收到2022年12月4日; 2023年8月3日接受;出版于2023年8月17日作者隶属关系:1分子环境微生物学实验室,韩国首尔韩国环境科学与生态工程系,韩国共和国。*信件:Woojun Park,WPARK@韩国。AC。KR关键词:抗生素耐药性;生物膜; DNA甲基化;外排泵;表观遗传学;甲基转移酶。缩写:AR,抗生素耐药性; Azi,阿奇霉素; CCCP,羰基氰化物3-氯苯基氢气; Col,Colistin; Ery,红霉素; Etbr,溴化乙锭; Gen,庆大霉素; IPD,脉间持续时间; Kan,Kanamycin; 6mA,n -6-甲基丹宁; 4MC,n -4-甲基环肽; 5MC,5-甲基胞嘧啶; MEM,MeropeNem; MIC,最小抑制浓度; MTase,甲基转移酶;小睡,核苷相关蛋白;也不,诺福路吗? OMV,外膜外囊泡; PMB,多粘蛋白B; rif,利福平; RM,限制修改; SEM,扫描电子显微镜; SMRT-SEQ,单分子实时测序; TF,转录因子; TMP,甲氧苄啶。†这些作者对此工作数据声明也同样贡献:本文或通过补充数据文件中提供了所有支持数据,代码和协议。本文的在线版本可以使用三个补充数据和六个补充表。001093©2023作者
抽象的质谱法(MS)的最新进展使定量蛋白质组学成为药物发现领域的强大工具,尤其是当应用于蛋白质组广泛的目标参与研究时。类似于温度梯度,增加有机溶剂浓度会刺激细胞蛋白质组的展开和沉淀。该特性可能受到与配体和其他分子的物理关联的影响,使单个蛋白质或多或少容易受到溶剂诱导的变性的影响。在此,我们通过将溶剂诱导的降水原理(Zhang等,2020)与现代定量蛋白质组学相结合,报告了全蛋白质组溶剂转移测定的开发。使用这种方法,我们开发了溶剂蛋白质组分析(SPP),该蛋白蛋白谱分析能够通过SPP变性曲线的分析来建立目标参与。我们很容易地确定了具有已知作用机理的化合物的特定靶标。作为进一步的效率提升,我们应用了曲线分析下的面积概念来开发溶剂组蛋白质组的积分溶解度改变(溶剂-PISA),并证明该方法可以作为SPP的可靠替代物。我们提出,通过将SPP与替代方法(例如热蛋白质组分析)结合在一起,可以增加通过任何一种方法来实现的高质量熔融曲线的绝对数量,从而增加可以筛选的蛋白质组的比例,从而增加以获得配体结合的证据。