Loading...
机构名称:
¥ 1.0

基因组资源联盟 (Alliance) 是一个可扩展的知识库联盟,专注于深入研究的模式生物的遗传学和基因组学。联盟由独立的知识中心组成,与其研究社区和集中式软件基础设施有着密切的联系,我们将在此讨论。联盟中目前代表的模式生物是芽殖酵母、秀丽隐杆线虫、果蝇、斑马鱼、青蛙、实验室小鼠、实验室大鼠和基因本体论联盟。该项目正处于快速发展阶段,旨在协调知识、存储知识、分析知识并通过网络门户、直接下载和应用程序编程接口 (API) 将其呈现给社区。在这里,我们关注过去 2 年的发展。具体来说,我们添加并增强了用于浏览基因组 (JBrowse)、下载序列、挖掘复杂数据 (AllianceMine)、可视化途径、文献全文搜索 (Textpresso) 和序列相似性搜索 (SequenceServer) 的工具。我们增强了现有的交互式数据表,并添加了一个交互式旁系同源物表,以补充我们对直系同源物的表示。为了支持单个模型生物群落,我们实施了物种特定的“登陆页面”,并将很快添加疾病特定的门户;此外,我们还支持在 Discourse 软件中实现的公共社区论坛。我们描述了我们在支持管理的中央持久数据库方面的进展、支持协调的数据建模,以及在实现集成人工智能和机器学习 (AI/ML) 的最先进的文献管理系统方面的进展。

基因组资源联盟中央基础设施的更新。

基因组资源联盟中央基础设施的更新。PDF文件第1页

基因组资源联盟中央基础设施的更新。PDF文件第2页

基因组资源联盟中央基础设施的更新。PDF文件第3页

基因组资源联盟中央基础设施的更新。PDF文件第4页

基因组资源联盟中央基础设施的更新。PDF文件第5页