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对阿尔茨海默氏病中脑脊液蛋白生物标志物的定量质谱分析
1标题2 3 3定量质谱分析分析4阿尔茨海默氏病中脑脊液蛋白生物标志物的定量质谱分析5 6作者7 8 Caroline M. Watson 1，Eric B. Dammer 1，Lingyan Ping 1，Duc M. Duc M. Duong M. Duong 2，Erica Modeste 1，Erica Modeste 1，E. 9 Kathleen Carter 2，E. 9 Kathleen Carter 2，Erik C. B. Blaine R. Roberts 1,2和10 Nicholas T. Seyfried 1,2* 11 12 13隶属关系14 1。埃默里大学医学院神经病学系15 2。埃默里大学医学院生物化学系16通讯作者：Nicholas T. Seyfried博士（nseyfri@emory.edu）;詹姆斯·J·拉（James J. Lah），医学博士17博士。 （jlah@emory.edu）; Allan I Levey，医学博士。 （alevey@emory.edu）18 19摘要20 21阿尔茨海默氏病（AD）是痴呆症的最常见形式，脑脊液液（CSF）22β-淀粉样蛋白（Aβ），TAU总tau和磷酸化的TAU提供了最敏感和特定的23个生物标记物来诊断。 但是，这些诊断生物标志物并不能反映淀粉样蛋白（A）和TAU（T）病理的AD大脑的复杂变化。 在这里，我们报告了选定的25个反应监测质谱法（SRM-MS）方法，具有同位素标记的标准标准26，用于CSF中的相对蛋白质定量。 生物标志物阳性（AT+）和负（AT-）CSF池27用作质量控制（QC）来评估测定精度。 我们检测到30个QC和133个对照（认知正常，AT），29 127个无症状（认知性正常，+AT+）和130个症状AD（认知性AD（认知性障碍），平均CV的平均CV为〜13％（认知正常），平均CV约为13％（认知正常）。 这证明了SRM-MS的实用程序33，以量化AD阶段的CSF蛋白生物标志物。埃默里大学医学院生物化学系16通讯作者：Nicholas T. Seyfried博士（nseyfri@emory.edu）;詹姆斯·J·拉（James J. Lah），医学博士17博士。（jlah@emory.edu）; Allan I Levey，医学博士。（alevey@emory.edu）18 19摘要20 21阿尔茨海默氏病（AD）是痴呆症的最常见形式，脑脊液液（CSF）22β-淀粉样蛋白（Aβ），TAU总tau和磷酸化的TAU提供了最敏感和特定的23个生物标记物来诊断。但是，这些诊断生物标志物并不能反映淀粉样蛋白（A）和TAU（T）病理的AD大脑的复杂变化。在这里，我们报告了选定的25个反应监测质谱法（SRM-MS）方法，具有同位素标记的标准标准26，用于CSF中的相对蛋白质定量。生物标志物阳性（AT+）和负（AT-）CSF池27用作质量控制（QC）来评估测定精度。我们检测到30个QC和133个对照（认知正常，AT），29 127个无症状（认知性正常，+AT+）和130个症状AD（认知性AD（认知性障碍），平均CV的平均CV为〜13％（认知正常），平均CV约为13％（认知正常）。这证明了SRM-MS的实用程序33，以量化AD阶段的CSF蛋白生物标志物。可以区分AT+ AT-个体的蛋白质包括SMOC1，GDA，14-3-3 31蛋白质以及参与糖酵解的蛋白质。可以区分认知障碍32的蛋白质主要是神经元蛋白（VGF，NPTX2，NPTXR和SCG2）。34 35背景和摘要36 37阿尔茨海默氏病（AD）在全球范围内影响超过4500万人，使其成为38种常见的神经退行性疾病1（https://wwwww.alz.alz.almedia/media/dia/dia/documents/alzheimers/alzheimers-39
无标签的定量热蛋白质组谱分析揭示了目标转录因子，其活动由MC3R信号调节
摘要：使用离子动力增强的LC-MS提供无标记定量的热蛋白质组分析，提供了多功能数据集，提供有关蛋白质差异表达，热稳定性和转录因子活性的信息。我们开发了一种多维数据分析工作流程，用于无标记的定量热蛋白质组分析（TPP）实验，该实验结合了基因集富集分析的各个方面，差异蛋白蛋白表达分析以及从LC- MS数据中推断转录因子活性的推断。我们将其应用于黑色素质素3受体（MC3R）激活的信号传导过程，这些激动剂源自促蛋白酶素皮质素激素：ACTH，α -MSH和γ -MSH。获得的信息用于绘制MC3R下游的信号通路，并推断出负责配体治疗的细胞反应的转录因子。使用我们的工作流程，我们确定了差异表达的蛋白质并研究了它们的热稳定性。我们在总共298个蛋白质中发现了由MC3R激活导致的热稳定性改变的蛋白质。在这些中，几种蛋白质是转录因子，表明它们是参与MC3R信号级联的下游目标调节剂。我们发现转录因子CCAR2，DDX21，HMGB2，SRSF7和TET2的热稳定性改变了。MC3R信号级联中的这些明显的目标转录因子在免疫反应中起着重要作用。此外，我们推断了数据集中确定的转录因子的活动。这种综合方法生成复杂这是使用贝叶斯统计数据使用我们使用无标签定量LC-MS获得的差异表达数据完成的。通过我们观察到的磷酸化肽丰度，在我们的生物学管道中验证了推断的转录因子活性，这突出了转录因子调节中翻译后修饰的重要性。我们的多维数据分析工作流程允许对MC3R激活下游的信号过程进行全面表征。它提供了有关蛋白质差异表达，热稳定性和关键转录因子活性的见解。本研究中生成的所有蛋白质组学数据均可在DOI上公开获取：10.6019/pxd039945。■引入蛋白质 - 配体相互作用在几乎所有生物过程中都起着至关重要的作用，这使得他们的研究对于不足的细胞功能和发展疗法至关重要。已经开发了许多方法来表征这些相互作用，通常集中于配体亲和力。然而，随访蛋白 - 配体相互作用与其下游效应（包括跨文字组，蛋白质组学和翻译后修饰（PTM）变化）非常重要。热蛋白质组分析（TPP）已成为一种有价值的技术，可以深入了解蛋白质功能，蛋白质 - 蛋白质相互作用，甚至预测与生理相关环境中的不良药物影响。1，2 TPP基于蛋白质 - 配体相互作用的内在特性，例如，当配体结合稳定蛋白质结构并因此增加了其熔化温度时。1，2详细使用，TPP采用了多步方法，包括配体处理，加热，提取，纯化，消化和LC -MS分析。
参考书目 - ETD UGM
[37] SZH Naqvi、M Arooj、S Aziz、MU Khan、MA Choudhary 和 MN ul。 Hassan，“通过肺音频谱分析对哮喘和肺炎喘息进行分类”，2020 年电气、通信和计算机工程国际会议 (ICECCE)，
科学家发现维生素 B6 的一种形式可以参与肿瘤反应性免疫细胞
这项研究的核心是对与 MR1 结合的小分子进行无偏质谱分析、对 MR1 与维生素 B6 相互作用的结构解析、以及由主要作者、莫纳什大学生物医学发现研究所的 Mitchell McInerney 博士和 Wael Awad 博士以及墨尔本大学彼得多尔蒂研究所的 Michael Souter 博士和 Yang Kang 先生进行的免疫学测定。
儿童注意力和创造力表现期间脑电图记录的功率谱和连接分析
摘要：本研究的目的是检查功率谱并探索注意力表现过程中的功能性大脑连接/断开情况，以注意力 d2 测试和创造力测试为衡量标准，以正常发育儿童的 CREA 测试为衡量标准。为此，我们通过使用相位同步性（即锁相指数 (PLI)）对 15 名 9 至 12 岁儿童通过 Emotiv EPOC 神经耳机获取的 EEG 信号进行检查来检查大脑连接。此外，作为补充，还对获取的信号进行了功率谱分析。我们的结果表明，在 d2 测试过程中，全局伽马相位同步增加，而全局 alpha 和 theta 波段去同步。相反，在 CREA 任务期间，功率谱分析显示 delta、beta、theta 和 gamma 波段显著增加。连接分析显示 theta、alpha 和 gamma 明显同步。这些发现与其他神经科学研究一致，表明多种大脑机制确实与创造力有关。此外，这些结果对于在临床和研究环境中评估注意力功能和创造力以及对具有正常和非正常发育的儿童的神经反馈干预具有重要意义。
Isonicotinohydrazide Chalcone及其Ni复合物作为酸清洗过程中的腐蚀抑制剂：理论和实验方法
对产生相应的（z）-n' - （（（1H-indol-3- yl）甲基甲基甲基甲基甲基）的相应的（z）-n' - （CH）的反应。 CH和CHN抑制剂的抑制效率分别分别减轻体重减轻，而CH和CHN抑制剂的抑制效率分别为约86.9％，CH和CHN抑制剂的抑制效率分别为降低的抑制剂，而CHN抑制剂的极化耐极能力高于CHN抑制剂的较高限制，而CHN抑制剂的浓度降低了，则在较大的情况下降低了COROSIT的差异。对于CH和CHN抑制剂，K ADS分别为11.4824 m -1和6.8667 m -1。吸附的自由能（∆ g o ads。）为-12.1685 kJ mol -1，CHN抑制剂为-14.7326 kJ mol -1。这表明CH和CHN抑制剂都被物理吸附到低碳钢表面上，而CHN则优先吸附。拉曼光谱分析对碳钢的分析揭示了表面上存在γ -FEOOH，而在与这些抑制剂的吸附相关的CH和CHN抑制剂后，检测到了其他峰。拉曼光谱分析对碳钢的分析揭示了表面上存在γ -FEOOH，而在与这些抑制剂的吸附相关的CH和CHN抑制剂后，检测到了其他峰。
基于化学计量学的气相色谱-质谱分析研究人脑肿瘤组织中的农药代谢物，探讨农药暴露与中枢神经系统肿瘤风险因素之间的假定相关性
摘要：农药被广泛使用，导致人类持续接触农药，并可能对健康产生影响。一些与农业工作有关的接触与神经系统疾病有关。自 2000 年代以来，文献中对农药在中枢神经系统 (CNS) 肿瘤发生中的作用的假设进行了更详尽的记录。然而，儿童脑癌的病因仍然很大程度上未知。这项工作的主要目的是根据问卷调查和统计分析从突尼斯斯法克斯哈比卜·布尔吉巴医院中部神经外科住院患者收集的信息，评估农药暴露作为中枢神经系统肿瘤风险因素的潜在作用，这些患者在 2022 年 1 月 1 日至 2023 年 5 月 31 日期间住院。它还旨在通过气相色谱-质谱技术开发一种简单快速的分析方法，用于研究一些收集的人脑肿瘤组织中农药代谢物的痕迹，以进一步强调我们对农药暴露与脑肿瘤发展之间这种相关性的假设。选取有高风险暴露史的患者进行进一步分析。采用化学计量学方法来辨别病理组和对照组之间的内在差异，并通过鉴定导致这种差异的差异表达代谢物来确定有效分离。三个样本显示出农药代谢物的痕迹，这些代谢物大多在早期检测到。一名 10 岁儿童的组织病理学诊断为髓母细胞瘤，27 岁和 35 岁成人的组织病理学诊断为高级别胶质瘤。双变量分析（比值比 >1 和 P 值 <5%）证实了暴露病例患癌症的可能性很大。Cox 比例风险模型显示，50 岁以后的致癌风险是农药毒性的长期影响。我们的研究支持农药暴露与人类脑肿瘤发展风险之间的相关性，表明孕前农药暴露，以及可能的怀孕期间的暴露，与儿童脑肿瘤风险增加有关。这一假设在鉴定出以神经毒性著称的氨基甲酸酯类杀虫剂代谢物痕迹以及以致癌性著称的哒嗪酮、有机氯 (OCs)、三唑类杀菌剂和 N-亚硝基化合物等代谢物痕迹后得到了进一步证实。2D-OXYBLOT 分析证实了杀虫剂的神经毒性作用，可诱导中枢神经系统细胞氧化损伤。在应激降解研究中鉴定出肟代谢物，证实了涕灭威具有脑致癌性。揭示 OC 类“氮丙啶”代谢物可能更好地强调了在早期检测农药代谢物痕迹的理论。总体而言，我们的研究结果促使我们建议限制农药在住宅中的使用，并支持为实现这一目标而制定的公共卫生政策，我们需要在上市后对人类健康影响的监测中保持警惕。
