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World File Search System致病性
针对致病性MHC II类的调节性T细胞
1个糖尿病中心，印第安纳州生物科学研究所，印第安纳州印第安纳波利斯，美国2号医学系，内分泌学，糖尿病和代谢，贝勒医学院，贝勒医学院，德克萨斯州休斯敦，美国德克萨斯州休斯敦，3美国，生物统计学和健康数据科学系3美国印第安纳波利斯印第安纳波利斯医学院治疗学院，美国，5计算生物学和生物信息学中心，美国印第安纳州印第安纳波利斯，印第安纳州印第安纳波利斯医学院，6赫尔曼B威尔斯儿科研究中心和印第安纳州印第安纳州印第安纳州印第安纳州印第安纳州印第安纳州的印第安纳州医学院，美国，美国，印第安纳州印第安纳州，印第安纳州，赫尔曼·B·威尔斯（Herman b Wells）。加利福尼亚州加利福尼亚大学旧金山大学糖尿病中心，美国加利福尼亚州，加利福尼亚大学9号，加利福尼亚大学旧金山分校，加利福尼亚州旧金山，美国10号，格拉德斯通基因组免疫学研究所，加利福尼亚大学，加利福尼亚大学，加利福尼亚州旧金山，加利福尼亚州，旧金山，糖尿病中心11美国印第安纳州印第安纳大学医学院的12个生物化学与分子生物学
一种基因致病性工具“ genepy”识别丢失的双质...
目的：100,000个基因组项目诊断出了四分之一的受影响参与者，但有26％的诊断不在应用基因面板上；许多人是从头变体。评估没有基因面板的双重变体更具挑战性。方法：我们试图使用Genepy识别丢失的双重诊断，其中包含等位基因频率，Zygosity和一个用户依赖的有害度量，每个参与者都会产生每个基因的综合基因分数。我们计算了78,216个100,000个基因组项目参与者的2862个隐性疾病基因的遗传评分。对于每个基因，我们对参与者的基因分数进行了排名，并在没有诊断的情况下对受影响的参与者进行了仔细检查，他们的分数在每个基因的前5名中排名。在参与者表型与感兴趣的疾病基因重叠的情况下，我们提取了稀有变体和应用相，clinvar和ACMG分类。结果：3184个未经分子诊断的人的受影响的个体的遗传评分为前5位，而3184中的682个（21％）的表型与顶级基因重叠。在669（18％）表型匹配的病例中的122例（不包括13例撤回参与者）中，我们确定了假定的错过诊断（占所有未诊断参与者的2.2％）。另外334例（50％）中有334例可能遗漏了诊断，但需要验证功能验证。结论：大规模应用基因研究已确定了456个潜在诊断，证明了新型诊断策略的价值。©2024作者。由Elsevier Inc.代表美国医学遗传与基因组学院出版。这是CC下的开放访问文章（http://creativecommons.org/licenses/4.0/）。
IFT88通过沿果蝇cilia 的定位信号蛋白来维持感觉函数 内皮细胞在心脏损伤期间采用促徒期免疫反应症 t细胞分化驱动致病性线粒体DNA变体的负选择 rb损失通过捕获PAR抑制后，将细胞敏感到与复制相关的DNA损伤 在径向神经胶质生物学和脑发育中了解葡萄糖代谢 辅酶A前体哑氨酸增强了肉瘤中的抗肿瘤免疫力 人Rad52刺激RAD51介导的同源搜索 增强子突变调节化学疗法诱导的骨髓抑制的严重程度 时空DNA甲基化动力学形状巨型级甲基甲基景观 细胞锌状态改变染色质的可及性和p53与DNA 的结合 异常的DNA甲基化扭曲了非典型Teratoid/burtabdoid肿瘤中的发育轨迹 defa1a3 DNA基因剂量调节上尿路感染期间肾脏先天免疫反应 在干细胞衍生的神经元中，在神经发育过程中的脂肪型获取
睫状缺陷引起几种纤毛病，其中一些纤毛发作迟到，这表明cilia被积极维持。仍然，我们对维护的机制的理解很糟糕。在这里，我们显示了果蝇黑色素果ift88（DM IFT88/nompb）继续沿着完全形成的感觉纤毛移动。我们进一步识别无活跃的，果蝇听力和负性持续性行为的TRPV通道亚基，以及尚未表征的果蝇鸟叶尼犬环酶2D（DM GUCY2D/ CG34357）作为DM IFT88货物。我们还显示了DM IFT88与循环酶的细胞内部分的结合，该部分在几种退化性视网膜疾病中是进化保守和突变的，对于DM GUCY2D的纤毛定位而言是不可能的。最后，成年纤维中DM IFT88和DM GUCY2D的急性敲低导致纤毛功能的维持，障碍和刺激性刺激性的行为导致缺陷，但并未显着影响睫状超结构。我们得出的结论是，成人范围内听力的感觉睫状功能涉及DM IFT88及其至少两个信号传导跨膜货物，DM GuCy2D和无效的主动维护程序。
家禽高致病性禽流感疫苗接种 - 第一部分 现有疫苗和免疫策略
已经开发了几种针对高致病性禽流感 (HPAI) 的疫苗，其中大部分是针对鸡的灭活全病毒疫苗。在欧盟，一种疫苗被批准用于鸡，但无法完全阻止传播，这凸显了针对不同家禽品种和生产类型的疫苗的必要性。疫苗可以超说明书使用，但有效性各不相同。疫苗通常是注射的，这是一个耗时的过程。在孵化场外大规模应用疫苗的情况仍然很少见。第一次接种时间从卵内到 6 周龄不等。目标物种的免疫开始和持续时间数据通常不可用，尽管这是有效规划的关键。尽量减少疫苗和野生毒株之间的抗原距离至关重要，需要快速更新疫苗以匹配循环毒株。生成显示疫苗减少传播能力的统一疫苗效力数据至关重要，这种能力也应在现场试验中进行评估。规划疫苗接种需要选择最合适的疫苗类型和疫苗接种方案。紧急保护性疫苗仅限于不受物种、年龄或预先存在的媒介免疫限制的疫苗，而预防性疫苗则应优先实现最高保护，特别是对高危传播地区的最易感物种。法国、意大利和荷兰的模型模拟显示：（i）鸭和火鸡养殖场比鸡更具传染性；（ii）减少受感染养殖场的数量仅在控制疾病传播方面表现出局限性，而1公里环状扑杀的效果优于或类似于紧急预防性环状疫苗接种方案，尽管减少的养殖场数量最多；（iii）对高危传播地区的最易感物种进行预防性疫苗接种是最大限度减少疫情数量和持续时间的最佳选择；（iv）在这些地区发生疫情时，在3公里半径范围内进行紧急保护性疫苗接种比在1公里和10公里半径范围内更有效。应监测疫苗效果并补充其他监测和预防措施。
氟化物导出是牙科生物膜模型中致病性微生物的竞争性适应性
摘要（250个单词）微生物使用来自几个不同分子家族之一的氟化物导出蛋白抵抗氟化物毒性。致癌物种链球菌突变和白色念珠菌分别使用CLC F F - /H +抗替代剂和Fex氟化物通道挤出了细胞内氟化物，而使用FlucCoccus gordonii，使用Flucococcus gordonii，使用Fluccoccus flucorty使用氟化氟化物。在这项工作中，我们研究了氟化物出口的遗传敲除如何影响单物种和三种牙科生物膜模型中的病原体适应性。用于使用CLC F转运蛋白的遗传敲除的生物膜生成的生物膜，暴露于氟化物较低的浓度降低了链球菌的数量，协同降低了白色念珠菌的种群，增加了恒定链球菌的相对比例，并降低了与生物含量降低的生产和HySyDrot的酸性生产和HySydrot的相关性能。生物膜具有FEX通道的遗传敲除，在氟化物存在下也表现出降低的适应性，但程度较小。成像研究表明，链球菌对氟化物高度敏感，当敲除菌株暴露于低氟化物的情况下，在适度的时间内进行完全裂解，并且生化纯化链球菌Clc f转运蛋白clc f转运蛋白和功能重新构造确立了功能性蛋白质是由单个基因编码的功能蛋白。一起，这些发现表明，特定抑制剂可以针对口腔病原体的氟化物出口，以恢复牙齿生物膜中的生物膜共生，并且链球菌链球菌特别容易受到氟化物毒性的影响。重要性（150个单词）：龋齿是一种全球盛行的疾病，发生在牙科生物膜中的病原体物种（包括链球菌变异物和白色念珠菌，诸如gordoccoccus gordoniii）之类的抗蛋白质有益物种时。氟化物通常用于口腔卫生中以防止龋齿。氟化物也具有抗菌特性，尽管大多数微生物具有氟化物出口商可抵抗其毒性。这项工作表明，通过氟化物出口商的遗传基因敲除改变牙齿生物膜的微生物组成和致病性能，致氟化链球菌和白色念珠菌对氟化物的敏感性。这些结果表明，抑制氟化物出口商的药物的开发可以增强氟化物在牙膏和嘴里冲洗等非处方产品中的抗性效果。这是治疗龋齿的新型策略。关键词：生物膜，社区，牙科，转运蛋白，氟化物，致病性，龋齿，CLC，CRCB，FLUC
基准对囊性纤维化变体的字母固定致病性预测
对囊性纤维化变体的字母敏感性致病性预测Eli Fritz McDonald 1,2，Kathryn E. Oliver 3,4，Jonathan P. Schlebach 5，Jens Meiler 1,2,6,7**生物学，范德比尔特大学，纳什维尔，田纳西州37240，美国3美国埃默里大学医学院儿科学系，亚特兰大，佐治亚州30322，美国4囊性纤维化和航空疾病中心，亚特兰大和埃默里大学的儿童医疗保健，亚特兰大大学，亚特兰大，亚特兰大，加利福尼亚州30322，美国5个部门。范德比尔特大学药理学，纳什维尔，田纳西州纳什维尔37240，美国7莱比锡大学药物发现研究所，莱比锡大学，莱比锡，萨克斯04103，德国8号，8 8日，纳什维尔大学生物科学系，纳什维尔，田纳西州37235，美国37235作者：JM（jens@meilerlab.org），lp（lars.plate@vanderbilt.edu）囊性纤维化跨膜电导调节剂基因（CFTR）中的摘要变体导致囊性纤维化 - 一种致死性自身骨膜衰减障碍。在CFTR蛋白中改变单个氨基酸的错义变体是最常见的囊性纤维化变体之一，但是迄今为止，用于准确预测错义变体的分子后果的工具已限制为迄今为止。字母启示（AM）是一项新技术，可预测基于双重学识料蛋白质结构和进化特征的错义变体的致病性。在这里，我们评估了AM预测CFTR错义变种的致病性的能力。AM预测总体CFTR残基的致病性很高，从而在CFTR2.org数据库的CF变体上产生了高的假阳性率和公平分类性能。AM致病性评分与CF患者的致病性指标适度相关，包括汗液氯化物水平，胰腺功能不全率和铜绿假单胞菌感染率。相关性也与CFTR运输和体外折叠能力相关。相比之下，AM分数与CFTR通道功能在体外良好相关 - 尽管在训练过程中缺乏此类数据，但表明双重结构和进化训练方法学习了重要的功能信息。跨指标表明AM的不同性能可能会确定CFTR中的多态性是否是隐性CF变体，但无法区分机理效应或病理生理学的性质。最后，AM预测提供了有限的实用性，以告知CF变体的药理响应，即Theratype。开发新方法以区分CFTR变体的生化和药理学特性，仍然需要完善新兴精度CF治疗剂的靶向。
致病性 CaMKIIδ 的 CRISPR-Cas9 碱基编辑可改善人源化小鼠模型中的心脏功能
引言心血管疾病，特别是冠状动脉心脏病及随后的心肌梗死，是全世界最常见的死亡原因，这凸显了先进治疗策略的必要性 (1)。已证实 Ca 2+ /钙调蛋白依赖性蛋白激酶 II δ (CaMKII δ ) 的慢性过度激活是心脏病的主要指标和诱因 (2–10)。在调节细胞稳态和信号传导至正常激活水平的同时，持续增加的 CaMKII δ 激活与兴奋-收缩偶联受损、细胞 Ca 2+ 处理紊乱、炎症、细胞凋亡和纤维化有关，所有这些都会损害心脏功能 (2、4、5、8–14)。因此，CaMKII δ 过度激活与心肌梗死和缺血/再灌注 (IR) 损伤、心力衰竭、心律失常、心脏肥大和睡眠呼吸障碍有关 (2、3、6-11、15、16)。从机制上讲，281 和 282 位上的 2 个蛋氨酸残基的氧化已被证明
致病性 CaMKIIδ 的 CRISPR-Cas9 碱基编辑...
引言心血管疾病，特别是冠状动脉心脏病及随后的心肌梗死，是全世界最常见的死亡原因，这凸显了先进治疗策略的必要性 (1)。已证实 Ca 2+ /钙调蛋白依赖性蛋白激酶 II δ (CaMKII δ ) 的慢性过度激活是心脏病的主要指标和诱因 (2–10)。在调节细胞稳态和信号传导至正常激活水平的同时，持续增加的 CaMKII δ 激活与兴奋-收缩偶联受损、细胞 Ca 2+ 处理紊乱、炎症、细胞凋亡和纤维化有关，所有这些都会损害心脏功能 (2、4、5、8–14)。因此，CaMKII δ 过度激活与心肌梗死和缺血/再灌注 (IR) 损伤、心力衰竭、心律失常、心脏肥大和睡眠呼吸障碍有关 (2、3、6-11、15、16)。从机制上讲，281 和 282 位上的 2 个蛋氨酸残基的氧化已被证明
细胞和转录组对致病性和非致病性弧菌性副溶血性菌株的菌株，导致急性肝癌坏死疾病（AHPND）litopenaeus vannamei
。cc-by 4.0国际许可（未经Peer Review尚未获得认证）是作者/资助者，他已授予Biorxiv的许可证，以永久显示预印本。这是该版本的版权所有，该版本发布于2023年11月8日。 https://doi.org/10.1101/2023.11.08.566166 doi：biorxiv preprint