尽管有几种备受瞩目的最先进的方法可用,但分析批量RNA-Seq数据仍在面临重大挑战。最近的研究的证据表明,流行的差异表达(DE)工具(例如EDGER和DESEQ2)容易受到惊人的错误发现率(FDR)的影响。这些研究表明,在这些模型中观察到的FDR通货膨胀可能归因于诸如违反参数假设的问题或无法有效处理数据中的异常值。在这里,我们认为群体异质性也可以促进这一提升的FDR,这一现象在很大程度上被研究界忽略了。我们介绍了一种新型的统计模型Robseq,该模型旨在在差异分析中有效的每种功能建模,当时是当群均均一的假设未得到满足时。Robseq利用了稳健的统计文献中建立的统计机制,包括M估计量来稳健地估计基因表达水平变化和Huber-Cameron方差估计器来计算异性设置中的鲁棒标准误差。此外,出于推理目的,它还结合了Welch T统计量的自由度调整,有效地解决了RNA-Seq差异表达中FDR通胀的问题。通过详细的模拟和全面的基准测试,我们表明Robseq成功地将错误的发现和I型错误率保持在名义级别,同时与众所周知的DE方法相比保留了高统计能力。对种群级RNA-seq数据的分析进一步表明,Robseq能够鉴定出与复杂人类疾病有关的具有生物学上重要的信号和途径,这些信号和途径涉及复杂的人类疾病,否则这些信号和途径否则无法通过已发表的方法揭示。Robseq的实现可在https://github.com/schatterjee30/robseq上公开提供。
虽然纵向超扫描研究仍然相对罕见,但它对于记录大脑间同步性的变化非常有价值,而大脑间同步性的变化可能反过来决定了行为在社会环境中如何发展和演变。这种实验方法的普遍性和生态效度取决于所选成像技术是否可移动——功能性近红外光谱 (fNIRS) 满足了这一要求。fNIRS 最常用于检查亲子二元组中大脑间同步性和行为的发展。在本文中,我们认为,关注纵向和代际超扫描将更广泛地造福社会和认知神经科学领域。我们认为,这种方法对于理解代际社会动态背后的神经机制特别重要,并且可能对评估心理和社会干预的进展至关重要,其中许多干预措施都处于代际背景下。根据我们的立场,我们强调了跨代研究的领域,这些领域有望通过使用移动设备进行纵向超扫描而得到加强,描述了现实世界中跨代测量可能出现的挑战,并提供了潜在的解决方案。
微生物相互作用对于维持海洋生态系统功能至关重要,但是它们的动态性质和复杂性在很大程度上尚未探索。在这里,我们使用关联网络来研究古细菌,细菌和picoeukaryotes之间在热带和亚热带全球海洋的不同深度和地理区域中的生态相互作用。我们的发现表明,潜在的微生物相互作用随深度和地理规模而变化,表现出高度异质的分布。有几种潜在的相互作用是全球性的,这意味着它们发生在相同深度的区域,而11-36%的区域是特定深度的区域。巴基流动带的全球关联比例最低,区域关联随深度的增加。此外,我们观察到,尽管微生物垂直分散,大多数地表水关联并不持续在更深的海洋层中。我们的工作有助于更深入地了解热带和亚热带全球互动,这对于应对全球变化带来的挑战至关重要。
本演示文稿包含有关未来结果,绩效和成就的前瞻性陈述,这些陈述受风险和不确定性的影响,并反映了由可用信息形成的管理层的观点和假设。历史事实陈述以外的所有陈述都是可以认为是前瞻性陈述的陈述。在此文档中使用时,诸如“预期”,“相信”,“估计”,“期望”,“打算”,“五月”,“计划”,“项目”或“应该”和类似表达式(与佳能相关的表达)之类的词,旨在识别前瞻性陈述。Many factors could cause the actual results, performance or achievements of Canon to be materially different from any future results, performance or achievements that may be expressed or implied by such forward-looking statements, including, among others, changes in general economic and business conditions, changes in currency exchange rates and interest rates, introduction of competing products by other companies, lack of acceptance of new products or services by Canon's targeted customers, inability to meet efficiency and cost reduction objectives, changes in business strategy and various其他因素,均在本演讲中引用和未引用。应实现一个或多个风险或不确定性,或者基本假设证明不正确,实际结果可能与本文所述的结果有很大不同。佳能不打算或承担更新这些前瞻性语句的任何义务。
本演示文稿包含有关未来结果,绩效和成就的前瞻性陈述,这些陈述受风险和不确定性的影响,并反映了由可用信息形成的管理层的观点和假设。历史事实陈述以外的所有陈述都是可以认为是前瞻性陈述的陈述。在此文档中使用时,诸如“预期”,“相信”,“估计”,“期望”,“打算”,“五月”,“计划”,“项目”或“应该”和类似表达式(与佳能相关的表达)之类的词,旨在识别前瞻性陈述。Many factors could cause the actual results, performance or achievements of Canon to be materially different from any future results, performance or achievements that may be expressed or implied by such forward-looking statements, including, among others, changes in general economic and business conditions, changes in currency exchange rates and interest rates, introduction of competing products by other companies, lack of acceptance of new products or services by Canon's targeted customers, inability to meet efficiency and cost reduction objectives, changes in business strategy and various其他因素,均在本演讲中引用和未引用。应实现一个或多个风险或不确定性,或者基本假设证明不正确,实际结果可能与本文所述的结果有很大不同。佳能不打算或承担更新这些前瞻性语句的任何义务。