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支持深部脑刺激编程的机器学习方法
摘要：由于存在大量不同的配置，因此调整刺激参数是深部脑刺激 (DBS) 治疗中的一项挑战。因此，基于特定刺激设置产生的组织激活体积 (VTA) 可视化的系统已经开发出来。然而，医疗专家仍然必须通过反复试验来寻找产生所需 VTA 的 DBS 设置。因此，我们的目标是为当前的临床设备开发一种 DBS 参数调整策略，以便在生物物理上可行的约束下定义目标 VTA。我们提出了一种机器学习方法，可以估计给定 VTA 的 DBS 参数值，该方法包括两个主要阶段：i) 基于 K 近邻的变形，以定义保留生物物理上可行约束的目标 VTA。ii) 参数估计阶段，包括使用度量学习突出显示相关 VTA 属性的数据投影，以及用于估计生成目标 VTA 的 DBS 参数的回归/分类算法。我们的方法允许设置符合生物物理的目标 VTA，并准确预测所需的刺激参数配置。此外，我们的方法的性能对于各向同性和各向异性的组织电导率都是稳定的。此外，经过训练的系统的计算时间对于现实世界的实现是可以接受的。
编程的细胞死亡配体2：癌症的新见解
免疫疗法已彻底改变了癌症治疗，抗PD-1/PD-L1轴治疗表现出各种肿瘤类型的显着临床效率。但是，应该注意的是，这种疗法对于所有PD-L1阳性患者而言并不普遍有效，强调需要加快对PD-1的第二个配体（称为程序性细胞死亡受体配体2（PD-L2））进行加快研究。作为免疫检查点分子，PD-L2与患者的预后有关，并且在癌细胞免疫逃生中起关键作用。对PD-L2表达的调节过程的深入了解可能会使患者从抗PD-1免疫疗法中分层。我们的综述着重于探索不同肿瘤中的PD-L2表达，其与预后，调节因子的相关性以及PD-L2与肿瘤治疗之间的相互作用，这可能在开发免疫组合疗法方面可提供明显的途径，并改善抗PD-1治疗的临床效率。
Djnn/Smala：面向交互编程的概念框架和语言
开发和维护交互式软件的持续困难揭示了传统命令式编程语言的不足。近年来，已经提出了几种解决方案，以专用于交互的结构来丰富现有语言。在本文中，我们提出了一种不同的方法，以交互为主要关注点来构建一种新的编程语言。我们提出了基于过程和过程激活概念的概念框架 Djnn，然后介绍了从该框架派生的编程语言 Smala。我们提出了一种解决方案，用于统一事件和数据流的概念，并从一小组基本结构中派生出复杂的控制结构。我们详细介绍了 Smala 的语法和语义。最后，我们通过一个真实大小的应用程序说明它如何构建交互式软件的所有部分。Djnn 和 Smala 可以为设计人员和程序员提供可用的方法来思考交互并将其转化为运行代码。
使用自适应动态编程的移动机器人的动态路径计划
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基于刮擦块的编程的当前研究趋势：系统评价
在K-12教育的不断发展的景观中，通过基于块的环境（例如Scratch）引入编程技能已经变得越来越普遍。这种方法满足了学生对计算机识字的日益增长的需求，但是它在改善学习成果方面的有效性仍然存在争议。本文的目的是系统地审查和总结有关将SCRATCH用作K-12教育的教学和学习工具的当前研究。使用Prisma（用于系统评价和荟萃分析的首选报告项目）方法，本文分析了27篇相关文章，以评估在教育环境中刮擦的影响和使用。该评论旨在确定与刮擦相关的教育研究中当前的趋势，方法和焦点。我们的结果表明，17项研究重点是在教授CS和ICT主题中使用刮擦，而10项研究了其在其他学术学科中的应用。评论在教育环境下通常显示出刮擦编程的积极结果。但是，它也强调了对更全面的实证研究的需求。这包括在更长的时间内使用更大，更多样化的学生样本进行研究，以更深入地了解刮擦编程如何有效地改善K-12教育中的学习成果。
Empire：基于用于能量过渡分析的多屈服编程的开源模型
能源和电力系统模型代表了对能源技术的技术运营的重要见解，这些技术运行能够以小时分辨率为时间步骤提供能源消耗。本文介绍了欧洲电力系统投资模式与可再生能源（Empire），该模型将短期运营与包括基础设施扩展在内的长期计划决策的代表结合在一起。帝国模型具有基于多匹马随机编程的独特数学建模结构，这意味着投资决策会受到以不同的操作场景实现来代表的短期不确定性。该模型是开源的，可以用来分析到2050年及以后的能量过渡方案。本文概述了模型及其软件结构的构建块。我们还提供了使用该软件的结果的说明性示例。©2021作者。由Elsevier B.V.这是CC下的开放访问文章（http://creativecommons.org/licenses/4.0/）。
基于可重编程的配体结合特异性的基于PYR1的矫形CID模块
植物使用化学诱导的二聚化（CID）模块（包括受体pyr1和HAB1）感知脱落酸（ABA），这是由配体激活的pyr1抑制的磷酸酶。此系统是唯一的，因为可以重新编程配体识别的相对容易。为了扩展Pyr1系统，我们设计了一个正交的“*”模块，该模块携带了二聚体界面盐桥； X射线晶体学，生化和体内分析证实了其正交性。我们使用此模块创建了Pyr1* mandi /hab1*和pyr1* azin /hab1*，它们对其激活的配体曼陀果实和偶氮甲基具有纳摩尔敏感性。在拟南芥和酿酒酵母中进行的实验证明了使用活物生物传感器和构建多输入/输出遗传电路的抗抑郁剂污染物的敏感检测。我们的新模块启用了用于植物和真核合成生物学的可编码的多渠道CID系统，可以增强新的基于植物和微生物的感应方式。
揭示帕金森病中神经自适应深部脑刺激编程的复杂性
在过去的三十年中，帕金森病 (PD) 的深部脑刺激 (DBS) 一直以连续开环方式应用，对特定患者一天内的状态或症状变化没有反应。最近神经刺激器技术的进步使得闭环自适应 DBS (aDBS) 成为 PD 的治疗选择，在不久的将来，刺激将以基于需求的方式进行调整。虽然 aDBS 在治疗运动症状方面具有巨大的临床潜力，但它也带来了更好地了解如何实施它以最大限度地发挥其益处的需求。从这个角度来看，我们根据对几种支持 aDBS 的研究神经刺激器的经验，概述了为 aDBS 编程几个关键参数的注意事项。从本质上讲，aDBS 取决于成功识别相关生物标志物，这些标志物可以实时可靠地测量，并与控制刺激适应的控制策略相结合。然而，诸如刺激允许适应的窗口以及刺激改变的速率等辅助参数对性能的影响同样巨大，并且会根据控制策略和患者而变化。标准化的 aDBS 编程协议对于确保其在临床实践中的有效应用至关重要。
可重编程的4D组织工程水凝胶支架通过可逆离子
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人，该版本发布于2025年2月15日。 https://doi.org/10.1101/2025.02.11.637741 doi：Biorxiv Preprint
使用无需编程的人工智能辅助图像分类对男性不育进行评分
“自 50 年前首次报道以来，Johnsen 评分已广泛应用于泌尿科。然而，睾丸的组织病理学评估并非易事，需要花费大量时间，因为睾丸组织非常复杂，精子发生过程中涉及多个高度专业化的步骤。我们的目标是利用人工智能技术简化这一耗时的诊断步骤。为此，我们选择了 Google 的自动机器学习 (AutoML) Vision，它不需要编程，可以为单个患者数据集创建人工智能模型。借助 AutoML Vision，没有编程技能的临床医生可以使用深度学习构建自己的模型，而无需数据科学家的帮助，”东邦大学医学院泌尿外科副教授 Hideyuki Kobayashi 博士说道（图 1）。