目标:恶性外周神经鞘肿瘤(MPNST)是高度侵略性的麦芽瘤,治疗率有限,存活率较差,因此需要发展新的治疗疗法。由于由近端抑制基因CDKN2A损失造成的乘客缺失,大约25-50%的MPNST港口丧失酶甲基腺苷磷酸化酶(MTAP)损失。PRMT5由于底物甲基噻吩并腺苷(MTA)的积累而被鉴定为MTAP被骨化细胞中的选择性依赖性,该细胞本身就是内源性PRMT5抑制剂。TNG908和TNG462是临床阶段MTA合件PRMT5抑制剂,可分别证明对MTAP细胞的选择性分别在15倍和45倍的MTAP -INTACT -INTACT细胞上。先前的报道表明,这两个分子都驱动了各种MTAP癌症组织学的异种移植模型中耐用的肿瘤回归。在这里,我们的目标是检查临床前MPNST模型中TNG908和TNG462的活性。
作为氮酶。ATP的16个分子(ATP =三磷酸腺苷,一种能量存储化合物)代表BNF反应发生所需的能量。形成氨(NH 3),它被转化为氨基酸,例如谷氨酰胺。氨基酸中的氮可以用于植物合成蛋白质的生长和发育。
缩写:Acpype,Antchamber Python Parser界面;助理,吸收,分布,代谢,排泄和毒性; ATP,三磷酸腺苷; cAMP,环状AMP,腺苷3',5' - 环状单磷酸盐; DCCM,动态交叉相关矩阵;涂料,离散优化的蛋白质能; DSSP,定义蛋白质的二级结构;美国食品和药物管理局FDA; FEL,自由能景观; GTP,三磷酸鸟嘌呤; Lincs,线性约束求解器; MD,分子动力学; mmpbsa,分子力学泊松 - 玻尔兹曼表面积; NPT,恒定数量的颗粒,系统压力和温度; NVT,恒定颗粒数,系统体积和温度; PCA,主成分分析; PDB,蛋白质数据库; PI,无机磷酸盐; PME,粒子网埃瓦尔德; PPA1,无机焦磷酸酶1; PPI,无机焦磷酸盐; RG,回旋半径; RMSD,均方根偏差; RMSF,根平方波动; SEM,平均值的标准误差;微笑,简化的分子输入线进入系统。
抽象的嘌呤能受体在中枢神经系统(CNS)中起重要作用。这些受体参与调节神经元,小胶质细胞和星形胶质细胞功能的细胞神经燃料反应。基于其内源配体,将嘌呤能受体分类为P1或腺苷,P2X和P2Y受体。在脑损伤或病理条件下,细胞外三磷酸腺苷(ATP)或尿苷三磷酸(UTP)从受损细胞中快速扩散,促进小胶质细胞的激活,从而导致这些受体在大脑中表达的变化。具有选择性正电子发射断层扫描(PET)放射性体的嘌呤能受体的成像,使我们对这些受体中某些受体在健康和患病的大脑中的功能作用有了我们的理解。在这篇综述中,我们已确保了当前可用的果虾能受体的PET放射线列表,这些PET受体用于阐明受体功能和参与中枢神经系统疾病。我们还审查了缺乏放射性示意剂的受体,为未来的新型PET放射性物体奠定了基础,以揭示这些受体在中枢神经系统疾病中的作用。
使用外源性向导 RNA 招募内源性腺苷脱氨酶来编辑细胞 RNA 是一种有前途的治疗策略,但使用当前的向导 RNA 设计,编辑效率和持久性仍然很低。我们设计了环状 ADAR 招募向导 RNA (cadRNA),以实现更高效的可编程 A-to-I RNA 编辑,而无需同时递送任何外源性蛋白质。使用这些 cadRNA,我们观察到在多个位点和细胞系中,在 RNA 的非翻译区和编码区中,都有稳健而持久的 RNA 编辑,并且具有高转录组特异性。此外,我们通过在反义域中整合散布的环路来增加靶腺苷的转录水平特异性,从而减少旁观者编辑。通过腺相关病毒在体内递送 cadRNA,可使 C57BL/6J 小鼠肝脏中的 mPCSK9 转录本实现 53% 的 RNA 编辑,并使 IDUA-W392X 小鼠 I 型黏多糖贮积症模型中的琥珀色无义突变实现 12% 的 UAG-UGG RNA 校正
不用担心 - 您不期望您知道构成DNA,RNA或AMP,ADP和ATP的核苷酸的结构公式(如上图所示)!您只需要学习由它们组成的不同基团(磷酸基团,戊糖糖和氮基)。请记住,腺嘌呤是氮基碱,而腺苷是核苷(碱 - 腺嘌呤 - 附着在五糖糖上)。
摘要:类似甲基转移酶的3(METTL3)和METTL14形成了一种催化最丰富的内部mRNA修饰的异二聚体复合物,N 6-甲基腺苷(M 6 A)。mettl3是结合二叶酸S-腺苷蛋氨酸(SAM)的催化亚基,而Mettl14参与mRNA结合。m 6修饰提供了对基因表达的转录后水平控制,因为它影响了mRNA生命周期的几乎所有阶段,包括剪接,核输出,翻译和衰减。有越来越多的证据表明Mettl3在急性髓样白血病中的致癌作用。在这里,我们使用催化亚基METTL3的结构和动态细节来开发与SAM竞争的小分子抑制剂。从通过高通量对接识别的命中开始,采用蛋白质晶体学和分子动力学模拟来指导抑制活性的优化。通过均匀分辨荧光测定法测量的效力成功提高了8000倍。优化化合物对脱靶RNA甲基转移酶METTL1和METTL16具有选择性。关键字:Mettl3/Mettl14,表面参考,计算机辅助药物设计(CADD),分子动力学,M 6 A-RNA,SAR■简介
作用于RNA(ADARS)的摘要腺苷脱氨酶是将腺苷转化为双链RNA中的插入(RNA编辑A-TO-I)的酶。adar1和adar2先前被报道为HIV-1前病毒因素。这项研究的目的是研究HIV-1表达期间ADAR2核糖核蛋白蛋白复合物的组成。通过在表达HIV-1然后进行质谱分析的细胞中使用双标记亲和力纯化程序,我们确定了10个非核糖体ADAR2-相互作用因子。先前发现了与长的散布元素1(Line1或L1)核糖核颗粒相关的这些蛋白质的很大一部分,并调节L1逆转录子的生命周期。考虑到我们先前证明ADAR1是Line-1逆转录座子活性的抑制剂,我们研究了ADAR2是否也起着相似的功能。为了达到这个目标,我们在过表达或消融的ADAR2的细胞中进行了特定的细胞培养逆转录分析。这些实验揭示了ADAR2作为L1反转座的抑制剂的新功能。此外,我们表明ADAR2结合了基底L1 RNP复合物。
定点 RNA 碱基编辑能够实现遗传信息的瞬时和可控改变,代表了一种操纵细胞过程的最新策略,为新型治疗方式铺平了道路。虽然已经对引入腺苷到肌苷变化的工具进行了深入研究,但对胞苷到尿苷编辑的精确和可编程工具的工程设计却有些落后。在这里,我们证明,从 RESCUE-S 工具中获取的 ADAR2 腺苷脱氨酶进化而来的胞苷脱氨酶结构域在将 RNA 靶向机制从基于 Cas13 更改为基于 SNAP 标签时提供了非常高效且高度可编程的编辑。向导 RNA 化学的优化进一步允许在难以编辑的 5'-CCN 序列环境中显着提高编辑产量,从而提高了该工具的底物范围。关于编辑效率,SNAP-CDAR-S 在所有测试目标上都明显胜过 RESCUE-S 工具,并且在扰乱 β-catenin 通路方面也非常出色。 NGS 分析表明,这两种工具都存在类似、适度的全局脱靶 A 到 I 和 C 到 U 编辑。
非酒精性脂肪性肝炎(NASH)是由肝细胞死亡通过caspase 6的激活而触发的,这是由于腺苷一磷酸腺苷(AMP)激活的蛋白激酶-Alpha(AMPKα)活性的降低而引起的。增加的肝细胞膜死亡会促进肝纤维化的炎症。我们表明,在纳什患者和纳什饮食中喂养的雄性小鼠中,核定定位的有丝分裂原活化蛋白激酶(MAPK)磷酸酶-1(MKP1)上调。这项工作的重点是研究MKP1是否以及如何参与NASH的发展。在NASH条件下增加氧化应激,诱导MKP1表达,导致核p38 MAPK去磷酸化并减少肝激酶B1(LKB1)磷酸化,以促进LKB1核出口所需的位点。nash饮食中MKP1的肝缺失喂养雄性小鼠将核LKB1释放到细胞质中,以激活AMPKα并防止肝细胞死亡,炎症和NASH。因此,需要核定定位的MKP1- P38 MAPK-LKB1信号传导才能抑制触发肝细胞死亡和NASH发展的AMPKα。