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World File Search System结核
液体有机肥料和无机肥料对马铃薯（豆植物结核）的效果组合。 Granola G2
摘要 - 马铃薯（索拉纳姆结核L.）是印尼社会高度要求的至关重要的食物来源。2018年国家马铃薯作物的生产力约为1,284,773吨。提高马铃薯的可用性需要通过扩大耕种区域并采用改进的耕种技术来提高生产率。但是，过度使用无机肥料可能会对土壤生育能力和质量产生不利影响。因此，必须使用有机肥料来增强有机物含量，例如源自加工糖甘蔗残留物的液体有机肥料，从而增强土壤生育能力。因此，本研究旨在确定液体有机肥料的最佳剂量，以增强马铃薯植物的生长和产量。这项研究是从2022年6月至2022年10月在帕苏鲁安摄政区图图尔区的Nongkojajar村进行的。使用了各种工具，包括手持式拖拉机，铭牌，竹子钉，宝石，胶带量，150 L鼓，搅拌钻，5升和250毫升量杯，车辆和相机。格兰诺拉麦片品种的马铃薯种子，液体有机肥料，无机肥料（尿素，SP-36和KCL）以及土壤和水样构成了研究的材料。采用了实验研究方法，利用环境随机块设计（RBD）重复了七种治疗方法。参数所观察到的植物高度，叶子数量，叶子面积，干重，植物生长速率，土壤化学分析，养分吸收和收获分析。结果表明，与没有肥料的对照组相比，在100％剂量下的液体有机肥料的治疗以50％，100％，150％和200％ + 80％的无机肥料的剂量综合治疗在马铃薯植物中的生产率较高。此外，这些治疗方法与100％标准剂量的无机肥料相比表现出可比的马铃薯植物生产力。
发现可以加速培养诊断的抗菌肽，包括结核分枝杆菌的生长缓慢的分枝杆菌
摘要：抗菌肽（AMP）可以直接杀死革兰氏阳性细菌，革兰氏阴性菌，分枝杆菌，真菌，包膜病毒和寄生虫。在浓度下，一些放大器和常规抗生素可以刺激细菌反应，从而提高其弹性，也称为刺激性反应。这包括刺激生长，流动性和生物膜产量。在这里，我们描述了刺激某些分枝杆菌生长的AMP的发现。肽14显示对结核分枝杆菌（MTB）的生长刺激作用，M。Bovis，M。Aviumsubsp。副结核病（MAP），M。Marinum，M。Avium-Intracellulare，M。Celatum和M. Abscessus。在低细菌接种物中，这种作用更为明显。与未处理的对照相比，肽从滞后相诱导更快的过渡到对数相，并在进入固定相之前将细菌保持更长的时间。在某些情况下，观察到分裂率的提高。使用MAP和75个肽的集合的初始屏幕显示13个具有激气作用的肽。对于MTB，筛选了25种人工肽的集合，发现13种可将阳性时间（TTP）的时间降低至少5％，从而改善了生长。一个天然存在的肽，11个天然发生的肽的片段和5种设计的肽，全部取自数据库APD3，并鉴定出另外44个肽，这些肽也将TTP降低至少5％。目前，在这项研究中鉴定出的肽正在商业用途，以改善人类和动物分枝杆菌诊断的恢复和培养。lasioglossin ll-iii（Bee）和ranacyclin e（青蛙）是最活跃的天然肽，人cathelicidin ll37 ll37碎片GF-17和猪cater依氏蛋白酶cathelicidin Protegrin-1片段是自然出现的肽的最活跃的片段。肽14显示10 ng/ml和10 µg/ml之间的生长活性，而稳定性优化的肽14D的活性范围为0.1-1 µg/ml。
结核分枝杆菌复合物的估算的祖先参考基因组更好地捕获了基于参考的ALI
收到2023年8月31日； 2023年12月7日接受；于2024年1月4日出版了作者分支：1麦吉尔大学医学系，蒙特利尔，魁北克H4A 3J1，加拿大； 2个细菌共生体进化，加拿大魁北克H7V 1B7，Inrs-Centre-Centre Armand-FrappierSantéBiotechnologie； 3宾夕法尼亚州立大学宾夕法尼亚州立大学动物科学系16802-3500； 4 McGill International TB Center，McGill University，蒙特利尔，魁北克H4A 3S5，加拿大。*信件：路加·哈里森（Luke B.基于参考的对齐；参考基因组。缩写：AIC，Akaike的信息标准； ATCC，美国类型文化收藏；床，浏览器可扩展数据； GATK，基因组分析工具包； Hal，分层对齐； IGV，综合基因组观众； MRCA，最终的共同祖先； MTBC，结核分枝杆菌复合物； NCBI，国家生物技术信息中心； NGS，下一代测序； PGAP，原核基因组注释管道； PHAST，具有空间/时间模型的系统发育分析； Rd，差异区域； RVD，[H37] RV-DETEATION; SNP，单核苷酸多态性； SRA，序列阅读档案； TBD1，结核分枝杆菌 - 特异性缺失1。数据语句：文章或通过补充数据文件中提供了所有支持数据，代码和协议。本文的在线版本可以使用五个补充表和三个补充数据。001165©2024作者
靶向纳米孔测序技术检测支气管肺泡灌洗液标本中结核分枝杆菌的初步评估
结核病（TB）是由结核分枝杆菌（M.tb）引起的传染病，对人类健康构成重大威胁。根据世界卫生组织（WHO）2021年全球结核病年度报告，中国估计有结核病病例约78万，估计结核病发病率约为每10万人55例，在30个结核病高负担国家中，中国估计结核病发病率位居第三位，低于印度尼西亚和印度。中国结核病病原体阳性率仅为58%（World Health O，2022）。因此，快速、准确的临床诊断方法对提高结核病诊断水平、治疗结核病患者、防止结核病传播至关重要。目前，在结核分枝杆菌（M.tb）的通用检测临床诊断方法中，AFB涂片具有检测方法快捷、简便、费用低廉的优势，但病原体阳性率低，M.tb.结核分枝杆菌培养时间长，无法满足临床快速诊断的要求。基于结核分枝杆菌培养的表型药敏试验（DST）受到生物安全、培养时间长及使用抗结核药物后培养率下降的影响。结核分枝杆菌生长缓慢的特点使得该方法耗时长、且由于培养不良或微生物污染等原因导致结果不确定，不能满足临床快速诊断的要求。快速准确地检测结核分枝杆菌样本和快速诊断耐药结核病是有效控制耐药结核病流行的关键。结核分枝杆菌的耐药表型主要通过多个基因的染色体突变来确认（Gygli et al.，2017）。例如，编码RNA聚合酶b亚基的rpoB基因突变导致的利福平耐药是结核分枝杆菌中最常见的基因突变。Xpert MTB/RIF检测采用半嵌套PCR直接从痰中检测结核分枝杆菌和rpoB基因突变。Xpert MTB/RIF最初于2010年被WHO推荐用于结核病诊断，但对于细菌载量较低的样本，Xpert MTB/RIF的检测结果灵敏度较低。此外，该检测只能检测利福平耐药突变，而不能报告突变类型。随着近年来新一代测序（NGS）的快速发展，WHO推荐使用NGS检测结核分枝杆菌复合群（MTBC）的耐药相关突变，并有针对性地采用高通量测序
深度学习驱动的细菌细胞学分析以确定结核分枝杆菌的抗菌机制
结核病 (TB) 是由结核分枝杆菌引起的，仍然是全球健康的重大威胁，估计 2022 年将影响 1060 万人。耐多药和广泛耐药菌株的出现迫使人们开发新型有效药物。加快确定这些药物的作用机制 (MOA) 对于推进结核病治疗至关重要。本研究介绍了 MycoBCP，这是针对结核分枝杆菌量身定制的独特细菌细胞学分析 (BCP)，利用 BCP 中的卷积神经网络 (CNN) 来克服传统图像分析技术带来的挑战。使用 MycoBCP，我们分析了各种抗菌化合物对结核分枝杆菌的形态学影响，捕捉广泛的模式而不是依赖精确的细胞分割。这种方法避免了结核分枝杆菌中普遍存在的细胞聚集和染色不均匀等问题。在盲测中，MycoBCP 准确识别了 96% 化合物的作用机理，只有一次错误分类，即利福布汀，它被错误地归类为影响翻译而不是转录。转录和翻译抑制产生的相似形态表明需要进一步改进以更有效地区分它们。将 MycoBCP 应用于一系列抗结核药物，成功识别了已知的作用机理并揭示了独特的作用，证明了其在早期药物发现和开发中的实用性。我们的研究结果强调了基于 CNN 的 BCP 在提高作用机理测定的准确性和效率方面的潜力，特别是对于结核分枝杆菌等具有挑战性的病原体。MycoBCP 代表了结核病药物开发的重大进步，为高通量筛选抗菌化合物提供了一种强大且适应性强的方法。
结核分枝杆菌细胞色素 bc1:aa3 新型抑制剂的结构和机制研究
附加声明：已报告存在竞争利益。AKV、RQK、MHL、SW、NV、AB 没有竞争利益。DL、CAP、JMB、RJC 和 JW 是 Janssen（强生公司）的全职员工和/或强生公司的潜在股东。JG、CV 和 DAL 已被列为 JNJ-2901 专利申请的发明人。
结核分枝杆菌复杂药物易感性测试的问题：吡喃辛酰胺
吡嗪酰胺是一种促毒物，需要MTBC转换为其活跃的金吡嗪酸（POA）。吡嗪酰胺通过被动扩散进入分枝杆菌细胞，随后通过蛋白质PNCA在细胞质中转化，蛋白质PNCA是一种非必需的细胞内烟碱烟碱酶，其具有吡嗪酰胺酶（PZase）活性，由PNCA基因编码。POA积聚在细胞质中，并被推定的外排泵积极排出。 在杆菌外，POA被质子化并重新进入质子释放的生物，导致酸性细胞质越来越多，POA的积累。 这破坏了膜的渗透性和运输，导致细胞损伤。 10–12虽然这种作用机理一直是普遍的理论，但其他人则提出，POA可能不负责细胞质的酸化，但可能仅在压力条件下（例如低氧）抑制对细菌必不可少的靶标。 最近，Gopal等人最近。 发现与天冬氨酸脱羧酶的POA在细菌细胞中pand结合，触发其降解并阻止必需辅酶A的生物合成A. 17 [参见正在进行的研究领域]POA积聚在细胞质中，并被推定的外排泵积极排出。在杆菌外，POA被质子化并重新进入质子释放的生物，导致酸性细胞质越来越多，POA的积累。这破坏了膜的渗透性和运输，导致细胞损伤。10–12虽然这种作用机理一直是普遍的理论，但其他人则提出，POA可能不负责细胞质的酸化，但可能仅在压力条件下（例如低氧）抑制对细菌必不可少的靶标。最近，Gopal等人最近。 发现与天冬氨酸脱羧酶的POA在细菌细胞中pand结合，触发其降解并阻止必需辅酶A的生物合成A. 17 [参见正在进行的研究领域]最近，Gopal等人最近。发现与天冬氨酸脱羧酶的POA在细菌细胞中pand结合，触发其降解并阻止必需辅酶A的生物合成A.17 [参见正在进行的研究领域]
使用增强型细胞破碎协议改进结核分枝杆菌的 MALDI-TOF MS 鉴定
摘要：结核分枝杆菌是导致结核病的微生物，这种疾病影响着全世界数百万人。基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 (MALDI-TOF MS) 是一种快速、可靠且经济高效的微生物鉴定方法，已用于鉴定分枝杆菌分离株。然而，分枝杆菌细胞壁富含脂质，这使得获取蛋白质进行 MALDI-TOF MS 分析变得困难。在本研究中，比较了两种细胞制备方案：MALDI-TOF 仪器制造商 Bruker Daltonics 推荐的 MycoEx 和本文描述的 MycoLyser 方案，后者使用 MagNA Lyser 仪器通过乙醇增强细胞破碎。使用两种方案对结核分枝杆菌 H37Rv 菌株进行细胞破碎和蛋白质提取步骤，并比较 MALDI-TOF MS 结果。MycoLyser 方案可以提高结核分枝杆菌的 Biotyper 鉴定率，因为使用此方案获得的 log(score) 值大多≥1.800，并且明显高于经过 MycoEx 处理的 log(score) 值。考虑到布鲁克标准，鉴定可靠性也提高了。鉴于这些结果，可以得出结论，MycoLyser 分枝杆菌细胞破碎和蛋白质提取方案提高了 MALDI-TOF MS 方法鉴定结核分枝杆菌的效率。
使用RNA生物标志物在结核分枝杆菌中加快药物易感性测试
科学和C服务细菌疾病 - 人类的传染病，科学疾病，朱丽叶·维特斯曼斯特拉特（Juliette wytsmanttrat），布鲁塞尔（Brussels），1050年，比利时B国家转诊和结核病的国家转诊，科学人，朱丽叶（Socientan），朱丽叶（Socient）里尔，CNRS，Inserm，Institute Pasteur de Lille，U1019 -UMR 9017-中心 - 里尔，里尔，59000，59000，法国D大学感染和免疫中心。里尔，CNRS，Inserm，Chu Lille，Institut Pasteur de Lille，US 41- UMS 2014 -PLBS，Lille，59000，法国E，MIT和哈佛大学，Main Street，Main Street 415，Cambridge，Cambridge，MA，MA，MA，02142，美国，美国，美国，MASSACHUSETS 4121142142 for Interventional Studies, Scienti fi c Direction Infectious Diseases in Humans, Sciensano, Rue Juliette Wytsmanstraat 14, Brussels, 1050, Belgium h Department of Molecular Biology, Massachusetts General Hospital, 55 Fruit Street, Boston, MA, 02114, USA i Laboratory of Microbiology, Parasitology and Hygiene, Faculty of Pharmaceutical, Biomedical and Veterinary Sciences, University of Antwerp, Universiteitsbaan 212, Antwerp, 2610, Belgium j Institut Pasteur, Université Paris Cité, CNRS UMR 6047, Unit for Integrated Mycobacterial Pathogenomics, Paris, 75015, France k Division of Molecular Biology and Human Genetics, SAMRC Centre for Tuberculosis Research, DST/NRF生物医学结核病卓越中心研究，医学和健康科学学院，斯特伦博斯大学，泰格伯格，泰格伯格，7505，南非，l Sciensano，Sciensano，Sciensano，Juliette wytsmanttsmantsmanttraat 14，Brusstrait，Brussirenty，Belgium Mycobciiguim Mycobci，Mycobcii，Mycobcii，热带医学研究所，国家埃斯特拉特（Nationalestraat）155，安特卫普（Antwerp），2000年，比利时n分枝杆菌培养物收集比利时比利时比利时协调的微生物藏品，《国家埃斯特拉特155》，安特卫普，2000年，比利时，比利时