基于 CRISPR 的功能基因组学筛选是识别合成致死癌症药物靶点的有力工具。目前分析汇集的 CRISPR 筛选的策略通常依赖于来自在两种实验条件下具有不同相对丰度的单个向导 RNA (sgRNA) 的信号。然而,传统方法通常容易受到由异常细胞克隆驱动的假阳性和假阴性的影响,因为 sgRNA 丰度不能解释由相同 sgRNA 的不同编辑结果导致的异质表型。为了克服这个问题,我们在每个 sgRNA 中添加了 DNA 条形码,以创建 CRISPR 文库的唯一分子标识符 (UMI),并开发了一个配套的分析平台,以实现强大的工业规模 CRISPR 筛选。在这里,我们介绍了 UMIBB,一种用于分析 UMI-CRISPR 数据的新型非参数贝叶斯方法。与每个 sgRNA 的对照实验条件相比,具有标准化计数消耗或富集的 UMI 数量由 beta-二项分布建模。基因水平统计数据是通过将 sgRNA 水平后验概率的 z 分数与每个 sgRNA 中 UMI 的数量加权而得出的。这种方法最大限度地减少了异常细胞克隆对统计数据的影响,并优先考虑每个基因中多个 UMI 之间计数差异一致的基因。为了评估 UMIBB 的功效,我们在低覆盖率(200X)基因组规模负选择筛选上对其进行了基准测试,并与高覆盖率(1000X)筛选的结果进行了比较。这些筛选是在用曲美替尼或载体对照处理的 KRAS 突变癌细胞(A549)上进行的。尽管在较低覆盖率筛选中通常会观察到高噪音水平,但我们的方法能够发现 >85% 的曲美替尼已验证的致敏基因,并且与传统方法相比实现了最高的灵敏度。此外,我们将 UMIBB 应用于基因组规模的正向选择筛选,并成功确定了新基因(RAD18 和 UBE2K)是 BRCA1/2 突变细胞系中 USP1 依赖性的关键介质。我们的研究表明,UMIBB 对克隆异质性导致的假阳性具有很高的稳健性,并且更有可能识别真正的遗传相互作用。
初步沟通 基于人工智能的车载自动列车障碍物距离估计 Ivan ĆIRIĆ*、Milan PAVLOVIĆ、Milan BANIĆ、Miloš SIMONOVIĆ、Vlastimir NIKOLIĆ 摘要:本文提出了一种新方法,利用图像平面单应性矩阵来改进对摄像机和成像物体之间距离的估计。该方法利用两个平面(图像平面和铁轨平面)之间的单应性矩阵和一个人工神经网络,可根据收集的实验数据减少估计误差。SMART 多传感器车载障碍物检测系统有 3 个视觉传感器——一个 RGB 摄像机、一个热成像摄像机和一个夜视摄像机,以实现更高的可靠性和稳健性。虽然本文提出的方法适用于每个视觉传感器,但所提出的方法是在热成像摄像机和能见度受损场景下进行测试的。估计距离的验证是根据从摄像机支架到实验中涉及的物体(人)的实际测量距离进行的。距离估计的最大误差为 2%,并且所提出的 AI 系统可以在能见度受损的情况下提供可靠的距离估计。 关键词:人工神经网络;自动列车运行;距离估计;单应性;图像处理;机器视觉 1 简介 通过遵循自动化趋势,可以大大提高铁路货运的质量和成本竞争力,以实现经济高效、灵活和有吸引力的服务。今天,自动化和自主操作已经在公路、航空和海运中变得普遍。现代港口拥有自动导引车 (AGV),可将集装箱从起重机运送到轨道旁、仓库、配送中心,而自动驾驶仪是航空公司和大型货船的标准配置,不需要大量机上人员。自动驾驶汽车和卡车的发展已经进入了一个严肃的阶段。此外,轨道交通自主系统的发展主要出现在公共交通服务领域(无人驾驶地铁线路、轻轨交通 (LRT)、旅客捷运系统和自动引导交通 (AGT))。基本思想是使用一定程度的自动化,将操作任务从驾驶员转移到列车控制系统(例如 ERTMS)。根据国际电工委员会 (IEC) 标准 62290-1,列车自主运行 (ATO) 是高度自动化系统的一部分,减少了驾驶员的监督 [1]。对于完全自主的列车运行,列车操作员的所有活动和职责都需要由多个系统接管,这些系统可以感知环境并俯瞰现场,检测列车路径上的潜在危险物体并做出相应的正确反应 [2-6]。障碍物检测系统作为 ATO 系统的主要部分,障碍物检测系统需要根据货运特定和一般用例(例如 EN62267 和/或自动化领域的相关项目)来监控环境。为了满足严格的铁路标准和法规,障碍物检测系统 (ODS) 应在具有挑战性的环境和恶劣的能见度条件下工作。ODS 是一种具有硬件和软件解决方案的机器视觉系统(图 1),用于提供有关铁路上和/或其附近障碍物的可靠信息,并估算从系统到检测到的障碍物的距离 [7]。该系统需要实时运行,并在不同的光照条件下运行(白天、
机械系统中的减振和能量耗散是一个快速发展的领域(例如[ 1 – 5 ]。该领域的发展源于设计更严格的减振装置的需求。这些装置应满足生产更轻、更复杂的机械产品的需求。减振方法有很多种(例如[ 6 – 8 ]),最常见的类型是调谐质量阻尼器 (TMD),它是由 H. Frahm [ 9 ] 首次设计的。它是一个被动线性系统,由一个通过弹簧和阻尼器连接到主结构的质量组成。TMD 仅在较窄的频率范围内表现良好,然而,由于多种原因,主结构也可能以其他频率振动 [10]。为了解决 TMD 系统的局限性,已经提出了替代的减振方法。非线性能量吸收器 (NES) 是一种很有前途的减振装置,因为它能够在各种振动频率范围内工作。NES 系统通常由连接到主质量的次级质量组成,具有高度非线性刚度。Vakakis 和 Gendelman [11] 最近提出了一种 NES 系统。Younesian 等人。[12] 研究了 NES 系统在铁路桥梁减振中的应用。NES 系统抑制气动弹性不稳定性的能力已在 [ 13 ] 中得到证实。在 [ 14 ] 中,NES 系统的应用
摘要 深度学习 (DL) 方法在多个复杂任务上取得的成功大大提高了人们对其学习复杂脑成像数据的细微特性以及扩展到大型数据集的能力的期望。也许是为了应对这种膨胀,最近的批评性评论不利地将 DL 与用于分析脑成像数据的标准机器学习 (SML) 方法进行了比较。然而,他们的结论是基于预先设计的特征,这剥夺了 DL 的主要优势:表征学习。在这里,我们对此进行了评估,并展示了表征学习对于 DL 在脑成像数据上的表现的重要性。我们报告了在 12,314 张结构性 MRI 图像上进行的十向年龄和性别分类任务中对 SML 方法与 DL 进行大规模系统比较的结果。结果表明,如果按照流行的 DL 实践实施和训练 DL 方法,则与 SML 方法相比,DL 方法有大幅改进的潜力。我们还表明,尽管 DL 方法更复杂,但其扩展性特别好,在相对计算时间中呈现出较低的渐近复杂度。我们的分析表明,随着训练样本量的增长,性能改进会趋于饱和,但始终表现出显著更高的性能。我们还提供了证据,表明 DL 的卓越性能主要归功于出色的表示学习能力,并且 SML 方法在对经过训练的 DL 模型生成的表示进行操作时也可以表现得同样出色。最后,我们证明 DL 嵌入跨越了可理解的投影谱,并且 DL 始终定位有判别力的大脑生物标志物,这为预测相关性估计的稳健性提供了一个例子。我们的研究结果强调了大脑成像数据中存在非线性,DL 框架可以利用这些非线性来生成用于表征人脑的卓越预测表示,即使在当前可用的数据量下也是如此。
政府正在就将于 2020/21 年实施的地方当局未来资金进行磋商;公平资金审查将根据对需求和资源的评估来评估所需的资金水平。这将与 75% 商业税保留的引入相吻合,预计我们所有的外部资金将通过调整我们的基准资金水平、关税/补足和征税来提供。还宣布新房奖金将以目前的形式停止,但预计遗留付款将继续。
制造工艺耐受原材料、操作条件、工艺设备、环境条件和人为因素的预期变化的能力称为稳健性。本文的目的是统一对当前工艺稳健性概念的理解以及它们如何应用于制药制造。本文还就稳健工艺的开发和维护提出了建议。这里提出的概念具有一般性,可应用于许多制造情况;然而,讨论的重点是将稳健性原则应用于非无菌固体剂型制造。本文提出的工具、案例研究和讨论围绕新产品开发和商业化展开,因为理想情况下,工艺稳健性活动从工艺设计的最早阶段开始,并贯穿产品的整个生命周期。人们还认识到,稳健性概念可以追溯应用于现有产品,以增强对工艺的理解。