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肠道微生物组在创伤后应激障碍中的新兴作用
创伤后应激障碍（PTSD）发生在暴露于涉及实际/威胁死亡，严重伤害或性暴力的可怕或灾难性事件后的某些人中。PTSD是一种常见且令人衰弱的精神障碍，对个人，家人，卫生服务和社会造成了重大负担。此外，PTSD是慢性疾病的危险因素，例如冠心病，中风，糖尿病以及过早死亡。此外，PTSD与免疫功能失调有关。尽管PTSD的患病率很高，但其病因和表现形式的基础机制仍然很少理解。令人信服的证据表明，人类肠道微生物组是一个复杂的微生物社区，生活在胃肠道中，在宿主神经系统的发展和功能，复杂的行为和脑电路中起着至关重要的作用。肠道微生物组可能通过影响炎症，压力反应和神经递质信号传导来促进PTSD，而肠道和脑之间的双向通信涉及微生物代谢物，免疫系统激活等机制。在本文献综述中，我们总结了有关肠道微生物组在PTSD中的作用的最新发现。我们讨论了现有研究的方法论局限性，并提出了未来的研究区域，以进一步了解肠道微生物组在PTSD中的作用。
更新了有关微生物组在...
心血管疾病（CVD），包括冠状动脉疾病，中风，心力衰竭和高血压，是全球主要的死亡原因，占全球死亡人数的30％以上。尽管已经了解了CVD的危险因素，并且已经建立了各种治疗方法和预防措施，但由于生活方式的变化以及现代一代的预期增加，CVD的死亡率和CVD的财务负担预计会随着时间的推移而成倍增长。宏基因组学和代谢组学分析的最新进展已确定肠道微生物组及其相关代谢物是CVD的潜在危险因素，这表明有可能开发针对CVD的更有效的新型治疗策略。此外，越来越多的证据表明，企业与细菌植物的比率发生了变化以及微生物依赖性代谢产物的失衡，包括短链脂肪酸和三甲胺N氧化物，在CVD的病原体中起着至关重要的作用。然而，到目前为止，确切的作用机理仍未确定。在这篇综述中，我们关注肠道微生物组的组成变化和
微生物组在整个环境中的相互联系，对健康人和健康的星球产生了重大影响
摘要。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。2简介。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。2微生物组的转移和环境微生物组中的相互作用。。。。3土壤植物连续体。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。3植物种子作为微生物群传播的车辆。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。4植物植物层和空气中微生物群的交换。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。5微生物的空降运输。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。6种昆虫和微生物传播。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 6微生物组在水生环境中的相互联系。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 8农业生产系统中人类病原体和抗菌抗性基因的传播。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。6种昆虫和微生物传播。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。6微生物组在水生环境中的相互联系。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。8农业生产系统中人类病原体和抗菌抗性基因的传播。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。9食品衍生的微生物群和人（肠）微生物组。。。。。。。。。。。。。。。。。。。10可食用的微生物组。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。10微生物在环境与动物起源食物之间的接口处转移。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。食品/饲料（生产）环境中的11个微生物组交换。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。11垂直传播和母乳喂养作为生命早期阶段的微生物组发育的驱动力。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。12其他影响人类微生物组的生活方式因素。。。。。。。。。。。13环境和微生物转移的社会互动的相关性。。。。13宠物和人类之间的微生物群交换。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。14在建筑环境中的微生物转移。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。15
社论：肠道微生物组在动物肠道连锁疾病中的潜在作用
微生物，包括细菌，真菌和病毒，它们在协同或拮抗关系中相互作用以维持稳定的肠道环境和功能（Zheng等，2020）。稳定的肠道微生物群已被证明是肠道执行各种复杂生理过程的先决条件，但是肠道微生物营养不良可能导致多种胃肠道疾病，包括腹泻，胃痛和结肠炎。此外，肠道微生物群落的影响范围超出了胃肠道系统，并可能引起其他全身性疾病。同样，为了提高我们对微生物组和宿主相互作用的知识，并开发了一种有效的方法来恢复扰动的动物和人类微生物生态系统。动物胃肠道系统中的肠道微生物替代或肠道微生物组组成和功能的差异与各种疾病有关，从代谢条件和胃肠道炎症到结肠炎到结肠炎，呼吸道疾病和呼吸道疾病。在这一研究领域，Zhang等。在过去的10年中对肠道和溃疡性结肠炎研究领域中的出版物进行了文献计量分析，这总结了有关肠道肠和溃疡性结肠炎全球研究趋势的当前知识。在另一只手上，了解整个肠道的微生物组成，并就如何提高动物的整体健康和生产力提供见解。Chang等。Chang等。已更新了我们对肠道猪的肠道菌群的结构和功能的了解，而藏猪猪的不同生长和发育阶段，这在其免疫性能中起着重要作用。
肠道微生物组在动脉粥样硬化心血管疾病发展中的作用
摘要：动脉粥样硬化心血管疾病（ASCVD）是全球死亡的主要原因，2020年直接归因于缺血性心脏病的900万死亡。自过去几十年以来，通过鉴定和治疗主要心血管危险因素（包括高血压，糖尿病，血脂异常，吸烟和久坐的生活方式），为初级和二级预防策略所付出了巨大的努力。曾经被标记为“被遗忘的器官”，最近重新发现了肠道菌群，并被发现在ASCVD发病率中起着关键功能，这既可以通过为动脉粥样硬化的发展而直接促进动脉粥样硬化的发展，并通过在基本心血管危险因素的发生中发挥作用而间接发挥作用。必需的肠道代谢产物，例如三甲胺N氧化物（TMAO），继发性胆汁酸，脂多糖（LPS）和短链脂肪酸（SCFA）与缺血性心脏病的程度有关。本文回顾了有关肠道微生物组在ASCVD发病率中的影响的最新数据。
通过 CRISPR/Cas 介导的同源重组在模型硅藻 Thalassiosira pseudonana 中进行有效的基因替换
CRISPR/Cas 能够对包括模型硅藻 Thalassiosira pseudonana 在内的许多不同植物和藻类进行靶向基因组编辑。然而，迄今为止，仅报道了通过同源重组 (HR) 实现的有效基因靶向适用于单倍体生命周期阶段的光合生物。在这里，使用 Golden Gate 克隆组装的 CRISPR/Cas 构建体能够在二倍体光合生物中实现高效的 HR。使用序列特异性 CRISPR/Cas 并与 dsDNA 供体基质配对，在 T. pseudonana 中诱导同源重组，从而用抗性盒 (FCP: NAT) 替换 silacidin、硝酸还原酶和脲酶基因。通过嵌套 PCR 筛选出高达约 85% 的 NAT 抗性 T. pseudonana 菌落对 HR 呈阳性。使用反向 PCR 方法确认了 FCP: NAT 在每个位点的精确整合。硝酸还原酶和尿素酶基因的敲除分别影响了硝酸盐和尿素的生长，而 T. pseudonana 中 silacidin 基因的敲除导致细胞尺寸显著增加，证实了该基因在中心硅藻中调节细胞尺寸的作用。HR 的高效基因靶向使 T. pseudonana 像 Nannochloropsis 和 Physcomitrella 一样易于遗传处理，从而迅速推进了功能性硅藻生物学、生物纳米技术和生物技术应用，这些应用旨在利用硅藻的代谢潜力。
泛基因组学和作物基因组在气候变化中的适应性
摘要：在农作物驯化和育种过程中，野生植物物种被塑造成现代高产作物，并适应主要的农业生态区域。然而，气候变化将影响这些地区的农作物生产力，农业需要适应以支持未来的粮食生产。在全球范围内，农作物野生亲属生长的环境比农作物物种更加多样化，因此可能携带支持农作物适应新环境和多变环境的基因。通过识别具有更高气候适应力的个体，我们可以更好地了解这种适应力的基因组基础，并将其转移到农作物上。泛基因组分析有助于识别农作物野生亲属中具有未开发基因组多样性的个体中潜在的应激反应基因。从这些泛基因组分析中获得的信息可以应用于培育现有作物的气候适应性或重新驯化作物，将环境适应性与作物生产力相结合。
微生物组在人类发展中的作用
摘要肠道菌群现在被认为是促进宿主健康调节的关键要素之一。实际上，我们所有的身体部位都被微生物殖民，暗示与我们的器官的串扰。由于分子工具和技术的发展（IE，宏基因组，代谢组，脂肪组，元复杂），宿主与不同微生物之间发生的复杂相互作用正在逐渐被解密。如今，肠道菌群偏差与许多疾病有关，包括肥胖，2型糖尿病，肝脂肪变性，肠道肠道疾病（IBD）和几种类型的癌症。 因此，提示与免疫，能量，脂质和葡萄糖代谢有关的各种途径受到影响。 在这篇综述中，给出了特定的注意，以对该领域的当前理解进行批判性评估。 许多分子机制解释了如何将肠道细菌与保护或疾病发作有因果关系。 我们检查了完善的代谢物（即，短链脂肪酸，胆汁酸，三甲基N-氧化物），并将其扩展到最近确定的分子参与者（即，IE，内源性大麻素，内源性脂质，生物活性脂质，生物活性脂质，酚类化合物和他们的高级聚糖端产物和肠性受体）） Alpha（PPARα）和Gamma（PPARγ），芳烃受体（AHR）和G蛋白偶联受体（IE，GPR41，GPR43，GPR43，GPR119，Takeda G蛋白偶联受体5）。如今，肠道菌群偏差与许多疾病有关，包括肥胖，2型糖尿病，肝脂肪变性，肠道肠道疾病（IBD）和几种类型的癌症。因此，提示与免疫，能量，脂质和葡萄糖代谢有关的各种途径受到影响。在这篇综述中，给出了特定的注意，以对该领域的当前理解进行批判性评估。许多分子机制解释了如何将肠道细菌与保护或疾病发作有因果关系。我们检查了完善的代谢物（即，短链脂肪酸，胆汁酸，三甲基N-氧化物），并将其扩展到最近确定的分子参与者（即，IE，内源性大麻素，内源性脂质，生物活性脂质，生物活性脂质，酚类化合物和他们的高级聚糖端产物和肠性受体）） Alpha（PPARα）和Gamma（PPARγ），芳烃受体（AHR）和G蛋白偶联受体（IE，GPR41，GPR43，GPR43，GPR119，Takeda G蛋白偶联受体5）。完全了解将肠道微生物与健康联系起来的复杂性和分子方面将有助于为已经开发的新型疗法树立基础。
CRISPR-CAS12A基因组在整个植物水平上使用两个兼容的RNA病毒载体
摘要使用可以在宿主植物中复制并系统地移动的病毒载体以传递细菌CRISPR组件，从而可以在整个植物水平上进行基因组编辑，并避免对劳动力密集型稳定转化的要求。但是，这种方法通常依赖于先前转化的植物，这些植物稳定地表达了CRISPR-CAS核酸酶。在这里，我们描述了使用烟草eTCH病毒（TEV； PotyVirus属）和马铃薯病毒X（PVX; PVX;属Potexvirus）得出的两个兼容的RNA病毒载体的成功无DNA的基因组编辑，这些病毒是在同一细胞中复制的。TEV和PVX载体分别表达CAS12A核酸酶和相应的指导RNA。这种新型的两场媒介系统改善了植物中无病毒诱导的基因组编辑的工具箱，并将促进繁殖更多营养，耐药性和生产性作物的努力。