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运动发酵单胞菌代谢工程用于厌氧异丁醇生产
摘要背景：通过生物化学转化从可再生生物质中获得的生物燃料和增值生物化学品已引起广泛关注，以满足全球可持续能源和环境目标。异丁醇是一种四碳醇，具有许多优点，使其成为有吸引力的化石燃料替代品。运动发酵单胞菌是一种高效的厌氧产乙醇细菌，使其成为生物精炼厂的有前途的工业平台。结果：在本研究中，研究了异丁醇对运动发酵单胞菌的影响，并构建了各种生产异丁醇的重组菌株。结果表明，运动发酵单胞菌亲本菌株能够在低于 12 g/L 的异丁醇存在下生长，而浓度高于 16 g/L 会抑制细胞生长。运动发酵单胞菌中异丁醇生产需要整合编码 2-酮异戊酸脱羧酶的异源基因，例如来自乳酸乳球菌的 kdcA。此外，在由四环素诱导启动子 Ptet 驱动的含有 kdcA 基因的重组菌株中，异丁醇产量从接近零提高到 100–150 mg/L。另外，我们确定在表达 kdcA 的重组 Z. mobilis 菌株中过表达异源 als 基因和两个参与缬氨酸代谢的天然基因（ ilvC 和 ilvD ）可将丙酮酸从乙醇生产转移到异丁醇生物合成。这一工程将异丁醇产量提高到 1 g/L 以上。最后，确定了含有由 Ptet 驱动的合成操纵子 als - ilvC - ilvD 和由组成型强启动子 Pgap 驱动的 kdcA 基因的重组菌株大大提高了异丁醇产量，最高滴度约为 4.0 g/L。最后，异丁醇生产受到通气的负面影响，通气较差的烧瓶中会产生更多的异丁醇。结论：这项研究表明，kdcA 与合成异源操纵子 als - ilvC - ilvD 的过度表达对于将丙酮酸从乙醇生产中转移出来以增强异丁醇的生物合成至关重要。此外，这项研究还提供了一种利用缬氨酸代谢途径在 Z. mobilis 中生产其他丙酮酸衍生生物化学物质的策略。关键词：Zymomonas mobilis、生物燃料、异丁醇、代谢工程、丙酮酸衍生生物化学物质、2-酮异戊酸脱羧酶 (Kdc)
新型假单胞菌产物在体外刺激气道上皮细胞中的白介素-8
由于在囊性纤维化患者的痰中发现了高浓度的IL-8，因此我们假设铜绿假单胞菌（PA）诱导呼吸道上层细胞和单核细胞中IL-8的产生。因此，我们与人类转化的支气管上皮细胞（16-HBE）或单核细胞一起孵育了PA培养物的植物。已与PA超代孵育6小时的16-HBE细胞的培养物具有趋化活性，该抗体受到对人IL-8的抗体的抑制。PA上清液诱导原代支气管上皮细胞，16-HBE细胞和单核细胞产生IL-8。与PA上清液孵育后，16-HBE细胞显示IL-8基因表达水平显着升高。负责IL-8生产的PA产品抵抗冻结，沸腾和蛋白水解。该产品不可提取脂质，并且存在于1 kD滤液中。我们得出的结论是，PA的小分子质量产物刺激了16-HBE细胞和单核细胞的IL-8产生，并且在Expo-DA后16-HBE产生的趋化活性主要归因于IL-8。（J.Clin。投资。1994。93：26-32。）关键词：上皮 - 细胞因子表达 - 囊性纤维化 *内毒素 *趋化性
在铜绿假单胞菌菌群中抗菌抗性的降低，铜绿菌菌血症之后的抗菌血症是199大流行病的：一项纵向观察性研究
在研究期间，观察到333例患者的总共493例PA菌血症实例。MDRPA的比例从21％（62/291）前流行降至9％（19/202）后p，调整后或0.38，95％CI 0.18-0.79，p = 0.01）。在最初的非MDRPA菌血症初期住院期间，MDRPA的发生很少见，不太可能比两周后发生。抗菌消耗模式在大流行开始后发生了变化，随着amikacin和ciprofloxacin的使用降低，头孢酸和美皮烯类的使用增加。MDRPA菌血症患者的总体不尸体死亡率仍然很高（28％），大流行前后没有实质性差异（调整后危险比1.57，95％CI 0.43-5.67，p = 0.49）。
通过对番茄和玉米分泌物的转录组反应揭示植物定植菌东湖假单胞菌 P482 的宿主适应性特征
假单胞菌具有代谢灵活性，可以在不同的植物宿主上茁壮成长。然而，宿主滥交所需的代谢适应性尚不清楚。在这里，我们通过采用 RNAseq 并比较东湖假单胞菌 P482 对两种植物宿主（番茄和玉米）根系分泌物的转录组反应来弥补这一知识空白。我们的主要目标是找出这两种反应之间的差异和共同点。仅由番茄分泌物上调的途径包括一氧化氮解毒、铁硫簇的修复、通过对氰化物不敏感的细胞色素 bd 进行呼吸以及氨基酸和/或脂肪酸的分解代谢。前两个表明测试植物的分泌物中存在 NO 供体。玉米特异性地诱导了 MexE RND 型外排泵的活性和铜耐受性。与运动相关的基因由玉米诱导，但被番茄抑制。对渗出液的共同反应似乎受到来自植物的化合物和来自其生长环境的化合物的影响：砷抗性和细菌铁蛋白合成上调，而硫同化、柠檬酸铁和/或其他铁载体的感知、血红素获取和极性氨基酸的运输下调。我们的研究结果为探索植物相关微生物的宿主适应机制提供了方向。
基因组学如何彻底改变分类学，
基因组中包含的信息对于我们植物病理学家来说是一座金矿，使我们能够改进诊断方法并寻找与流行病学和植物-微生物相互作用有关的特征，以及它们背后的进化过程。2022 年是《自然》杂志上发表的前两个黄单胞菌全基因组序列（da Silva 等人，2002 年）的 20 周年。十年后，我加入了黄单胞菌社区，致力于宿主适应性研究，这篇出版物是我阅读的第一篇黄单胞菌论文之一。这项工作的一个核心方面是比较两种黄单胞菌致病变种，即柑橘致病菌黄单胞菌和油菜致病菌黄单胞菌，它们分别对柑橘和十字花科植物具有致病性。这种方法使作者能够识别菌株特异性基因并提出可能解释不同宿主特异性和致病过程的机制，这是我们社区中的两个热点问题（Harris 等人，2020 年；Jacques 等人，2016 年）。这种比较基因组学分析在许多方面都具有开创性，下一个黄单胞菌基因组花了三年多的时间才发表。几年后，随着越来越快、越来越便宜的测序技术的出现，全基因组测序“民主化”了（Zhao & Grant，2011 年），很快导致每年发布几十个，然后是几百个黄单胞菌基因组序列（图 1）。
开发脊椎病变性治疗更新*
1。Grupp SA，Kalos M，Barrett D等。嵌合抗原回收的T细胞，用于急性淋巴白血病。n Engl J Med。2013; 368：1509 - 1518。2。Maude SL，Frey N，Shaw PA等。嵌合抗原受体T细胞，可持续减轻白血病。n Engl J Med。2014; 371：1507 - 1517。3。Wherry EJ。 t细胞耗尽。 nat免疫。 2011; 12：492 - 499。 4。 Wherry EJ，Ha SJ，Kaech SM等。 在慢性病毒感染期间CD8 ＋T细胞耗尽的分子特征。 侵害。 2007; 27：670 - 684。 5。 Zajac AJ，Blattman JN，Murali-Krishna K等。 由于活化的T细胞的持续存在而没有效应子功能，病毒免疫逃避。 J Exp Med。 1998; 188：2205 - 2213。 6。 Martinez GJ，Pereira RM，Aijo T等。 转录因子NFAT促进了激活的CD8 （＋）T细胞的耗尽。 免疫。 2015; 42：265 - 278。 7。 Blackburn SD，Shin H，Freeman GJ，Wherry EJ。 通过alphapd-l1阻断对耗尽的CD8 T细胞子集选择性扩展。 Proc Natl Acad Sci U S A. 2008; 105：15016 - 15021。 8。 Pauken KE，Sammons MA，Odorizzi PM等。 表观遗传sta-Wherry EJ。t细胞耗尽。nat免疫。2011; 12：492 - 499。4。Wherry EJ，Ha SJ，Kaech SM等。在慢性病毒感染期间CD8 ＋T细胞耗尽的分子特征。侵害。2007; 27：670 - 684。 5。 Zajac AJ，Blattman JN，Murali-Krishna K等。 由于活化的T细胞的持续存在而没有效应子功能，病毒免疫逃避。 J Exp Med。 1998; 188：2205 - 2213。 6。 Martinez GJ，Pereira RM，Aijo T等。 转录因子NFAT促进了激活的CD8 （＋）T细胞的耗尽。 免疫。 2015; 42：265 - 278。 7。 Blackburn SD，Shin H，Freeman GJ，Wherry EJ。 通过alphapd-l1阻断对耗尽的CD8 T细胞子集选择性扩展。 Proc Natl Acad Sci U S A. 2008; 105：15016 - 15021。 8。 Pauken KE，Sammons MA，Odorizzi PM等。 表观遗传sta-2007; 27：670 - 684。5。Zajac AJ，Blattman JN，Murali-Krishna K等。由于活化的T细胞的持续存在而没有效应子功能，病毒免疫逃避。 J Exp Med。 1998; 188：2205 - 2213。 6。 Martinez GJ，Pereira RM，Aijo T等。 转录因子NFAT促进了激活的CD8 （＋）T细胞的耗尽。 免疫。 2015; 42：265 - 278。 7。 Blackburn SD，Shin H，Freeman GJ，Wherry EJ。 通过alphapd-l1阻断对耗尽的CD8 T细胞子集选择性扩展。 Proc Natl Acad Sci U S A. 2008; 105：15016 - 15021。 8。 Pauken KE，Sammons MA，Odorizzi PM等。 表观遗传sta-病毒免疫逃避。J Exp Med。1998; 188：2205 - 2213。 6。 Martinez GJ，Pereira RM，Aijo T等。 转录因子NFAT促进了激活的CD8 （＋）T细胞的耗尽。 免疫。 2015; 42：265 - 278。 7。 Blackburn SD，Shin H，Freeman GJ，Wherry EJ。 通过alphapd-l1阻断对耗尽的CD8 T细胞子集选择性扩展。 Proc Natl Acad Sci U S A. 2008; 105：15016 - 15021。 8。 Pauken KE，Sammons MA，Odorizzi PM等。 表观遗传sta-1998; 188：2205 - 2213。6。Martinez GJ，Pereira RM，Aijo T等。转录因子NFAT促进了激活的CD8 （＋）T细胞的耗尽。免疫。2015; 42：265 - 278。7。Blackburn SD，Shin H，Freeman GJ，Wherry EJ。 通过alphapd-l1阻断对耗尽的CD8 T细胞子集选择性扩展。 Proc Natl Acad Sci U S A. 2008; 105：15016 - 15021。 8。 Pauken KE，Sammons MA，Odorizzi PM等。 表观遗传sta-Blackburn SD，Shin H，Freeman GJ，Wherry EJ。通过alphapd-l1阻断对耗尽的CD8 T细胞子集选择性扩展。Proc Natl Acad Sci U S A.2008; 105：15016 - 15021。 8。 Pauken KE，Sammons MA，Odorizzi PM等。 表观遗传sta-2008; 105：15016 - 15021。8。Pauken KE，Sammons MA，Odorizzi PM等。表观遗传sta-
基因组学如何彻底改变分类学
基因组中包含的信息对于我们植物病理学家来说是一座金矿，使我们能够改进诊断方法并寻找与流行病学和植物-微生物相互作用有关的特征，以及它们背后的进化过程。2022 年是《自然》杂志上发表的前两个黄单胞菌全基因组序列（da Silva 等人，2002 年）的 20 周年。十年后，我加入了黄单胞菌社区，致力于宿主适应性研究，这篇出版物是我阅读的第一篇黄单胞菌论文之一。这项工作的一个核心方面是比较两种黄单胞菌致病变种，即柑橘黄单胞菌和油菜黄单胞菌，它们分别对柑橘和十字花科植物具有致病性。这种方法使作者能够识别菌株特异性基因，并提出可能解释不同宿主特异性和致病过程的机制，这是我们社区的两个热点问题（Harris 等人，2020 年；Jacques 等人，2016 年）。这种比较基因组学分析在许多方面都具有开创性，下一个黄单胞菌基因组花了三年多的时间才发表。几年后，随着越来越快、越来越便宜的测序技术的出现，全基因组测序“民主化”了（Zhao & Grant，2011 年），很快导致每年发布几十个，然后是几百个黄单胞菌基因组序列（图 1）。
相关的腹泻疾病
抽象背景：铜绿假单胞菌不是常见的肠道病原体。尚未研究人类组织血液组抗原（HBGAS）和铜绿假单胞菌肠道感染之间的辅助。方法：我们为铜绿假单胞菌肠道定植率收集了来自2岁以下健康儿童的粪便样品。唾液样品是从铜绿假单胞菌 - 相关腹泻疾病和正常健康儿童的患者中收集的。基因组DNA进行ABO血组键入和FUT2基因分型。使用ELISA测定法进行了刘易斯表型。结果：总共有85例铜绿假单胞菌相关性腹泻疾病和105名健康儿童收集唾液标本。健康儿童的粪便定殖率为5/101（5％），婴儿为4/58（6.9％），1 E 2岁儿童的粪便分别为1/43（2.3％）。血型A在患有铜绿假单胞菌相关性腹泻疾病的患者中比健康儿童（17.6％）（P Z 0.035）更常见。所有患者和健康的孩子都是阳性的。在铜绿假单胞菌相关性腹泻疾病患者中，弱 - 分泌基因型SE 385/ SE 385的分布分别为23/84（27.4％），健康儿童的分别为17/104（16.3％）（p z 0.06）。患有铜绿假单胞菌相关性腹泻病的患者比健康的
免疫和细胞治疗新进展学术会议
肿瘤衍生的外泌体在将肿瘤分子转移到相邻细胞中起着关键作用，从而导致其表型改变并促进肿瘤生长，转移，耐药性和调节肿瘤微环境。我们对恶性脑肿瘤的研究表明，胶质母细胞瘤干细胞（GSC）通过细胞外囊泡（EVS）将其货物转移到肿瘤非茎细胞或正常细胞中，从而导致具有治疗性耐药性和癌性特性的肿瘤干细胞亚型的发展。tzab-001，一种由GSC衍生的细胞外囊泡产生的单克隆抗体，通过阻断EV的细胞间传播，可以显着降低肿瘤干细胞的治疗性耐药性。TZAB-001在神经胶质瘤中识别的蛋白质比其他肿瘤高了60倍。免疫组织化学染色和蛋白质印迹表明，TZAB-001抗体明确识别人GBM干细胞，肝癌细胞系HEPG2，胰腺癌细胞PANC-1和肺癌细胞系A549，但不是正常脑细胞。结果表明，TZAB-001具有肿瘤诊断，癌症干细胞的CART免疫疗法以及ADC药物开发的应用潜力，以提高其功效。
探讨医师在未来「再生细胞治疗」的角色
近年大家对外泌体（外泌体）治疗疾病的相治疗疾病的相：甚至有些学者把异体的外泌：首先外泌体的萃取非常困难复：首先外泌体的萃取非常困难复，理论上必须要把长满干细胞盒子内的培养液，理论上必须要把长满干细胞盒子内的培养液，放在冷冻超高速离心机，放在冷冻超高速离心机10万转，超过，超过12个小时以上，（50-200nm），所以可以穿过所以可以穿过（血脑屏障，Bbb）已，这应该叫msc的条件培养基。至于，经由身体的需求，让干细胞在身体的微环境内