌基因组数据库、WormBase、FlyBase、小鼠基因组数据库、斑马鱼信息网络、大鼠基因组数据库和基因本体资源。联盟致力于提供多种益处:为这些项目服务的各个社区提供更好的服务;为所有生物医学研究人员、生物信息学家、临床医生和学生提供统一的数据视图;以及提供更可持续的基础设施。联盟已统一了跨生物体数据,以提供基因功能、基因表达和人类疾病相关性的有用比较视图。比较视图的基础是直系同源关系的共享调用和通用本体的使用。关键的数据类型是等位基因和变异、基于基因本体注释的基因功能、表型、与人类疾病的关联、基因表达、蛋白质-蛋白质和遗传相互作用以及参与途径。信息呈现在统一的基因页面上,便于轻松总结所涵盖的 7 种生物(芽殖酵母、线虫秀丽隐杆线虫、果蝇、家鼠、斑马鱼、褐家鼠和人类)中每种基因的信息。统一的知识可在 alliancegenome.org 门户网站上免费获取,以可下载文件和 API 的形式提供。我们希望其他现有和新兴知识库能够加入这一努力,提供每个知识库目前提供的有用数据和功能的统一。
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