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Lepidocephalichthys berdmorei 的完整线粒体基因组及其在鲡科（鲤形目）中的系统发育地位
本研究首次采用引物步移序列法测定了Lepidocephalichthys berdmorei的线粒体全基因组。该基因组全长16,574 bp，包括13个蛋白质编码基因（PCG），22个转移RNA（tRNA）基因，2个核糖体RNA（rRNA）基因和一个控制区（D-loop）。基因排列模式与其他硬骨鱼类相同。整体碱基组成为29.9％A，28.5％T，25.5％C和16.1％G，A+T偏向为58.4％。进一步，基于18种鲂科鱼线粒体基因组中的13个PCG，采用3种不同的方法（邻接法、最大似然法和贝叶斯推断）进行系统发育分析。所有方法一致表明鳞头鱼属的四个物种形成一个单系群。本研究将为鳞头鱼物种提供有效的分子信息，并为物种鉴定研究提供新的遗传标记。
用超保守的元素数据澄清Eupoinae Maddison的系统发育放置
supfoinae maddison，2015年是一群来自东南亚的小叶叶式跳跃蜘蛛。尽管以前的分子植物遗传研究表明，它是跳跃蜘蛛中的基底（非甲状腺素）谱系之一，但其确切的位置尚不清楚。在这项研究中，从主要的盐族谱系中收集了超保存的Element数据，以研究所有盐酸亚家族的系统发育关系，并特别关注欧盟Poinae的放置。结果为跳跃蜘蛛亚家族提供了良好的系统发育，并提出了Eupoinae与Spartaeinae Wanless的姐妹关系，1984年是跳跃蜘蛛的基础谱系，具有相对较高的物种多样性以及形态学和行为多样性。随着eupoinae的放置，我们解决了所有盐酸亚科的关系船，为跳跃蜘蛛的进化研究提供了强大的框架。
保守的基因内容和独特的系统发育历史是 Triturus 平衡致死系统背后的“bloopergene”的特征
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可证永久有效。它以预印本形式提供（未经同行评审认证），作者/资助者已授予 bioRxiv 许可，可以在该版本中显示预印本。版权所有者于 2024 年 10 月 25 日发布了此版本。；https://doi.org/10.1101/2024.10.25.620277 doi：bioRxiv 预印本
鸟类肺Mycobiome：肺摄入群落的系统发育和生态驱动因素及其潜在病原体
脊椎动物肺部包含多种微生物群落，但鲜为人知的是社区组成或其对健康的后果的原因。肺微生物组组装，例如分散，协同进化和宿主开关。然而，肺微生物组的比较调查很少，特别是对于真菌成分，是mycobiome。区分真菌分类群是通才或专业共生体，潜在的病原体或偶然吸入的孢子，这是迫切的，因为有很高的新兴疾病潜力。在这里，我们提供了禽肺菌落体的第一个特征，并测试了环境，系统发育和功能性状的相对影响。我们使用了195个肺样本中的元法编码和培养，代表20个家庭中的32种鸟类。我们确定了532个真菌分类群（Zotus），其中包括许多机会病原体。这些主要由门comycota（79％）组成，其次是basidiomycota（16％）和粘膜瘤（5％）。酵母和类似酵母菌的类群（Malassezia，Filobasidium，saccharomyces，Meyerozyma和Aureobasidium）和丝状真菌（cladosporium，cladosporium，externaria，neurospora，fusarium和spergillus）很丰富。肺Mycobiomes受环境暴露的强烈影响，并通过宿主身份，性状和系统发育亲和力进一步调节。我们的结果暗示了迁移性鸟类作为机会性致病真菌的长距离传播的潜在向量。
估计用于系统发育分析的DNA混合模型
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未获得同行评审证书）获得的是作者/资助者，他已授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是该版本的版权所有，该版本于2024年10月1日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.03.20.586035 doi：Biorxiv Preprint
系统发育放置，整个基因组组装和全基因组的结合研究：一种新型的人类感染物种，引起了毛尿症，对阿苯达唑 - 膜片蛋白
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证。是根据作者/资助者提供的预印本（未经Peer Review的认证）提供的，他已授予Biorxiv的许可证，以在2024年9月28日发布的此版本中在版权所有者中显示预印本。 https://doi.org/10.1101/2024.06.11.598441 doi：biorxiv Preprint
起重机之间的系统发育关系（Gruiformes
ABSTRACR。-我使用DNA-DNA杂交方法在Gruidae（Cranes）和外部limpkin（Ara-Midae）之间产生1,200多个成对比较。基于每个细胞的3-10个复制实验，遗传距离的矩阵包括所有细胞的平均delta tm值以及起重机之间的倒数值。i选择了Delta t•作为适当的差异度量，因为在标准的实验条件下，起重机基因组中几乎所有同源的单拷贝DNA序列都足够相似。所有起重机物种对的归一百分比杂交百分比（NPH）值接近100。由于与小遗传距离的测量相关的实验变化，delta TM数据略微脱离了度量。DNA数据以最佳拟合树方法进行了分析，并通过具套品来检查内部一致性，支持传统的观点，即加冕起重机（Balearica）是现存的最古老的Gruid谱系。神秘的西伯利亚起重机（Grus leucogeranus）作为其余物种的姊妹组，分为四个密切相关的群体。Bugeranus和Anthropoides是姊妹团体。澳大利亚的三种种类（Antigone，Rubicunda和Vipio）形成了进化枝，五种主要是果皮的Grus（Grus，Monachus，Monachus，Nigricollis，Japo-Nensis和Americana）也是如此。Sandhill Crane（G. Canadensis）虽然显然是Gruine进化枝的成员，但它是一个没有近亲的旧血统。1989年3月21日收到，1989年5月18日接受。
耦合DNA条形码和外显子捕获量以解决Turridae（胃足，conoidea）的系统发育
图1无脊椎动物和水产养殖软体动物中受过比较训练的免疫反应模型。该图说明了在无脊椎动物和海洋软体动物中观察到的训练反应的多样性。训练诱导后的免疫反应（主要反应）和挑战（次要反应）。 文献中描述的不同响应模式由不同颜色的曲线表示。 传说指示观察到不同模式的物种：训练时诱导的持续反应，没有消光期，直到次级响应（深蓝色线）；免疫移位显示出定性不同的主要和次要反应，涉及不同的基因集（浅蓝色和深绿色线）；具有主要响应的公差响应，但没有次级响应（浅蓝色线）。 双相反应，命名为召回响应，其主要响应随后是灭绝阶段，以及对后续挑战（浅绿线）的相似或更强大，更快，更快的次要响应。训练诱导后的免疫反应（主要反应）和挑战（次要反应）。文献中描述的不同响应模式由不同颜色的曲线表示。传说指示观察到不同模式的物种：训练时诱导的持续反应，没有消光期，直到次级响应（深蓝色线）；免疫移位显示出定性不同的主要和次要反应，涉及不同的基因集（浅蓝色和深绿色线）；具有主要响应的公差响应，但没有次级响应（浅蓝色线）。双相反应，命名为召回响应，其主要响应随后是灭绝阶段，以及对后续挑战（浅绿线）的相似或更强大，更快，更快的次要响应。