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World File Search System胞嘧啶
核酸研究（3,4）。
摘要 正常组织 DNA 的总体 5-甲基胞嘧啶 (m5C) 含量在组织特异性方面存在很大差异。通过高效液相色谱法，我们检查了 103 种人类肿瘤（包括良性、原发性恶性和继发性恶性肿瘤）的 DNA 酶消化物的 m5C 含量。这些肿瘤样本的多样性和数量使我们能够比较肿瘤组织和人类正常组织的 DNA 甲基化水平范围。大多数转移性肿瘤的基因组 m'C 含量明显低于大多数良性肿瘤或正常组织。具有高甲基化 DNA 的原发性恶性肿瘤的百分比介于转移性和良性肿瘤之间。这些发现可能反映了 DNA 的广泛去甲基化参与了肿瘤进展。这种去甲基化可能是与癌症相关的不断产生的细胞多样性的来源。
聚谷氨酰胺脊髓小脑共济失调的基因治疗
摘要：多聚谷氨酰胺脊髓小脑共济失调 (SCA) 是由单个基因编码区胞嘧啶-腺嘌呤-鸟嘌呤重复扩增引起的六种常染色体显性共济失调的异质性群体。目前，这些疾病尚无治愈或减缓疾病的治疗方法，但它们的单基因遗传为基因治疗策略的发展提供了理论依据。事实上，RNA 干扰策略已在 SCA1、SCA3、SCA6 和 SCA7 的细胞和/或动物模型中显示出有希望的发现。此外，反义寡核苷酸疗法已在 SCA1、SCA2、SCA3 和 SCA7 模型中提供了令人鼓舞的概念证明，但它们尚未进入临床试验。相反，基因编辑策略，例如成簇的规律间隔的短回文重复序列 (CRISPR/Cas9)，已被引入
碱基-4 的序列定向动态共价组装
DNA 中的信息被编码在以侧链形式固定在脱氧核糖磷酸聚合物骨架上的碱基序列中。腺嘌呤-胸腺嘧啶和鸟嘌呤-胞嘧啶成对碱基残基之间的双氢键和三氢键使互补 DNA 序列能够选择性地自组装，从而产生以四碱基编码的分子梯状结构。1 由于这种序列选择性自组装，DNA 已成为一种多功能的纳米结构介质，在热熔化和退火后，设计的 DNA 链混合物可以杂交以提供复杂的多维结构。2–4 然而，尽管基于 DNA 的纳米技术取得了成功，但对链间氢键和糖磷酸骨架的依赖可能会损害所得结构的机械、热和化学稳定性。5,6
DNA I-motif在中性pH下的形成是由动力学分配驱动的
富含胞嘧啶的DNA区域可以基于半蛋白酶的C.C +对形成四链结构，称为I-Motifs（IMS）。使用CD，UV吸收，NMR光谱和DSC量热法，我们表明模型（C n t 3）3 C N（CN）序列在neu-Tral或略微碱性条件下采用IM。然而，在这些条件下以持久的动力学形成IMS，并用显着的hy虫融化。在两个或多个分隔的步骤中使用N> 6融化的序列，表明存在不同的IM物种，其比例取决于温度和孵育时间。在环境温度下，形成了低稳定性的动力学偏爱的IM，最有可能由较短的C.C +块组成。这些物种充当动力学陷阱，并防止热力学偏爱，完全C.C +
SY-1425的抗肿瘤协同作用，选择性RARA激动剂，...
AML和MD的部分原因是转录因子（即Runx1，NPM1）中的遗传替代，以及表观遗传修饰的基因（即MLL，DNMT3A），导致肿瘤抑制基因失活，从而使不成熟细胞的扩散产生。3在DNA甲基转移酶（DNMT）中的改变特异性导致DNA高甲基化，这有助于通过启动子失活通过启动子灭活基因沉默，并且可以由HMA靶向，HMA可以模仿天然核苷残基并在DNA中取消核苷。一旦合并，HMAS被DNMT1作为胞嘧啶处理，但是这种相互作用会产生一种不可逆的DNA-DNMT1加合物，需要DNA损伤修复才能解决。这会导致DNMT1的损失，因为DNA蛋白加合物被DNA损伤响应途径降解。9损失
利用 CRISPR/nCas9 对花生进行碱基编辑
花生 ( Arachis hypogaea L.) 是豆科植物的异源四倍体，能够在热带和亚热带地区生长茂盛，被认为是一种很有前途的全球油籽作物。提高油酸含量已成为花生育种的主要目标之一，因为它具有降低血液胆固醇水平等健康益处、抗氧化特性以及延长保质期等工业效益。花生基因组测序已证明存在编码脂肪酸去饱和酶 2 ( FAD2 ) 的同源基因 AhFAD2A 和 AhFAD2B，它们负责催化单不饱和油酸转化为多不饱和亚油酸。研究表明，导致 FAD2 基因移码或终止密码子的突变会导致油中油酸含量升高。在本研究中，使用与不同脱氨酶融合的 Cas9 构建了两个表达载体 pDW3873 和 pDW3876，并测试了它们作为诱导花生 AhFAD2 基因启动子和编码序列点突变的工具。两种构建体都含有单核酸酶无效变体 nCas9 D10A，PmCDA1 胞嘧啶脱氨酶与该变体融合到 C 端（pDW3873），而 rAPOBEC1 脱氨酶和尿嘧啶糖基化酶抑制剂 (UGI) 分别融合到 N 端和 C 端（pDW3876）。将三个 gRNA 独立克隆到两个构建体中，并在 AhFAD2 基因的三个靶位点测试其功能和效率。两种构建体都显示出碱基编辑活性，其中在靶向编辑窗口中胞嘧啶被胸腺嘧啶或其他碱基取代。 pDW3873 的效率高于 pDW3876，表明前者是花生中更好的碱基编辑器。这是一个重要的进步，因为将现有突变基因渗入优良品种可能需要长达 15 年的时间，这使得该工具对花生育种者、农民、行业以及最终对消费者都大有裨益。
推出 CRISPR/Cas9 胞嘧啶碱基编辑器工具箱“LeishBASEedit”——无需 DNA 双链断裂、同源重组或供体 DNA 即可对利什曼原虫进行基因编辑和高通量筛选
。CC-BY-NC 4.0 国际许可证永久有效。它是在预印本（未经同行评审认证）下提供的，作者/资助者已授予 bioRxiv 许可，可以在该版本中显示预印本。此版本的版权持有者于 2022 年 12 月 8 日发布。；https://doi.org/10.1101/2022.12.08.519658 doi：bioRxiv 预印本
巨噬细胞靶向纳米粒子介导结核病的协同光动力治疗和免疫治疗
因此，迫切需要更好的替代治疗方法。CpG 寡脱氧核苷酸 (CpG ODN) 是合成的单链脱氧核糖核酸 (DNA) 分子，含有未甲基化的胞嘧啶-磷酸-鸟嘌呤 (CpG) 基序，以六聚体序列为核心。7 CpG ODN 可单独用作免疫佐剂或免疫治疗剂。8,9 CpG ODN 很容易被哺乳动物免疫系统识别，并通过刺激巨噬细胞等细胞内溶酶体中的 Toll 样受体 (TLR) 促进 T 辅助细胞 1 型 (Th1) 细胞因子的产生，如 IL-12，进而诱导强烈的 Th1 免疫反应。9,10 这种免疫刺激活性使得 CpG ODN 在免疫疗法中的应用非常有吸引力。有报道称CpG ODNs作为免疫佐剂可以增强