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World File Search System组蛋白
阿尔茨海默氏病的组蛋白全乙酰基组的关联研究1
控制i）Eno2的模型：r = 0.99，p <1.00e -50; ii）olig2：r = 0.99，p <1.00e -50; iii）157
三甲基 - 内酮H3-k27兔子PAB
组蛋白是基本的核蛋白，负责真核生物中染色体纤维的核小体结构。核小体由大约146 bp的DNA包裹在组蛋白八聚体周围，该组蛋白八聚体由四个核心组蛋白（H2A，H2B，H3和H4）组成。通过接头组蛋白H1与核小体之间的DNA的相互作用进一步压实染色质纤维，以形成高阶染色质结构。该基因是无固有的，并且编码是组蛋白H3家族成员的复制依赖性组蛋白。该基因的转录本缺乏Polya尾巴；取而代之的是，它们包含一个终止终止元素。 该基因与6p22-p21.3染色体基因簇中的其他H3基因分开。该基因的转录本缺乏Polya尾巴；取而代之的是，它们包含一个终止终止元素。该基因与6p22-p21.3染色体基因簇中的其他H3基因分开。
HDAC 和 HDAC 抑制剂在癌症发展和治疗中的作用
在过去的几十年中，人们已经清楚地认识到表观遗传异常可能是癌症的标志之一。例如，组蛋白的翻译后修饰可能通过调节基因转录、染色质重塑和核结构在癌症的发展和进展中发挥关键作用。组蛋白乙酰化是一种研究充分的翻译后组蛋白修饰，受组蛋白乙酰转移酶 (HAT) 和组蛋白去乙酰化酶 (HDAC) 的相反活性控制。通过去除乙酰基，HDAC 可逆转染色质乙酰化并改变致癌基因和肿瘤抑制基因的转录。此外，HDAC 可去乙酰化多种非组蛋白细胞底物，这些底物控制着包括癌症发生和进展在内的多种生物过程。本综述将讨论 HDAC 在癌症中的作用以及 HDAC 抑制剂 (HDACi) 作为癌症治疗的新兴药物的治疗潜力。
沿着表观遗传时间线漫步
表观遗传学是指所有在不改变基因序列的情况下调节基因表达的可逆、可遗传过程。研究表明，DNA和组蛋白可以发生甲基化和乙酰化等化学修饰（仅对组蛋白而言），这些修饰可以引导DNA缠绕在组蛋白周围[5]，并决定染色质的压缩。这些化学修饰通常被称为表观遗传“标记”。DNA和组蛋白之间的相互作用可以导致真染色质构象，在这种构象下基因可接近并因此被激活，或者导致异染色质构象，在这种构象下基因无法接近并因此受到抑制[6]。除了DNA和组蛋白修饰之外，其他机制也参与表观遗传调控，如核小体定位[7]和非编码RNA[8]。在这里，我们选择关注与衰老相关的研究最多的 DNA 和组蛋白修饰，尽管重要的是不要忘记所有表观遗传机制都是相互联系、相互影响的 [ 9 , 10 ]。例如，DNA 甲基化失调会诱导
真核生物中的 DNA 包装
长度为 30 nm，称为螺线管纤维。它以典型的螺线管纤维形式包裹几乎所有剩余的 DNA。 H1 组蛋白对染色体的邻近组蛋白具有亲和力。 H1 组蛋白在中心彼此靠近并形成卷曲的电话线
组蛋白赖氨酸去甲基化酶 KDM4B 的治疗靶向阻断去势抵抗性前列腺癌的生长
对照载体转染的 LNCaP-ctl 细胞（图 1C）。为了测试 KDM4B 在 PCa 进展中的临床相关性，我们对接受雄激素剥夺疗法的局部或转移性激素敏感性 PCa（AJCC III 期和 IV 期）患者的前列腺活检组织样本进行了 KDM4B 表达染色。在肿瘤样本中观察到显著的 KDM4B 染色，而在正常组织中发现的染色很少（图 1D）。KDM4B 表达较高的患者的存活率明显较短（图 1E）。我们在体内测试了 KDM4B 过表达的影响。在注射 LNCaP-4B 细胞的小鼠中观察到 30% 的肿瘤形成率，而注射对照 LNCaP-ctl 细胞的小鼠没有肿瘤（图 1F）。LNCaP-4B 细胞未能在阉割动物中形成肿瘤（未显示数据）。
microRNA和组蛋白修饰在增强大豆及其在分子繁殖中的应用中的作用
大豆是一种从野生大豆（Glycine soja sied。＆ZUCC）在东亚6,000至9，000年前，随着中国，韩国，日本和世界其他地区的人类食品和牲畜饲料的广泛生长。全球气候变化导致了大豆种植和育种方面的一系列挑战。随着高通量基因组测序技术的发展，有关大豆的基因组信息现在更容易获得，并且对分子繁殖很有用。然而，关于作物发育的表观遗传法规仍然在很大程度上尚未开发。在这篇综述中，我们总结了大豆对生物和非生物胁迫的适应性调节机制的最新覆盖，这在组蛋白修饰和microRNA（miRNA）方面尤其重要。最后，我们讨论了这种知识对组蛋白修饰和miRNA在大豆分子繁殖中的潜在应用，以在不断变化的环境中证明作物的性能。
组蛋白甲基转移酶SETDB2调节金属蛋白酶 - 基质金属蛋白酶活性在腹部主动脉aneu
目的：确定表观遗传酶功能的巨噬细胞特异性改变，这有助于腹部主动脉瘤的发展（AAAS）。背景：AAA是一种威胁生命的疾病，其特征在于由基质金属脂蛋白酶和金属蛋白酶（TIMPS）的基质金属 - 脂蛋白酶和组织抑制剂的不平衡驱动的病原血管重塑。识别调节巨噬细胞介导的细胞外基质降解的机制对于开发新型疗法至关重要。方法：通过单细胞RNA测序和在人类主动脉组织样品中检查了set结构域在AAA形成中的组蛋白赖氨酸甲基转移酶2（SETDB2）的作用，通过单细胞RNA测序以及在质量促进的Miete and Angins a Gons Dietant和agn-fim-fatin和高-Fat诱导的单细胞型RNA测序以及髓样特异性setDB2中的作用。结果：与对照组相比，在主动脉/巨噬细胞和鼠AAA模型中，识别setDB2的人AAA组织的单细胞RNA测序上调。从机械上讲，干扰素-β通过JANUS激酶/信号传感器和转录信号传导的激活剂调节setDB2的表达，这将TIMP1-3基因启动子上的组蛋白3赖氨酸9赖氨酸9进行抑制，从而抑制了未控制的基质基质蛋白蛋白酶活性。巨噬细胞特异性敲除SETDB2（setDB2 f/f lyz2 cre +）保护的小鼠免受AAA形成，并抑制了血管内肿块，巨噬细胞的巨噬细胞和弹性碎片。setDB2的遗传耗竭阻止了由于去除TIMP1-3基因启动子上的抑制性组蛋白3赖氨酸9三甲基化标记，导致TIMP表达增加，
组蛋白脱乙酰基酶抑制剂可减弱致命的大鼠肠粘膜损伤
几项研究表明，缺氧诱导因子1（HIF-1）在缺氧诱导的细胞屏障损伤中起关键作用（7,8）。HIF-1增加了红细胞生成素（EPO）的表达，保留内皮细胞中内皮一氧化氮合酶（ENOS）的含量，而细胞外信号调节激酶（ERK）激活ENOS激活ENOS以产生一氧化氮（NO）（NO）（NO）（9）。几项研究表明，eNOS产生的没有可以调节胃肠道粘膜血流并保护胃肠道免受损伤（10,11）。还报道了组蛋白脱乙酰基酶抑制剂（HDACIS）可以预防燃烧诱导的肠道屏障功能障碍（12）。2-甲基2戊酸（2m2p）和丙戊酸（VPA）都是HDACIS；它们的结构相似，但是2M2P的效果比VPA弱。先前的研究发现，乙酰组蛋白H3在K9（AC-H3K9）是反映组蛋白乙酰化水平的可靠指数（13）。Zonula occludens-1（ZO-1）是紧密连接（TJ）蛋白家族的代表性蛋白质，这是肠上皮屏障调节的主要因素。降低TJ蛋白表达和分布的变化在发生功能损害对肠上皮屏障的功能损害中起重要作用（14）。但是，很少有研究研究VPA诱导的NO是否参与增加肠粘膜血流（IMBF）并保护肠粘膜屏障。此外，据报道，HIF-1诱导的EPO可能会在
非小细胞肺癌中的组蛋白脱乙酰基酶抑制：炒作还是希望？
表观遗传调节，包括乙酰化，甲基化，磷酸化和泛素化，在基因表达的调节中起关键作用。组蛋白乙酰化 - 组蛋白乙酰转移酶（HATS）和组蛋白脱乙酰基酶（HDAC）的活性之间的平衡 - 是关键的表观遗传事件之一。我们对HDAC在癌症中的作用的理解正在发展。许多HDAC同工酶在多种恶性肿瘤中过表达。异常组蛋白乙酰化与肿瘤抑制基因失调有关，导致几种实体瘤和血液学恶性肿瘤的发展。临床前研究表明，HDAC-1基因表达与肺癌进展有关。组蛋白低乙酰化与肺腺癌中更具侵略性的表型有关。HDAC抑制剂（HDACI）具有多效细胞作用，并诱导凋亡基因/蛋白质的表达，导致细胞分化和/或细胞周期停滞，抑制血管生成，并抑制过渡到间质表型。 因此，用HDACI治疗在非小细胞肺癌（NSCLC）细胞系中显示出抗增殖活性。 尽管在临床前研究中有希望的结果，但HDACI在肺癌临床试验中仅显示出适度的单药活性。 HDAC激活被认为是引起化学疗法，分子靶向治疗和免疫检查点抑制的机制之一。 因此，将HDACI与这些试剂相结合以增强其效率或反向抵抗力的兴趣越来越大。HDAC抑制剂（HDACI）具有多效细胞作用，并诱导凋亡基因/蛋白质的表达，导致细胞分化和/或细胞周期停滞，抑制血管生成，并抑制过渡到间质表型。因此，用HDACI治疗在非小细胞肺癌（NSCLC）细胞系中显示出抗增殖活性。尽管在临床前研究中有希望的结果，但HDACI在肺癌临床试验中仅显示出适度的单药活性。HDAC激活被认为是引起化学疗法，分子靶向治疗和免疫检查点抑制的机制之一。因此，将HDACI与这些试剂相结合以增强其效率或反向抵抗力的兴趣越来越大。在本文中，我们回顾了在NSCLC中使用HDACI的可用临床前和临床证据。我们还审查了排除HDACI作为癌症疗法和未来方向的广泛临床实用性所面临的挑战。