摘要:在生命的三个领域中,同源重组(HR)的过程在修复双链DNA断裂和重新开始停滞的复制叉中起着核心作用。奇怪的是,参与人力资源过程的主要蛋白质参与者似乎对于高素化的古细菌提出了有关人力资源在极端条件下的古细菌中的复制和修复策略中的作用的有趣问题。该过程的一个关键参与者是重组酶RADA,它允许同源链搜索,并提供了遵循DNA合成并恢复遗传信息所需的DNA底物。DNA聚合酶在古细菌中尚不清楚链交换步骤后的操作。使用Abyssi Abyssi蛋白的工作,在这里我们表明,DNA聚合酶,家庭-B聚合酶(POLB)和家族-D聚合酶(POLD)都可以负责处理RADA介导的重组中间体。我们的结果还表明,与POLB相比,POLD的效果要少得多,以扩展位移环(D-Loop)底物处的入侵DNA。这些观察结果与先前对热圆菌物种获得的遗传分析相吻合,表明POLB主要参与DNA修复,而不是必不可少的,这可能是因为Pold可以接管其他伴侣。
在女性生殖系统中,最致命的癌性生长被称为上皮性卵巢癌 (EOC)。根据 2020 年全球癌症统计数据,卵巢癌在全球女性恶性肿瘤中排名第七,每年新发病例超过 310,000 例(Lee 等人,2022 年;Konstantinopoulos 和 Matulonis,2023 年)。卵巢癌每年夺走约 210,000 人的生命。2020 年,中国有 60,000 例新诊断病例被诊断为卵巢癌,并导致 40,000 人死亡(Zhao 等人,2023 年)。晚期卵巢癌患者的 5 年生存率约为 30%。随着多次复发,治疗和复发的间隔变得更短,导致对铂类药物的敏感性降低,最终发展为铂类耐药性。该病的治疗难度大,预后往往较差(Marchetti等,2021;Porter和Matulonis,2023)。克服卵巢癌的化疗耐药性是一个紧迫而重要的临床问题。炎症反应主要分为急性和慢性两类。急性炎症主要发生在物理、化学或急性感染情况下,是机体的早期防御机制,通常很快可自行缓解(Yang等,2023)。慢性炎症则发生在慢性感染或自身免疫性疾病中,机体正常的反馈调节无法阻止炎症,导致慢性炎症(Liu等,2022)。统计数据显示,全球约20%的恶性肿瘤是由慢性炎症引起的(Kennel et al., 2023; Venakteshaiah and Kumar, 2021; Haas et al., 2021),非甾体抗炎药物在临床上可以降低各类实体瘤的发病率和转移率,降低肿瘤引起的死亡率。慢性炎症被认为对癌症的发生、生长和进展有显著的影响。慢性炎症引发肿瘤发生、发展的机制多种多样,但往往与炎症为肿瘤提供的微环境有关。癌相关成纤维细胞(CAFs)作为癌症基质的重要组成部分,与炎症和肿瘤免疫微环境(TME)密切相关(Chen et al., 2021)。 CAFs 与 NF- κ B、PI3K-Akt、IL6-JAK-STAT3 和 TGF- β 等各种信号通路相互作用,帮助形成和维持 TME,影响 ECM 结构并产生免疫治疗耐药性(Mao et al., 2021; Wu F. et al., 2021)。此外,活化的 CAFs 促进单核细胞粘附并驱动巨噬细胞向 M2 极化方向分化,进一步抑制 TME 中的免疫反应(Lavie et al., 2022; Galbo et al., 2021)。因此,分析与炎症相关的基因与肿瘤免疫环境之间的关系有助于
背景和目的。在医学成像中,群体研究必须克服个体之间存在的差异,以识别可用于诊断目的的不变图像特征。在功能性神经成像中,识别在群体水平上成立的神经编码原理的一个有吸引力的解决方案是受试者间模式分析,即从来自多个受试者的数据中学习预测模型并评估其对新受试者的泛化性能。尽管近年来它越来越受欢迎,但由于文献中明显缺乏正式定义,其广泛采用仍然受到阻碍。在本文中,我们精确介绍了针对功能性神经成像的多变量组分析的受试者间模式分析的第一个原则性形式化。方法。我们建议将受试者间模式分析构建为多源传导传递问题,从而将其置于几个定义明确的机器学习设置中并拓宽可用算法的范围。我们描述了两组使用几个开放数据集的受试者间大脑解码实验:一项涉及 16 名受试者的脑磁图研究和一项涉及 100 名受试者的功能性磁共振成像范例。我们通过进行模型比较来评估我们框架的相关性,其中一个大脑解码模型利用我们的形式化,而其他则不利用。结果。第一组实验证明了使用受试者标准化的大脑解码器与使用其他标准化方案的最先进模型相比具有优越性,证明了我们形式化的传导和多源组件的兴趣第二组实验定量表明,即使经过这样的转换,大脑解码器也更难以推广到新参与者而不是来自训练阶段可用的参与者的新数据,从而凸显了需要克服的转移差距。结论。本文将受试者间模式分析的第一个形式化描述为多源传导迁移学习问题。我们利用几个互补的功能性神经成像数据集上的概念验证实验证明了这种形式化的附加价值。这项工作将有助于推广功能性神经成像人群研究的受试者间模式分析,并为未来的方法创新铺平道路。
预印本(未通过同行评审认证)是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此版本的版权持有人于2025年2月2日发布。 https://doi.org/10.1101/2023.09.09.03.556087 doi:Biorxiv Preprint
对阿尔茨海默病患者大脑的转录组分析发现了导致癫痫的失调基因 Abdallah M. Eteleeb 1,2¶ 、Suélen Santos Alves 3¶ 、Stephanie Buss 5,6 、Mouhsin Shafi 5,6 、Daniel Press 5,6 、Norberto Garcia-Cairasco 3,4 、Bruno A. Benitez 5,6¶ * 1 美国密苏里州圣路易斯华盛顿大学精神病学系。 2 美国密苏里州圣路易斯华盛顿大学查尔斯 F. 和乔安妮奈特阿尔茨海默病研究中心 3 巴西圣保罗大学里贝朗普雷图医学院(FMRP-USP)神经科学与行为科学系。 4 巴西圣保罗大学里贝朗普雷图医学院 (FMRP-USP) 生理学系。5 美国马萨诸塞州波士顿贝斯以色列女执事医疗中心神经病学系 6 美国马萨诸塞州波士顿哈佛医学院 * 通讯作者:电子邮件:bbenitez@bidmc.harvard.edu ¶ 共同作者
更新理由:• 为补体抑制剂添加了 ravulizumab (Ultomiris®)。• 更新以澄清脑膜炎球菌疫苗不定期提供给医护人员。• 更新了 7 岁及以上使用补体抑制剂的个体的加强剂量建议。• 更新了特定年龄组的时间表和剂量之间的最小间隔。
(未经同行评审认证)是作者/资助者。保留所有权利。未经许可不得重复使用。此预印本的版权所有者此版本于 2025 年 2 月 3 日发布。;https://doi.org/10.1101/2025.02.03.636311 doi:bioRxiv preprint
辣椒泥是一种高度有价值的园艺作物,由于其高水量而面临与快速恶化有关的挑战。已提出将辣椒加工成泥,以扩大其保质期。但是,由于其水含量助长了微生物的生长,在环境环境中留下时,新鲜的辣椒果会迅速腐烂。为了解决这个问题,已经研究了将鱼池用作替代且环保的存储方法。与常规的冰箱储存相比,这项研究探讨了储存在鱼池中的辣椒泥的代谢组变化和保存机制。使用气相色谱系统分离后,通过质谱分析确定辣椒泥中的代谢产物。可以通过化学计量技术全面测量代谢物,可以理解储存过程中果泥的化学成分和果泥的变化。即使众所周知,储存在冰箱中的地面辣椒的感觉参数与储存在池中持续五个星期的地面辣椒的感觉参数相对较差,但分子众所周知,这两个样品中代谢物的分布与第四周开始不同。从这项研究中获得的洞察力可以导致量身定制的存储条件,从而最大程度地发挥保存潜力并确保保留的辣椒泥的质量和安全性。这项研究强调了鱼池的潜力,可以延长辣椒泥的保质期,同时最大程度地减少废物和资源使用。©2025 SPC(SAMI Publishing Company),《亚洲绿色化学杂志》,用于非商业目的。
1 Celvia CC AS,塔尔图,爱沙尼亚 10 2 塔尔图大学临床医学研究所妇产科系,塔尔图,爱沙尼亚 11 3 卡罗琳斯卡医学院和卡罗琳斯卡大学医院临床科学、干预和技术系妇产科,12 瑞典斯德哥尔摩 13 4 塔尔图大学分子与细胞生物学研究所,爱沙尼亚 14 15
金属污染物具有持久性,可能有毒,并在自然环境中积累。它们对生物体的毒性取决于暴露时间和剂量 [Pande et al., 2022]。它们通过限制土壤微生物的数量和活性来影响土壤微生物 [Abbas et al., 2021]。锰、铁和钴对微生物至关重要 [Farrag, 2017; Zeinert et al., 2018; Uzoh and Babalola, 2020]。同时,如果过量存在,它们也会造成危害 [Łopusiewicz et al., 2020; Zhang, 2022; Wu et al., 2022]。这也与对土壤酶活性的影响有关,土壤微生物是酶活性的来源之一。土壤的酶活性受非生物、生物和人为因素的影响。与施肥和使用植物保护产品有关的人类活动是农业土壤中金属的主要来源,并导致金属含量的增加[Furtak